Cours 2- Croissance microbienne et exigences nutritionnelles Flashcards

1
Q

Quelles sont les 4 phases de croissance?

A
  1. Latence
  2. Exponentielle
  3. Stationnaire
  4. Mortalité
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Q

Explique la phase de latence et elle varie en fonction de quoi?

A

C’est une phase d’adaptation avant de débuter à croître qui dépend de:
1. âge des bactéries
2. origine (composition/température du milieu)

donc on gros ça dépend de la bactérie et de son mileu où elle croit

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3
Q

Dans quelle phase on est à la vitesse de croissance maximale de croissance?

A

exponentielle

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4
Q

V ou F, la phase exponentielle est de courte durée

A

V

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5
Q

La phase exponentielle varie en fonction de quoi?

A

Concentration des nutriments disponibles

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6
Q

Pourquoi y a-t-il une stabilité au niveau de la phase stationnaire et c’est causé par quoi?

A

Parce qu’il y a autant de division que de mort cellulaire
* Mort causé par une accumulation de déchets toxiques et acides et un manque de nutriments

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7
Q

V ou F
l’arrêt de la division cellulaire est le début de la phase de mortalité

A

V

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8
Q

Quelles sont les causes de mortalité des cellules?

A
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9
Q

Quelle sont les deux méthodes de mesure de la croissance des microorganismes?

A

Méthodes directes (on compte les bactéries):
1) Décompte totale
2) Décompte des unités viables (qui peuvent se reproduire)

Méthodes indirectes (on ne compte pas les bactéries):
1) Mesure de l’activité des moo (manger, excréter, composition)
2) Mesure de la masse cellulaire

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10
Q

Explique le compteur de cellule Coulter et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode directe - Décompte totale
Pour les cellules mammifères, levures et protistes

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11
Q

Explique les dilutions en milieux liquides+étalement sur gélose et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode directe - Décompte des unités viables (seule les unités viables pourront croitre sur les géloses)

  1. On fait une dilution en milieux liquides
  2. On étale chacune de ces dilutions sur des gélose
  3. On calcule le nombre de colonies (en multipliant par le facteur de dilution) d’une gélose n’ayant pas trop/peu de colonies
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12
Q

Explique le cytomètre de flux et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode directe - Décompte total
Pour les cellules mammifères, les levures et les protistes

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13
Q

Explique la turbidimétrie et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode indirect - Masse cellulaire
On calcule la densité optique pour connaître la concentration cellulaire
1) On place une suspension dans un spectophotomètre qui va calculer la densité optique et on établit une courbe de référence
2) ↑ de lumière passe = ↓de cellules/colonies (absorbance ↓, transmission vers le détecteur↑)
3) ↓ de lumière qui passe = ↑ de cellules/colonies (absorbance ↑, transmission vers le détecteur↓)

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14
Q

Explique l’hémocytomètre et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode directe - Décompte total
Chambre de comptage observée au microscope pour les cellules mammifères et les levures
1. Puisqu’on connait la longueur, la largeur et la profondeur, on peut calculer le volume de la chambre de comptage (0.1 cm x 0.1cm x 0.1 cm = 1/10 000 cm3)
2. 10 000 x cellules comptées x facteur de dilution (si la suspension fut diluée)

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15
Q

Mesurer l’alimentation, les déchets et les constituants cellulaires sont des techniques associées à quelle méthode?

A

Méthode indirecte - Mesure de l’activité
* Alimentation: consommation des substrats (C, O2, N2, etc)
* Déchets: CO2, NH3
* Constituants : ATP, ADN, protéines

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16
Q

Explique les filtres de cellulose et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode directe - Décompte des unités viables
1) on fait passer une suspension à travers un filtre de cellulose
2) le filtre de cellulose emprisonnant les moo est placé sur une gélose
3) décompte des unités ayant pu se reproduire sur la gélose

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17
Q

Explique la mesure du poids sec et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode indirecte - Masse cellulaire
1.

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18
Q

Explique la cellule de Petroff-Hausser et c’est une technique associée à quelle méthode?

A

Méthode directe - Décompte total
Chambre de comptage observée au microscope pour les bactéries
* Même principe que l’hémocytomètre mais 10 x plus petit (pour de plus petites cellules)
* 100 000 x cellules comptées x facteur de dilution (au besoin)

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19
Q

Quelles sont les techniques utilisées en méthode directe?

