5. Systèmes organisés

Question 1

C’est quoi des interactions quinaires

Answer 1

Interactions sporadiques en haute concentration de protéines

Question 2

C’est quoi la structure quinaire et que permet-elle de faire?

Answer 2

niveau d’organisation des protéines où interactions peu stables et faibles échanges d’énergie

permet fct cellule, interactions enzymatiques

Question 3

V ou F les enzymes sont réparties uniformément dans la cell

Answer 3

F, les enzymes se regroupent en métabolons pour canaliser les métabolites d’une réaction à l’autre

Question 4

Que permet la canalisation du substrat

Answer 4

eviter l’utilisation de metabolites par d’autres voies enzymatiques concurrentes.

regule flux aux points d’embranchement

Question 5

V ou F la canalisation du substrat permet de rendre la voie métabolique plus efficace ou plus rapide.

Answer 5

Faux, misconception.

À part 2 exceptions (E parfaites et très faible concentration d’E)

Question 6

Explique les deux exceptions pour lesquelles la canalisation pourrait accélerer la vitesse catalytique

Answer 6

-Enzymes parfaites: très haute activité catalytique au point où elles sont slm limitée par diffusion des S

-Faible concentration d’Enzymes: grande distance d’une enzyme à l’autre

Question 7

2 avantages de canalisation du substrat dans le TCA

Answer 7

1- regul flux aux embranchements
2- séquestration intermédiaires toxiques

Question 8

Explique rétention électrostatique entre enzymes et leur coévolution

Answer 8

Enzymes s’assemblent grâce aux charges opposées sur leur surface

ont coévolué pr avoir struct complément

Question 9

C’est quoi des clusters?

Answer 9

enzymes non séquentielles qui servent de pts de nucléation (regroupement) en facilitant interactions entre enzymes séquentielles.

Question 10

V ou F dans un cluster on augmente les probabilités de canalisation

Answer 10

V

Question 11

C’est quoi des métabolons?

Answer 11

complexes dynamiques d’Enzymes qui permettent de canaliser les substrats

Question 12

ou retrouvons nous le metabolon glycolytique dans les cellules

Answer 12

sur les filaments d’actine

Question 13

V ou F les ARN ont un rôle dans l’assemblage des métabolons glycolytiques

Answer 13

V

Question 14

C’est quoi un condensat (séparation de phases)?

Answer 14

ségrégation spontanée de certaines molec dans des compartiments distincts du milieu

processus réversible, lliquie/solide

interactions influencée par températue, pH, cofacteurs

Question 15

Condensat vs Agrégat

Answer 15

Condensat: dynamique, réversible, permet de remplir fct

Agrégat, assemblages pathologiques

Question 16

Avantages séparation de phases (3)

Answer 16

1. ctrl espace
2. molécules coacervées LLPS (phase riche en soluté se séparant de la phase aq)
3. formation MLO (membraneless organelles)

Question 17

Nomme des éléments aidant à l’assemblage de condensats (2)

Answer 17

IDR: régions intrinséquement désordonnées (protéine qui a pas tt sa struct 3D stable)
ARN

Question 18

Consequences fonctionnelles de la formation de condensats (4)

Answer 18

1. augmentation concentration: aug cinétique et spécificité
2. modif des propriétés physiques: ex aug viscosité formation fibrilles
3. séquestration molec ds le condensat
4. concentration maintenue ds le milieu

Question 19

On cherche a savoir si le microenvironnement biochimique au sein d’un condensat régule la fonction enzymatique ?

Quels 3 éléments utilisons-nous dans cette expérience

Answer 19

1. région IDR de la CAPRIN1 (permet formation condensat)
2. ARN polyA court (ne contribue par à LLPS)
3. enzyme CNOT qui clive ARN polyA

Question 20

Résultats de l’expérience du microenvironnement chimique

Answer 20

CNOT7 a une queue en C-term qui l’empêche de cliver ARN polyA.

En condensat CAPRIN1, la queue C-term est tronquée donc CNOT7 augmente activité catalytique.

Donc l’environnement liquide distinct d’un condensat peut fr régulation enzymatique.