Cours 1 : Structure de l'ADN

Question 1

Qu’est ce qu’un atome

Answer 1

La plus petite unité possédant les propriétés d’un élément

Question 2

Quelles sont les 3 principales particules élémentaires qui constituent les atomes

Answer 2

1. Neutron
2. Protons
3. Électrons

Question 3

Où se retrouvent les neutrons et les protons dans l’atome

Answer 3

Dans le noyau

Question 4

Où se retrouvent les électrons dans l’atome

Answer 4

Ils gravitent autour de l’atome à la vitesse de la lumière

Question 5

Qu’indiquent les rangées dans le tableau périodique des éléments

Answer 5

Le nombre de couches d’électrons pour chaque atome

Question 6

Qu’est ce que la couche de valence

Answer 6

C’est la dernière couche d’électrons

Question 7

Que permet la couche de valence

Answer 7

Les interactions entre les atomes

Question 8

Qu’est ce que la règle de l’octet

Answer 8

Pour être stable, un atome cherche à compléter sa dernière couche électronique avec 8 électrons en faisant des liaisons chimiques avec d’autres atomes

Question 9

Quels atomes font exception à la règle de l’octet

Answer 9

H et He (2 électron sur leur couche de valence)

Question 10

Qu’est ce que l’état électriquement neutre

Answer 10

Le nombre de protons est égal au nombre d’électrons

Question 11

Pourquoi la formation d’une liaison chimique entre 2 atomes dégage-t-elle de l’énergie

Answer 11

Parce que les atomes deviennent stable et bougent moins

Question 12

Que faut-il apporter pour briser une liaison chimique

Answer 12

De l’énergie pour permettre aux atomes de retrouver leur mouvement initial

Question 13

Classer les types de liaisons chimiques de la plus énergétique à la moins énergétique

Answer 13

1. Covalentes (polaires et non-polaires)
2. Ioniques
3. Hydrogènes
4. Interactions hydrophobes
5. Van Der Waals

Question 14

Par quel type de liaison s’effectue la formation de chaînes carbonnées

Answer 14

Liaison covalente

Question 15

3 types de liaisons que peuvent faire les carbones entre eux
3 types de squelettes carbonnés

Answer 15

Simple, double ou triple
Longue rectiligne, ramifiée ou cyclique

Question 16

Est ce que les chaînes carbonées peuvent faire des liaisons avec d’autres molécules

Answer 16

Oui, pour construire des tissus et des organes

Question 17

De quoi dépendent les propriétés d’une molécule organique

Answer 17

1. Disposition des carbones
2. Molécules se liant au squelette carboné

Question 18

Qu’est ce qu’un groupement fonctionnel

Answer 18

Groupement d’atomes qui participent aux réactions chimiques des molécules organiques

Question 19

Quel est l’avantage de posséder des liaisons covalentes polaires par rapport aux liaisons covalentes non-polaires

Answer 19

Favorise l’équilibre et l’efficacité énergétique

Question 20

Quel type de liaison contiennent les groupements fonctionnels

Answer 20

Covalentes polaires (parfois ionisés)

Question 21

Par quoi est déterminé la forme d’une macromolécule

Answer 21

Par la séquence

Question 22

Par quel type de liaison les monomères sont-ils liés les uns aux autres

Answer 22

Par des liaisons covalentes

Question 23

Par quels types de liaisons la structure 3D des macromolécules sont-elles stabilisées

Answer 23

Liaisons covalentes et non-covalentes

Question 24

Vrai ou faux : Plus 2 molécules s’assemblent bien, plus elles forment de lien covalents entre elles

Answer 24

Faux, plus elles forme de liens NON-COVALENTS

Question 25

Pourquoi les interactions de faible énergie sont elles efficaces pour stabiliser les molécules

Answer 25

Parce qu'elles sont très nombreuses

Question 26

Dogme central de la biologie

Answer 26

Réplication Transcription Traduction

Question 27

Qu'est ce qu'un nucléotide

Answer 27

Sucre + base azotée + groupement phosphate

Question 28

Qu'est ce qu'un nucléoside

Answer 28

Sucre + baze azotée

Question 29

Différence entre ribose et désoxyribose

Answer 29

OH sur le C2 du sucre (ribose) H sur le C2 du sucre (désoxyribose)

Question 30

Quelles sont les 2 purines

Answer 30

Adénine Guanine

Question 31

Quelles sont les 2 pyrimidines

Answer 31

Cytosine Thymine (Uracile)

Question 31

Qu'est ce que le lien phosphodiester

Answer 31

Lien entre le C5 du sucre et le groupement phosphate

Question 32

Qu'est ce que le lien glycosidique

Answer 32

Lien entre le C1 du sucre et la base azotée

Question 33

Lors de la formation des liaisons phosphodiester et glycosidique, quelle molécule est relâchée

Answer 33

H2O (réaction de condensation)

