COURS 03 - GRANDS GROUPES DE MOs Flashcards
(151 cards)
1
Q
nommer les 3 domaines de la vie
A
- bactéries
- archées
- eucaryotes
2
Q
à quels 2 domaines peuvent appartenir les procaryotes
A
- bactéries
- archées
3
Q
quelle est la principale différence entre les procaryotes et les eucaryotes
A
- les procaryotes n’ont pas de noyau alors que les eucaryotes oui
4
Q
nommer les règnes possibles des procaryotes
A
- aucun, les bactéries et les archées n’ont pas de règne défini
5
Q
nommer les règnes possibles des eucaryotes (4)
A
- protistes (eucaryotes unicell)
- fungi (mycètes)
- plantes
- animaux
6
Q
les plantes peuvent-elles infecter l’H?
A
oui :
une seule algue unicellulaire non photosynthétique peut infecter l’humain ; elle ressemble a une levure
7
Q
ou se situent les virus et les prions dans le domaine du vivant (4)
A
- agents infectieux acelllulaires
- ne font pas partie du domaine du vivant
- on en retrouve cependant associées à pls branches du vivant
- leur spectre d’hote est en général restreint a certaines rangs taxonomiques, souvent même limité a une espèce
8
Q
comment se repliquent les virus (3)
A
- réplicons semi-autonomes grace a leur acide nucléique
- ils doivent infecter une cellule pour se faire répliquer par la machinerie cellulaire de leur hote
- une fois répliqués, ils peuvent migrer hors de la cellule hote initiale et aller en infecter une autre
9
Q
que sont les prions (2)
A
- pas des réplicons
- ce sont des agents patho de nature protéique dépourvus d’acide nucléique
10
Q
comment les prions causent-il des dommages a l’organisme hote?
A
- un prion infectieux va entrainer une cascade de changements conformationels chez des prots apparentées saines et ainsi provoquer des dommages aux cellules infectées
11
Q
quels organismes sont désignés par le terme “microbe”? (4)
A
- bactéries
- fungi
- protozoaires
- virus
12
Q
caract des microbes (7)
A
- très petite taille
- omniprésents et abondants dans la nature
- unicellulaires (exception : les fungi incluent des uni- et pluricell et les virus sont acellulaires)
- organisation simple
- inclut des procaryotes et des eucaryotes
- disposent d’un potentiel métabolique (sauf les virus)
- capables de se reprod (sauf les virus)
13
Q
définir la classification bactérienne
A
taxonomie des microbes
14
Q
définir l’identification bactérienne
A
nécessité de savoir a quel microbe on a affaire (Dx + Tx)
15
Q
définir génotype
A
connaissance des gènes microbiens
16
Q
définir phénotype (2)
A
- caract observables
- résultat de l’expression des genes
17
Q
nommer des outils de classification et d’identification (6)
A
- morphologiques
- biochimiques
- physico-chimiques
- sérologiques
- protéonomiques (ex : MALDI-TOF)
- génétiques
18
Q
de quelle taille peuvent etre les eucaryotes
A
10-5 à 10-3 m
19
Q
de quelle taille peuvent etre les procaryotes
A
10-7 à 10-4 m
20
Q
de quelle taille peuvent etre les virus
A
10-8 à 〜10-6
21
Q
de quelle taille peuvent etre les protéines
A
10-9 à 〜10-7
22
Q
qu’est-ce que la nomenclature binomiale en latin
A
- genre + espèce
- ex : Staphylococcus aureus
23
Q
nommer 3 exemples de racines de noms des bactéries
A
- suivant la racine latine
- suivant la racine grecque
- en l’honneur de personnalités
24
Q
que signifie bacillus
A
petit batonnet
25
que signifie lactobacillus
petit batonnet du lait
26
que signifie sarcina
en paquet
27
que signifie micrococcus
petit grain
28
que signifie clostridium
fuselé
29
que signifie corynebacterium
batonnet en forme de massue
30
nommer les tailles et formes possibles des bact et leurs nomenclature (4)
* batonnets : bacilles, coccobacilles
* spères : cocci
* spirales : vibrio, spirochètes
* difformes : pleïomorphes
31
nommer les arrangements spatiaux possibles des bact et leur nomenclature (4)
* individuelles
* paires : diplo-
* chainettes : strepto-
* amas : organisés ou non
32
nommer la forme #1
coque (cocci)
33
nommer la forme #2
diplocoque
34
nommer la forme #3
diplocoque encapsulé
| (pneumocoque)
35
nommer la forme #4
staphylocoque
36
nommer la forme #5
streptocoque
37
nommer la forme #6
sarcina
38
nommer la forme #7
tétrade
39
nommer la forme #1
coccobacille
40
nommer la forme #2
bacille
41
nommer la forme #3
diplobacille
42
nommer la forme #4
palisade
43
nommer la forme #5
streptobacille
44
nommer la structure 1
hyphe
45
nommer la structure 2
queue
46
nommer la forme #1
extrémités effilées - fusobacterium
47
nommer la forme #2
vibrion
48
nommer la forme #3
en virgule (vibrio)
49
nommer la forme #4
en massue
50
