AN Flashcards
1
Q
Fonctions des AN
A
Stockage de l’info génétique
Expression
Prod et stockage d’E
Orchestration de l’expression des gènes
2
Q
Composition d’un AN
A
BA
Sucre
Phosphate a, B, gamma
3
Q
Quels sont les types d’AN
A
ADN
HNA
TNA
GNA
4
Q
Combien d’atomes du sucre cyclisé sont dans le plan
A
4 sur 5
5
Q
Quelle liaison entre BA et un sucre
A
N glycosidique
6
Q
Quels sont les deux classes de bases
A
Puriques
Pyrimidiques
7
Q
Quel est le nom de l’adénine
A
6-aminopurine
8
Q
Quel est le nom de la guanine
A
2amino-6oxypurine
9
Q
Quel est le nom de la cytosine
A
2oxy-4aminopyrimidine
10
Q
Quel est le nom de la thymine
A
2,4-dioxy-5-méthylpyrimidine
11
Q
Quel est le nom de l’uracile
A
2,4-dioxypyrimidine
12
Q
Qu’est ce que la lactame
A
Cycle carbonné contenant une fonction amide
13
Q
Qu’est ce que la lactime
A
Tautomère du lactame avec une fonction énol
14
Q
Qu’est ce que la tautomérisation
A
Isomérisation dépendante du pH (mvmt d’H)
15
Q
Qu’est ce que les conséquences des tautomérisations
A
Implication dans la reconnaissance et catalyse par l’ARN
Génère des erreurs de trad
16
Q
Ou est retrouvé majoritairement la pseudouridine
A
ARNr
ARNt
17
Q
Qu’est ce qu’un nucléotide
A
Un nucléoside mono/di/triphosphate
18
Q
D’où vient l’E du ribosome
A
Du GTP
19
Q
De quoi dérive l’AMPc
A
De l’ATP
20
Q
Quelle est l’activité de l’AMPc
A
Active l’expression des gènes du métabolisme des sucres
21
Q
Est ce que les nucléotides peuvent être des cofacteurs
A
Oui (cycle de krebs)
22
Q
Quand a été découvert les AN
A
19ème
23
Q
Est ce que les AN sont orientés
A
OUI
24
Q
Sens de la synthèse enzymatique
A
5->3
25
Sens de la lecture enzymatique
3->5
26
Convention d’écriture des AN
5->3
27
Qu’est ce qu’il faut préciser lors de l’écriture des séquences d’AN
La nature des grpmt terminaux
28
Quels sont les propriétés des AN
Neutralisation des charges négatives par des cations
Excellente hydrosolubilité
29
Quel est le principe de la précépitation alcoolique r
Déstruction des couches d’hydratations
Précipitation
30
Quelles sont les différents exemples d’appariement de bases
Paire de watson-crick
Parie de Hoogsteen
Triplet de bases
Quartet de purines
31
Vitesse d’incorporation de la polymérase bacterienne
30 à 750 incorporations/s
32
Distance ente les C1 des liaisons N glycosidiques
33
Combien de liaisons H entre AT et GC
AT: 2
GC: 3
34
Combien de bases par tour d’hélice
10,5
35
Qu’est ce un réduit l’absorbance des AN
L’empilement
36
Qu’est ce que l’effet hyperchrme
On le comprend okam
37
Def de la température de fusion Tm
T° a laquelle la moitié de l’ADN est sous forme simple brin
38
Quel est la différence entre entre syn et anti
Syn : base au dessus du sucre
Anti: position « normale »
39
Est ce que les pyrimidiques peuvent être anti ou syn
OUI
40
Par quoi est induit la forme A de l’ADN
Déshydratation
41
Quand est ce qu’on a une forme Z de l’ADN
Alternance de purine/pyrimidines
42
Taille du sillon majeur
12 A°
43
Taille du sillon mineur
6 À°
44
Par quoi se fait la reconnaissance spécifique préférentiellement
Sillon majeur
45
Pourquoi reconnaître les AN par des protéines
Transcrire
Réguler la transcription
Modifier l’ADN
46
Par quoi est catalyser la méthylation des bases
Méthyltransférase DAM
47
Par une méthyle transferase quel est le donneur du méthyl
Méthionnine
48
Sur quoi est modifié l’ADN des pro et eucaryotes
Procaryotes: séquences CCAGG et CCTGG
Eucaryotes: îlots CpG
49
Qu’est ce que la M éthylation des cytosines pour les eucaryotes
Marquage épigénétique réversible
50
Quel est le premier degré de compactions de l’ADN
Par les histones
51
Combien de bases par tour d’histones
146
52
Qu’est ce qu’un nucléosome
Cœur d’histone + 200 Pb
53
De quoi est formé un cœur histone
2 copies de :
H2A
H2B
H3
H4
54
H1 fait parti du cœur de histone ?
