Chapitre 10 : Résistances aux antimicrobiens (mécanismes) et alternatives (dont bactériophages) Flashcards
Quels sont les principaux mécanismes de résistance ? /!\
Résistances naturelles :
- intrinsèques (toujours exprimées dans l’espèce) = spectre de l’antibiotique Gram- à la pénicilline G
Gram+ à la streptomycine
- induites (gène présent mais exprimé qu’après exposition à l’Ab)
Résistances acquises = nouvelles propriétés = hors du spectre de l’antibiotique
Gram- à la streptomycine
Gram+ à la pénicilline G
Mutations de gènes existants ou incorporation de nouveaux gènes
Quels sont les mécanismes de détection des antibiorésistances ?
Antibiogramme en milieu gélosé avec pastille d’antibiotique
Antibiogramme dans un milieu liquide
Détection des gènes de résistances par PCR ou WGS
Quelles sont les alternatives aux antibiotiques ?
La vaccination, phagothérapie et/ou phage-prophylaxie, antiseptiques et désinfectants, probiotiques et prébiotiques, niveau d’hygiène, management général (ventilation, nourriture, …), larvothérapie, phytothérapie et/ou phytoprophylaxie
Qu’est-ce qu’un phage tempéré et un phage lytique ? /!\
Phage tempéré : le génome peut s’intégrer dans l’ADN de la cellule hôte. Une fois intégré, le phage prend le nom de prophage. On dit que le phage tempéré est capable de lysogéniser la bactérie infectée.
Phage lytique : le phage infecte la cellule hôte, se réplique à l’intérieur et la lyse pour se libérer dans le milieu extérieur.
Comment se passe le cycle lytique et le cycle lysogénique ? /!\
Cycle lytique : le bactériophage s’attache à la cellule, va injecter son ADN dans la cellule, va se répliquer et il y aura transcription et traduction. Puis il y aura une phase de maturation des bactériophages avant d’induire la lyse des cellules et de sortir en extra-cellulaire
Cycle lysogénique : mécanisme de reproduction viral dans lequel l’ADN viral est intégré au génome de l’hôte. Le nouvel ensemble de gènes du génome de l’hôte s’appelle le prophage. De ce fait, l’ADN viral devient une partie du génome de l’hôte. Une fois que le génome de l’hôte se réplique, les gènes viraux sont également répliqués simultanément. Comme aucune nouvelle progéniture n’est produite par le cycle lysogène, la cellule hôte ne se lyse pas.
Comment se fait la phase d’attachement du bactériophage ?
Différentes cibles possibles :
- Lipopolysaccharides
- Acides teichoïques
- Protéines
- Flagelles.
La fixation est contrôlée par la queue du phage :
- queue contractile➔par l’intermédiaire des protéines de liaison situées sur la plaque basale,
- queue non contractile ➔ par l’intermédiaire des fibres de leur queue,
- queue courte non contractile➔par l’intermédiaire d’un récepteur primaire de l’hôte suivi d’une dégradation enzymatique de ce récepteur permettant aux fibres de la queue de prendre contact avec un récepteur secondaire à la surface de la cellule.
Comment se passe la pénétration et injection de l’ADN du bactériophage ?
La pénétration permet l’injection de l’ADN dans la bactérie :
- queue contractile :
- modification de la conformation de la plaque basale ➔ contraction de la gaine
- digestion locale des polysaccharides externes et une glycosidase de la queue détruit la couche de peptidoglycan.
- tube interne de la queue pénètre l’enveloppe de la cellule et injecte le génome du phage.
- longue queue non-contractile :
- pénètrent la membrane externe avec leur queue
- dégradation enzymatique de la couche de peptidoglycan
- Modification de la conformation de la plaque basale et injection du génome du phage
- queue courte non contractile :
- réorganisation des protéines de la queue afin de détruire localement la couche de peptidoglycan,
- injection du génome du phage.
Quelles sont les stratégies du phage pour contrer la résistance ?
- Inhibition du système de restriction/modification : des enzymes de restriction clivent l’ADN étranger tout en protégeant son propre ADN.
- Inhibition du système CRISPR-cas (présent dans 50% des bactéries)
- Rétablissement du système toxine/antitoxine inhibé par l’infection phagique.
Quels sont les avantages et inconvénients de la phagotérapie ? /!\
Spectre d’hôte étroit : pas d’impact sur les bactéries non ciblées (avantage) mais approche probabiliste difficile (inconvénient)
Grande diversité : Echec d’isolement de phage contre une bactérie spécifique très peu probable (A)
Mécanisme d’action : Activité bactéricide rapide, indépendant de la résistance aux AB et activité anti-biofilm pour certains (A), mais relargage d’endotoxines lors de la lyse (I)
Nature virale : de petite taille donc bonne diffusion, n’infecte pas les cellules eucaryotes, organisme réplication sur le lieu de l’infection, présent dans l’environnement et isolement toujours possible (A), mais immunité cellulaire et humorale contre le phage, stabilité dépend de différents facteurs (pH, T°…), capacité potentielle à transférer des gènes de virulence ou de résistance (I)
