Cours 8 - Régulation entre l’ADN et le Phénotype

Question 1

Vrai ou Faux

L’ADN est composé à environ 25% de séquence codante

Answer 1

Faux

Seulement 1.5% du génome code pour des protéines

Question 2

L’ADN mitochondriale contient combien de gènes

Answer 2

Entre 3 et 67 gènes selon les espèces

Question 3

Vrai ou Faux

La densité génique augmente avec l’évolution

Answer 3

Faux

C’est l’inverse (plus grand génome mais pas plus de gènes)

Question 4

Nommer 2 impacts de variabilité dans la régulation de la transcription (région non-codante)

Answer 4

• Pénétrance

- Expressivité

Question 5

Qu’est-ce qu’un SNP

Answer 5

Il s’agit d’une point de polymorphisme simple (un nucléotide différent)

Question 6

Quelle est la différence entre un allèle et un variant

Answer 6

• Un allèle est une variation dans un gène
• Un variant est une variation dans l’ADN intergénique
• • 95% des SNP sont dans l’ADN intergénique **

Question 7

Vrai ou Faux

Un individu hétérozygote pour l’allèle mutant démontre une faible expression de l’allèle fonctionnel

Answer 7

Faux

Ça va dépendre de la régulation

Question 8

À quoi sert un marqueur d’expression

Answer 8

Voir où la protéine est exprimé (Sa régulation)

** On ne voit pas la protéine en soit **

Question 9

La polydactylie est du à quoi

Answer 9

À un problème de régulation du gène SHH

** La protéine est fonctionnelle (PAS du à un protéine mutée) **

Question 10

Vrai ou Faux

La zone ZRS est très loin physiquement du gène SHH

Answer 10

Faux

Malgré qu’elle se situe à plus d’un milion de paires de bases, elle est proche physiquement (boucle)

Question 11

Qu’est-ce que la zone ZRS

Answer 11

• Une région conservé au cours de l’évolution qui régule SHH

- Une mutation dans cette région peut causer la polydactylie ou moins de doigts

Question 12

Vrai ou Faux

Un SNP dans une région à plus d’un million de paires de base d’un gène peut affecter sa régulation

Answer 12

Vrai

Ex: ZRS et SHH

Question 13

Qu’est-ce que l’épigénétique

Answer 13

Des changements stables et transmissibles lors de la mitose, causés par l’activation et la désactivation des gènes par une modification de l’accès à l’ADN et aux gènes transcrits.
** Sans altération des séquences de nucléotides **

Question 14

Comment est influencé l’épigénétique

Answer 14

Par des conditions environnementales interne (Âge, sexe, etc) et externe (Ex: famine, température, etc)

Question 15

Qu’est-ce que l’épigénétique influence

Answer 15

• La pénétrance
• L’expressivité
• • Modifications essentielles pour l’établissement du destin cellulaire **

Question 16

Expliquer le processus d’extinction des gènes

Answer 16

• L’ajout de groupement de méthyle DIRECTEMENT sur l’ADN (sur les A ou C) marque la région pour la formation d’hétérochromatine
  => Les groupements méthyles sont conservés pendant la mitose
  => Leur présence active la méthylation sur le brin complémentaire
  ** Pour toujours **

Question 17

Nommer 2 types d’épigénétique

Answer 17

• Le processus d’extinction (Agit sur l’ADN directement)

- Les complexes remodelant (Agit sur les histones)

Question 18

Expliquer le processus des complexes remodelants (2)

Answer 18

• Ajout d’un groupement méthyle sur les histones marque la région pour la formation d’hétérochromatine
• Ajout d’un groupement actéyle ou phosphate neutralise la charge des histones => Facilite l’accès à l’ADN => Augmente la transcription
• • Modification post-traductionnelle possible => Permet de moduler la condensation **

Question 19

Nommer un exemple de maladie lié à l’épigénétique

Answer 19

Syndrôme de X-fragile:
- Îlots CpG
- Sur le chromosome X
=> Induit la méthylation du promoteur du gène FMR1

Question 20

Vrai ou Faux

La méthylation de l’ADN et des modifications post-traductionnelle des histones sont maintenues lors des mitoses

