chp7 Βιολογία ιών Flashcards
(72 cards)
define virus + give its basic properties
= γενετική πληροφορία (DNA ή RNA) περικυκλωμένη απο ένα προστατευτικό κάλυμμα
- Δεν εμφανίζουν κανένα από τα χαρακτηριστικά της ζωής —> δεν θεωρούνται ζωντανοί οργανισμοί
- Εκτός από την αναπαραγωγή
- Υποχρεωτικά ενδοκυτταρικά παράσιτα
- Είναι ενεργοί μόνο όταν βρίσκονται εντός ενος ξενιστή
what types of organisms are affected by virus?
Όλες οι μορφές ζωής είναι προσβάλλονται από τους ιούς
- Ζωικά κύτταρα
- Φυτικά Κύτταρα
- Οι ιοί που μολύνουν μόνο Βακτήρια = βακτηριοφάγοι/ απλάφάγοι
why is it difficult to study viruses?
- επειδή η αύξηση τους απαιτεί την παρουσία κάποιου ξενιστη
—> ξενιστής τους πρέπει να είναι ζωντανός - είναι διακριτοί μόνο στο ηλεκτρονικό μικροσκόπιο
name the κύρια χαρακτηριστικά που τους διαχωρίζουν από άλλους μικροοργανισμούς
- Νουκλεϊνικό οξύ
- Ανύπαρκτός Μεταβολισμός
- Μέγεθος
list and describe the structure of a virus
Ιόσωμα ή ιοσωμάτιο —> σωματίδιο του ιού
- αποτελείται από νουκλεοκαψίδιο = καψίδιο (πρωτεϊνικό κάλυμμα) + νουκλεϊνικό οξύ
describe the capsid + function
Shape:
σχηματίζονται από πανομοιότυπες πρωτεϊνικές υπομονάδες, τα καψομερή τα οποία συγκροτούνται αυτόνομα (αυτοσυγκρότηση) με μια συγκεκριμένη συμμετρία
Role:
- προστατεύει το νουκλεϊνικό από τα διάφορα ένζυμα και από χημικέςουσίες του περιβάλλοντος
- Μπορεί να φέρει ουσίες η οποίες παίζουν σημαντικό ρόλο στη μολυσματική ικανότητα και εξειδίκευση του ιού έναντι του ξενιστή
what shapes can a virus take? what determines which shape it takes?
Ανάλογα με τη συμμετρία του καψιδίου οι ιοί μπορεί να έχουν μια από τις ακόλουθες μορφές:
- Πολυεδρικοί ιοί
- Ελικοειδείς ιοί
- Σύνθετοι ιοί
what is an extra structure that can be found in virus sometimes?
Κάποιοι ιοί μπορούν να διαθέτουν ένα επιπλέον εξωτερικό περίβλημά το απόκαλείται φάκελο —> έχει λιπιδική σύσταση
και περιβάλει το καψίδιο
describe the φακελο structure
- προέρχεται μορφολογικά από μεμβράνες του ξενιστή
eg ιός έρπητα —> πυρηνική μεμβράνη
eg ιός γρίπης & ιλαρά —> πλασματική μεμβράνη) - περιέχει συχνά ιικές γλυκοπρωτεΐνες (ινίδια ή ακίδες)
why is there ινίδια και ακίδες in the φακελο? (role)
Τα ινίδια και οι ακίδες είναι χαρακτηριστικά για κάθε ιού και
παίζουν σημαντικό ρόλο:
- Στην ταυτοποίηση ενός ιού
- Στην προσκόλληση στην επιφάνεια ξενιστή
- Αποτελούν στόχους του ανοσοποιητικού συστήματος αντισωμάτων & πολλών αντιικών φαρμάκων
why are proteins important for virus? (roles)
- Αποθήκευση νουκλεϊνικού υλικού εντός του καψιδίου
- Πρωτεΐνες καψιδίου, ινιδίων ουράς και ακίδες —> δρουν ως υποδοχείς αναγνώρισης και προσκόλλησης του κυττάρου ξενιστή – κυτταρική αναγνώριση
- Ένζυμα (σε μερικούς ιούς) —> διείσδυση εντός του ξενιστή, πολυμεράσες νουκλεϊνικού οξέος (π.χ. DNA και RNA πολυμεράση)
how do virus metabolize compounds?
