Wykład 14

Question 1

wiązania w nukleotydach

Answer 1

N-glikozycowe między rybozą a zasadą
estrowe między rybozą a resztą kwasu fosforanowego
wiązanie bezwodnikowe między resztami kwasu

Question 2

co jest podjednostką strukturalną NDA?

Answer 2

nukleotyd

Question 3

jakimi wiązaniami są połączone nukleotydy w łańcuchu DNA

Answer 3

3-5 fosfodiestrowe

Question 4

Reguły Chargaffa

Answer 4

A + G = T + C

Question 5

Opisz krótko B-DNA, A-DNA, Z-DNA

Answer 5

B-DNA 
kształt pośredni, prawoskrętna
A-DNA
najszersza, prawoskrętna
Z-DNA
najwęższa, lewoskrętna

Question 6

Co opakowuje chromatynę?

Answer 6

histony

Question 7

Histony lizyno-bogate

Answer 7

H2A, H2B

Question 8

Histony arginino-Bogate

Answer 8

H3, H4

Question 9

Poziomy upakowania DNA

Answer 9

DNA
Nukleosomy
Solenoid (6/skręt)
Pętle (50/skręt)
Miniprążek
Chromosom

Question 10

Co to jest Tm?

Answer 10

Temperatura topnienia, w której dochodzi do utraty połowy helikalnej struktury

Question 11

co ma większą temp. topnienia - dsDNA czy ssDNA?

Answer 11

dsDNA

Question 12

rodzaje replikacji

Answer 12

Dyspersyjna
semikonserwatywna
konserwatywna

Question 13

co to jest origin?

Answer 13

Miejsce w cząsteczce DNA, gdzie rozpoczyna się replikacja

Question 14

Co to jest replikon?

Answer 14

odcinek DNA, zawierający miejsce inicjacji replikacji oraz sekwencje fizycznie do niego przylegające

Question 15

OriC

Answer 15

miejsce inicjacji replikacji E. Coli (245 pz)

Question 16

czym jest kompleks preinicjacyjny

Answer 16

widełki replikacyjne wyposażone w komplet białek replikacynych

Question 17

Helikaza DnaB

Answer 17

rozrywanie wiązań wodorowych za pomocą ATP

przyłączenie prymaty DnaG w OriC i inicjacji fragmentów okazaki

Question 18

DnaC

Answer 18

funkcja przekaźnika ułatwiającego dołączanie Dna do ssDNA

aktywuje DnaB

Question 19

Białka SSb

Answer 19

stabilizują jednonaciowe DNA

Question 20

co to jest ARS?

Answer 20

autonomiczne replikujące się sekwencje drożdży - funkcjonalny odpowiednik OriC

Question 21

ABF1 i ORC

Answer 21

ABF1 - aktywator replikacji

ORC - białka inicjacyjne

Question 22

Co potrzeba di syntezy łańcucha DNA?

Answer 22

matryca, starter, dNTP, Mg2+, polimeraza

Question 23

Replikacja procarionta

co trzeba

Answer 23

topoizomeraza
helikaza
białka stabilizujące
prymaza
polimerazy DNA
ligaza DNA

Question 24

funkcja Topoizomerazy DNA

Answer 24

kataliza reakcji przecinania i łączenia polinukleotydowych łańcuchów DNA
usuwanie napięcia torsyjnego
u eukariota przepuszczalność jąder, utrzymywanie struktury chromatyny

Question 25

Co hamuje aktywność topoizomerjazy II? (bakteryjna gryraza)

Answer 25

nowoybiocyna (wiązanie ATP), kwas nalidyksowy, cyprofloksacyna (ponowne łączenie DNA)

Question 26

białka SSB

Answer 26

stabilizacja nici,

Question 27

odpowiednik SSB u Eucariota

Answer 27

białko replikacyjne A

Question 28

co syntezuje u bakterii startery?

Answer 28

Prymaza (potem Polimeraza III)

Question 29

co syntezuje u eukariota startery?

Answer 29

Polimeraza alfa (potem polimeraza delta

Question 30

co to jest prymasom?

Answer 30

kompleks białek zaangażowanych w replikacje DNA

Question 31

co się składa na prymasom?

Answer 31

helikaza, SSB, prymaza

Question 32

Aktywność 5-3, 3-5, funkcja Polimeraza I II III

Answer 32

``` I 3-5, 5-3, usuwa startery naprawa DNA replikacja II 3-5, sprawdzanie poprawności, naprawa DNA III 3-5, głowy enzym replikacyjny ```

Question 33

jaka aktywność może być opisana jako korekcyjna?

Answer 33

Aktywność 3-5 egznonukleazy

Question 34

co robią egznonukleazy 5-3?

Answer 34

usuwają startery, minery pirymidynowe

Question 35

jak idzie polimeraza?

Answer 35

5-3 (nowa nić)

Question 36

czym jest replikom?

Answer 36

kompleks białek zaangażowanych w replikację DNA (prymasom + kompleks polimerazy III)

Question 37

``` polimeraza alfa beta gamma delta epsilon ```

Answer 37

alfa - replikacja, synteza starterów beta - naprawa DNA gamma - 3-5, replikacja mitochondrialnego DNA delta, 3-5, główny enzym replikacyjny epsilon - 3-5, replikacja i sprawdzanie poprawności syntezy DNA

Question 38

Czemu odpowiada polmeraza I II III

Answer 38

alfa epsilon delta

Question 39

odpoco usuwa startery u eucariota?

Answer 39

FEN1, RNAza H

Question 40

Czy u eukariota istnieje replikom?

Answer 40

nie - fabryki replikacyjne

Question 41

jak są replikowane genomy bakteryjne?

Answer 41

dwukierunkowo

Question 42

czym są białka TUS?

Answer 42

pozwalają na wejście widełek replikacyjnycrh posuwających się w jednym kierunku, ale zatrzymuje widełki przesuwające się drugą stronę - w mechanizm włączona helikaza DnaB

Question 43

czym eukariota ma odpowiednik bakteryjnych sekwencji terminator owych oraz białek Tus

Answer 43

nie