A

Décompte total (mortes et vivantes):
* Compteur de cellules Coulter
* Cytomètre de flux
* Chambre de comptage: Hémocytomètre et Cellule de Petroff-Hausser

Décompte des unités viables (vivantes/pouvant se reproduire):
* Dilution en milieu liquide et étalement sur gélose
* Filtre de cellulose

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20
Q

Quelles sont les techniques utilisées en méthode indirecte?

A

Mesure de l’activité:
1. Consommation des substrats (C, O2, N2, etc)
2. Excrétion de CO2, NH3, etc
3. Composant cellulaires (ATP, ADN, protéines,etc)

Mesure de la masse cellulaire:
1. Poids sec
2. Turbidité par densité optique (concentration cellulaire)

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21
Q

Explique c’est quoi le temps de génération/doublement

A

Temps entre chaque génération/doublement de cellules
temps de génération/doublement : g
g= temps / nb de générations
g=t/n

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22
Q

Explique c’est quoi le taux de croissance

A

Nb de génération/doublement de cellules par unité de temps
taux de croissance : k
k= nb de générations/temps
k= n/t

23
Q

Quelle est la distinction entre le temps de génération/doublement et le taux de croissance?

A

g et k sont réciproques et ont les même variables mais ne sont pas issus du même calcul et représente pas la même chose

24
Q

Explique le princpe d’une culture continue (ouvert) et quelle est la phase de croissance qui en est affectée?

A
  • Culture continue (ouvert)= apport en nutriments et élimination des déchets continuellement
  • La phase exponentielle est donc beaucoup plus longue puisqu’il y a moins d’accumulation de déchet toxiques/acides + constamment de nutriments = moins de morts
25
Q

Quels sont les 2 types de culture continue et quelle est leur différence?

A

Chemostat: Vitesse apport nutritionnel = Vitesse élimination des déchets
Turbidostat: Apport nutritionnel et élimination des déchets dépend de la concentration cellulaire
Notre but est de maintenir une population cellulaire normale (on veut pas de sous/sur- population)

turbidostat = turbidité (DENSITÉ OPTIQUE/CONCENTRATION CELLULAIRE)

26
Q

Quelle est la différence entre les milieux de cultures liquide et solides?

A

Liquide: bouillon de culture
Solide: bouillon de culture + ajout d’agar (polymère provenant d’une algue rouge)

27
Q

Comment ça se fait que l’agar n’est pas dégradé/mangé par les bactéries?

A

Les bactéries ne métabolisent pas l’agar

28
Q

Quelle est la différence entre les milieux de culture synthétique et empirique ?

A

Synthétiques:
* On sait ce qu’il y a à l’intérieur puisqu’il s’agit de produits chimiques achetés commercialement
* Milieux pauvres avec le strict minimum (C, N, S, etc) donc seulement certaines bactéries peuvent y croitre

Empiriques:
* On ne se sait pas exactement ce qu’il y a à l’intérieur. Ils possèdent également des produits biologiques (ex: peptone, extrait de levure)
* Milieux riches où plusieurs bactéries peuvent croitre
* Miluex enrichis: on a ajoutés des additifs (ex:gélose sang) pour les bactéries fastidieuses

29
Q

C’est quoi des bactéries fastidieuses?

A

Bactéries avec des besoins supplémentaires qui ont donc besoin de milieux enrichis

30
Q

Quelle est la différence entre les milieux de culture de base/propagation, sélectif et différentiel ?

A

Milieux de base/de propagation:
* la majorité des MOO peuvent croitre

Milieux sélectifs:
* On inhibe la croissance de certains MOO de façon sélective
* ex: présence de sels biliaire et cristal violet qui inhibe les bactéries gram+ et favorise les bactéries gram-

Milieux différentiels:
* Il y a des substrats qui nous permettent de différencier les bactéries par la couleur des colonie/gélose
* ex: gélose devient rouge-rose lorsqu’une bactérie fermente le lactose , reste incolore si elle ne le fermente pas

IMPORTANT

31
Q

La gélose sang est un milieu _?

A

Empirique/enrichi

32
Q

La gélose MacConkey est un milieux _?

A

Sélectif ET différentiel
S: présence de sels biliaire et cristal violet qui inhibe les bactéries gram+ et favorise les bactéries gram-
D: gélose devient rouge-rose lorsqu’une bactérie fermente le lactose , reste incolore si elle ne le fermente pas

IMPORTANT

33
Q

Quelle est la couleur des colonies/gélose MacConkey en présence de E-coli (+ signification)?