Question 34

Est ce qu'il est possible de polymériser l'ADN avec des nucléotides monophosphates

Answer 34

Non, la polymérisation de l'ADN requiert des nucléotides triphosphates

Question 35

3 fonctions des nucléotides

Answer 35

1. Source d'énergie chimique (liaison entre les gr. phosphate) 2. Coenzyme (association avec différents gr. chimiques) 3. Molécules de signalisation

Question 36

Combien d'énergie donne l'hydrolyse de l'ATP à pH7

Answer 36

7.3 kcal/mol

Question 37

Par quel lien se fait la polymérisation de l'ADN

Answer 37

Par le lien phosphodiester

Question 38

2 éléments requis pour la polymérisation de l'ADN

Answer 38

1. Polymérase (enzyme) 2. apport en nucléotide triphosphate

Question 39

Dans quel sens se fait la polymérisation et quelle molécule est libérée

Answer 39

Du 5' au 3' On libère une molécule de pyrophosphate

Question 40

Quelle est la charge globale de l'ADN

Answer 40

négative

Question 41

Quel groupe se retrouve à l'extrémité 3' et à l'extrémité 5' des chaines de nucléotides

Answer 41

5' : groupe phosphate 3' : groupe hydroxyle libre

Question 42

Comment est identifier une séquence de chaîne de nucléotides

Answer 42

Avec les bases azotées (du 5' vers 3')

Question 43

Quelles liaisons assurent la formation de la structure bicaténaire de l'ADN

Answer 43

Les liaisons hydrogènes (faibles, mais nombreuses)

Question 44

Quelles sont les règles de Chargaff

Answer 44

1. Peu importe la source, %A=%T et %C=%G 2. Le rapport des purines sur pyrimidines est toujours de 1 3. % de (G+C)/(G+C+A+T) d'un génome dépend de l'espèce (mais est toujours le même pour une espèce donnée)

Question 45

Quels nucléotides se lient ensembles avec combien de liens H

Answer 45

A se lie avec T (2 liens H) G se lie avec C (3 liens H)

Question 46

Que veut dire orientation antiparallèle

Answer 46

Les liens H ne se forment entre les couples compatibles que si le 5' est face au 3'

Question 47

Les bases sont-elles situées vers l'intérieur ou l'extérieur de l'ADN

Answer 47

Vers l'intérieur

Question 48

Qu'est ce qui constitue l'information génétique

Answer 48

Le nombre et l'ordre précis des bases

Question 49

Les protéines peuvent-elles toujours lire les séquences de bases

Answer 49

Non, il faut avoir accès aux bases

Question 50

Vrai ou faux : certaines protéines peuvent reconnaitre des séquences à travers les sillons de l'ADN

Answer 50

Vrai

Question 51

Peut ont répliquer l'ADN sans ouvrir la double hélice d'ADN

Answer 51

Non, il faut briser les liens H entre les bases pour ouvrir l'ADN

Question 52

pourquoi y a-t-il un sillon mineur et un sillon majeur dans l'ADN

Answer 52

À cause de l'angle entre 2 liens glycosidiques d'un couple de nucléotides (2 angles différents)

Question 53

Quels sont les angles des sillons mineurs et majeurs

Answer 53

Mineur : 120 Majeur : 240

Question 54

Quels sont les groupes chimiques exposés dans chaque sillon

Answer 54

Mineur : AHA et ADA Majeur : ADAM, MADA, HDAA et AADH

Question 55

Une protéine peut lire plus d'information dans le sillon mineur ou majeur

Answer 55

Majeur, elle a aussi plus de place pour approcher le sillon majeur

Question 56

Qu'est ce que la dénaturation

Answer 56

Perte de la structure quaternaire, tertiaire ou secondaire présente dans la forme native de la molécule

Question 57

Qu'arrive-t-il si on chauffe l'ADN à 95 degrés

Answer 57

On brise les liens H entre les bases azotées et on obtient 2 chaines d'ADN à un seul brin

Question 58

Est ce que la dénaturation est réversible

Answer 58

Oui, lorsque la température redescend, les brins se réassocient selon leur compatibilité

Question 59

Comment peut-on détecter une séquence spécifique d'ADN dans un échantillon

Answer 59

En hybridant l'ADN avec un brin ajouté qui correspond à la séquence complémentaire de la séquence recherchée (voir diapo 32-33)

Question 60

Qu'est ce que la spécificité

Answer 60

Le degré de complémentarité entre 2 molécules (dépend de la complémentarité de forme et du nombre de liens chimiques formés)

Question 61

Vrai ou faux : plus la température d'hybridation est élevée, plus l'hybride est spécifique

Answer 61

Vrai

Question 62

Qu'est ce que la technique d'hybridation in situ

Answer 62

Permet de voir une séquence cible grâce à l'hybridation de l'ADN avec sonde marquée fluorescente (voir diapo 35-36)

Question 63

Technique d'hybridation sur membrane

Answer 63

Voir diapo 38-41