mgr Flashcards

1
Q

Escherichia coli

A
  • gram-ujemna
  • pałeczka
  • rzęski - poruszanie się
  • fimbrie - przyleganie do powierzchni
  • fakultatywny beztlenowiec
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

chorobotwórcze szczepy Escherichia coli

A
  1. enteroinwazyjny EIEC
  2. enterotoksyczny ETEC
  3. enteropatogenny EPEC
  4. werotoksyczny VTEC
  5. enterokrwotoczny EHEC
  6. enteroagregacyjny EAEC, EAggEC
  7. dyfuzyjno-adherentny DAEC
  8. adherentno-inwazyjny AIEC
  9. nekrotkosygeniczny NTEC
  10. uropatogenny UPEC
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

enteroinwazyjne E. coli

EIEC

A
  • ludzie, naczelne
  • atakują i niszczą komórki nabłonka jelita grubego przy pomocy inwazyny IpaH -> komórka zamknięta w pęcherzyku endosomu -> możliwość przenikania do przyległych komórek
  • działanie inwazyny -> proces zapalny -> niszczenie erytrocytów -> czerwonka
  • plazmid pINV, wyspa patogenności ipa-mxi-spa
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

enterotoksyczne Escherichia coli

ETEC

A
  • biegunki podróżnych, noworodkowa biegunka niemowląt, cieląt prosiąt i szczeniąt,
  • przeżuwacze, świnie, ludzie, psy
  • ahezja do komórek nabłonka jelit przy pomocy fimbrii CFs -> uwalnianie enterotoksyn [termostabilnych STI, STII, termolabilnych LTp/h, LT-IIa, LT-IIb] i wiązanie z ich receptorami [cyklaza adenylowa-termolabilne-STII; cyklaza guanylowa-STII] na powierzchni nabłonka jelit -> wypływ jonów z komórek -> nagromadzenie wody -> biegunki
  • plazmidy
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

enteropatogenne Escherichia coli

EPEC

A
  • ssaki
  • śluzowe biegunki, rzadko z krwią
  • przyłączanie do nabłonka jelita za pomocą fimbrii LPF i tych tworzących wiązkę Bfp -> wydzielanie białek EspA, EspB, EspD [transfer sygnału do wnętrza erytrocytu], intyminy i jego recptora [białko Tir, transfer do wnętrza za pomocą systemu sekrecji typu 3] -> zmiana lokalizacji aktyny w cytoszkielecie komórki -> utworzenie piedestału aktynowego i możliwe wbudowanie białka Tir w błonę komórkową -> zagnieżdżenie bakteryjnej adhezyny [intymina] -> zamiany A/E [zanik mikrokosmków -> ścisłe przyleganie bakterii -> zmiana cytoszkieletu enterocytu przez akumulację aktyny] -> biegunka
  • geny zmian A/E - wyspa patogenności LEE -> trzy regiony
    1. geny esc i sep - T3SS
    2. geny eae i tir - intymina i receptor Tir
    3. geny espA, espB, espD - białka EspA, EspB, EspD
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

werotoksyczne Escherichia coli

VTEC

A
  • zespół hemolityczno-mocznicowy u ludzi, choroba obrzękowa prosiąt
  • werotoksyny I i II łączą się z receptorem w błonie komórkowej jelita, śródbłonka naczyń i nerek -> ich endocytoza do cytoplazmy -> blokowanie syntezy białek -> śmierć komórki
  • zmiany A/E [zanik mikrokosmków -> ścisłe przyleganie bakterii -> zmiana cytoszkieletu enterocytu przez akumulację aktyny] - wyspa patogenności LEE -> trzy regiony
    1. geny esc i sep - T3SS
    2. geny eae i tir - intymina i receptor Tir
    3. geny espA, espB, espD - białka EspA, EspB, EspD
  • przeżuwacze jako nosiciele
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

enterokrwotoczne E. coli

EHEC

A
  • krwotoczne zapalenie okrężnicy u ludzi, biegunkę młodych cieląt
  • fimbrie LPF - kolonizacja, ochrona przed fagocytozą, powstrzymanie aktywności klasycznej drogi dopełniacza
  • zmiany typu A/E [zanik mikrokosmków -> ścisłe przyleganie bakterii -> zmiana cytoszkieletu enterocytu przez akumulację aktyny] - wyspa patogenności LEE -> trzy regiony
    1. geny esc i sep - T3SS
    2. geny eae i tir - intymina i receptor Tir
    3. geny espA, espB, espD - białka EspA, EspB, EspD
  • toksyna Shiga -> zespół hemolityczno-mocznicowy
  • przeżuwacze jako nosiciele
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

