Biologie - IV - Mots-clefs Flashcards Preview

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Flashcards in Biologie - IV - Mots-clefs Deck (49):
1

Génome

ensemble des molécules d’ADN d’une cellule ou d’un organisme, et de l’information qu’elles portent.

2

Gène

unité d’information génétique héréditaire, portée par l’acide nucléique génomique, dont le support est l’ensemble des séquences précises et ordonnées de nucléotides codant au moins une chaîne polypeptidique ou un ARN non traduit, et des séquences nécessaires à son expression.

3

Eucaryote

l’un des trois domaines majeurs de la classification phylogénétique du vivant, regroupant les organismes dont les structures cellulaires sont pourvues d’organites délimités par des membranes

4

Eubactérie

l’un des trois domaines majeurs de la classification phylogénétique du vivant, regroupant les organismes uncicellulaires dont les structures cellulaires sont dépourvues d’organites ; les eubactéries et les archées constituent les procaryotes

5

ADN

Acide désoxyribonucléique
Bases : guanine, cytosine, adénine, thymine
structure en double hélice, relations structure-fonction, support moléculaire du génome

support universel et permanent de l’information génétique : molécule bicaténaire, 2 brins antiparallèles, structure en double hélice droite
- relations structure-fonction : stabilité mécanique et chimique (stabilité des bases, stabilisation du squelette ose-phosphate par des protéines histones), stabilité informative (appariements Watson-Crick, information portée en double), mais déstabilisation locale possible via l’apport d’énergie par des protéines
- réplication semi-conservative.

6

Opéron

regroupement fonctionnel de gènes, associant des séquences codantes (cistrons) et des séquences régulatrices communes aux différents gènes (promoteur / terminateur)

7

Chromosome

édifice supramoléculaire formé d’une (ou deux) molécule d’ADN double brin, possédant au moins 1 ORI et des protéines associées à l’ADN, ainsi qu’un centromère et deux (ou quatre) télomères

8

Transcription

processus de synthèse d’un ARN à partir d’une molécule d’ADN, durant l’interphase du cycle cellulaire ; elle constitue la première étape de l’expression d’un gène

9

Polymérisation

polarisée de nucléotides triphosphates
– brin codant, brin transcrit
– appariement Watson-Crick
– ARN polymérase ADN-dépendante
– diversité des ARN

10

Initiation de la transcription

promoteur
– séquences consensus non palindromiques (TATA, GC et CAAT boxes)
– facteurs généraux d’initiation

11

Elongation de la transcription

hétéroduplex transitoire
– déstabilisation de liaisons faibles
– bulle de transcription dynamique
– processus multicopie.

12

Terminaison

séquences consensus de fin de transcription (sites de clivage et de polyadénylation)
– terminaisons ρ-(in)dépendantes

13

Maturation nucléaires

coiffe 5’
– queue poly-A 3’
– édition
– épissage alternatif.

14

Contrôle de la transcription

interactions entre séquences régulatrices et facteurs de transcription
– opéron (contrôle eubactérien)
– contrôle par un facteur spécifique de transcription hormono-dépendant (contrôle eucaryote)
– euchromatine permissive à la transcription
– hétérochromatine inhibant la transcription
– complexes de remodelage de la chromatine
– modification covalentes des histones ou de l’ADN.

15

Contrôle de l'expression de l'information génétique

ARNmi (complexe RISC
– ARN coupé-dégradé ou traduction inhibée)
– ARNsi (complexe RISC – dégradation d’ARN viraux – complexe RITS – inhibition de la transcription).

16

Diversité des transcriptomes eucaryotes

diversité des régulations transcriptionnelles
– diversité des maturations post-transcriptionnelles
– épigénétique.

17

Epigénétique

étude des changements d’expression des gènes, transmissibles au fil des divisions cellulaires voire des générations, sans modification de la séquence d’ADN

18

Duplication de l'information génétique

mécanisme moléculaire de la réplication de l’ADN

19

Réplication de l'ADN

processus de reproduction conforme d’une molécule d’ADN, réalisée de façon semi-conservative, durant la phase de synthèse (phase S) du cycle cellulaire

20

Réaction de polymérisation de l'ADN

réplication semi-conservative
– polymérisation polarisée de nucléotides triphosphates
– appariement Watson-Crick
– ADN polymérase ADN-dépendante
– œil de réplication, fourche de réplication
– réplication bidirectionnelle
– brin précoce, brin retardé
– fragment d’Okazaki

21

Initiation de la réplication

séquence ORI (origine de la réplication)
– fusion de la double hélice par DnaA (hélicase)
– positionnement des DnaB grâce aux DnaC (ATPase)
– détorsion de la double hélice par DnaB (hélicase)
– synthèse d’une amorce ARN par l’ARN polymérase I (brin précoce) ou l’ARN primase (brin retardé)
– fixation coopérative de SSB (single strand binding protein)

