הרצאה 2 דנה 11-18

Question 1

Class 1 מהם שלבי השעתוק והתרגום של וירוסים ?

Answer 1

Class 1- דו גדיליים DNA וירוסי

1. immediate early proteins תרגום של

mRNA אלו הם פקטורי שעתוק שגורמים לשעתוק של

ויראליים נוספים.

פולימרז התאי RNA וירוסים שמשוכפלים בגרעין ישתמשו ב

וכאלו שמשתכפלים בציטופלזמה יביאו איתם בויריון פולימרז משלהם.

2. early proteins תרגום של

DNA כל החלבונים שמתבטאים לפני הרפליקציה של ה

חלבונים ואנזימים הנחוצים לרצפליקציה.

3. late proteins תרגום של

כולל חלבוני הקפסיד (משתמע פה שזה אחרי הרפליקציה של הדנא)

Question 2

Class 1 מהם הוירוסים שניתנו כדוגמאות לוירוסים

ואיפה כל אחד מהם עובר רפליקציה?

Answer 2

וירוסים דנא דו גדילי

1. pox- עוברים רפליקציה בציטופלזמה
2. אדנו וירוסים- עוברים רפליקציה בגרעין
3. הרפס- עוברים רפליקציה בגרעין

Question 3

vaccinia מה דובר על וירוס ה?

pox קשור ל

מה הגודל שלו? איפה עובר רפליקציה? לאיזה רצפטור נקשר?

Answer 3

Question 4

אדנו וירוסים-

איזה סוג של וירוסים הם?

איפה עוברים רפליקציה?

למה הם גורמים?

באיזו טכניקה משתמשים בו היום?

מה הגודל שלו וכמה הוא תלוי בתא?

לאיזה חלבון חשוב הוא משעתק שנלמד בכתה? מה התפקיד שלו?

Answer 4

DS DNA דנא דו גדילי

עובר רפליקציה בגרעין, למרות זאת יש לו דנא פולימרז משלו

צינון, מעיים, עיניים, סרטן

היום נעשה שימוש בוירוס הזה כדי לעשות ריפוי גנטי. מחדירים לתוך רקמה סרטנית את האדנו-וירוס והוא מוביל לשעתוק של גנים הנלחמים בסרטן.

קטן- תלוי מאוד במנגנוני השעתוק התאיים.

E1A משעתק ל immediate early אחד מה

E1A התפקידים של:

א. פקטור שעתוק גם של הגנים המוקדמים וגם של גנים שדרושים להדבקה של תאים נוספים

ולכן גם יכול להיות אונקוגני S ב. דוחף את התא לעבר שלב

pRB עושה זאת באמצעות קישור ל

E1B ג. משמש כאונקוגן ביחד עם החלבון

Question 5

host-cell shut down מהם ה

של האדנו וירוסים? נראה לי שהם של האדנו וירוסים אבל אולי זה כללי

Answer 5

1. התאי לעבור לציטופלזמה לתרגום mRNA מונע מה
2. התאי mRNA חוסם תרגום של

בשלבי ההדבקה cap binding proteins עי השתקה של

המאוחרים.

mRNA חותך מבנים שניוניים של CBP -תזכורת

מה שמאפשר לריבוזום לסרוק אותו.

Question 6

משפחת וירוסי ההרפס

איזה סוג של וירוסים הם? איפה עוברים רפליקציה? מה הגודל שלהם?

איזה פקטור שעתוק חשוב יש לו?

לאילו אנזימים חשובים הוא מקודד?

Answer 6

DS DNA דנא דו גדילי

עוברים רפליקציה בגרעין, גדולים ולכן יש להם פונקציות ויראליות עצמאיות רבות

פולימרז ויראלי DNA פולימרז התאי, אך ב RNA משתמשים ב

_{פולימראז ויראלי הוא מטרה לתרופות DNA ה}

פקטור שעתוק חשוב שנמצא בויריון V16

_{הוא מוביל לקידוד של הגנים המוקדמים מאוד (אלפא), אשר מובילים לקידוד הגנים המוקדמים (ביתא). הגנים של ביתא ואלפא יחד יעודדו את ביטוי הגנים המאוחרים (גמא). הביטוי של הגנים המאוחרים יעכב את הביטוי של הגנים המוקדמים- אלפא וביתא. זה מגביר את היעילות של רפליקציה הוירוס}

DNA מקודד לאנזימים ששותפים למטבוליזם של

Question 7

של ההרפס host cell shut off מהם מנגנוני ה?