enteroagregacyjne E. coli

EAEC, EAGgEC

A
  • fimbrie agregacyjne AAF I-iV - agregacyjna adhezja do enterocytów, hemaglutynacja erytrocytów -> biegunki
  • biofilm na enterocytach -> wydzielanie do ich wnętrza cytotoksyn i endotoksyn:
    1. enterotoksyna Shigella Set1 - niszczenie błony komórek nabłonka, wypływ jonów, nagromadzenie płynu w świetle jelita -> biegunka
    2. toksyna PicU - egzotoksyna, usuwa mucyny ze śluzu, umożliwia kolonizację i degradację komórek nabłonka i pęcherza moczowego, hamowanie klasycznej drogi dopełniacza
    3. termostabilna toksyna EAST-1 - aktywacja cyklazy adenylowej na enterocytach -> wytwarzanie cAMP -> zniszczenie nabłonka jelita -> biegunka
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Dyfuzyjno-adherentne E. coli

DAEC

A
  • biegunki, infekcje dróg moczowych, posocznica
  • adhezyny DAEC1 i 2 -> wzbudzenie przekazania sygnału do enterocytów -> wydłużenie wypustek komórkowych otaczających bakterie -< wywołanie stanu zapalnego jelita
  • struktury homologiczne do wysp patogenności LEE - zmiany typu A/E
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

adherentno- inwazyjne E. coli

AIEC

A
  • przetrwanie i replikacja wewnątrz makrofagów
  • fimbrie typu I - adhezja do komórek
  • fimbrie S - adhezja do komórek dolnych dróg moczowych, komórek nabłonka jelita i nerkowych, przenikanie bakterii do tkanek
  • fimbrie P - pobudzenie limfocytów T do produkcji cytokin, czynnik kolonizacji w zakażeniach pozajelitowych
  • hemolizyna HlyA - tworzy pory w błonach komórek -> liza
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

nekrotoksygeniczne E. coli

NTEC

A
  • biegunki, infekcje dróg moczowych, posocznice u ludzi i zwierząt
  • cytotoksyczne czynniki nektrotyzujące CNF1 i 2
  • α-hemoliizyny
  • adhezyny fimbrialne
  • siderofory
    odporność na układ dopełniacza
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

uropatogenne E. coli

UPEC

A
  • infekcje pęcherza moczowego, stany zapalne nerek, zakażenia krwi, sepsa u ludzi i zwierząt
  • możliwe bezobjawowe nosicielstwo
  • fimbrie typu 1 - przyłączanie do powierzchni komórki
  • fimbrie P - stymulacja limfocytów T do produkcji cytokin
  • fimbrie S - przyłączanie do komórek dolnych dróg moczowych, komórek nabłonka jelita i nerkowych, ułatwienie przenikania bakterii do tkanek
  • hemolizyna HlyA
  • toksyna autotoransportująca - sat, vat powodujące wakuolizację komórek
  • cytotoksyczny czynnik nekrotyzujący CNF - zmiany w cytoszkielecie komórek, stymuluje tworzenie syncytiów
  • autotransporter picU
  • yersiniabkterynę
  • enterobakterynę
  • mochelina
  • system transportu żelaza
  • system wykorzystania hemu
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

podział E. coli na grupy filogenetyczne A, B1, B2, C, D, E

A
  • różne zajmowane nisze, filogeneza, zdolnością wykorzystania cukrów, opornością na antybiotyki, tempem wzrostu, wielkością genomu [A i B1 genomy mniejsze], ilością czynników wirulencji [B2 i D więcej]
  • chorobotwórcze zwykle w B2 i D
  • komensale zwykle w A i B1
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Ściana komórkowa funkcje

A

nadaje kształt komórce mikroorganizmu,
ochrania ją przed środowiskiem zewnętrznym (na przykład przed zmianami ciśnienia osmotycznego lub układem odpornościowym gospodarza),
jest podstawą, w której zakotwiczone są elementy powierzchniowe bakterii (fimbrie, rzęski) oraz elementy rozpoznawane przez układ immunologiczny człowieka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

budowa ściany komórkowej bakterii gram-ujemnych

A

trzy zasadnicze części: wewnętrzna,
dwuwarstwowa błona cytoplazmatyczna (ang. inner membrane, IM); przestrzeń peryplazmatyczna (z 2-3 warstwami peptydoglikanu) oraz błona zewnętrzna (ang. outer membrane, OM)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

błona zewnętrzna (OM)

