Eksamen 2021 Flashcards
(5 cards)
A (25%) Redegør kort for, hvilken effekt en øget aktivitet af en sådan efflux transporter viø have på MIC (minimal inhibitory concentration) for et givet antibiotikum der er substrat for efflux transporteren (antag at det skal ind i cytoplasma for at udøve sin effekt)
MIC er den mindste koncentration der er brug for, for at dræbe bakterier. Så en øget aktivitet af efflux transporter, vil betyde at en større del af det givne antibiotikum vil blive transporteret ud i stedet for at virke på bakterierne. Her med vil MIC stige.
MdtK kobler antiport til transport af Na+ og udnytter dermed, at der er en Na+-gradient fra cellens ydre mod cellens indre, som kan drive efflux af fx antibiotika.
B (25%) Redegør kort for, over hvilken membran Na+-gradienten vil forekomme, den ydre eller den indre cytoplasmatiske membran
Na+-gradienten vil forekomme i det indre cytoplasmatiske membran, fordi det ydre membran indeholder poriner der tillader metalioner herunder Na+ at passerer frit. Poriner findes ikke i den indre cytoplasmatiske membran.
MdtK er et membranbundet protein. Nedenfor finder du to primærsekvenser fra MdtK på hver ti aminosyrer.
- Met-Gln-Lys-Tyr-Ile-Ser-Glu-Ala-Arg-Leu
- Leu-Leu-Ala-Leu-Ala-Ile-Pro-Val-Ile-Leu
C (25%) Redegør kort for, hvilken af de to sekvenser der sandsynligvis er cytosolisk hhv. ligger i lipidmembranen (transmembranelt)
Sekvens nr. 2 består udelukkende af non-polære aminosyrer, mens sekvens nr. 1 indeholder 6 polære eller ladede aminosyrer ud af de 10. da transmembranelle dele af et protein typisk består af non-polære aminosyre er det mest sandsygeligt at sekvens nr. 1 er cytosolisk og sekvens 2 er transmembranelt.
En specialestuderende på Inst. for Lægemiddeldesign og Farmakologi arbejder med at teste nye typer af antibiotika. Hun vil gerne teste, om hendes nye antibiotika pumpes ud ad E. coli via MdtK. For at teste dette, udtrykker hun MdtK i en eukaryot cellelinje, der ikke påvirkes af antibiotika. Hun inkuberer først cellerne med en radioaktiv udgave af hendes stof og måler derefter på efflux af det radioaktive stof (altså det modsatte af, hvad du gjorde i øvelsen, hvor du målte influx).
Nedenfor ses en tabel med den beregnede efflux-hastighed som funktion af den koncentration af stof, hun inkuberede cellerne med. Hun lavede forsøg med to forskellige stoffer, stof A og B.
D (25%) Beregn den maximale efflux-hastighed (Vmax) der kan opnås for hhv. stof A og B. Redegør derefter kort for, hvilken af de to stoffer hun bør udvikle videre på som et muligt nyt antibiotikum.
Hun burde arbejde videre med stof A da den har den laveste Vmax af de to og dermed kan forventes at blive pumpes ud af bakterien med en lavere hastighed og dermed har stof A en bedre chance for at virke.