nommer la forme #5
hélicoïdale
51
nommer la forme #6
en tire-bouchon
52
nommer la forme #7
filamenteuse
53
nommer la forme #8
spirochète
54
nommer les différentes formes possibles des colonies sur gélose (6)
* punctiforme
* circulaire
* filamenteuse
* irreg
* rhizoïde
* fusidforme
55
nommer les différentes élévations possibles des colonies sur gélose (5)
* plane
* élevée
* convexe
* bombée
* bossue
56
nommer les différents bords possibles des colonies sur gélose (6)
* regulier
* ondulé
* lobé
* dentelé
* filamenteux
* bouclé
57
nommer toutes les caract des colonies sur gelose pouvant contribuer à l'identification de la bact (6)
* forme
* élévation
* bord
* couleur
* transparence
* surface
58
nommer la structure #1
pili
59
nommer la structure #2
cytoplasme
60
nommer la structure #3
ribosomes
61
nommer la structure #4
nucléoide (ADN)
62
nommer la structure #5
memb cytoplasmique
63
nommer la structure #6
parois
64
nommer la structure #7
capsule
65
nommer la structure #8
flagelle
66
composantes structurales et fonctionnelles des bact - définir “enveloppes”
différentes structures qui entourent les bact
67
composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les 3 types d'enveloppes
* matériel extracell (capsule, glycocalyx, couches-s)
* paroi cell
* memb cytoplasmique
68
composantes structurales et fonctionnelles des bact - caractéristiques de la capsule (5)
* seules certaines bact en possèdent une
* procure un pouvoir patho en empechant la phagocytose
* constituée de polysaccharides
* = antigène K
* il en existe 83 variantes (déterminent le sérotype) pour les pneumocoques
69
composantes structurales et fonctionnelles des bact - qu'est-ce que le glycocalyx (3)
* sorte de “”capsule"" intercellulaire formant des biofilms agglutinants
* favorise l'adhésion aux matériaux (prothèses, tuyaux)
* ex : streptococcus mutans → carie dentaire
70
composantes structurales et fonctionnelles des bact - qu'est-ce que la paroi cellulaire
paroi rigide qui assure la forme de la bact
71
composantes structurales et fonctionnelles des bact - quels sont les 2 structures possibles de paroi cell
* gram +
* gram -
72
comparer gram + et gram - en ce qui a trait aux peptidoglycans et aux lipopolysaccharides
* PG : couche épaisse chez les gram+, mince chez les gram-
* LPS : couche supplémentaire que l'on retrouve chez les gram-
73
quel est le pouvoir pathogène de la couche de LPS des gram- (2)
* endotoxine
* = antigène O
74
composantes structurales et fonctionnelles des bact - définir membrane cytoplasmique
bicouche de phospholipides avec prots transmembranaires
75
composantes structurales et fonctionnelles des bact - roles de la memb cytoplasmique (3)
* barrière osmotique : controle les taux ioniques
* transport : régulation des échanges interne/externe
* enzymes : role dans le métabolisme énergétique
76
composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les constituants internes (3)
* cytoplasme
* plasmides
* appareil nucléaire
77
composantes structurales et fonctionnelles des bact - que contient le cytoplasme (2)
l'appareil nucléaire et les ribosomes
78
composantes structurales et fonctionnelles des bact - décrire l'appareil nucléaire
ADN double brin sans memb nucléaire
79
composantes structurales et fonctionnelles des bact - qu'est-ce qu'un plasmide (3)
* ADN extra-chromosomique circulaire
* se réplique de manière autonome
* code pour des propriétés facilitant la survie, dont des gènes de résistance
80
composantes structurales et fonctionnelles des bact - role des flagelles (2)
* appendice de mobilité → pouvoir pathogène accru
* = antigène H
81
composantes structurales et fonctionnelles des bact - combien de flagelle y a-t-il? (2)
* nb et disposition varient selon les genes
* pas une structure obligatoire : peut en avoir 0
82
nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #1
monotriche
83
nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #2
lophotriche
84
nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #3
péritriche
85
nommer la bactérie selon son nb de flagelle(s) - #4
amphitriche
86
composantes structurales et fonctionnelles des bact - role des pilus sexuels (1)
transfert de plasmide et ADN lors de la conjugaison
87
composantes structurales et fonctionnelles des bact - role des pili et des fimbriae (1)
attachement
88
quels genres de bact font des endospores (2)
bacillus et clostridium
89
endospores - fonction (1)
survie dans les conditions défavorables
*fonction très différentes des spores des mycètes*
