Culture pure Flashcards
(33 cards)
Y a t’il beaucoup de bactérie dans l’environnement?
biodiversité extrêmement élevé. exemple: microflore humaine ( peau, muqueuse) buccale (700 espèces microbiennes) éternuement 10^4 à 10^5 microorg. intestinale 10^11 microorg. /g sol = 10^9 microorg. /g En nature : culture mixte!!!
Nomme les 4 méthodes de sélections.
- méthode d’enrichissement
- méthode chimique
- méthode physique
- méthode biologique
Décrit moi la méthode d’enrichissement.
But: augmenter la proportion du microorg. d’intérêt
Doit tenir compte: 1. proportions de l'espèces d'intérêt 2. vitesse de croissance 3. caractéristiques spécifiques chimiques, physiques et biologiques
Décrit moi la méthode chimique
Enrichir le milieu de culture. Nutriments ou source E particulière au microorg.
source de Carbone: cellulose ou CO2
source d’azote: N2
Par rapport à la méthode chimique, nomme des substances inhibitrices.
Colorant: violet de cristal, vert brillant ( dim. Gram+)
Alcool phenyléthyline: (dim. Gram -)
Sels biliaire ( agents chaotrophiques)—désoxycholate de Na : sélection de bactéries entériques ( organismes intestinaux) et milieu MacConkey (favorise la croissance de bactéries entériques), ( gram -, lactose +-)
Pour ce qui est de la méthode chimique, à t’on des exemples de milieu diluée?
- Caulobacter— eau douce milieu oligotrophe (rare+nourriture) donc milieu pauvre en nutriment.
- Peptones 0,01% vs 2% (autres espèces) nourriture rare mais capacité capture nutriments efficaces donc quantité moins importantes nécessaire dans env.
Décrit moi les méthodes physiques.
Traitement à la chaleur 80 deg Cel, 10 min— endospores (seuls org. prod. endospores)
Dessication : 10 jours en présence de dessicant (streptomyces)—élimine l’eau
Temp d’incubation particulière
Taille cellulaire (filtre o,22 u (treponema denticola)
décrit moi la méthode biologique.
(par infection expérimentale)
1) pahogénicité
mycobacterium leprae : lépromes (lèpres/incultivable in-vitro)
Bactéries dans le sang (septicémie)
Bactéries dans liquide céphalorachidien
2) Symbiose
Plante-Rhizobium: Nodules
De quoi sont inspirés les méthodes de sélections?
inspirées des méthodes de la sélection dans la nature ( basées sur des conditions de section existant naturellement)
Définition d’une culture pure.
population de microorg, ou tous les individus ont les mêmes caractéristiques (population homogène).
- Provient de la multiplication d’une ou quelques cellulles identiques (reproduxtion asexuée)
Colonie pure = culture pure???
Dépend!
1) si échantillon biodiversité grande ? ( plus c’est grand , plus probabilité qu’il y ait + d’un type de microorg.)
2) Présence biofilm/glycocalyx—absorption de plusieurs cellules (1 seule colonie)
3) plusieurs séquences d’isolement.
Quels sont les 3 types d’ensemencements
ensemencement en tries, en surface ou en profondeur. striation sur milieu solide (milieu gélosé)
explique la striation
striation sur milieu gélosé :
fil à boucle
série de stries successives -stérilisation du fil entre séries - épuisement quantité des colonies pour isoler colonie spécifique
Qu’elles sont les limites de la striation sur milieu gelosé?
si proportion diminue de lespece alors, perte de l’échantillon désirée ( non visible)
Dilution séquentielle en milieu liquide suivies d’un étalement
1) dilution
2) en surface du milieu ((à l’aide d’une tige plastique stérile) croissance sur la surface)
En profondeur ( gélose de surface, dépend différente concentration d’agar (45 deg Cel)— répartition avec la gélose (form. gélose de surface)
uniformisation afin d’atteindre un milieu dilué (croissance en profondeur)
colonies envahissantes (cell. emprisonnées dans agar) Met en surface afin de limiter impacts.)
limites de la dilution
proportion diminuer espèce d’intérêt, bact. thermosensibles ( gélose de surface 45 deg Cel)
Avantages: quantif.
Nomme les organismes de référence pour les souches-types
American Type Culture Collection
National Collection of Type Culture (UK)
Japan collection of organisms
Caractères culturaux
Milieu solide
- Caractérisitque coloniales (même milieu/colonies isolées/Diff.-contamination ou mutants?)
- Taille
- Marge (bord, surface, dentelé, filamenteuse, lobée)
- Élévation (plate, convexe, bombée)
- Texture (Mucoide (contient muccus), sèche, cassante)
- Caractéristique optiques (opaque, transclucide, transparent)
- Pigmentation (typique culture +Temp)—distinguer une colonie diffusion—-pigment hydrophile.
- Autres (hémolyse gélose sang) (fluorescent phosphorescent)
Milieu liquide
- Quantité de croissance cellulaire
- Distribution
- Texture
De nos jours , retour étude cultures mixtes
technique à la base de la microbiologie.
Donne un exemple d’oublis de ces techniques.
confusion E.coli/ S.cerevisiae
pigment vert d’e.coli.
colonie ne veut pas dire culture pure savoir pourquoi;)
Décrit brièvement ce qu’est un biofilm.
Forme de croissance ubiquitaire dans les environnement aqueux.
Les biofilms sont composés de populations microbiennes enrobées d’une matrice de polymères extracellulaires où les cellules adhèrent les une aux autres ou à une surface/interface.
Présence de plusieurs microorg.
Très ancienne (stromatolithes—forme de vie prédominante datant de 3,5x10^09 à 5x10^6 ans)
Décrit les surfaces des biofilms.
inorganiques (minerais, métal, plastiques,etc)
organiques (vivants ou morts)
Flocs (agrégats microbiens)—macro-colonies libres en suspension donc pas attachés `des surfaces)
Qu’elles sont les avantages pour les bactéries d’avoir des matrices dans biofilms.
1) accès plus grand aux nutriments
2) création d’un microenv.
3) favorise croissance
différence entre les cellules plantoniennes et les cellules en biofilms (sessiles) attaché/fixé à biofilm?
planctoniques: unicellulaire
Sessiles: pluricellulaire
-échanges nutriment, signaux mol (senseurs de masse critique :quorumsensing)
*devient comme une cellule dans un groupe (comme pluricellulaire
Quelles sont les 5 étapes de la formation d’un biofilm?
1) attachement à une surface
2) Stabilisation de l’attachement
3) Formation de micro-colonies
4) Maturation du biofilm
5) Essaimage
