C3 Flashcards

1
Q

peptide def

A

condensation linéaire d’acides aminés

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2
Q

oligopeptides

A

inf à 20 AA

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3
Q

polypeptides

A

inf à 100

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4
Q

on parle de protéines à partir de ……AA

A

100

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5
Q

deux catégories de protéines

A

monomérique, une chaine
multimérique pls chaines

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6
Q

les AA sont unis par

A

liaison peptidiques covalente: liaison amide

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7
Q

caractéristiques des liaisons peptidiques

A

stable, pas d’hydrolyse spontanée

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8
Q

structure mésomère

A

structure dont les électrons tourne à l’intérieur du cycle rendant la structure plus stable

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9
Q

les seuls point de pivot sont les

A

carbone alpha

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10
Q

grâce à la structure mésomère il y a

A

coplanéité des 6atomes

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11
Q

2 angles de rotation

A

psi, phi

psi c alpha+1 et C du carbonyle
phi c alpha+1 et N

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12
Q

la position privilégié est la position

A

trans

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13
Q

cette position trans favorise les

A

interactions hydrogènes

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14
Q

nomenclature des chaines peptidiques

A

1AA d’une chaine peptidique=résidus
noms des AA+ suffixe -yl
les AA sont numérotés de gauche à droite

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15
Q

types de peptides

A

linéaires , mono ou polycaténaires
mono un mésomère, poly pls mésomères mais linéaires

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16
Q

ionisation

A

extrémité C term et Nterm , certaines chaines latérales sont chargées

quand ph sera supérieur à pHi la charge globale sera négative

17
Q

structure primaire

A

ordre enchainement

17
Q

pour repérer les extrémités d’AA on regarde les liaisons peptidiques

A

O dbl C l NH

18
Q

structure secondaire

A

organisation tridimensionnelle d’un enchainement limité de quelques acides aminés
cette organisation fait intervenir des repliements grâce aux possibilités de rotation
stabilisation par des interactions hydrogène, des liaisons ioniques

rotations possibles, faciliter la stabilisation des conformations

19
Q

structures secondaires ordonnées hélice alpha

A

hélice droite, le sens de rotation, hélice sens des aiguilles d’une montre

structure compacte, 3.6 résidus par tour, interaction hydrogène entre AAn et AAn+4
le c dbl o est en aval, NH est en amont, bas
les chaines latérales sont tournées vers l’extérieur

20
Q

structures secondaires ordonnées plissé B

A

étirée plissements au niveau des carbone alpha , orientation alternée
stabilisation par des intéractions hydrogènes

21
Q

structures secondaires ordonnées coudes

A

2 types 4 résidus
coude proline

22
Q

structure tertiaire

A

accumulation de structures secondaires, aspect tridimensionnels , les acides aminés polaires se trouve en périphérie pour offrir des capacités hydrophiles

23
Q

structure tertiaire repliements et stabilisation

A

pont disulfure
interactions hydrophobes
ioniques
hydrogène
transfert électronique deux AA à cycles aromatiques
VDW

24
Q

Les interactions tertiaires

A

représente un ensemble organisé compact qui détermine la forme active faisant apparaître les domaines fonctionnels

25
Q

structures quaternaires

A

uniquement les protéines multimériques donc à pls sous unités

association de plusieurs structures par pont disulfures parfois mais surtout interaction faibles ioniques hydrogènes

26
Q

domaine

A

un domaine: une fonction distincte
domaines structuraux