Intracellulär Trafik Flashcards

(47 cards)

1
Q

Vilka tre generella transportmekanismerna för transport mellan kompartments?

A

Por-transport (gated transport)

Translokering

Vesikulär transport

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vilka typer av molekyler kan diffundera genom membran?

A

Små oladdade molekyler som O2, CO2, H2O, Urea, NO2 och små organiska syror som mjölksyra

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad innebär Por-transport (gated transport)?

A

Öppna kanaler med samma miljö på båda sidor

Finns framförallt i kärnmembranet

Molekyler och joner kan passera fritt
Större molekyler som protein kan behöva en import-sekvens för att släppas in

Proteiner kan passera veckade

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad heter den sekvens som ett protein behöver för att släppas in i kärnan?

A

NLS (Nuclear localisation signal)

Till denna sekvens binder Importin som hjäpler proteiner genom nuklear por

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad heter den sekvens som behövs för att ett protein ska kunna ta sig ut ur kärnan?

A

NES

Nuclear export signal

Till denna sekvens binder Exportin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad innebär translokering?

A

Transport över ett membran mha en translokator - kräver ATP

Sker framförallt för import till ER och import till mitokondrien

Proteinet måste veckas upp för att kunna passera

Proteinet måste innehålla en ER-signalsekven

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad innebär vesikulär transport?

A

Flyttar ämnen, molekyler och proteiner mellan kompartments utan att de passerar membran

Transport i en vesiken - membranbubbla

Sker mellan ER, golgi endosom, lysosom och PM

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vilka tre olika typer av coating finns det på vesiklar?

A

Clathrin
COP1
COP2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vilket typ av coating har vesiklar som flyttas mellan plasmamembran - endosomalt nätverk - transgolginätverk?

A

Clathrin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vilken typ av coating har vesiklar som transporterar inom golgi-nätverket och till ER?

A

COP1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vilken typ av coating har vesiklar som transporterar från ER till Golgi?

A

COP2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad är ett adaptorprotein?

A

Ligger mellan coating och mambranet.

Binder coating och fångar in transmembranprotein och cargoreceptorer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Varför tillsätts SDS till protein som ska undersökas i elektrofores?

A

För att denaturera proteinet, förhindrar de festa icke-kovalenta interaktioner

Binder in till proteinet och ger en negativ laddning som motsvarar proteinets storlek

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Varför tillsätts merkaptoetanol till protein som ska undersökas i elektrofores?

A

För att bryta disulfidbindingar och ge proteinet dess primärstruktur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad sker i Smooth ER?

A
Produktion av lipider
Nedbrytning av gifter, cytokrom p450
Vesikulär transport 
Kolesterol
Syntes av steroidhormoner
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad sker i golgi?

A

O-glykosylering
Modifiering av N-glykosylering

Sortering av proteiner genom att sätta på en adresslapp

Klyvning av SREBP

Manning-6-P tagg

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vilka olika typer av transport sker i mellan golgis olika delar?

A

Organellutmognad

Vesikeltransport

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vad sker i RER?

A
  • Proteinveckning
  • Syntes av Transmembranprotein
  • Translokering/retrotranslokering
  • Viss translation
  • Unfolded protein response
  • GPI-förankrade proteiner bildas (proteiner sätts på)
  • glykosylering av protein (N-glykosylering)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Vad är sarcoplasmatiskt retikelum?

A

Lager för Ca2+ i muskelceller. Sträcker sig mellan muskelceller, eftersom muskelceller är sammanvuxna

20
Q

Hur går glykosylering av protein till (N-länkad glykosylering)?

A

Sker i RER

  1. Enzymet Oligosackaryl transferas överför en oligosackarid från Dolikol till proteinet
  2. Energin för att skapa den nya bindingen kommer från den högenergi-fosfatbinding som bryts
  3. Glykoproteinet trimmas sedan av ett glykosidas
  4. Är proteinet rätt foldat kan det nu lämna ER och transporteras till Golgi för fortsatt modifiering
  5. Är proteinet inte rätt veckat kommer ett glykosyltransferas att addera en glukosmolekyl dit chaperonet Calnexin kan binda
21
Q

Vad är dolikol?

A

En membranbunden lipid som får sina socker-molekyler från cytosolen. Sedan flippas lipiden till ERs lumen

22
Q

Vad händer om ett protein har genomgått flera cykler av glukosaddition och trimmning men ändå är felveckat?

A

Efter flera varv kommer en specifik mannons i glykosyleringen att plockas bort av mannosidas - detta markerar att proteinet ska retrotranslokeras till cytosolen och brytas ner

Translokatorn innehåller ett ubiquitin-ligase som märker proteinet med en ubiquitin-adresslapp så att det transporteras till proteasomen och bryts ner

23
Q

Vad innebär unfolded protein response?

A

Om mycket felveckat protein bindas kommer transkriptionen av vissa gener öka.

  • proteiner som hjälper till vid retrotranslokering av felveckat protein
  • protein som behövs för nedbrytning av felveckat protein
  • chaperoner som behövs för veckning av protein i ER
24
Q

Vad gör Dynamin?