A

Asymetryczna, półprzepuszczalna
zasadniczo dwuwarstwa złożona z fosfolipidów oraz lipopolisacharydów (LPS, w skład którego wchodzą 3 części: lipid A - fosfolipid na bazie glukozaminy, krótki rdzeń oligosacharydowy oraz antygen O – swoisty), pomiędzy którymi znajdują się białka

17
Q

Białka błony zewnętrznej

A
  • ważna rola w patogenezie infekcji bakterii Gram-ujemnych – są pełnowartościowymi antygenami znajdującymi się na powierzchni komórki; indukują odpowiedź układu immunologicznego gospodarza; mogą być dystrybuowane poza bakterię lub działać w obrębie błony zewnętrznej
  • scalają dwuwarstwę lipidową oraz stabilizują ścianę komórkową i błonę zewnętrzną (lipoproteina Brauna) –
    to białka integralne, które złożone są z hydrofobowych konserwatywnych segmentów transbłonowych o budowie typu β oraz transbłonowe fragmenty β-nici zasobnych w glicynę, reszty tyrozyny i tryptofanu.
  • budują również kanały dyfuzyjne przepuszczające hydrofilowe substancje – to poryny złożone z białek OmpA praz FhuA, wykazujące strukturę β-baryłki z wychodzącymi na zewnątrz β-domeny, które są odpowiedzialne za rozpoznawanie ligandów (małe cząsteczki odżywcze), czynników toksycznych, bakteriofagów, a w przypadku patogenów również docelowych komórek eukariotycznych.
  • możliwy podział na: białka główne (występujące w dużej ilości - OmpA, OmpC, OmpF, OmpX) oraz białka drugorzędne (ich ilość zależna od potrzeb komórki – PhoE, LamB, FhuA, FepA)
18
Q

OMPs, które stanowią czynniki wirulencji E. coli

A
  • intyminy α i γ (adhezja bakterii do komórek jelitowych, uszkodzenie kosmków jelitowych, co prowadzi do ich całkowitego zaniku) i adhezyny, takie jak np. adhezyna Ag43 umożliwia szczepom uropatogennym kolonizację pęcherza moczowego i utworzenie biofilmu
  • OmpA, OmpX, Ail oraz NspA pełniły ważną funkcję w bakteryjnej kolonizacji i inwazji.
  • OmpA, PagC, Rck i OmpX uczestniczą w wykształceniu oporności na układ dopełniacza w surowicy
  • OmpA i PagC możliwe jest przeżycie bakterii w makrofagach
  • wzmożona ekspresja białka OmpW umożliwia rozwój oporności na wrodzoną obronę immunologiczną gospodarza
  • OmpF i OmpC przyczynia się do przeżycia bakterii w różnych warunkach osmolarności
19
Q

metodę top-down

A

analizującą nienaruszone białka, ich fragmentacja następuje wewnątrz MS

występują przeszkody techniczne uwarunkowane analizą całego proteomu z poziomu nienaruszonego białka, co skutkuje mniejszą czułością i pokryciem proteomu

20
Q

metodę bottom-up

A

wykorzystującą peptydy powstałe w skutek trawienia proteolitycznego białek, które następnie poddawane są eksperymentowi w MS

może nastąpić utrata informacji o możliwych modyfikacjach potranslacyjnych lub izoformach białek (szczególnie tych, które występują w bardzo małej ilości),

21
Q

E. coli wzrost na podłożu:

A
PODŁOŻE CPS
•Kolonie
–Przezroczyste
–Czyste
–Strefa wokół wzrostu koloni ciemno-fioletowa
PODŁOŻE MC - macconkeya
•Kolonie
–Jagodowe
–Okrągłe
–Różowa otoczka
PODŁOŻE SS -salmonella-shigella
•Kolonie
–Bardzo drobne
–Okrągłe
–Różowo-czerwone
•Podłoże różowe
PODŁOŻE COS - agar z krwią
•Kolonie
–Szarawe
–Małe
–Wypukłe
–Gładkie brzegi
•Czerwone podłoże