Enzymologie (Tailleux) Flashcards
(34 cards)
Définition enzyme?
catalyseur d’une réaction chimique dans un milieu biologique
Définition Substrat?
Molécule qui entre dans une réaction catalysée par une E pour y être transformée
Définition du Produit?
Molécule qui apparaît au cours de la réaction catalysée par l’E
Illustration de la réaction enzyatique via une équation?
E+S←→ES (E et S unis)←→ E+P
Quelles sont les caractéristiques essentielles des enzymes?
• Ce sont des protéines (! Exception: ribozymes)
• Leur taille:
Variable, de plusieurs 10² à plusieurs 10³ AA. De manière générale, Taille E»_space;> Taille S
• Spécificité:
Spécificité vis à vis de la réaction qui va être catalysée.
• A la fin de la réaction, E régénérées et non modifiées
• Catalyseurs puissants
x10⁶
• Fonctionnement autonome
→ études in vitro (à extraire avec précaution pour préserver leur structure, donc attention au pH, T°, milieu d’extraction)
Quelques exemples d’enzymes?
- Peptidases
- Glucokinase
- Hexokinase
- Glucosidases
Caractéristiques de la glucokinase?
– phosphoryle le glucose uniquement
– hépatocytes
– Km élevé→ basse affinité glucose,
– régulé par le glucose 6 phosphate),
Cractéristiques de l’hexokinase?
– phosphoryle toutes les hexoses, dont le glucose
– ubiquitare
– Km bas → forte affinité glucose
Quel est le rôle des glucosidases?
coupent les glucoses (alpha et bêta glucosidases)
Que permettent notamment l’observation des réactions biochimiques in vivo?
Permet la connaissance du métabolisme: structure, propriétés, régulation des E…
Que se passe-t-il lorsqu’il y a déficit d’une enzyme?
accumulation du substrat et déficit de produit
Quelles sont les applications de l’enzymologie?
♣ Réactions biochimiques in vivo
♣ Pathologies liées à un déficit enzymatique
♣ Cibles thérapeutiques
♣ Marqueurs de pathologies
♣ Outils de mesure de concentration en substrats
Deux exemples d’utilisation des enzymes comme cibles thérapeutiques?
- La biosynthèse du cholestérol: HMGCoA (via HMGCoA qui est inhibé par les statines) → Acide mévalonique → Cholestérol
- Acide Arachidonique → PGH2 (Via COX: inhibition avec aspirine) → prostaglandines, thromboxanes → explique ses propriétés anti-inflammatoire, anti-pyrétique, antalgique, anti-coagulant
Comment les enzymes peuvent-elles être utilisées comme marqueurs de pathologies?
Analyses biomédicales. Sur prélèvement sanguin: mesure de l’activité d’E (réactifs, dosages standardisés, automatisées)→ marqueurs pour aide au diagnostic
Trois exemples d’utilisation d’enzymes comme marqueurs de pathologies?
- CPK et infarctus du myocarde: en cas d’Infarctus, présence +++ de CPK dans la circulation → indicateur
- transaminases et cytolyse hépatique
- Amylase et pancréatite
Comment les enzymes peuvent-elles être utilisées comme outils de mesure de concentrationd en substrats?
Analyses biomédicales, Méthode de dosage enzymatique colorimétrique
Un exemple d’utilisation des enzymes comme outils de mesure de concentrationd en substrats avec le dosage du glucose?
Ex: dosage du glucose:
Glucose → (via glucose peroxydase) Acide gluconique + H2O2
H2O2 + chromogène → (via peroxydase) Chromogène coloré
(même système avec le cholestérol)
Les trois différentes nomenclatures des enzymes?
- Nom commun→ aucune indication sur la réaction, le substrat, etc.
- Nomenclature fonctionnelle: nom du S + type de réaction catalysée + suffixe -ase
- Nomenclature officielle: commission des enzymes
Détailler la nomenclature officielle des enzymes
1 enzyme = EC suivi de 4 chiffres:
• X1: classe
• X2: sous-classe
• X3: substrat spécifique ou coenzyme
• X4: numéro d’ordreLes 6 classes d’enzymes?
◦ EC1: Oxydoréductases
◦ EC2: Transférases
◦ EC3: Hydrolases
◦ EC4: Lyases
◦ EC5: Isomérases
◦ EC6: LigasesDu point de vue thermodynamique, comment observe-t-on le pouvoir catalytique de l’enzyme?
Variation d’énergie libre au cours de la réaction. L’enzyme diminue DG* sans changer DG (D= delta) → elle augmente la vitesse de la réaction.
Où se situe le site actif?
Le site actif est toujours dans une zone interne de l’enzyme
De quoi le site actof est-il composé?
Il comprend deux parties: le site de liaison, une partie de l’enzyme constituée des AA qui vont se lier au substrat
Elle comprennent aussi le groupe (ou site) catalytique, contenant les AA qui vont opérer la réaction
De quelle nature sont les liaisons site actif-AA?
Ce sont généralement des liaisons non covalentes, mm si elles peuvent parfois être covalentes