Δεν έχουν δικά τους μεταβολικά συστήματα (ένζυμα, συνένζυμα, πρωτεΐνες, δομικά συστατικά κ.τ.λ.) – Μεταβολικά ανίκανοι
—> Υποχρεωτικά χρησιμοποιούν τα μεταβολικά/βιοχημικά συστήματα του κυττάρου ξενιστή
name some virus enzymes
- Λυσοζύμη
- Ένζυμα αντιγραφής όπως αντίστροφη μεταγραφάση και πολυμεράσες
- Νευραμινιδάσες
describe the genetic material of virus
- περιέχουν μόνο ένα είδος νουκλεϊκου οξέος είτε RNA είτε DNA
—> allows to categorize them as either DNA ιοί or RNA ιοί
—> αντιγράφονται με διαφορετικό τρόπο
Το γονιδίωμα μπορεί να είναι:
- δίκλωνο ή μονόκλωνο
- γραμμικό ή κυκλικό
define + describe how similar/different the process of viruses to do αντιγραφή is (not steps)
= πολλαπλασιασμού του ιού/μόλυνση μέσα στο κύτταρο ξενιστή
—> Όλοι οι ιοί έχουν σχεδόν παρόμοιο τρόπο αντιγραφής
—> Ο τρόπος εισόδου στο κύτταρο ξενιστή διαφέρει for different viruses
—> παρουσιάζουν εξειδίκευση ως προς το κύτταρο ξενιστή που μολύνουν
Για τους ιούς των φυτών και των βακτηρίων (φάγοι) υπάρχει το πρόσθετο εμπόδιο του κυτταρικού τοιχώματος. Για το λόγο αυτό, ο ιός παραμένει συνήθως έξω από το κύτταρο ξενιστή και μόνο το νουκλεϊνικό του υλικό εισέρχεται εντός
explain the Φάσεις αντιγραφής/μόλυνσης ιών (steps)
- Προσκόλληση του ιού στη μεμβράνη
- Διείσδυση του ιού εντός του κυττάρου (ή μόνο του νουκλεϊνικού οξέος)—> εκλείπει (δεν υπάρχει ενεργός ιός ούτε μπορεί να ανιχνευθεί)
- Σύνθεση νεών πρωτεϊνών και νουκλεϊνικού οξέος (δεν υπάρχει ενεργός ιός)
- Ωρίμανση και συγκρότηση ιικών σωματίων. Υπάρχει ενεργός ιός και μπορεί να ανιχνευθεί
- Απελευθέρωση με ή χωρίς τη λύση του κυττάρου ξενιστή
whatare the criterias needed for a virus to infect a host?
- Την αντιγονική σύσταση του ιού στον μανδύα ή το νουκλεοκαψίδιο
- Την παρουσία κατάλληλων υποδοχέων στην εξωτερική επιφάνεια του κυττάρου ξενιστή
- Τη διαθεσιμότητα κατάλληλων κυτταρικών ενζύμων που απαιτούνται για τον ιικό
- πολλαπλασιασμό
Γιατί είναι σημαντικό να μελετήσουμε τους φάγους? list a few reasons
- Είναι εύκολο να καλλιεργηθούν εργαστηριακά
- Χρήσιμα μοντέλα για τη μελέτη και την κατανόηση της μοριακής βιολογίας και της σχέσης των ιών με το ξενιστή τους
- Εξυπηρετούν ως φορείς μεταφοράς γονιδίων στα βακτήρια
- Σημαντική οικολογική και ιατρική σημασία
- Αποφυγή βακτηριακών λοιμώξεων —> eg χρήση φάγων που μολύνουν το βακτήριο Listeria monocytogenes ως αντιμικροβιακό παράγοντα σε έτοιμα προς κατανάλωση κρέατα και προϊόντα πουλερικών
name and describe the 2 είδη βακτηριοφάγων με βάση τη
σχέση που αναπτύσσουν με το ξενιστή τους
- Λυτικοί φάγοι:
- η μόλυνση καταλήγει με τη λύση και το θάνατο του κυττάρου ξενιστή (επιθετικοί φάγοι) - Λυσογενής φάγοι:
- το κύτταρο ξενιστής παραμένει ζωντανό (ήπιοι φάγοι) μετά τη μόλυνση
- Το γενετικό υλικό τους σχετίζεται με αυτό του ξενιστή (προφάγος) και μεταφέρεται στα θυγατρικά κύτταρα.
- Μπορεί να συμβεί και μικρό ποσοστό λύσης των θυγατρικών κυττάρων
describe how λυτικοί φάγοι work
- προκαλούν το θάνατο του ξενιστή τους μετά το τέλος του κύκλου αντιγραφής τους
- το κύτταρο ξενιστής λύεται και πεθαίνει
- Παραγωγική μόλυνση —> σχηματισμός νέων ιοσωματίων
eg T4 φάγος
- Ο λυτικός κύκλος διαρκεί συνολικά 25 λεπτά
- απελευθερώνονται 100+ νέα ιοσωμάτια
what is an extra layer that lytic phages have + what can break it
Για τους φάγους υπάρχει ένα πρόσθετο εμπόδιο: το κυτταρικό τοίχωμα → ο ιός παραμένει απέξω και μόνο το νουκλεϊνικό οξύ εισέρχεται εντός
—> Τ4 Λυσοζύμη διασπά το κυτταρικό τοίχωμα
describe the lytic pathway
- στάδια έκφρασης —> η ιική νουκλεάση αποικοδομεί το DNA του ξενιστή
- σύνθεση δομικών πρωτεϊνών και νουκλεϊνικών οξέων
- Συναρμολογηση πρωτεϊνών και νουκλεϊνικών οξέων
- Απελευθέρωση —> το κύτταρο παθαίνει λύση και οι νέοι ιοί
απελευθερώνονται
which pathway do λυσιγόνος φάγος follow
έχει την “επιλογή” να ακολουθήσει είτε λυτικό (παραγωγικό) είτε λυσιγόνο κύκλο μόλυνσης
define λυσιγόνος μόλυνση
= ενσωμάτωση του ιικού γενετικού υλικού μέσα στο γονιδίωμα του ξενιστή