A

rouge-rose pcq il ferment le lactose (lac+)

34
Q

Quelle est la couleur des colonies/gélose MacConkey en présence de Pseudomonas (+ signification)?

A

incolore parce qu’il ne fermente pas le lactose (lac-)

35
Q

Quels sont les besoins nutritifs des MOO?

A

C’HOPKNS

Ecq le reste est è apprendre, vérifier avec prof

36
Q

Explique la classification pour la source de carbone des moo

A

Autotrophe: source inorganique CO2
Hétérotrophe: molécules organiques hydrocarburées

37
Q

Explique la classification pour la source d’énergie des moo

A

Énergie
Phototrophe: à partir de la lumière
Chimiotrophe: à partir de l’oxydation de composés organiques et inorganiques

38
Q

Explique la classification pour la source d’électrons des moo

A

Litiotrophe: molécules inorganiques réduites
Organotrophe: molécules organiques réduites

39
Q

Explique c’est quoi:
- Autotrophes photolitotrophes
- Hétérotrophes photoorganotrophes
- Autotrophes chimiolitotrophes
- Hétérotrophes chimioorganotrophes

A

Autotrophes photolitotrophes:
* Auto= CO2, Photo= lumière, Lito= inorganiques réduites

Hétérotrophes photoorganotrophes:
- Hétéro: molec. organiques, Photo= lumière, organo= organiques réduites

Autotrophes chimiolitotrophes
* Auto= CO2, Chimio= oxydation composé org/inorg, Lito= inorganiques réduites

Hétérotrophes chimioorganotrophes
- Hétéro: molec. organiques, Chimio = oxydation composé org/inorg, organo= organiques réduites

40
Q

V OU F
Lorsqu’un chimioautotrophe ne peut dégrader une substance organique, cette substance est appelé NON-BIODÉGRADABLE

A

F
lorsqu’un chimiohétérotrophe ne peut dégrader une substance organique, cette substance est appelé NON-BIODÉGRADABLE

41
Q

Pourquoi l’azote est essentiel et quelles sont les différentes formes d’azote utilisées par les MOO?

A

Parce que l’azote forme les acides aminés, bases azotées, certains glucides/lipides etc

MOO utilise l’azote organique et inorganique

42
Q

Donne moi des exemples d’azote inorganique utilisé par les MOO (+ de quelle façon)

A

Inorganique:
- Azote atmosphérique N2 (en la fixant)
- Ammoniaque NH3 (en oxydant ammoniaque→ nitrites (nitrosation))
- Nitrites NO2 (en oxydant nitrites → nitrates (nitration))
- Sel d’ammonium NH4+

43
Q

Donne moi des exemples d’azote organique utilisé par les MOO

A

Organique:
- acides aminés
- bases azotées
- phospholipides

44
Q

Pourquoi le phosphore est essentiel et quelles sont les différentes formes de phosphore utilisées par les MOO?

A

Phosphore forme l’ATP, les acides nucléiques, les phospholipides (membrane), etc

Forme INORGANIQUE seulement : Phosphate PO4

45
Q

Pourquoi le soufre est essentiel et quelles sont les différentes formes de soufres utilisées par les MOO?

A

Soufre forme certaines acides aminés
* Inorganique: Sulfate SO4
* Organique: composés soufrés organiques comme la cystéine

46
Q

Pourquoi les ions inorganiques sont essentiels pour les MOO ?

A

Équilibre physicochimique au sein des cellules

47
Q

Explique c’est quoi des facteurs de croissance

A

Les facteurs de croissance sont des composés que certaines MOO ne peuvent synthétiser elle même:
- vitamines
- acides aminés
- bases azotés

48
Q

C’est les bactéries prototrophe ou auxotrophe qui ont besoin de ces facteurs de croissance? et explique leur distinction

A

Prototophes: moo qui peuvent synthétiser leur propres métabolites essentiels. Ils sont autonome et peuvent croitre sur un milieu minimal/pauvre.
Auxotrophes: moo qui ne peuvent pas synthétiser leur propres métabolites essentiels et donc peuvent croitre en milieu enrichi en ceux-ci

49
Q

C’est l’eau libre ou liée qui est disponible pour les MOO?

A
50
Q

Comment peut-on calculer l’activité de l’eau libre (Aw)?

A
51
Q

V ou F
tout les eucaryotes sont aérobiques

A
52
Q

Pourquoi l’oxygène est important pour presque tout les eucaryotes et une partie des procaryotes?

A
53
Q

Quels sont les 5 groupes de bactéries à l’égard de loxygène?

A
54
Q
A