Answer 20

Vrai

Question 21

Vrai ou Faux

La méthylation de l’ADN et des modifications post-traductionnelle des histones sont maintenues lors de la méïose

Answer 21

Faux

La méthylation est retiré lors de la méïose et de la formation de gamètes

Question 22

Vrai ou Faux

Il peut y avoir de l’hérédité transgénérationnel des modifications épigénétiques

Answer 22

Faux

• Il y a un effacement massif des marques épigénétiques
• Il y a l’apparence d’hérédité transgénérationnelle du au contact entre les cellules de la F1 avec la F2

Question 23

Qu’est-ce que le phénomène de l’empreinte génétique

Answer 23

L’empreinte génétique est un phénomène où une des deux copies (soit maternelle ou paternelle) est gardée silencieuse par la méthylation.
** Normalement les mammifères les 2 copies sont exprimées de façon semblable **

Question 24

Qu’est-ce que les maladies d’empreinte

Answer 24

Une maladie pour laquelle il y a une pénétrance spécifique selon le parent d’origine.
Ex: - La copie paternelle est silencieuse
=> Les enfants d’un père atteint seront porteur mais sains
=> Les enfants d’une mère atteint seront malade

Question 25

Décrivez le développement des empreintes génomiques

Answer 25

1) Effacées dans les cellules primordiales 2) Établies pendant la gamétogenèse 3) Maintenues dans l'embryon

Question 26

Quelle est la cause du syndrôme d'Angelman

Answer 26

Causée par la délétion d'une portion du chromosome 15 maternel comprenant un gène important ** Il s'agit d'une maladie d'empreinte transmise seulement par la mère **

Question 27

Qu'est-ce que la compensation de dosage

Answer 27

Le processus par lequel l'expression des gènes portés par le chromosome X est quantitativement équivalente chez le mâle et la femelle, suite à l’inactivation des chromosomes X supplémentaires.

Question 28

Pourquoi le processus de compensation de dosage est important

Answer 28

Car l'humain est sensible au dosage chromosomique (Cause généralement la mort précoce du foetus)

Question 29

Comment nomme-t-on le chromosome X inactivé chez la femelle

Answer 29

Un corpuscule de Barr

Question 30

Vrai ou Faux | L'inactivation d'un chromosome X chez la femelle est aléatoire

Answer 30

Vrai (Au début) Après la première inactivation, l'inactivation est maintenue à travers les divisions cellulaires (Toute la descendance d'une cellule portera le mm chromosome X inactivé

Question 31

À quel stade du développement le deuxième chromosome X des femelles est désactivé

Answer 31

Au stade blastocyte

Question 32

Qu'est-ce que XIST (1)

Answer 32

Un long ARN non-codant

Question 33

Quel est le rôle de XIST

Answer 33

Le chromosome qui l'exprime (paternel ou maternel) sera inactivé

Question 34

Expliquez le mécanisme de XIST

Answer 34

- Il recrute une histone méthyle-transférase (PRC2) => Le chromosome devient inaccessible à la machinerie de transcription => Il se condense en hétérochromatine => Devient le corpuscule de Barr

Question 35

Nommer 2 similarités entre la souris et l'humain pour l'inactivation du chromosome X

Answer 35

- Doit toujours se faire tôt dans le développement | - Reste aléatoire au final.

Question 36

Nommer 1 différence entre la souris et l'humain pour l'inactivation du chromosome X

Answer 36

Chez la souris, on observe une première phase où il y a empreinte génétique dans l'inactivation (PAS chez l'humain)

Question 37

Vrai ou Faux | XIST n'est pas exprimé chez les hommes

Answer 37

Vrai ** Le niveau d'expression de XIST augmente de manière proportionnelle au nombre de X présent (plus de X, plus de XIST!) **

Question 38

Vrai ou Faux | Le nombre de corpuscule de Barr est égal au nombre de chromosome X chez un individu

Answer 38

Faux | Nombre de corpuscule de Barr = (Nombre de chromosome X) - 1

Question 39

Expliquer l'exemple du pelage bicolore des chats

Answer 39

- La couleur du pelage est déterminé par un gène sur le chromosome X => Seul les femelles hétérozygotes peuvent être bicolore