Genetika bakterij in njihovih virusov

Question 1

S katerim procesom bakterije izmenjujejo gene?

Answer 1

S konjugacijo

Question 2

Kako proces konjugacije uporabimo za katriranje genov?

Answer 2

Konjugacija se začne na “O mestu” na plazmidu in od tega trenutka lahko mapiramo kako dolgo časa traja, da se vnese posamezen gen

Question 3

Kako pride do interakcij med genomi fagov in genomi bakterij?

Answer 3

Ko fag okuži bakterijo, vanjo vnese svojo DNA. Včasih namesto lastne DNA v nove fage “zapakira” bakterijsko DNA

Question 4

Kako lahko kartiramo genom bakteriofaga?

Answer 4

Ko se v bakterijsko DNA vključi virusna, lahko kartiramo, kateri geni so to

Question 5

Kako bakterije pridobivajo novo DNA (3 načini)?

Answer 5

konjugacija
transformacija
transdukcija

Question 6

Kako se razmnožujejo fagi?

Answer 6

Tako da okužijo bakterijo in uporabijo njen metabolizem za izgradnjo svoje DNA in proteinov, nato zapustijo bakterijo

Question 7

konjugacija

Answer 7

združitev dveh različnih celic

Question 8

transformacija

Answer 8

pridobitev genetskega materiala iz okolja

Question 9

transdukcija

Answer 9

pridobitev genetskega materiala bakterije v genom faga (in nato v drugo bakterijo)

Question 10

rekombinacija fagov

Answer 10

ko dva genetsko različna faga okužita isto bakterijsko celico

Question 11

prototrof

Answer 11

organizem, ki raste na minimalnem mediju (gojišču)

Question 12

auksotrof

Answer 12

mutant, ki ni sposoben sintetizirati določene komponente (npr. aminokisline)

Question 13

odporni mutant

Answer 13

mutant, ki lahko raste v prisotnosti inhibtorjev, antibiotikov

Question 14

faktor F

Answer 14

fertilni faktor, ki genetsko pogojuje lastnost donorstva pri konjugaciji

Question 15

plazmid

Answer 15

majhna krožna DNA, ki ni del osnovne DNA, nosi pa pomembne gene za preživetje določenih razmer

Question 16

pilus

Answer 16

tvorba, prek katere v konjugaciji donor vzpostavi stik s prejemnikom

Question 17

pomnoževanje kotalečega kroga

Answer 17

proces v katerem na osnovi plazmida F nastane enoverižna kopija, ki se prenese v prejemnika, kjer se sintetizira še komplementarna veriga

Question 18

Hfr sev

Answer 18

“high frequency recombination” - sev, ki ima F faktor integriran v kromosom in pr križanju z F- sevom producira 1000x več rekombinant in (skoraj) nobenega starša ne pretvori v Hfr (oz. F+)

Question 19

ekskonjugant

Answer 19

bakterija, ki ima poleg svojega genoma prisotno še drugo (tujo) DNA in je morala prisostvovati v konjugaciji

Question 20

Linearni prenos Hfr genov

Answer 20

donorski aleli se pojavijo v prejemniku ob točno določenem času
donorski aleli se pojavijo v točno določenem vrstnem redu
“kasnejši” aleli so prisotni v manj celicah prejemnika

Question 21

Fino kartiranje z uporabo rekombinantnih frekvenc

Answer 21

da ekskonjugant prejme donorski element, se mora zgoditi rekombinacija - čas vstopa ni pogojen z rekombinantno frekvenco

Question 22

endogenot

Answer 22

kromosom prejemnika pri konjugaciji

Question 23

eksogenot

Answer 23

nepopolen fragment F+/Hfr seva pri konjugaciji

Question 24

Merozigot

Answer 24

delni diploid - ima zapis za isto lastnost na svoji DNA in na plazmidu

Question 25

R-plazmid

Answer 25

plazmid z lastnostno odpornostjo

Question 26

kompetentne bakterije

Answer 26

bakterije, ki smo jih pripravili tako, da so bolj dovzetne za transformacijo

Question 27

Kartiranje s transformacijo

Answer 27

če se spremenita dva gena, sta bila skoraj zagotovo na istem fragmentu - torej blizu skupaj

Question 28

lizija

Answer 28

bakterijska celica se odpre in sprosti fage

Question 29

lizat

Answer 29

populacija potomstva fagov

Question 30

lizogeni cikel

Answer 30

bakteriofagni genom je vgrajen v genom bakterije, do lizije pride le ob določenih signalih

Question 31

plak

Answer 31

prosojna točka, ki nastane na bakterijski kulturi, ki je bila okužena s fagom

Question 32

križanje fagov

Answer 32

če dva faga naenkrat okužita isto bakterijo, lahko "zapakirata" tujo DNA, ohranita pa svojo originalno infektivnost

Question 33

splošna transdukcija

Answer 33

lahko se prenaša katerikoli del genoma bakterije

Question 34

specializirana transdukcija

Answer 34

omejena na določen del genoma (v primeru, da je DNA faga vgrajena v DNA bakterije)

Question 35

poskus z U-cevjo

Answer 35

poskus, v katerem imamo cev v obliki črke U, ki ima na dnu filter, ki ločuje levo in desno stran cevi. Ves čas mešamo tekočino, ne mešajo pa se bakterije

Question 36

virulenten fag

Answer 36

takoj naredi lizijo celic in ubije gostitelja - litični cikel

Question 37

zmeren fag

Answer 37

lahko ostane v celici za določen čas, ne da bi jo ubil

Question 38

profag

Answer 38

fag, ki se integrira v genom bakterije in miruje

Question 39

lizogena bakterija

Answer 39

bakterija, ki v genomu nosi profag

Question 40

transpozon

Answer 40

DNA sekvenca, ki je sposobna samointegracije v bakterijski genom, mesto integracije je naključno