HC 24 Diagnostiek AML – cytogenetica

Question 1

Cytogenetica

Answer 1

• Constitutioneel: genetisch aangeboren afwijkingen
  o Prenatale cytogenetica: vruchtwater en vlokken diagnose voor de geboorte
  o Postnatale cytogenetica: bloed en weefsel diagnose na geboorte
• Verkregen
  o Tumor cytogenetica: beenmerg/tumorweefsel diagnose van de leukemie of tumor

Question 2

Chromosomale en genetische afwijkingen (verkregen)

Answer 2

1. Numerieke afwijkingen: chromosoom teveel/ te weinig
2. Structurele afwijking
   a. Gebalanceerd: er gaat geen genetisch materiaal verloren (Translocatie, inversie en insertie)
   b. Ongebalanceerd: er gaat wel genetische informatie verloren (Deletie, amplificatie, ongebalanceerde translocatie en genmutatie)

Question 3

CML chromosoom afwijking

Answer 3

• De philadelphia translocatie: t(9:22)(q34;q11)
  o Zorgt voor het oncogene eiwit BCR-ABL

Question 4

AML chromosoom afwijking

Answer 4

a. t(8:21)/(q22:q22): goede prognose
b. inv(16)/t(16:16): goede prognose

Question 5

Karyotypering

Answer 5

• Metafasen opnemen, analyseren en karyogram maken
• Karyotype: chromosomen bij elkaar opzoeken en dan kijken of ze wel geheel kloppen
• Er zijn goede en slechte risico afwijkingen

Question 6

FISH

Answer 6

• Probe: stukje DNA waarvan je exact weet waar het ligt
• Labelen met fluorescerende stof
• Metafase FISH: FISH op gekweekte (delende) cellen
  o lymfocyten, leukocyten (beenmerg/bloed), solide tumoren
• Interfase FISH: FISH op kernen van niet/slecht delende cellen

Question 7

FISH voordelen

Answer 7

• De cellen hoeven niet te delen om zichtbaar te zijn
• Het is een snelle analyse
• Detectie cryptische translocaties
• Er zijn weinig cellen nodig

Question 8

FISH nadelen

Answer 8

• Je kan alleen zoeken naar al bekende mutaties
• Gelimiteerde gevoeligheid voor afwijkingen
• Er kunnen niet veel targets tegelijk worden onderzocht

Question 9

SNP-array

Answer 9

• Er wordt gekeken naar het hele genoom ipv kleine
  stukjes
• De DNA streng van de moeder wordt vergeleken met die van de vader
• Zit er een mutatie in één streng dan zijn ze niet gelijk en
  kleurt het geel
• Alleen ongebalanceerde mutaties → er kunnen deleties
  en amplificaties mee bekeken worden