90
endospores - décrire le volume et la position des endospore pour une espèce donnée
caractères constants
91
endospores - nommer 4 maladies causées par des bactéries sporulées
* gangrène
* tétanos
* botulisme
* anthrax
92
endospores - décrire les étapes du cycle de sporulation et de germination (9 étapes)
1. croissance
2. division cellulaire
3. formation du filament axial
4. formation su septum (**si conditions sont difficiles**)
5. enkystement de la préspore
6. formation du cortex et synthèse de la tunique
7. lyse cellulaire et lib.ration de la spore
8. spore libre
9. germination
93
nommer les différents antigènes bactériens (3)
* H : flagelles
* K : capsule
* O : endotoxine dans la paroi des Gram- (LPS)
94
composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les composantes obligatoires (5)
* paroi cell
* memb plasmique
* cytoplasme
* chromosome
* ribosomes
95
composantes structurales et fonctionnelles des bact - nommer les composantes facultatives (7)
* capsule (et autres matériaux extracell)
* endotoxine (LPS)
* plasmide
* flagelle
* pili
* spore
* corps d'inclusion/granule
96
identification par tests colorimétriques - définir “coloration simple”
application d'un seul colorant
97
identification par tests colorimétriques - nommer les étapes (5) de la coloration différentielle de gram ainsi que les résultats attendus
1. fixation
2. application de crystal violet (violet)
3. application d'iode
4. décoloration
5. application de safranine (rouge)
gram + : mauve, gram - : rouges
98
nommer les 3 différentes observations possibles en microscopie optique
* champ clair
* constraste de phase
* fond noir
99
quelle est l'observation régulière en microscopie optique
le champ clair
100
que permettent la microscopie a fluorescence et confocale (1)
des phénomènes d'interactions vivantes peuvent etre filmés
101
nommer 3 types de microscopie électronique
* à transmission (2D)
* a balayage (3D)
* a l'aide d'un couteau diamant
102
quel est le grossissement maximal du matériel inerte sur un microscope optique?
jusqu'a environ 100 000 x
103
identification par test biochimiques - nommer les différentes technologies phénotypiques (4)
* tubes éprouvettes
* plaquettes de cupules
* plaque 96 puits (micro-scan)
* micropuits
* etc
104
identification par test biochimiques - que recherche-t-on? (5)
* sources de C
* aérobiose vs anaérobiose
* potentiel de fermentation
* produits terminaux du métabolisme
* tolérance aux inhibiteurs métaboliques et antibiotiques
105
identification par test biochimiques - comment fonctionne le pointage dans la technologie micro-scan (2)
* selon les rxn positives : rangée 1 = 4 pts, rangée 2 = 2 pts et rangée 3 = 1 pt
* le nb final correspond a un genre et espèce de bactérie
106
identification par test biochimiques - comment le micro-scan permet-il de vérifier la résistance aux Ab?
* certaines rangées permettent de le vérifier
* si ++ : résistant
* si - - : sensible
* si - + : intermédiaire
107
détection immunologique : que permet-elle de détecter (2)
des Ag microbiens ou des Ac par réponse sérologique
108
détection immunologique : nommer deux tests utilisés
* test ELISA
test immunochromatographique rapide
109
détection immunologique : décrire le fonctionnement du test ELISA
* on met un réactif coloré flurorescent ou enzymatique en contact avec un Ac de détection, lequel se fixera sur la protéine cible
* la protéine cible doit aussi se fixer sur l'Ac de capture pour que le test soit +
110
détection immunologique : nommer les avantages du test ELISA (2)
* spécifique +++ car double reconnaissance de la prot cible/Ag : Ac de détection et Ac de capture
* sensible +++ car le réactif coloré fluo ou enzymatique amplifie le signal (augmente la coloration rouge)
111
détection immunologique : décrire les désavantages du test immunochromatographique rapide (2)
* pas d'amplification de signal = peu sensible
* pas de lavages = moins spécifique
112
détection immunologique : décrire les étapes du test immunochromatographique rapide (2)
* on met l'analyte sur une plaque
* si l'analyte est compatible avec les Ac marqués, le complexe se liera aux Ac de capture (test line)
113
nommer deux méthodes de test Dx microbien par détection d'ADN
* trousses de détection d'un seul microbe spécifique soupçonné présent dans un échantillon clinique
* détection simultanée potentielle de plusieurs espèces de microbe
114
nommer des exemples de microbes pour lesquelles on utilise souvent les trousses de détection pour le test Dx par détection d'ADN (5)
