Proteiner, aminosyror och aminosyrametabolism Flashcards

30/9, Sara

1
Q

Vad består en aminosyra av?

A
  • Ett kol som binder ihop alla
  • En karboxylgrupp
  • En aminogrupp
  • En sidokedja (-R)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hur ser en peptidbidning ut, och mellan vilka grupper förekommer den?

A

Bindningen sker mellan karboxylgruppen hos en aminosyra och amingrupp hos en annan syra

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Ge två exempel på sekundärstrukturer hos proteiner?

A
  • Alpha-helix
  • Beta-flak
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hur aktiveras ett enzym?

A
  • Aktivt säte
  • Allosteriskt säte
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vilka är källorna till aminosyror i kroppen?

A
  • Födan
  • Egen syntes av aminosyror
  • Nedbrytning av egna proteiner
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hur ser aminosyran Arginin (Arg) ut?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilken aminosyragrupp tillhör Arginin (Arg)?

A

Positivt laddade R-kedjor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hur ser aminosyran Glutamat (Glu) ut?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vilken aminosyragrupp tillhör Glutamat (Glu)?

A

Negativt laddade R-kedjor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hur ser aminosyran Aspartat (Asp) ut?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vilken aminosyragrupp tillhör Aspartat (Asp)?

A

Negativt laddade R-kedjor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vilka aminosyragrupper finns det?

Ge exempel på en aminosyra från varje grupp?

A
  • Icke-polära, alifatiska R-kedjor = glycin, alanin, valin, leucin
  • Polära, oladdade, R-kedjor = glutamin, cystein
  • Positivt laddade R-kedjor = arginin, lysin
  • Negativt laddade R-kedjor = aspartat, glutamat
  • Aromatiska R-kedjor = phenylalanin, tyrosin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vilka är de essentiella aminosyrorna?

A
  • Fenylalanin
  • Isoleucin
  • Leucin
  • Lysin
  • Metionin
  • Treonin
  • Tryptofan
  • Valin

För barn är även argining och histidin essentiella

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vilka molekyler/typer av molekyler används till syntes av icke-essentiella aminosyror i människa?

A
  • Pyruvat / Oxaloacetat
  • Glukos / Glycerol
  • Ornitin
  • Andra aminosyror
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur kan proteiner brytas ned intracellulärt?

A
  • I lysosom
  • I proteasom
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad är lysosomer och vad har de för pH?

A
  • Lysosomer är cellens soptunna, bryter ner alla möjliga biomolekyler i en icke-selektiv process, men kan bli selektiv vid svält
  • Innehåller ett stort antal proteaser och andra enzymer
  • Har pH 5
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hur går proteasom-nedbrytning till?

A
  • Protein märks för destruktion med enzym
  • När enzymkedja fäst vid proteinet, kan den gå vidare till proteasomerna
  • I proteasomerna spjälkas proteinen ner till mindre komponenter som kan återanvändas
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vad heter enzymet som proteiner märks med inför destruktion?

A

Ubiquitinin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Var i matspjälkningssystemet hittas följande enzymer: pepsin, trypsin, aminopeptidaser

A
  • Pepsin - magsäcken
  • Trypsin - pankreas / bukspottskörteln
  • Aminopeptidaser - tunntarmen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Om vi nu tar upp bara di & tri-peptider, hur kan man få prionsjukdom genom födan?

A

Felveckade proteiner (= prionproteiner) som kommer utifrån resulterar i att egen-syntetiserade proteiner felveckas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad är en prion?

A

En infektiös mikroorganism, innehållande ett prionprotein, som orsakar felveckning av proteiner och leder till prionsjukdomar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Ge exempel på några prionsjukdomar?

A
  • Kuru
  • Bovine spongiform encephalophathy (BSE)
  • Creutzfeldt-Jacon Disease (vCJD)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Genom vilka metabola cykler bryts aminosyror ned?

A
  • Kolskelettet bryts ned via citronsyracykeln
  • Kvävet omvandlas till urea i ureacykeln
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vad är deaminering?

A

När en aminogrupp tas bort från ex. en aminosyra

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vad är nettoreaktionen för transaminering?

A

aminosyra + NAD++ H2O → ketosyra + NADH + NH4+

26
Q

Vilka aminosyror har egna, specifika enzymer och vad heter dessa?

A

Serine - serine dehydratase

Threonine - threonine dehydratase

27
Q

Var i kroppen sker aminosyranedbrytning?

A

Sker framförallt i lever och njurar

28
Q

Vad är dehydrataser?

A

Enzymer som tar bort vatten från en aminosyra innan deaminering

29
Q

Mellan vilka två organ sker alanin-cykeln?

A

Mellan levern och musklerna

30
Q

Vilka är “active pathways” i Alanin-cykeln?

A
  1. Glykogenes - nedbrytning av glykogen
  2. Glykolys - en glukosmolekyl bryts ner till två pyruvatmolekyler
  3. Citronsyracykeln
  4. Oxidativ fosforylering - utvinning av ATP från ADP och fosfat
  5. Glukoneogenes - nybildning av glukos från icke-kolhydrater
  6. Ureacykeln
31
Q

Vad är skillnaden mellan en glukogen och ketogen aminosyra?

A

Glukogen - nedbrytningsprodukten kan bilda glukos genom glukoneogenes

Ketogen - produkten kan inte bilda glukos, men kan brytas ned direkt till Acetyl CoA (genom ketogenes)

32
Q

Vad är speciellt med aminosyror som är både ketogena och glukogena?