22

Elongation de la réplication

ADN polymérase III, activité polymérase 5’-3’, activité exonucléase 3’-5’, activité exonucléase 5’-3’
– fixation du clamp par une protéine d’assemblage du clamp
– fixation du réplisome, holoenzyme ADN polymérase III dimérisée
– fusion de l’ADN par une hélicase
– dépolymérisation de l’amorce ARN et polymérisation de dNTP par l’ADN polymérase I
– catalyse de la reformation de liaisons phosphodiester par l’ADN ligase
– relâchement des contraintes accumulées par l’hélice par des topoisomérases I

23

Terminaison de la réplication

séquences Ter
– protéines Tus (terminus utilisation substance)
– résolution des molécules d’ADN par des topoisomérases II (gyrases) ou IV

24

Fidélité de la réplication

fidélité intrinsèque, appariement Watson-Crick, disponibilité équiprobable des dNTP, dépendance à l’amorce ARN
– correction sur épreuve (proofreading), activité exonucléase 3’-5’
– système de correction des mésappariements (système MMR : DNA mismatch repair), tautomérie céto-énolique, tautomérie amino-imine, MutS, MutL
– correction par excision de bases

25

Fidélité de la réplication

fidélité intrinsèque, appariement Watson-Crick, disponibilité équiprobable des dNTP, dépendance à l’amorce ARN
– correction sur épreuve (proofreading), activité exonucléase 3’-5’
– système de correction des mésappariements (système MMR : DNA mismatch repair), tautomérie céto-énolique, tautomérie amino-imine, MutS, MutL
– correction par excision de bases.

Processus conservateur de l’information génétique mais générateur de mutations

26

Cycle cellulaire

ensemble des étapes qui décrivent la vie d’une cellule, qui s’étendent de la formation d’une cellule, suite à une division cellulaire, jusqu’à sa propre division en deux cellules-filles.

27

Mitose

division d’une cellule-mère en deux cellules-filles qui lui sont génétiquement identiques, durant la dernière phase du cycle cellulaire.

28

Mutation

tout changement héréditaire affectant la séquence nucléotidique de l’ADN ; seule source de diversification des génomes et force évolutive majeure

29

Allèles

versions alternatives d’un même gène

30

Polymorphisme

un locus est dit polymorphe lorsqu’il présente plus d’un allèle, l’allèle le plus commun ayant une fréquence inférieure à 0,95

31

Population

ensemble des individus d’une même espèce, vivant dans une zone géographique donnée

32

Lésion = altération de l'ADN

modification chimique ponctuelle et accidentelle de l’ADN.

33

Mésappariement

anomalie de structure de la double hélice d’ADN, due au non-respect des règles d’appariement Watson-Crick.

34

Taux de mutation

probabilité qu’a une entité (génome, gène, paire de bases…) de muter pendant un temps donné.

35

Fréquence de mutation

proportion de mutants dans une population (individus, ensemble d’allèles…).

36

Agent mutagène

facteur présent naturellement ou artificiellement dans l’environnement cellulaire, capable d’augmenter la fréquence de mutation.

37

Brassage chromosomique

ensemble des mécanismes assurant des combinaisons alléliques originales, à l’origine de phénotypes nouveaux, dits recombinés, dans la descendance

38

Cycle de développement

ensemble des étapes de la vie, depuis un zygote jusqu’à la formation d’un autre zygote par le premier zygote

39

Génération

entité structurale (organisme, massif cellulaire) et fonctionnelle bornée dans le cycle ; elle commence par un élément générateur (spore, gamète, zygote) et se termine lorsqu’elle est susceptible de mettre en place un autre élément générateur

40

Place de la méiose et de la fécondation dans les cycles de développement : différents cycles

cycle haplophasique – cycle haplo-diplophasique – cycle diplophasique

41

Haplotype

ensemble des combinaisons d’allèles présents sur différents loci

42

Sexualité

échange ou transfert de gènes

43

Reproduction

formation de nouveaux individus

44

Reproduction asexuée

reproduction sans sexualité

45

Parasexualité

sexualité sans reproduction

46

Reproduction sexuée

sexualité sans reproduction

47

Méiose

succession de deux divisions cellulaires, précédées d’une seule réplication d’ADN, formant, à partir d’une cellule diploïde, quatre cellules haploïdes à l’origine des gamètes

48

Chiasma (enjambements)

structure cruciforme s’établissant entre les chromatides de chromosomes homologues

49

Crossing-over

échange de matériel chromosomique entre deux chromosomes homologues, par cassure puis réassociation des chromatides non-jumelles cassées