Chap 8 Bis : CYP450

Question 1

Quel type de reaction catalyse les CYP450

Answer 1

Oxydation

Question 2

CYP450 est quoi comme prot ?

Answer 2

Metaloprot avec une moitie d’heme (fer) liee de maniere covalente

Question 3

Longeur d’absorption des CYP450 ?

Answer 3

450 nm ROUGE

Question 4

Structure de CYP450 ?

Answer 4

14 helice à antiparallèles et 5 feuillets bêta chacun d’un cote
L’heme est au centre région hydrophobe liee a une CYS

Question 5

Explique les etapes de la catalyse d’un cyp450

Answer 5

1. liaison au substrat à proximité du site du ligand heme
2. réduction du fer d’un électron (Fe3+ devient Fe2+) par la Flavoproteine de NADPH cytochrome P450 réductase
3. Réaction du fer ferreux par l’O2 pour former un intermédiaire FE O2, peu stable.
4. Transfert du deuxième électron de reductase NADPH ou de cytochrome B5.
5. Scission hétérolytique de la forme FEO–O(H). ETAPE LIMITANTE
6. Oxydation du substrat et abstraction formelle de l’atome d’hydrogène ou d’électrons.
7. Recombinaison radicale.
8. Libération du produit.

Question 6

Est ce que le CYP450 est une enzyme parfaite ??

Answer 6

Noon sa catalyse a bcp d’etapes qui peuvent deboucher sur des voies non productives

Question 7

Dans la structure du site actif de CYP450 y’a t il une fluctuation conformationnel ?

Answer 7

Ouii helice alpha bouge et laisse acces au canal

Question 8

Quel est la structure du canal d’un CYP450 ?

Answer 8

Helice F G G’ et les 5 feuillets beta

Question 9

La cavite du site actif est remplie de combien de mol h2O

Answer 9

5-6 et une boucle de AA aussi

Question 10

Quel interaction domine au site actif ?

Answer 10

Interaction hydrophobe

Question 11

Chez les différents CYP450 les sites actifs sont identiques ?

Answer 11

Noon poche de liaison tres flexible pour des substrats tres variés

Question 12

Dans un CYP450 est ce qu’il y’a un seul canal ? Est ce que tout le monde l’emprunte ?

Answer 12

Non plusieurs canaux par exemple l’H2O et l’O2 ne prennent pas forcément le meme et le substrat non plus

Question 13

Dans le CYP3A4 y’a combien de canaux pour que le substrat atteigne le site actif ? Et quel residus les bloques ?

Answer 13

6
Residus Phe qui doivent etre brises

Question 14

Plus précisément dans le CYP3A4 combien de canaux ont accès a quoi ?

Answer 14

6 canaux
1 pour le solvant
5 pour substrats

Question 15

Exemple avec CYP2C9 et ibuprofen ??

Answer 15

Ibuprofen rentre dans la Mb et est aspiré par un canal ensuite il devient hydrophile donc relache par autre canal dans le cytosol

Question 16

A quoi sert une reductase du CYP450 ?

Answer 16

Partenaire du CYP450 qui fournie les electrons pour reduire Fe3+ en Fe2+

Question 17

Combien d’electrons apporte le NADPH du cyp450 reductase ?

Answer 17

2 e mais le cyp peut accepter que un seul a la fois (cyp b5 peut participer aussi)

Question 18

Particularité du CPR ? Oxydoreductase P450

Answer 18

2 cofacteurs FAD FMN qui sont dynamiques, deux formes possibles

Compact ou FAD/FMN rapprochés pour transfert e interflavine

Etendu ou FMN expose pour transfert au CYP450

Question 19

Quelles interactions sur le complexe de rencontre favorise le transfert d’electron ?

Answer 19

Complementarite de charges des surfaces de CPR (aspartate et glutamate) et Cyp450 (lysine argine)
Aussi force hydrophobe

Question 20

C’est quoi l’effet tunnel d’electron ?

Answer 20

C’est le domaine FMN qui s’approche de l’heme pour reduire la distance de 18A a 14A (voire 8A) ce qui augmenterait bcp le taux maximum de transfert d’electrons et rendrait notre modèle viable

Question 21

Est que cyp1A1 et cpr forment toujours des complexes stables dans la mb du ER ??

Answer 21

Ouii avec une distance Fe-N5 de 14 - 16A le transfert d’e- est a son prime

Question 22

As tu compris le principe de la theorie de tunnel quantique ? Qui a travaillé dessus ?

Answer 22

Oui sinon va lire ton cours
Rudolph Marcus

Question 23

Theorie tunnel quantique : quels sont les facteurs importants ?

Answer 23

Effet de resistance
Distance

Question 24

Est ce que les proteines avec des centres multiredox ont des separations de moins de 14A ??

Answer 24

Ouii
Exemple : Xanthyne Oxidase

Question 25

Est ce que les valeurs de transfert de e- sont toujours superieurs au Kcat ?

Answer 25

Ouii