AA, peptides et prot

Question 1

prot

Answer 1

polymères > 20 aa

Hb, Actine et Myosine, Ac, Enzymes…

Question 2

masse molaire aa

Answer 2

110g/mol = 110 Da

masse molaire d’une prot = 110 x nmbr aa

Question 3

Calpha

Answer 3

asymétrique
optiquement actif
centre de chiralité (isomères D et L sont énantiomères)

Question 4

aa dans nature

Answer 4

+ de 300 aa ≠
aa constitutifs de prot = aa L
aa libres peuvent avoir fnct biologique

Question 5

zone tampon

Answer 5

zone qui correspond à une faible variation de pH malgré ajout de OH-

Question 6

∑ tampon

Answer 6

acide faible et sa base conjuguée résistant au changement de pH

Question 7

acide acétique

Answer 7

CH3COOH/ CH3COO-

Question 8

titrage histidine

Answer 8

pK1 = 1,82
pKr = 6
pK2 = 9,17
PI = 7,6
\+2 → -1

Question 9

% ionisation du noyau imidazole de l’histidine à pH =7

Answer 9

91% de forme neutre N

9% de forme chargée +, NH+

Question 10

propriétés ln peptidique

Answer 10

polaire, rigide, plane

Question 11

angles ln peptidique

Answer 11

omega: trans (180º) ou cis (0º) → au centre ln
trans always (sauf proline)
phi/psi: valeurs compatibles avec absence d’encombrement stérique → rotation entre les 2 plans séparés par un Calpha

Question 12

valeurs phi/psi

Answer 12

diagramme de Ramachandran montre valeurs autorisées

hélice alpha: phi = -57º et psi = -47º

Question 13

Alanine

Answer 13

-CH3
peu encombrant 
compo du collagène
très abondant dans le muscle
précurseur du glucose
interchangeable avec pyruvate lors de réaction de transamination

Question 14

phénylalanine

Answer 14

le plus hydrophobes des aa aromatiques
précurseur de la tyrosine (+ OH)
pathologie accumulation phenylalanine: phénylcétonurie

Question 15

dérivés tyrosine

Answer 15

cathécolamines
hormones thyroïdiennes
mélanine

Question 16

dérivés tryptophane

Answer 16

niacine aka Vit B3

sérotonine

Question 17

cystéine ou cystine

Answer 17

cystéine: dans conditions red, dans espaces intracell

cystine: dans conditions oxydantes, dans espaces extracell ou lorsque pH > pKr de la cystéine

Question 18

dérivés arginine

Answer 18

oxyde nitrique aka monoxyde d’azote NO

ornithine

Question 19

histamine

Answer 19

vient de décarboxylation histidine
vasodilatateur
sécrétion suc gastrique
réactions allergiques

Question 20

sérotonine

Answer 20

vient de décarboxylation du 5-OH-tryptophane

nombreuses fonctions cellulaires

Question 21

DOPA

Answer 21

vient décarboxylation tyrosine
∑ dopamine
traitement maladie parkinson

Question 22

GABA

Answer 22

vient décarboxylation acide glutamique

Nt

Question 23

alanine interchangeable

Answer 23

avec pyruvate lors réaction de transamination

Question 24

acide aspartique interchangeable

Answer 24

avec l’oxaloacétate dans réactions de transamination

Question 25

acide glutamique interchangeable

Answer 25

avec alpha-cétoglutarate dans réactions transamination

Question 26

21ème aa

Answer 26

Sélénocystéine chez tous mammifères constitutive certaines prot mitochondrie

Question 27

22ème aa

Answer 27

Pyrrolysine | spé des procaryotes

Question 28

aa dérivés de prot constitutives du triplet du collagène

Answer 28

4-OH-proline | 5-OH-lysine

Question 29

L-aa non constitutifs des prot impliqués dans métabolisme

Answer 29

ornithine et citrulline → élimination azote

Question 30

ln peptidique inhabituelle

Answer 30

glutathion ln faisant intervenir grp carboxyle en gamma de l’acide glutamique (et fnct amine portée par Calpha de la cystéine) + glycine

Question 31

Glycine

Answer 31

le plus petit as Calpha pas asymétrique apporte flexibilité motif collagène (Gly-X-Y)333

Question 32

Valine

Answer 32

encombrant: CH3 sur Cbeta consolide structure tridimensionnelle de prot car grp méthyles CH3 s’attirent entre eux

Question 33

Leucine

Answer 33

encombrant mais moins que Valine et Ile car pas de ramification CH3 sur Cbeta consolide structure tridimensionnelle de prot car grp méthyles CH3 s’attirent entre eux

Question 34

Isoleucine

Answer 34

encombrant consolide structure tridimensionnelle de prot car grp méthyles CH3 s’attirent entre eux Cbeta: 2ème C asymétrique

Question 35

Méthionine

Answer 35

grp thioether -S-CH3 rôle dans traduction des prot convertie en SAM/ principal donneur de méthyle CH3 réaction de methylation

Question 36

Proline

Answer 36

``` chaîne latérale cyclisée coude dans chaînes peptidiques déstabilise hélices alpha compo triplet Gly-X-Y collagène X: proline Y: OH-pro ou OH-lys ```

Question 37

Tyrosine

Answer 37

grp OH réactif (polaire, établit ln H) moins hydrophobes des aa aromatiques absorbe UV à 280nm phosphorylable (sur OH)

Question 38

Tryptophane

Answer 38

``` grp NH (hydrophile/ ln H) absorbe UV 280nm ```

Question 39

Sérine

Answer 39

alanine + OH phosphorylable O-glycosylable

Question 40

Thréonine

Answer 40

Val OH instead of CH3 phosphorylable O-glycosylable

Question 41

Aspargine

Answer 41

N-glycosylé | sucre sur grp amide

Question 42

Glutamine

Answer 42

le + abondant dans le sang | acteur de l’élimination de l’ammoniac

Question 43

Cystéine

Answer 43

grp -SH | formation ponts disulfures

Question 44

Lysine

Answer 44

fonction amine primaire NH3+ sur Cepsilone

Question 45

Arginine

Answer 45

essentiel chez nouveau-nés | grp guanidinium

Question 46

Histidine

Answer 46

essentiel chez nouveau-nés | grp imidazole