Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

ביוכימיה > חלבונים > Flashcards

חלבונים Flashcards

1
Q

D L חומצות אמינו

A

העדפה ביולוגית ל L

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מבנה חומצה אמינית

A 
פחמן אלפא כיראלי= פעילות אופטית
קבוצה קרבוקסילית COOH
קבוצה אמינית NH2
מימן
R - משתנה בגודל, מטען, מבנה, קוטביות, מסיסות
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

קשר דיסולפידי

A

קשר קוולנטי דרך הגופרית של ציסטאינים. כשהן מחוברות=ציסטין
מצב מחוזר SH
מצב מחומצן SS, הידרופובי
תיואסתרי: בין תיול לקרבוקסיל. יוצר קשר בין גופרית לקרבוניל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

ח. אמינו יוצאות דופן

A

א. 4-הידרוקסי-פרולין: דורש ח. אסקורבית, מצוי בקולגן
ב. 5-הידרוקסי-ליזין: מצוי בקולגן
ג. 6-אן-מתיל-ליזין: מצוי במיוזין
ד. גמא-קרבוקסי-גלוטמט: מצוי בטרומבין, מסייע בקשירת סידן
ה. דזמוזין: נגזר מליזין, מצוי באלסטין
ו. סלנוציסטאין: נגזר מסרין, מוספת כשאר החומצות האמיניות
ז. אורניטין, ציטרולין- מטבוליטים במעגל האוריאה ובמסלול החנקן.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

חומציות של ח. אמינו

A

pH נמוך: מטען חיובי
pH בין הקרבוקסיל לאמין: מטען ניטרלי, צביטריון
pH גבוה: מטען שלילי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

pI נקודה איזואלקטרית

A

pH בו סך המטען החשמלי הוא אפס.

חישוב: ממוצע של שני ערכי pK ביניהם המטען יהיה אפס (של השייר ושל הקבוצה הדומה לו)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

קשר פפטידי

A

יצירת אמיד ע”י דחיסה בין פחמן קרבוקסילי לחנקן אמיני. יוצא מים.
קשר עם רזוננס=חזק כמו קשר כפול, נטיה של השיירים להסתדר בטרנס

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

אורך החלבון: הגדרות

A

אוליגופפטיד: עד 10 ח.א
פוליפפטיד: יותר מ10 ח.א, פחות מ10 קילודלטון
חלבון: מעל 10 קילודלטון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מבנה חלבונים

A

ראשוני: רצף ח.א
שניוני: קשרי מימן בשלד הפפטיד. סליל אלפא, סדין בתא
שלישוני: מבנה תלת מימדי, כולל קשרים בין השיירים
רביעוני: קשרים בין שרשראות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

אוליגומר

A

חלבון המורכב מכמה שרשראות כאשר לפחות 2 מהן זהות. היחידות הזהות: פרוטומרים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

חלבונים מצומדים

A

ליפו-פרוטאינים: קבוצה פרוסטטית ליפיד

גליקו-פרוטאינים: קבוצה פרוסטטית סוכר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

קשרים בקיפול חלבוני

A

קשרי די-סולפידיים: מייצבים מבנה שלישוני ורביעוני. נדיר בציטופלזמה - סביבה מחזרת, גלוטטיון
אינטראקציות הידרופוביות: התרחקות מהמים ומרשת קשרי המימן
אינטראקציות הידרופיליות: קשרי מימן עם המים
גשרי מלח: קשרים אלקטרוסטטיים, משיכות חשמליות של פלוס ומינוס

העדפה בקיפול למס’ המקסימלי של אינטראקציות בין-מולקולריות - בהתאם לאנרגיה חופשית, בעיקר קשור לעליה באנטרופיה של המים בעקבות אינטראקציות הידרופוביות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

דיאגרמת רמצ’דראן

A

ערכי פסאיי ופיי של הקשרים הפפטידיים והמבנים השניוניים האופיניים כתלות בזויות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

אלפא הליקס - מספרים

A

קשרי מימן בין קרבוקניל של ח.א לאמין של ח.א+4.
סיבוב = 3.6 ח.א בממוצע.
זוית הסיבוב בין 2 ח.א = 100 מעלות.
המרחק בין 2 פחמני אלפא = 1.5 אנגסטרם.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

אלפא הליקס- מבנה

A

השיירים פונים לחוץ הסליל
נטיה לסליל ימני, קרבוקסיל למטה אמין למעלה
דיפול חשמלי מייצב את ההליקס: שיירים חיוביים יהיו קרובים לצד הקרבוקסילי ולהיפך.
גליצין (קטנה) ופרולין (נוקשה ובעלת אמין שניוני שלא עושה קשרי מימן) נדירות בסליל אלפא
השפעות על ציבות ההליקס: רמצ’דרן, אינטראקציות בין שיירים, גודל שיירים, שכיחות פרולין וגליצין, השפעה על הדיפול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

קונפורמציית בתא

A

מבנה של זיג-זג.השיירים מתארגנים בטרנס- מעל ומתחת למישור

סדין בתא- כמה גדילי בתא מיוצבים ע”י קשרי מימן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

סוגי סדיני בתא

A

לא מקביל: נפוץ ויציב. קשרי המימן ממש אחד מעל השני.

