Genoomvolgorde Bepaling Flashcards
Wat is die genoomwye assosiasiestudie (GWAS)
Dis ń studie wat die gene kan identifiseer wat betrokke is by genetiese siektes, plantopbrengse en diere en vleisgehalte
Hoekom is “next generation sequencing” beter as sangervolgordebepaling?
Dis vinniger ( kan meer bp’s op ń slag bepaal) ( van 1000 bp na 13000000000 bp gegaan)
Dis baie goedkoper
Wat is die stappe vir NGS
- Berei genomiese DNS monster voor
Fragmenteer lukraak genomiese DNS stukke
2.Heg aan oppv aan binneknant van vloeistofkanaal - Brugversterking
- DNS word dubbelstring
- DNS denatureer en word weer enkelstring
- Volledige versterking
- Bepaal eerste basis
- Beeld 1 ste basis uit na laseropwekking
- Bepaal 2de basis
- Beeld 2 de basis uit
- Volgorde word oor veelvuldige siklusse gelees
- Belyn data en vergelyk met verwysing en identifiseer volgorde verskille
Wat kan genoomvolgorde bepaling nie doen nie?
Kan nie bepaal waar die geen uitgedruk gaan word nie
Hoe kan ons bepaal waar ń geen uitgedruk word
Deur die gebruik van transkriptomika
Neem RNA in verks stadiums van die uitdrukking van die geen
Skakel dit om in kDNS en grbuik MGS om geenvolgordes te vergelyk
Wat is die verksil tussen transkeiptoom en proteoom
Transkriptoom is die volledige stel RNS molekules wat in ń enkele populasie selle geproduseer word
Proteoom is die volledige stel proteiene in ń sel
Wat is metaboloom
Dis die volledige stel metaboliete in ń sel
Waarvoor kan omikas gebruik word
Om gene op te spoor wat met siektes verband hou
Wat is metabolomika
Die bepaling van hoeveel metaboliete in ń sel is
2 toipes
GC-MS (gaschromatografie- massaspetrometrie)
En
LC-MS (vloeistofchromatografie- massaspektrometrie)
Waarvoor word farmakogenomika gebruik
Om te bepaal hoe verskillende mense op medisyne reageer agv hul genetiese samestelling