A

Ett protein samlas kring en buddings ”nacke” och hjälper membranet att smälta samman så att en vesikel bildas

25
Hur hittar en vesikel rätt target-membran?
- vesiklar har ytmarkörer som identifieras av receptorer på targetmembranet - Rab-protein på vesikeln binder till Rab- effektor på targetmembrenet - SNARE-protein hjälper till med fusionen av lipidlagren
26
Förklara THETHERING, DOCKING och FUSION
Thethering är när vesikeln får kontakt med targetmembranet, t.ex. mha av RAB protein och effektor DOCKING är när v-SNARE och tSNARE interagerar och tvinnas samman till en stabil 4-helix struktur - detta gör att vesikel- och targetmembran kommer tillräckligt nära varandra och H2O pressas bort FUSION är när membranet sammansmälter
27
Vad behövs för att SNARE-protein ska tvinnas upp och släppa från membranet?
ATP
28
Vad är Synaptobrevin och VAMP för sorts protein?
V-SNARE
29
Vad är Snap25 och Syntaxin för sorts protein?
t-SNARE
30
Vad händer med Rab efter docking av vesikeln?
Rab hydrolyserar sitt bundna GTP och dissocierar från membranet
31
Hur är små early endosomes märkta? Så att de kan fusera med varandra
Med Rab5
32
Vad innebär Autofagi?
”Self-eating” - när cellen gör sig av med delar som ej länbgre behövs via nedbrytning i lysosomen
33
När aktiveras Autofagi?
För att bilda specialicerade celler med annan organelluppsättning Vid svält eller infektion
34
Hur går autofagi till?
1. Fagosomalt membran bildas genom fusion av vesiklar 2. Membranet bildar en skålformad kurvatur runt cargot (dubbelmembran) 3. Omsluter cargot = autofagosom 4. Fusion med en lysosom, katalyserat av SNAREs 5. Det inre membranet och autofagosomens innehåll bryts ner
35
Vilka två olika typer av Autofagi finns det?
Icke-selectiv - respons på svält där nedbrytning behövs för cells överlevnad Selectiv - specifikt cargo som uttjänta organeller och invaderade mikrober
36
Vad menas med konstitutiv exocytos?
Oreglerad exocytos där vesiklar skickas direkt efter att de bildas. Sker i alla celler
37
Vad menas med reglerad exocytos?
Signalförmedlad exocytos Sker huvudsakligen i sekretoriska celler Vesiklar ligger och väntar på signal och frisätts sedan samtidigt Signalen är ofta hormon eller höjning av Ca2+ konc
38
Vad kännetecknar snabb exocytos?
Små vesiklar | Synaptotagmin som Ca2+ sensor
39
Vad kännetecknar långsam exocytos?
Större vesiklar | Doc2 som Ca2+ sensor
40
Vad gör synaptotagmin och Doc2?
Proteiner som inhiberar SNARE och förhindrar exocytos Fungerar som Ca2+ sensorer och förändrar konformation när Ca2+ binder in så att Docking möjliggörs - exocytos
41
Vad gör Munc18?
Hjälper till vid att fusera vSNARE och tSNARE
42
Vad är Fagocytos?
Endocytos som utförs av Fagocyter - kan vara mikrofager eller grandolocyter -tar upp mikroorganismer, bakterie, döda celler eller främmande partiklar för nedbrytning i lysosom
43
Hur går Fagocytos till?
1. Receptorer på Fagocyten binder till antikroppar på materialet som ska tas upp 2. Inbindingen aktiverar cellens aktimfilament att polymeriseras och bilda pseudopedia 3. Pseudopedia omsluter materialet och bildar ett membran runt det samtidigt som det tas upp i cellen genom endocytos —> bildar en fagosome 4. Fagosomen sammansmälter med en lysosom och bildar en fagolysosom
44
Vad menas med pinocytos?
Pinocytos betyder ”celldrickande” -vatten och där i lösta ämnen I dagens mening benämns upptag av de flesta partiklar som endast Endocytos Med macropinocytos menas upptag av vätska i större mängd - genom att det bildas ett membranutskott som tillslut sluts i membranet och bildar ett större kompartment
45
Hur går Clathrin-beroende endocytos till?
1. Cargo binder till receptorer på target-membran. 2. Adaptorprotein känner igen en signalsekvens på receptorn och binder in till membranets cytosolsida 3. Clathrin binder in till adaptorprotein 4. En coated pit bildas och halsen på denna klyvs av Dynamin 5. Coatingen kläs av Om receptorn för cargot är en PIP(fosfatidylinositolfosfat) kläs coatingen av mha av PIP-defosforylas
46
Vad menas med mannos-6-fosfat beroende sortering?
Hydrolaser markeras med en MGP i sina N-länkade oligosackarider när de passerar CGN. En M6P receptor binder in M6P på hydrolaset när den passerar TGN - vesikel bildas Hydrolaset släpps från receptorn och aktiveras vid lågt pH - vilket gör att de är fullt aktiva först när endosomen mognat till en lysosom Receptorerna återvinns till TGN
47
Vad gör en proteasom?
Ett ATP-beroende proteinkomplex i cytosolen Tar in proteiner märkta med ubiquitin och bryter ner de mha av hydrolaser