NON
55
Que fait H1
Interagit avec ADN linker
Fixe l’ADN
56
Qu’y a t t’il tout les 10Pb
AA
AT
Ou TT
57
Quel est la caractéristique du sillon majeur AT
Il est comprimable
58
Quel est la caractéristique du sillon mineur GC
Rigide
59
Que contactent les AA basiques
ADN nucléosomale
AA acides des cœurs d’H
60
Comment on module la compaction de l’AN
Modif des AA basiques
61
Quelles sont les principales réactions de modification
Acétykation des Lys, Arg par les HAT
Méthylation des Lys, Arg par des HMT
Phosphorylation des Ser Thr et Tyr par kinases
62
Qu’est ce que HAT
Histone acétyl transférase
63
Qu’est ce que HMT
Histone méthyl transférases
64
quelle partie des histones sont cible de nombreuses modifications
Les queues d’histones
65
Qu’est ce que le code histone
Marque épigénétique
Leur présence influence la présence des autres modif
66
Comment est compacté l’ADN bactérien
Actions de NAP
67
Quels sont les différents ARN
Messager
Ribosomal
Transfert
SnoRNA
IncRNA
MiARN
68
Quel est la proportion d’ARN codant et non-codant
Codant 5-10%
Non-codant : 90-95%
69
Quelle est la diff entre ARN et ADN
Désoxyribose
70
Dans quel sens est synthétisé l’ARN
5->3
71
Nb d’incorporation de l’ARN polymérase
30 a 200 nucléotides/s
72
Est ce que l’ARN polymérase a besoin d’amorce
NON
73
Qu’est ce qu’une RNase A
Endonucléase coupant après les pyrimidines non appariées
74
À quoi tend une molécule d’ARN
Former des structures secondaires
75
Quels sont les propriétés des hélices d’ARN
Interférences entre le 2OH et le phosphate
Sucres en C3-endo
Hélices sous forme A
76
Quelles sont les différentes structures des ARN
Tige-boucle
Bulge
Boucle interne
Interactions longues distances
77
Quelle est la fonction de la RNase P
Maturation de l’extrémité 5’ des ARNt
78
Quel est le rôle de l’anticodon dans l’ARNt
Lecture de l’ARN messager
79
Quelles sont les 2 capacités de l’ARN
Codant
Catalytique
80
Quels sont les principales classes technologiques ou on utilise de l’ADN
Amplification des AN
Séquençages
Transplantation de séquences
Édition de génomes
Dev d’AN artificiels
Nanotechnologies
81
Diapo 33
????
82
Quels sont les étapes de la PCR avec la T°
Dénaturation, 95°
Hybridation, 55°
Extension, 72°
83
Composition du milieu de PCR
Dinucléotides TP
ADN polymérase Thermostable (Taq)
Amorces spé de synthèse
Tampon et additifs
84
Quels sont les propriétés de la PCR
Le produit n’apparaît qu’au 3ème cycle
Amplification exponentielle
85
La plus part des techno de séquençage repose sur le principe….?
D’extension d’amorces
86
Quel est la techno de s équencage la plus utilisée en routine
Méthode danger
87
Omprendre la méthode de sanger
88
Avec la méthode de sanger sur quoi on lit la séquence AN
Autoradiogramme
89
Quelles sont les caractéristiques du séquençage a très haut débit
Analyse de millions de s équences en parallèle
Ouvre la voie a des analyses génomiques et transcriptomiques
90
Quels sont les différentes modifications de l’ADN
(Dé)phosphorylation
Adénylation
Méthylation
Légation
Digestion
91
Quel est l’origine des enzymes de restriction
Système bactérien de défense antivirale impliquant des enzymes de modif et de restriction
92
Quels sont les types d’enzymes de restriction
types:
I
II
III
93
Quels sont les caractéristiques des enzymes de restrictions I
Plusieurs sous-unités
Nécessite ATP et Mg
Coupure à distance du site de reco
94
Que reconnaît une enzyme I
Une séquence spé
95
Quelles sont les caractéristiques des enzymes II
Enzymes dimériques
Uniquement la restriction
Nécessite Mg
Coupure dans le site de reco
96
Comment marche CRISPP-Cas9
Reconnaissance et clivage par une prot unique (Cas9)
97
Par quoi est dirigée CRISPR
Par un ARN guide
98
Qu’est ce qu’un aptamère
Petit oligonucléotide simple brin reconnaissant spécifiquement une molécule cible
99
Qu’est ce que SELEX
Systematic Évolution of Ligand by EXponential enrichissement
100
Qu’analyse t on en SELEX
Les fluorescentes individuelles
101
Quel sont les intérêts et applications des aptamères
Outils de détection
Peu immunogènes
Prod en mass très reproductible
Facilement modifiable
Alternative aux AC