מקביל: קשרי מימן לא ישרים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

סיבוב בתא

A

סיבוב חד בשרשרת ליצירת סדין בתא לא מקביל
מכיל 4 ח.א- קשר מימן בין ח.א ראשונה לרביעית

טייפ 1: פרולין, עמדה 2
טייפ 2: גליצין, עמדה 3

לפעמים פרולין בציס, טייפ 1 נפוץ יותר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

קרטין

A

חלבון סיבי- לא מסיס במים
סיב ביניים, נמצא ביונקים בשיער, פרווה, צמר, קרניים, עור
אלפא קרטין- אלפא הליקס ימני
מבנה רביעוני: סליל מסולסל (בדימר האמין בשני הסיבים באותו צד, די-דימר בצורה הפוכה וכן הלאה חיבורים הפוכים) בליפוף שמאלי
יציב הודות לקשרים דיסולפידיים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

סלסול קבוע של השיער

A

שינוי מבנה הקרטין
הוספת חומר מחזר- שבירת קשרי SS
חימום השיער - שבירת קשרי המימן, סלילי האלפא הופכים לגדילי בתא
הוספת חומר מחמצן- יצירת קשרי SS

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

קולגן

A

חלבון סיבי, הנפוץ ביותר באדם. מצוי ברקמת החיבור, מעניק קשיחות. נמצא בעצמות, סחוס, עור, קרנית, מפרקים
אלפא קולגן: לעומת אלפא הליקס (הליקס של 4 ח.א, זוית 100, סיבוב ימני), כאן ההליקס של 3 ח.א, זוית פיתול של 120 וסיבוב שמאלי
מבנה רביעוני: סופר הליקס (שלוש שרשראות) בליפוף ימני

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

ח.א של קולגן

A

בעיקר: גליצין, אלאנין, פרולין, הידרוקסיפרולין.
סידור: לרוב חזרות של גלי-פרו-הידרו
הידרוקסי-ליזין: ההידרוקסילציה מתבצעת בתא במהלך ההפרשה, נוצרים קשרי צילוב בינה לבין ליזין וזה מגדיל את החוזק של הקולגן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

צפדינה

A

מחלת יורדי הים.
מחסור בחומצה אסקורבית שחיונית להידרוקסילציה של פרולין וליזין, פוגע בקולגן
רוב בעלי החיים מייצרים ויטמין C, השאר צורכים אותו מהמזון- פירות טריים, פלפל, עגבניות…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

משי

A

פיברואין- חלבון סיבי, מסודר בסדין בתא אנטי-מקביל (יותר יציב). עשיר בגליצין ואלאנין.
מבנה גמיש (קשרים בין מולקולריים חלשים) אך לא מתיח.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

מיוגלובין

A

חלבון גלובולארי, משמש להובלת חמצן בשריר. מכיל קבוצת הם- ברזל וקשירת חמצן
רוב הארגון הפנימי הוא באלפא הליקס

26
Q

Heme

A

קבוצה אורגנית שנמצאת בתוך המיוגלובין. במרכזה יון ברזל 2+ (פרוס, מחוזר, פעיל) או 3+ (פריק, מחומצן, לא פעיל) שמתחבר להיסטדין ולחמצן

27
Q

מוטיב

A

מבנה המייצג מרכיב מתוך חלבון ומתייחס לרצפי מבנים שניוניים.

דוגמאות: בתא-אלפא-בתא, חבית בתא, סליל מסולסל

28
Q

דומיין

A

חלק מחלבון אשר יציב בפני עצמו ובעל תפקיד ופעילות עצמאית. דומיין יכול להכיל מוטיבים רבים.

