Epigenetic mechanism Flashcards
Methy grup en çok nerelere takılır
CPG sites
ara başka yapılana da takılabilir
Epigenetikte sitozin ve adenin farkı nedir
sitozin metillenebilir, hidroksimetilkenebilir, ormienblir ya da kaboksillenebilir ancak adenin sadece metillenebilir
DNMT nedir görevi nedir
DNMT: DNA methyltransferase
CpG metillemeyi yapar gene aktivitesini durdurur
SAM’den (S-adenyl methionine) metil aktarır
DNMT1
DNMT3A ve DNMT3B’nin görevleri nelerdir
DNMT1replikasyon sonrası olan metilasyon kalıbını bir sonraki DNA’ya yapar
DNMT3A/B de novo yani ilk embriyonik metilasyonu yapar
sex specific metilasyon hücrelerde hangi zamanda olur
spermde doğumdan önce yumurtada doğumdan sonra
fertilizasyondan sonra hangi genom nasıl demetilasyon geçirir
paternal: active demethylation
maternal: passive demethylation
TET ne görev yapar
aktif demetiasyonda önce oksidasyon gerçekleştirir
histon metillenmesi nasıl olur
H3K9 (9. lysine) metillenir
gen ekspresyonu azalırh
histon asetilasyonu nasıl olur
histonların terminal tail’lerindeki lysinlere bağlanır acetyl grup
bağlanan acetyl nukleozomların katlanmasını engeller gen ekspresyonu artar
2. ve 4. kromatin yapısına katlanma engellenir
miRNA’nın epigenetik olarak görevi nedir
mRNA degradation: eğer miRNA’a hedef mRNA’ya mükemmel şekilde oturursa onu parçalar
mRNA supression: eğer oturmada sıkıntı varsa özellikle 3’UTR ucunda ya mRNA paçalanır ya da traslasyona ifadelenme düzeyi azalır
mRNA degradation in cytoplasmc p-body: 3’UTR ucu ile birleşmemiş miRNA ve mRNA cytoplazmada bulunan çeşitli enzimatik süreçlerin gerçekleştiği yere gider ve burada parçalanır
kısacası miRNA parçalanması için mRNA’yı hedef haline getirir
long non codin RNA’lar nasıl iş görür
genelde neural dokuda çoktur
transkripsiyonu inhibe edebilirler
mRNA düzenlemesini düzenler
alternatif splicing’de görev görür
miRNA’ların çalışmaarını düzenler