Answer 7

VHS

שבא עם הויריון RNAase אנזים שהוא

התאי mRNA עושה דגרגציה ל

בשלב המאוחר הוא עושה גם דגרגציה לגנים של חלבונים מוקדמים

Question 8

מהו מנגנון היציאה של ההרפס?

Answer 8

1. מתורגם בציטופלזמה
2. חוזר לגרעין לצורך איסוף החלבונים
3. יוצא מהגרעין, ביציאה מהממברנה הפנימית מקבל מעטפת וביציאה מהממברנה החיצונית מאבד אותה
4. נכנס לגולגי, מקבל מעטפת מהגולגי ויוצא ממנו עטוף באנדוזום
5. עושה אקסוציטוזה מהממברנה הפלסמטית ומאבד את האנדוזום- כך נשארת לו המעטפת

Question 9

מהי האינטראקציה בין וירוס דנא דו גדילי לתא המארח?

ההיבט של איזון הכוחות בין השניים

Answer 9

התא מנסה למנוע מהוירוס להשתכפל באמצעות מנגנון תאי שנועד לטפל בנזקי דנא.

DDR- DNA damage response

_{יש סנסורים שמזהים שבירה חד או דו גדילית בדנא, כאשר הם מגלים שבירה כזו הם מפעילים מערכת אותו שגורמת ל: שינויים בכרומטין אשר יאפשרו את תיקון הנזק, שפעול חלבונים שנועדו לתקן את הנזק, עצירה של השעתוק בתא עד שיתוקן הנזק, ועצירה זמנית של מעגל התא כדי שהתא לא יעבור חלוקה ויעביר את הנזק הזה הלאה. אם הנזק גדול מדי, חלבוני הסנסור ידחפו את התא לאפופטוזיס.}

MRN שבירה דו גדילית מזוהה עי סנסור בשם

ATR שבירה חד גדילית מזוהה עי סנסור בשם

הוירוסים מנגד מנסים להשתיק את המנגנונים הללו, למשל דרך

1. סימון הסנסורים ביוביקוויטין ליגז לדגרגציה
2. הרחקת הסנסורים ממוקדי הרפליקציה הויראליים
3. DDR דה פוספורילציה לחלבונים של ה

Question 10

Class 4 איזה סוג וירוסים הם וירוסים?

מה המידע הגנטי שהם מכילים בויריון?

איך נראית הרפליקציה שלהם?

אילו וירוסים לדוגמה ממשפחה זו?

Answer 10

אוריינטציה חיובית -single strand RNA +

גדול ופוליציסטרוני עם כל האינפו הגנטי mRNA יש להם

אשר עובר חיתוך polyprotein הוא מתורגם ל

לחלבונים שונים החשובים להתפתחות הוירוס כמו חלבונים סטרוקטורלים ואנזימים.

ברפליקציה הרנא החיובי הופך קודם לסיב המשלים שלילי ואז הסיב המשלים הזה הוא התבנית לעותקים האחרים של הרנא הויראלי

לשים לב שיש הבדל בין הרפליקציה לבין התוצרים החלבוניים. חיובי= חיובי שקל לו לתרגם חלבונים

PICORNA, Caliciviridae, Flaviviridae וירוסים לדוגמה ממשפחה זו

Question 11

PICORNA מהם הסוגים השונים של?

איזה קלאס הם בוירוסים ומה מאפיין אותם?

Answer 11

Class 4

וירוסים קטנים

סוגים שונים:

1. entroviruses- כמו פוליו
2. rhinoviruses- צינון
3. hepatoviruses- כבד
4. Aphtoviruses- פה ורגליים

HEAR ראשי תיבות

אסוציאציה קורן כמו פופקורן זה משהו ששומעים

Question 12

מה המבנה של וירוס הפוליו?

איפה הוא עובר רפליקיה?