29
Q

צ’פרונים

A

חלבוני עזר בקיפול החלבונים
HSP70- חלבוני עקת חום
פעילים לרוב כדימרים
נקשרים לאזורים הידרופוביים
קושרי ATP = מצב פתוח, זיקה נמוכה לאתרים לא מקופלים
קושרי ADP = מצב סגור, זיקה גבוהה לאתרים לא מקופלים
דרך פעולה: קישור לאזור הידרופובי - הידרוליזה לATP - הגברת זיקה - יציאה של ADP - התנתקות מהחלבון והזדמנות לקיפול נכון
חלבוני סיוע: HSP40, NEF

30
Q

דנטורציה

A

הרס מבנה החלבון
חום- פירוק קשרי מימן בעיקר, מנגנון קואופורטיבי
pH- משפיע על מטעני השיירים
ממס אורגני- משפיע על אינטראקציות הידרופוביות
חומר מחזר- משפיע על SS

31
Q

כריסטיאן אנפינסן

A

דנטורציה של ריבונוקלאז A ע”י אוריאה וחומר מחזר, ורה-נטורציה ע”י הסרת החומרים
מסקנה: הקיפול ספונטני ומקודד ברצף החלבון

לא נכון ברוב החלבונים, שנעזרים בצ’פרונים לקיפול.

32
Q

צ’פרונינים

A

קומפלקסים המסייעים בקיפול לא ספונטני של חלבונים
יוקריוטי: HSP60
פרוקריוטי: GroEL (barrel), GroES (cover)
מבנה החבית: 2 חביות צמודות, כל חבית מכילה 7 יחידות קושרות ATP
ב. השפה ההידרופובית קושרת את החלבון והמכסה סוגר את החבית
ATP ג. עובר הידרוליזה
ד. החלבון מתקפל בחבית
ה. המכסה מתנתק וADP יוצא החוצה
במקביל- סבב של חבית תחתונה

33
Q

עמילואידוזיס

A

מחלה שנובעת מקיפול חלבונים שגוי
אגרגציה של חלבונים שקופלו לא נכון
עליה בריכוז ח.א ארומטיות

34
Q

פריונים

A

מחלה שנובעת מקיפול חלבונים שגוי

החלבון בסדין בתא במקום בסליל אלפא, מפגש עם חלבון תקין יהפכו גם אותו לפגום

35
Q

induced fit

A

התאמה מושרית

מנגנון בו קישור הליגנד לאתר גורם לשינוי קונפורמציה שמעלה את הזיקה ומהדקת את החיבור

36
Q

המוגלובין- תפקיד ומבנה

A

חלבון מעביר חמצן בדם
קומפלקס המורכב מ2 יחידות אלפא-גלובין, 2 יחידות בתא-גלובין וקבוצת הם. הגלובינים מחוברים ביניהם בקשרים הידרופוביים
בעובר- גמא מחליף את בתא
המוגלובין נקשר לחמצן, ולפרוטונים ופד”ח שמורידים זיקה לחמצן

37
Q

Heme

A

מכיל יון ברזל קושר חמצן, כלומר טעון +2 ולא +3- הגלובין מונע חמצון
הברזל קשור ל4 חנקנים של פרוטופירין (חומר אורגני טבעתי, מוצאו מגליצין), להיסטדין ולחמצן
פנילאלנין וואלין מסייעות בעגינה לגלובין

38
Q

קבוע דיסוציאציה Kd

A

ריכוז הליגנד בו 50% מהרצפטורים תפוסים
מדד הופכי לאפיניות
האפיניות הגבוהה ביותר: בין ביוטין לאבידין- הלבן של הביצה
קשרים לפי מידת אפיניות: אבידין-ביוטין, נוגדן-אנטיגן, חלבון-דנא, רצפטור-ליגנד, אנזים-סובסטרט

39
Q

אפיניות בהמוגלובין

A

חלבון אלוסטרי. הקישור במנגנון קואופורטיבי- קישור ראשון מעלה זיקה של שאר היחידות
R זיקה גבוהה
T זיקה נמוכה
בריאה- יותר R, ברקמות- יותר T

40
Q

חלבונים אלוסטרים

A

קישור של ליגנד לאתר אחד משפיע על יכולת הקישור של אתר אחר. משנה K0.5 ולא מהירות מקסימלית
גרף סטורציה סיגמואידי. לדוגמא, המוגלובין
הומוטרופי- אותם ליגנדים ב2 אתרי הקישור
הטרוטרופי- ליגנדים שונים ב2 אתרי הקישור

41
Q

אפקט בוהר

A

המוגלובין ברקמה פעילה קושר פד”ח ולכן בעל זיקה נמוכה לחמצן . מצב T
המוגלובין בריאה קושר חמצן שקיים בריכוז גבוה ומשחרר פד”ח . מצב R

42
Q

BPG

A

מולקולה שמיוצרת בכדוריות דם אדומות כתוצר ביניים של גליקוליזה
מולקולה אחת מורידה זיקה של כל 4 היחידות בהמוגלובין לחמצן- הכל במצב T
משפיעה פחות על המוגלובין עוברי

