Intracellulär Trafik Flashcards
(47 cards)
Vilka tre generella transportmekanismerna för transport mellan kompartments?
Por-transport (gated transport)
Translokering
Vesikulär transport
Vilka typer av molekyler kan diffundera genom membran?
Små oladdade molekyler som O2, CO2, H2O, Urea, NO2 och små organiska syror som mjölksyra
Vad innebär Por-transport (gated transport)?
Öppna kanaler med samma miljö på båda sidor
Finns framförallt i kärnmembranet
Molekyler och joner kan passera fritt
Större molekyler som protein kan behöva en import-sekvens för att släppas in
Proteiner kan passera veckade
Vad heter den sekvens som ett protein behöver för att släppas in i kärnan?
NLS (Nuclear localisation signal)
Till denna sekvens binder Importin som hjäpler proteiner genom nuklear por
Vad heter den sekvens som behövs för att ett protein ska kunna ta sig ut ur kärnan?
NES
Nuclear export signal
Till denna sekvens binder Exportin
Vad innebär translokering?
Transport över ett membran mha en translokator - kräver ATP
Sker framförallt för import till ER och import till mitokondrien
Proteinet måste veckas upp för att kunna passera
Proteinet måste innehålla en ER-signalsekven
Vad innebär vesikulär transport?
Flyttar ämnen, molekyler och proteiner mellan kompartments utan att de passerar membran
Transport i en vesiken - membranbubbla
Sker mellan ER, golgi endosom, lysosom och PM
Vilka tre olika typer av coating finns det på vesiklar?
Clathrin
COP1
COP2
Vilket typ av coating har vesiklar som flyttas mellan plasmamembran - endosomalt nätverk - transgolginätverk?
Clathrin
Vilken typ av coating har vesiklar som transporterar inom golgi-nätverket och till ER?
COP1
Vilken typ av coating har vesiklar som transporterar från ER till Golgi?
COP2
Vad är ett adaptorprotein?
Ligger mellan coating och mambranet.
Binder coating och fångar in transmembranprotein och cargoreceptorer
Varför tillsätts SDS till protein som ska undersökas i elektrofores?
För att denaturera proteinet, förhindrar de festa icke-kovalenta interaktioner
Binder in till proteinet och ger en negativ laddning som motsvarar proteinets storlek
Varför tillsätts merkaptoetanol till protein som ska undersökas i elektrofores?
För att bryta disulfidbindingar och ge proteinet dess primärstruktur
Vad sker i Smooth ER?
Produktion av lipider Nedbrytning av gifter, cytokrom p450 Vesikulär transport Kolesterol Syntes av steroidhormoner
Vad sker i golgi?
O-glykosylering
Modifiering av N-glykosylering
Sortering av proteiner genom att sätta på en adresslapp
Klyvning av SREBP
Manning-6-P tagg
Vilka olika typer av transport sker i mellan golgis olika delar?
Organellutmognad
Vesikeltransport
Vad sker i RER?
- Proteinveckning
- Syntes av Transmembranprotein
- Translokering/retrotranslokering
- Viss translation
- Unfolded protein response
- GPI-förankrade proteiner bildas (proteiner sätts på)
- glykosylering av protein (N-glykosylering)
Vad är sarcoplasmatiskt retikelum?
Lager för Ca2+ i muskelceller. Sträcker sig mellan muskelceller, eftersom muskelceller är sammanvuxna
Hur går glykosylering av protein till (N-länkad glykosylering)?
Sker i RER
- Enzymet Oligosackaryl transferas överför en oligosackarid från Dolikol till proteinet
- Energin för att skapa den nya bindingen kommer från den högenergi-fosfatbinding som bryts
- Glykoproteinet trimmas sedan av ett glykosidas
- Är proteinet rätt foldat kan det nu lämna ER och transporteras till Golgi för fortsatt modifiering
- Är proteinet inte rätt veckat kommer ett glykosyltransferas att addera en glukosmolekyl dit chaperonet Calnexin kan binda
Vad är dolikol?
En membranbunden lipid som får sina socker-molekyler från cytosolen. Sedan flippas lipiden till ERs lumen
Vad händer om ett protein har genomgått flera cykler av glukosaddition och trimmning men ändå är felveckat?
Efter flera varv kommer en specifik mannons i glykosyleringen att plockas bort av mannosidas - detta markerar att proteinet ska retrotranslokeras till cytosolen och brytas ner
Translokatorn innehåller ett ubiquitin-ligase som märker proteinet med en ubiquitin-adresslapp så att det transporteras till proteasomen och bryts ner
Vad innebär unfolded protein response?
Om mycket felveckat protein bindas kommer transkriptionen av vissa gener öka.
- proteiner som hjälper till vid retrotranslokering av felveckat protein
- protein som behövs för nedbrytning av felveckat protein
- chaperoner som behövs för veckning av protein i ER
Vad gör Dynamin?
Ett protein samlas kring en buddings ”nacke” och hjälper membranet att smälta samman så att en vesikel bildas