A

Vissa av deras kol-atomer kommer ut som Acetyl-CoA eller Acetoacyl-CoA, och andra som glukos-prekursrorer: acetoacetat, fumarat och pyruvat

33
Q

Vilka aminosyror är både ketogena och glukogena?

A
  • Isoleucine
  • Threonine
  • Phenylalanine
  • Tyrosine
  • Tryptophan
34
Q

Var i ureacykeln introduceras kväve-atomerna?

A
  • CO2 och fritt ammoniak bildar karbamoylfosfat
  • När aspartat introduceras, och bildar arginosuccinate tillsammans med citruline
35
Q

Vilka intermediärer delar citronsyracykeln med ureacykeln?

A
  • Argininosuccinate
  • Fumarate / Malate
36
Q

Vad kan ske vid genetiska defekter i ureacykeln / leversjukdom?

A
  • Ammoniak har en neurotoxisk effekt på CNS
  • Höga koncentrationer ammoniak → koma / död
37
Q

Vad innebär negativ kvävebalans och vad kan det leda till?

A
  • Negativ kvävebalans = man utsöndrar mer kväve än man tar upp
  • Kan leda till svält: proteiner bryts ned för att kompensera
38
Q

Vad innebär positiv kvävebalans och vad kan det leda till?

A
  • Positiv kvävebalans= man tar upp mer kväve än man utsöndrar
  • Positivt vid graviditet
  • Igentagning efter svält
39
Q

Vad är phenylketonuria?

A

En genetisk defekt där man saknar enzymet som bryter ned phenylalanin

40
Q

Vilka handlingar krävs vid phenylketonuria?

A

Viktigt att begränsa intaget av protein och aspartam (sötningsmedel)

41
Q

Ge exempel på puriner?

A
  • Adenine
  • Guanine
42
Q

Ge exempel på pyrimidiner?

A
  • Cytosine
  • Uracil
  • Thymine
43
Q

Vad är AMP?

A

Adenosine monophosphate

44
Q

Vad är en nukleosid och en nukleotid?

A
  1. En bas = purin eller pyrimidin (ex. adenin)
  2. En pentos som kopplas till basen = nukleosid (ex. adenosine)
  3. En fosfat-grupp som kopplas till nukleosiden = nukleotid (ex. AMP - adenosine monofosfat)
45
Q

Hur binder nukleotider till varandra och vad bildas då?

A

Nukleotider binder kovalent med vätebindnignar och formar nukleinsyror

46
Q

Vad är nukleotidernas funktioner?

A
  • Binder till varandra med kovalenta bindningar = bildar nukleinsyror
  • Cellens valuta: bärare av kemisk energi
  • Koenzym: bildar koenzymer med andra grupper
  • Fungerar som cellsignaleringsmolekyler
47
Q

Vad är ett koenzym?

A

En icke-proteinös komplex molekyl som behövs för ett proteins aktivitet

48
Q

Vad är PRPP och vad syntetiseras det från?

A

PRPP = 5-phosphoribosyl-1-pyrophosphate

  • Behövs för syntes av alla nukleotider
  • Syntetiseras från ribose-5-phosphate
49
Q

Vilka två vägar finns vid biosyntes av nukleotider?

A
  • De novo syntes - nybildning
  • Salvage pathway - nedbrytning/återvinning
50
Q

Vad krävs för omvandling av P-Ribose-NH2 till IMP?

A
  • Glycin
  • Folsyra - N-formyltetrahydrofolat
  • Glutamin
  • Aspartat

+ 7 ATP

51
Q

Vad är IMP?

A

Inosine monophosphate (inosinate)

52
Q

Vilka nukleotider kan IMP biosyntetiseras till?

A
  • AMP
  • GMP
53
Q

Av vilka ämnen bildas pyrimidin-nukleotider?

A
  1. Carbomyl phosphate + aspartate → carbamoylaspartate
  2. Carbamoylaspartate → orotate
  3. Orotate + PRPP → UMP

UMP → UTP → CTP

UMP → dTTP

54
Q

Hur bildas urinsyra i kroppen?

A

Från nedbrytning av puriner

55
Q

Vilka är stegen för nedbrytning av pyrimidiner, till urin?

A

Pyrimidiner → NH3 → urea → urin

56
Q

Vad är gikt och vad orsakas det av?

A
  • Ledinflammation, som orsakas av att halten urinsyra (urat) i blodet ökar (hyperurikemi) och faller ut som kristaller
  • Kristallerna lägger sig i leder, senor och omgivande vävnad
57
Q

Hur behandlas gikt - akut eller långsiktigt?

A
  • Akut = behandlas med anti-inflammatoriska läkemedel
  • Långsiktig = minskat återupptag av urinsyra (Probenecid) och genom inhibering av urinsyraproduktion (Allopurinol / Febuxostat)
58
Q

Vad bryts Heme ned till?

A

Bilirubin

59
Q

Vilka är riskfaktorerna för gikt?

A
  • Njursjukdom
  • Högt blodtryck och psoriasis
  • Leukemi
  • Proteinrik mat
  • Alkohol
60
Q

Hur utsöndras kvävet från Hem i kroppen?

A

I form av bilirubin via gallan

61
Q

Vad är porfyrier?

A

Ärftliga sjukdomar som beror på en brist på någon av de enzymer som deltar vid syntesen av Hem

62
Q

Vad innebär akut intermittent porfyri?

A

Mutation i PBGD-genen