43
Q

המוגלובין עוברי

A

מכיל גמא גלובין במקום בתא גלובין

זיקה גבוהה יותר לחמצן, נמוכה יותר לBPG

44
Q

CO והמוגלובין

A

גז רעיל שנקשר להמוגלובין באתר הקישור לחמצן בזיקה גבוהה פי 250 מחמצן
מעבירה את היחידות לR ולכן חמצן לא משתחרר ברקמות, בנוסף לירידה במספר האתרים הפעילים

45
Q

אנמיה חרמשית

A

אוטוזומלית רציסיבית
גלוטמאט הופכת לואלין ביחידה בתא גלובין בכדורית הדם האדומה
יחידות בתא ללא חמצן שוקעות בתא ומשנות את צורתו
A יחידה בריאה מסיסה
S יחידה חולה יוצרת אגרגטים
מלריה (אפריקה) לא חודרת לכדורית חולה

46
Q

איזומראז

A

יצירת איזומר מבני- שינוי מבנה המולקולה

מוטאז- העברת קבוצה כימית בין פחמנים על אותה מולקולה

47
Q

ליגאז

A

חיבור 2 חתיכות בדחיסה. דורש אנרגיה

48
Q

אוקסידורדוקטאז

A

זירוז ריאקציית חמצון חיזור

דה-הידרוגנאז- העברת פרוטון וזוג אלקטרונים לנשא אלקטרונים

49
Q

טרנספראז

A

העברת קבוצה כימית בין מולקולות. קינאז

50
Q

הידרולאז

A

זירוז ריאקציית פירוק בשיתוף מים= הידרוליזה

פפטידאז, נוקלאז, ליפאז, פוספטאז…

51
Q

ליאז

A

רה-ארגון לקשר כפול.

מעורב בקרבוקסילציה ודה-קרבוקסילציה

52
Q

קופקטור

A

יון או מתכת - קבוצה לא אורגנית

53
Q

קו-אנזים

A

קבוצה אורגנית (או מתכת+אורגנית) שקשורה בצורה הפיכה לאנזים

54
Q

קבוצה פרוסטטית

A

קבוצה אורגנית (או מתכת+אורגנית) שקשורה בצורה בלתי הפיכה לאנזים
אפו-אנזים – אנזים ללא הקבוצה הפרוסטטית - לא פעיל.
הולו-אנזים – אנזים עם הקבוצה הפרוסטטית – פעיל.

55
Q

פעילות אנזים

A

הורדת אנרגיית אקטיבציה של ריאקציה ע”י ייצוב מצב המעבר, ובכך הגברת קצב הריאקציה

56
Q

כימוטריפסין

A

סרין-פרוטאז. חותך בקצה הקרבוקסילי של ח”א ארומטיות
משופעל ע”י טריפסין במעי
טריאדה קטליטית: באתר הפעיל יש סרין (נוקלאופיל), אספרטט והיסטדין DSH
פעילות: אצילציה- קשר קוולנטי בין האנזים לח.א, ודה-אצילציה- ניתוק מהאנזים ע”י מים

57
Q

הנחות יסוד למיכאליס מנטן

A

מיכאליס מנטן: פעילות האנזים בזמן 0

הזנחה של קיום תוצר ושל הריאקציה ההפוכה
ריכוז הסובסטרט גדול מריכוז האנזים = ריאקציה מסדר ראשון
שלב קובע מהירות: K2 - בין ES לP+E
ריכוז ES לא משתנה
V0 = K2[ES] = (Vmax*[s])/(K+[s])
58
Q

Km

A

הנטיה של אנזים לקשור סובסטרט ולזרז את הריאקציה קדימה
לא מדד לאפיניות- אאכ K2 זניח (קבוע דיסאוציאציה: קבוע פירוק הקומפלקס חלקי קבוע היווצרותו)
ריכוז הסובסטרט כשהמהירות ההתחלתית היא חצי מהמהירות המקסימלית

Km= (K2+K-1)/K1

59
Q

סוגי מעכבים

A

מעכב בלתי הפיך
מעכב הפיך תחרותי
מעכב הפיך בלתי תחרותי un
מעכב הפיך אל-תחרותי non

60
Q

פניצילין

A

אנטיביוטיקה הפוגעת בביוסינתזה של הפפטידוגליקאן D בדופן התא של חיידקים
מעכב בלתי הפיך הנקשר קוולנטית לאנזים טראנס-פפטידאז.

61
Q

סינתאז וסינתתאז

A

אנזימים מנצלי אנרגיה
סינתתאז מנצל אנרגיה מנוקלאוטיד - ATP וכו
סינתאז מנצל אנרגיה ממקור אחר

ביוכימיה (6 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions