cours 4 (acides nucléiques) Flashcards
(40 cards)
1
Q
nuclétotide définition
A
monomère des acides nucléiques
2
Q
nucléotides parties (3)
A
- base azotée liée à un
- pentose (sucre à 5 atomes de C) lié à un
- groupe phosphate
3
Q
nucléotide: base azotée
A
- composé cyclique azoté
- deux familles selon que la base ait 1 ou 2 cycles
- les bases se distinguent par les groupements fonctionnels qui y sont liés
4
Q
nucléotide: base azotée: 2 familles
A
- pyrimidine
- purine
5
Q
nucléotide: base azotée: pyrimidine
A
- 1 cycle comprenant 4C et 2N
= Cytosine C: C(4)H(5)N(3)O
= Thymine T: C(5)H(6)N(2)O(2)
= Uracile U: C(4)H(4)N(2)O(2)
6
Q
nucléotide: base azotée: purine
A
- 2 cycles comprenant 5C et 4N
= Adénine A: C(5)H(5)N(5)
= Guanine G: C(5)H(5)N(5)O
7
Q
nucléotide: pentose (4)
A
- une ribose sous forme cyclique
- par convention:
= C dans pentose: C1’, C2’
= C dans base: C1, C2 - OH de C1’ au dessus du plan du cycle
= B-ribose - type de sucre va déterminer le nom de l’acide nucléique
= 2 types de pentoses => 2 types d’acides nucléiques
= ribose dans l’ARN: OH lié à C2’
= désoxyribose dans l’ADN: H lié à C2’
8
Q
nucléotide: groupement phosphate
A
- groupement PO(4)
- vient de l’acide phosphorique H(3)PO(4)
- 5 électrons de valence
9
Q
nucléotide: lien entre base azotée et pentose
A
- base azotée se lie au C1’ du pentose
= nucléoside - par liaison N-glycosidique
= OH du C1’ (pentose) et H de NH (base) forme H(2)0 = condensation
= C1’ (pentose) et N (base) établissent une liaison covalente (forte)
10
Q
nucléotide: lien entre pentose et groupement phosphate
A
- par liaison phosphoester
- H(3)PO(4) se lie au C5’ (pentose) du nucléoside
= nucléotide - OH du C5’ (pentose) et un H du H(3)PO(4) forme H(2)O = condensation
- C5’ du pentose et un O de H(2)PO(4) forment une liaison covalente (forte)
11
Q
nucléoside vs nucléotide: nucléoside (3)
A
- base azotée + pentose
- ribonucléoside si pentose est le ribose (dans l’ARN)
- désoxyribonucléoside si pentose est le désoxyribose (dans l’ADN)
12
Q
nucléoside vs nucléotide: nucléotide (3)
A
- nucléoside + groupement phosphate
- ribonucléotide si le pentose est le ribose (dans l’ARN)
- désoxyribonucléotide si le pentose est le désoxyribose (dans l’ADN)
13
Q
polymérisation des nucléotides
A
- polymériser pour former les chaînes ADN et ARN
- le C3’ d’un monomère se lie au groupement phosphate du monomère voisin par condensation et liaison covalente
- et ainsi de suite tout le long de la chaîne
14
Q
extrémités de la chaîne polynucléotidique
A
tête: extrémité 5’
queue: extrémité 3’
- reflètent le sens de polymérisation
15
Q
liaison phosphodiester
A
un groupement phosphate se retrouve impliqué dans deux liaisons phosphoesters:
1. celle qui le relie au C5’ de son nucléotide
2. celle qui le relie au C3’ du nucléotide précédent
16
Q
diversité des acides nucléiques
A
réside dans la séquence et le nombre des nucléotides
- eux-mêmes caractérisés par la nature des bases azotées
= pyrimidine: C, T, U
= purine: A, G
17
Q
autres nucléotides: autres fonctions (3)
A
- transport d’énergie chimique
- messagers cellulaires spécifiques
- constituants d’enzymes
18
Q
ADN nom complet
A
acide désoxyribonucléique
19
Q
ADN: définition
A
- polymère linéaire de désoxyribonucléotides
- généralement bicaténaire: 2 chaînes = 2 brins
20
Q
ADN: niveaux de structure
A
- primaire
- secondaire
- tertiaire
21
Q
ADN: structure primaire
A
- composition de deux brins: nature, nombre et séquence de désoxyribonucléotides reliés par liaison phosphoesters covalente
- en résulte une polarité: extrémité 5’ (tête) et l’autre extrémité 3’ (queue) de chaque chaîne
22
Q
ADN: structure secondaire
A
- les 2 brins sont anti paralèlles et complémentaires
- les liaisons H permettent sa forme hélocoïdale
= meilleure stabilité
23
Q
ADN: structure secondaire: 2 brins complémentaires
A
- les bases azotés sont positionnées face à face selon un appariement strict
- les bases sont reliées par des liaisons hydrogène
- la pyrimidine d’un brin fait face à la purine d’un autre brin
= T-A: lié par 2 liaisons H
= G-C: lié par 3 liaisons H
24
Q
ADN: structure tertiaire: 2 molécules
A
- molécule circulaire
- molécule linéaire enroulé autour de protéines nommées histone
25
ADN: structure tertiaire: molécule circulaire
- ADN des bactéries (procaryotes, cellules sans noyau)
- ADN des mitochondries (dans toutes les cellules eucaryotes, avec noyau)
- ADN des chloroplaste (dans les cellules végétales)
26
ADN: structure tertiare: molécule linéaire mais entourée autour de protéines nommées histone
- ADN du noyeau des cellules eucaryotes
= les histones compactent et protègent l'ADN
= se lie à l'ADN par des liaisons ioniques et H
27
ADN pour hérédité
matériel héréditaire des organismes vivants
28
ADN: hérédité et reproduction
- molécule très stable, produite une fois et dure toute la vie d'une cellule
- seule molécule possédant la capacité à produire une copie d'elle-même, propriété essentielle à la continuité du vivant
= reproduction à l'échelle moléculaire
- code toutes les fonctions de la cellule mais ne les exécute pas elle-même
29
ARN: nom complet
acide ribonnnucléique
30
ARN: définition
- polymère linéaire de ribonucléotide
- monocaténaire: 1 chaîne
- complémentaire avec un segment d'un brin d'une molécule d'ADN
= beaucoup plus court que l'ADN
= très instable
- 3 niveaux de structure:
1. primaire (tous les types)
2. secondaire (certains)
3. tertiaire (certains types)
31
ARN: structure primaire
sa composition: nombre, nature et séquence de rubonucléotide relié par liaison phosphoester covalente
- 2 pyrimidines: C et U
- 2 purines: A et G
32
ARN: structure secondaire
le transcrit d'ARN peut se replier
- ARNm et ARNr sont surtout linéaires, mais peuvent se replier
- ARNt forme des épingles à cheveux où
= appariement de U-A et de C-G par des liaisons H doubles ou triples le long des tiges
= au bout, boucle sans appariements de bases
33
ARN: structure tertiaire
- ARNt: la molécule se replie sur elle-même en forme de L
- ARNr: certains ont une activité catalytique et acquièrent une structure 3D, comparable à celle des protéines
34
ARN: classification (différents types d'ARN)
- ARNm: ARN messager
- ARNt: ARN de transport
- ARNr: ARN ribosomal
35
ARN messager
- l'ARNm est transcrit à partir d'un gène codant une protéine
- le seul type d'ARN qui est traduit en protéine
36
ARN de transfert
- petite molécule d'environ 80 ribonucléotides
- transcrit à partir d'une partie d'un gène mais pas traduit en protéine
= sert d'adaptateur entre l'ARNm et les acides aminés lors de la synthèse protéique
- structure secondaire en forme de trèfle à 5 tiges
37
ARN de transfert: structure secondaire en forme de trèfle à 5 tiges
- le long des tiges: les bases azotées qui se font face établissent des liaisons H
- dans les boucles: les bases ne forment pas de liaisons H (elles sont trop éloignées)
38
ARN ribosomal
- transcrit par une partie de gène, mais pas traduit en protéine
- retrouvé dans les ribosomes
- ARN la plus abondante dans les cellules
39
ribosome
- composante cytoplasmique comprenant:
= ARN ribosomal (60% de sa masse)
= protéines ribosomales (40% de sa masse)
40
ribosome et sous-unités
- ribosome a des sous unités, une petite et une grosse
= elles sont utilisées séparémment, jusqu'à ce qu'elles soient utilisées ensemble pour la synthèse protéique
- les ribosomes et sous-unités se décrivent par leur taux de sédimentation
