H1 lijstjes etc. Flashcards
(33 cards)
Moeilijke diagnose DM
- Op levend dier enkel door uitsluiting andere ziekten
- Onvolledige penetrantie
- Inwerking andere genen
- Interferentie DNA test = hetero lijkt homozygoot
Problemen monogenische aandoeningen
- Onvolledige penetrantie
- Variabele expressiviteit
Types DNA beschadiging
- Mismatch
- Verlies base
- Wijziging base
- Nick
- Dubbelstrengige breuk
- Covalente verbinding strengen
Soorten mutaties
- Kiemlijnmutaties
- Somatische mutaties
- Epimutaties
- Spontane mutaties
- Geïnduceerde mutaties
- Conditionele mutaties
- Mutaties met effect op expressieniveau
Spontane mutaties
- Replicatiefouten
- Strand slippage
- Ongelijke overkruising
- Spontane depurinatie
- Spontane deaminatie
- Tautomerisatie
Genetische anticipatie
Steeds erger wordend
Geïnduceerde mutaties
- Mutagene basenanalogen
- Intercalerende heterocyclische mutagenen
- Chemische mutagenen
- Straling
Mutaties op expressieniveau
- Silent mutations
- Neutrale mutatie
- Missense mutaties
- Nonsense mutaties
- Suppressormutaties
- Leesraammutaties
- Splice site mutaties
- Regulatorische mutaties
Allelen en genotypenfrequenties bepalen makkelijk
- Codominant
- Intermediair
Voorwaarden Hardy Weinberg
- Panmixie
- Geen selectie
- Geen mutaties
- Geen migratie
- Geen genetische drift
Reactienorm
Effect van milieu op allel
Mutatie snelheid
Kans dat nucleotide (allel) zal worden veranderd door mutatie
Wahlund principe
Terugdringen hoge frequentie schadelijk allel
Migratieconsequenties
- Egaliserende invloed tussen verschillende poulaties.
- Meer genetische diversiteit binnen conglomeraat populatie.
- Terugdringen homozygoot defect door inkruisen (sub)populaties.
Effecten (natuurlijke) selectie
- Directioneel
- Disruptief
- Stabiliserend
Algemeen selectiemodel
Voorspelling van het effect van selectie op allelen en genotypenfrequentie van een populatie.
Selectiecoëfficiënt
Hoe sterk tegen een bepaald geno/fenotype wordt geselecteerd
Selectietypes
- Directionele selectie tegen recessief allel a
- Directionele selectie tegen dominant allel A
- Onvolledige selectie dominant allel
- Selectie tegen heterozygoten/onderdominantie
- Selectie ten voordele van heterozygoten/overdominantie
Formule na directionele selectie tegen recessief allel a
p2 + 2pq + q2(1-s) = 1-sq2
Formule na onvolledige selectie tegen dominant allel A
p2(1-s) + 2pq(1-s) + q2 = 1-sp(2-p)
Formule na selectie tegen heterozygoten
p2(1-SAA) + 2pq +q2(1+Saa) = 1 + SAAp2 + Saaq2
Formule na selectie ten voordele van heterozygoten
p2(1-SAA) + 2pq + q2(1-Saa) = 1-SAAp2 - Saaq2
Inteelt
- Geen panmixie
- HWE verstoord
- Assortatieve paring
- Sterke invloed op genotypefrequenties
- Minder genetische variatie
- Vnl in kleine populaties
Inteelt/fixatiecoëfficiënt F
Kans dat 2 allelen IBD zijn