* S. aureus résistant a la méticilline
* staphylocoques sensibles ou résistants
* entérocoques résistants a la vancomycine
* clostridium difficile
* streptocoques B lors de l'accouchement
115
nommer l'appareil utilité pour les tests de détection simultanée potentielle de plusieurs espèces de microbes
appareil revogene de GenePOC
116
comment fait-on l'identification phénotypiques de microbes (2)
* batterie de tests
* base de donnée (+ ou -) biochimiques ou microbiologiques
117
comment fait-on l'identification génotypique de microbes (2)
* ADN/ARN
* base de données des séquences (ACGT)
118
comment fait-on l'identification MALDI-TOF des microbes (2)
* ratios masse/charge (physicochimie)
* base de données (m/z) via séquençage de l'ADN et des prots
119
qu'est-ce qui distingue les virus des autres organismes? (10)
* très petits (microscope électronique nécessaire)
* acellulaires
* structure simple : acide nucléique + emballage
* ARN ou ADN seulement
* aucun métabolisme, énergie
* parasites intracellulaires obligatoires, pas de reprod autonome
* cycle de réplication dans l'hote
* culture sur cellule hote seulement
* Tx = antiviraux
* Ab = inefficaces
120
taille approx du virus de la rage
150 nm
121
taille approx du virus de l'influenza et VIH
100 nm
122
taille approx du virus du rhinovirus
70 nm
123
taille approx du virus de la polio
27 nm
124
a partir de quelles caractéristiques procède-t-on a la classification virale? (7)
* nature du génome (ADN/ARN)
* configuration du génome
* taille du génome (kbp/kb)
* enveloppe (oui/non)
* morphologie
* taille du virion
* hote
125
décrire le génome viral (3)
* ADN **ou** ARN, pas les deux
* ADN : simple brin ou double brin
* ARN : simple brin (positif ou négatif) ou double brin
126
comment est-ce que le virus se fait répliquer par la cellule hote
en y injectant son matériel génétique
127
décrire les virus enveloppées
* entourés d'une bicouche lipidique acquise lors de leur sortir de l'hote par bourgeonnement
128
décrire l'enveloppe des virus enveloppés (3)
* bicouche lipidique
* provient de la memb cellulaire des cellules hotes
* le virus y “attache” des protéines membranaires
129
comment appelle-t-on les virus sans enveloppes
virus nus
130
nommer les différentes formes de capsides possibles (3)
* hélicoïdale
* icosaédrique
* mixte ou complexe (icosaédrique + hélicoidale)
131
distinguer capside et enveloppe
* capside : emballage protéique
* enveloppe : bicouche lipidique
132
définir nucléocapside
nucléocapside = capside + acide nucléique
133
nommer les enzymes virales des rétrovirus (3)
* transcriptase inverse virale (TIV)
* intégrase
* protéase
134
enzymes virales des rétrovirus - role de la TIV
rétro-transcrit l'ARN viral en ADN
135
enzymes virales des rétrovirus - role de l'intégrase
intègre l'ADN viral au chromosome de l'hote
136
enzymes virales des rétrovirus - role de la protéase
favorise la maturation des prots virales
137
nommer une enzyme des virus influenza
* neuraminidase
138
enzymes virales de l'influenzavirus - décrire la neuraminidase (3)
* contribue au relargage des virus hors des cellules
* 9 possibilités
* ex : H1N1 = neuraminidase #1
139
enzymes virales des rétrovirus - combien de possibilité d'hémagglutinine y a-t-il?
* 16
* ex : H1N1 = hémagglutinine #1
140
nommer un virus faisant partie de la classe des rétrovirus
VIH
141
comment se reproduisent les levures?
* peuvent produire des pseudohyphes (bourgeonnement)
142
comment se reprduisent les moisissures?
par spores asexuées volatiles (la maj du temps)
143
distinguer l'apparence des colonies de levures et de moisissures
* levures : lisses et muqueuses
* moisissures : chevelues et poudreuses
144
nommer des levures d'interet alimentaire (3)
* saccharomyces cerevisiae (alcool, pain)
* penicillum roqueforti (fromages bleus)
* penicillum camemberti (fromage)
145
nommer des levures d'interet medical (1)
candida albicans
146
nommer les embranchements des mycètes (3)
* zygomycètes
* ascomycètes
* basidiomycètes
147
décrire les zygomycètes (3 caract)
* moisissure commune
* saprophytes
* ex : rhizopus
148
décrire les ascomycètes (1 caract)
* conidiospores
149
décrire les basidiomycètes (2 caract)
* 30 000 espèces
* micro- ou macroscopiques
150
définir protozoaires
protistes unicellulaires ayant des cycles de vie complexe pouvant affecter pls espèces d'hotes différents dans leur développement
151
nommer 3 exemples de maladies causées par des protozoaires
* toxoplasmose
* giardiase
* malaria