באיזה חלבון הוא משתמש כדי לחדור לתאים?

Answer 12

חסר מעטפת איקוסה הידרלי, 27 ננומטר בלבד

עובר רפליקציה בציטופלזמה

VPg (viral protein genomic) משתמש ב

ומסייע לחדירה לתאים RNA שנקשר ל

משבית תא מארח באמצעות פרוטאז שחותך את ה

של החלבונים הרגילים של התא cap binding protein

חיתוך החלבונים של הוירוס- בתמונה המצורפת

Question 13

Class 5 מי הם הוירוסים ?

איך הם משכפלים את עצמם ואיך הם מייצרים לעצמם חלבונים בתא המארח?

מה הם מביאים איתם כדי לעשות את הפעולות האלו?

Answer 13

single strand RNA (-)

בשביל החלבונים של הפעילות שלהם הם צריכים להפוך את הרנא השלילי לרנא באוריינטציה חיובית, משם לעשות אם.רנא שיהיה הטמפלט ורק אז יכולים להתחיל ליצור חלבונים לפעילותם. לכן יש להם גם רנא פולימראז עצמאי בויריון.

ברפליקציה הם צריכים להשתמש ברנא החיובי כטמפלט.

וירוס לדוגמה- שפעת.

Question 14

וירוס השפעת- מאיזה סוג של וירוסים הוא?

מהם הרכיבים של הויריון?

Answer 14

class 5- RNA single strand (-)

NP- יש לו 8 סגמנטים של רנא, כל אחד עטוף בנוקלאופרוטאין

PB2, PB1 PA לכל סגמנט נקשרות שלוש פולימרזות

למעטפת יש ארבעה חלבונים

1. HA hemagglutinin

טרימר, לכל מונומר יש חלק מוארך (מחובר לממברנה של הוירוס) וחלק גלובולרי (עגול) ובו יש אתר קישור לרצפטור התאי (שהוא חומצה סיאלית שנמצא על גליקופרוטאינים). לחלק זה יש תפקיד ביציאה של הוירוס מהאנדוזום (הוירוס נכנס באנדוציטוזה למרות שיש לו מעטפת וכדי לצאת מהאנדוזום הוא משתמש בחלק זה).

2. NA neuraminidase

חלבון שמנתק את הוירוס מהחומצות הסיאליות כדי שיוכל לחדור לתא. אחת התרופות של שפעת הן כאלו שמעכבות את החלבון הזה.

3. M1 matrix protein

קושר את הסגמנטים של הרנא אל הגליקופרוטאינים ומעגן אותם במעטפת

4. M2 תעלה מוליכת יונים

חשובה לשלב החשיפה. כאשר הוירוס נכנס ועדיין נמצא באנדוזום הוא בסביבה חומצית, התעלה מכניסה פרוטונים אל החלקיק הויראלי וההחמצה היא הגורם לניתוק של הסגמנטים מהמעטפת.

Question 15

וירוס השפעת- איזה סוג של וירוס הוא?

מה הייתה החפירה על ההבדל בין שפעת של עופות חזירים ומה שמסוכן לעולם.

Answer 15

class 5- RNA single strand (-)

Question 16

וירוס השפעת

איזה סוג של וירוס הוא?

איך הוא משתמש במידע הגנטי של התא בשביל לעזור לעצמו?

Answer 16

class 5- RNA single strand (-)

בשביל לתרגם חלבונים לעצמו הוא “גונב” לתא המארח את

שמחובר לאם.רנא התאי. ומדביק אותו לאם.רנא שלו cap

ככה הוא מייצר פריימר לסינתזה של האם.רנא החיובי המשלים ומשם הוא יוכל לתרגם את החלבונים שלו.

יש לציין שהאם.רנא החדש עם הקאפ לא יוכל להיות טמפלט לרפליקציה של הגנום הויראלי בגלל שנוספו לו נוקלאוטידים. לכן צריך לשעתק רנא משלים נוסף שיהיה קו לינארי עם הגנום הויראלי השלילי. נקרא אנטיגנום.

הוירוס קודם כל יביא לתרגום של נוקלאוקפסידים וכשהם יתחילו להצטבר ידחפו למעבר ליצירה של אנטי גנום.