Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

BIOS2910 > DNA repliction > Flashcards

DNA repliction Flashcards

(42 cards)

Start Studying
1
Q

Hvordan blir DNA sekvensen determinert ved replikasjon?

A

Sekvensen til en strand bestemmer sekvensen til den komplementære stranden.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hva er de to nøkkel substratene ved DNA-syntese?

A
  • Byggeklosser: dNTPs

- Startpunkt: primer/template junction

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvordan blir DNA syntetisert?

A

Utvider 3’-enden av primeren

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hva er den drivende kraften ved DNA syntese?

A

Hydrolyse av pyrofosfat (2Pi).

Hvor hydrolyse er opptak av vann…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvordan blir riktig base inkorporert, og hvorfor er det bare deoxy-nukleotider?

A
  • Kinetisk rettlesning: 10000x raskere ved riktig dNTP vs feil
  • Spesifikk geometri og distanse
  • Med rNTP blir det feil geometri pga ekstra hydroksyl-gruppe.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hva er en kilde til feil inkorporering av nukleotider?

A
  • Tautomeric shift: baser kan flippe i «feil» tautomeric form -> feil baseparing.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvordan rettleser DNA polymerase?

A
  • Ved exonuclease: fjerner feil base
    • Mistmatch DNA endrer geometrien ved det aktive setet -> senere rate.
    • Flere basepar av ssDNA beveger seg til exonuclease setet.
    • Etter exonuclease beveger 3’-OH enden tilbake til det aktive setet.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hva er processivity?

A
  • Antall dNTP polymerisert hver gang enzym binder til primer templat.
  • DNA pol er et processive enzym
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hva menes med replikasjon gaffelen?

A
  • Begge strandene repliserer samtidig. To polymeriserings reaksjoner nær hverandre. Y-formet junction = replikasjons gaffel.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hva er primase?

A

Spesialisert RNA polymerase, lager korte RNA primere, er startpunkt for DNA polymerase.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvor går «leading strand»?

A
  • DNA pol «jager» replikasjons gaffelen, går i samme retning.
  • Motsatt for «lagging strand».
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvilke steg er det for replikasjon gaffel åpningen?

A
  1. Strand separasjon

2. RNA primase og fjerning av RNA primer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hva er oppgaven til DNA helicase?

A

Unwind heliksen ved hjelp av ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hva er oppgaven til topoisomerase?

A

Fjerner positiv supercoiling,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hva er oppgaven til

SSB?

A

Proteiner som beskytter ssDNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hva er MCM komplekset?

A
  • DNA helicase i eukaryote
  • Ringformet hexamer
  • Human helicase: MCM2-7 kompleks
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hvor mange DNA pol inngår i eukaryot DNA replikasjon?

Study These Flashcards
A

Samarbeid mellom 3 DNA polymeraser

18
Q

Hva gjør DNA pol α?

Study These Flashcards
A

Starter DNA replikasjon etter binding av primase

19
Q

Hva gjør DNA pol ε?

Study These Flashcards
A

Syntetiserer leading strand -> mer processive enn DNA pol α.

20
Q

Hva gjør DNA pol δ?

Study These Flashcards
A

Syntetiserer lagging strand -> mer processive enn DNA pol α

21
Q

Hva gjør at DNA pol δ og ε har høyere processvity enn DNA pol α?

Study These Flashcards
A
  • Det kommer av sliding camp.
  • Sliding camp er et donutformet kompleks som omringer DNA.
  • Reduserer dissosiering av DNA pol
22
Q

Hvordan festes sliding camp?

Study These Flashcards
A

Via en clamp loader -> åpner sliding camp ved å bruke ATP -> kan «omsluke» DNA’et.

23
Q

Hva heter alle proteinene som inngår i replikasjons gaffelen?

24
Q

Hvordan samarbeider DNA pol i replikasjons gaffelen?

Study These Flashcards
A
  • Via et stort proteinkompleks med flere DNA pol.
  • E.coli: 3 kopier av DNA pol III + 1 kop av 5-subenhet sliding clamp loader med sliding clamp + 3 koper av τ protein som holder hver sin DNA pol III.
25
For prokaryote. Hva gjør DNA pol I og III?
- DNA pol I: RNA primer fjerner, DNA reparering. | - DNA pol III: Kromosom replikasjon.
26
Hva heter det bestemte området DNA replikeres fra?
Replicon
27
Hva heter startpunkter for DNA replikasjon?
-Origin of replication (ori), det er AT-rikt DNA sekvenser i E.coli.
28
Hva kalles cis-elementet/DNA sekvensen som trengs for replikasjon initiering?
Replicator (> ori)
29
Hva kalles proteinet som gjenkjenner elementene på replicator?
Initiator
30
Hva er replikator sekvenser?
Initiator-bindings sete + lett avtvinnet AT-rikt DNA.
31
Hva består replikator OriC i E.coli av?
- 5x 9-mer: initator vil binde hver 9-mer | - 3x 13-mer: AT-rikt seter for åpning og avtvinning.
32
Hvordan er re-initiering kontrollert i bakterier?
Dam/SeqA axis
33
Hvor ofte skjer replikasjon per cellesyklus?
Eksakt 1, dette skjer ved tidsmessig separasjon av MCM2-7 helicase.
34
Når bli eukaryotisk helicase loaded?
I G1 fase i celleskyklus. Er strengt regulert.
35
Hvordan får man tidsmessig (temporal) kontroll av DNA replikasjon, for å unngå re-replikasjon?
Prokaryote: Bakterier bruker DNA metylerings-basert mekanisme. Eukaryote: MCM helicase regulering -G1: helicase loading -> ingen helicase aktivering. - S, G2, M: ingen helicase loading -> helicase aktivering.
36
Når blir eukaryotisk helicase aktivert?
- S-fase i cellesyklus. Siden to kinaser blir aktivert -> DDK + CDK. Etter en kaskade av reaksjoner vil helicasene splitte opp og binde ssDNA på vanlig vis. - Altså aktivering skjer fra dsDNA-binding -> ssDNA-binding.
37
Hvilke problem er knyttet til slutten av transkripsjon?
- Ingen templat for siste RNA primer på lagging strand. | - Ekstreme ender kan ikke bli replikert.
38
Hva er telomerer og hvilken funksjon har de?
- Telomerer er endene på kromosomene. - Spesialisert origin of replication hvor telomerase fasiliteter slutt replikasjon. - Består av tandem repitert DNA - Beskytter DNA og forhindrer at andre kromosom fusjoneres sammen. - Telomerer forkortes litt etter hver celledeling.
39
Hva er Telomerase?
- Spesialisert DNA pol som replikerer telomerer. - Telomerase RNA består av korte sekvenser som er komplementær til telomer repeat. - Telomerase inneholder RT-polymerase (reverse transcriptase) som lager DNA fra RNA templat.
40
Hva er hTERT?
Humant Telomerase reverse transcriptase -> DNA pol som forlenger telomerer.
41
Hva er en av grunnene til aldring?
forkortning av telomerer
42
Hva angriper en av de mest effektive anti-cancer chemotherapy medisiner?
De angripe DNA replikasjon

BIOS2910 (8 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions