Introduction à la microbiologie et aux microorganismes

Question 1

Quelles sont les grandes catégories de microorganismes d’importance médicale ?

Answer 1

1 - Bactéries
2 - Champignons
3 - Parasites
4 - Virus
5 - Prions (protéines)

Question 2

Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des bactéries ?

Answer 2

• Structure : Unicellulaire
• Reproduction : Fission binaire
• Paroi : Peptidoglycans
• Relation avec l’hôte : Free-living (intracellulaire facultatif ou obligatoire)

Question 3

Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des champignons ?

Answer 3

• Structure : Unicellulaire (1) vs Pluricellulaire (2)
• Reproduction : Fission binaire (1) vs Reproduction sexuée (2)
• Paroi : Paroi chitine
• Relation avec l’hôte : Free-living (intracellulaire facultatif)

Question 4

Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des parasites ?

Answer 4

• Structure : Unicellulaire (1) vs Pluricellulaire (2)
• Reproduction : Fission binaire (1) vs Reproduction sexuée (2)
• Paroi : Complexité variable jusqu’à petits animaux
• Relation avec l’hôte : Free-living

Question 5

Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des virus ?

Answer 5

• Structure : Acellulaire
• Reproduction : Réplication via machinerie génétique de l’hôte (comme notre organisme qui reproduit le covid)
• Paroi : Capside +/- enveloppé
• Relation avec l’hôte : Intracellulaire obligatoire

Question 6

Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des prions ?

Answer 6

• Structure : Protéine (pas matériel génétique)
• Reproduction : Réplication via machinerie génétique de l’hôte
• Paroi : Aucune
• Relation avec l’hôte : Intracellulaire obligatoire

Question 7

À quoi correspond une structure acellulaire ?

Answer 7

Structure de protéines dans laquelle se retrouve du matériel génétique

Question 8

Quelle catégorie de microorganisme cause la maladie de la vache folle ?

Answer 8

Les prions

Question 9

Les champignons levure et filamenteux sont-ils uni ou pluricellulaire ?

Answer 9

• Levure : unicellulaire

- Filamenteux : pluricellulaire

Question 10

Nomme un parasite

Answer 10

Amibe

Question 11

Nomme un virus autre que le covid

Answer 11

VIH

Question 12

Nomme les différents types d’interactions hôte et agent infectieux

Answer 12

1 - Commensal : hôte et pathogène vivent ensemble, pas de dommage ou de bénéfice à l’hôte ou à l’agent
2 - Saprophyte : bénéfice pour l’agent infectieux sans avoir de dommages pour l’hôte
3 - Parasite : avantage pour l’agent infectieux et dommage pour l’hôte
4 - Symbiose : avantages pour les deux

***Parasite : mécanisme d’interaction, peut être bactéries ou champignons, ne pas confondre avec le groupe des parasites

Question 13

Différencie les colonisants vs les pathogènes

Answer 13

Colonisant :

• Cause aucun problème à l’hôte, tant qu’il y reste en équilibre
• Microorganisme vivant sur une surface interne ou externe du corps
• Commensal > saprophyte > symbiose (+ utile, - fréquent)

Pathogène :

• Dommage pour l’hôte (parasite)
• Pathogène obligatoire (infection pour tous les hôtes)
• Pathogène opportuniste (infection seulement chez les hôtes immunosupprimés)

Question 14

Quelles sont les utilités des bactéries ?

Answer 14

• Carnivores : essentielles à la désintégration des tissus morts
• Industrielle ; décontamination, fuite toxique, yogourt,…

Question 15

Quelles sont les utilités des champignons ?

Answer 15

• Végétariens : dégradation des matières végétales

Question 16

Qu’est-ce que la virulence et de quels éléments dépend-t-elle ?

Answer 16

C’est la capacité à produire une infection.

• Environnement : ex bactérie de la peau ou de l’intestin dans la circulation sanguine
• Hôte infecté : immunité
• Microorganisme :

Question 17

Quelles sont la 4 grandes modalités diagnostiques de la microbiologique ?

Answer 17

1 - Examen direct (comme coloration de Gram)
2 - Culture (gellose, gélatine/sang de mouton, encensement)
3 - Immunodiagnostic
4 - Dx moléculaire

Question 18

En quoi consiste l’antibiogramme ?

Answer 18

Bactéries étalées sur un nouveau milieu de culture, on y met des pastilles avec des antibios. On incube le tout en répliquant les conditions du corps humains et on visualise la prolifération. Plus il y a un grand cercle autour de la pastille, plus l’antibio a une grande efficacité.

Question 19

Immunodiagnostic :

• Définit antigène
• Définit anticorps
• Nomme 2 méthodes de diagnostiques

Answer 19

• Composante sur la surface d’un microorganisme
• Réponse immune de l’hôte à l’antigène
• ELISA et Agglutination

Question 20

Quelles sont les différentes classes des champignons ?

Answer 20

• Levure
• Dimorphes
• Filamenteux

Question 21

Nomme les différents types/genres de champignons à levure

Answer 21

• Candida
• Cryptococcus
• Malassezia

Question 22

Nomme 2 types de champignons filamenteux

Answer 22

• Hyalins (Aspergillus, dermatophytes, mucorales)

- Dématiés (champignons noirs)

Question 23

Les champignons à levure se retrouve plus à ________ de l’être humain et les champignons filamenteux plus à __________ de l’être humain.

Answer 23

1 - intérieur

2 - extérieur

Question 24

Nomme les différentes classes (7) d’antifongiques

Answer 24

1 - Azoles (ex : fluconazole, pricipalement pour levure)
2 - Allylamines (terminafine, pied d’athlète)
3 - Echinocandins
4 - Polyènes (nystatin)
5 - 5 - fluorocytosine (5-FC)
6 - Griséofulvine (infection dermatophyte : peau, cheveux, ongles)
7 - Cyclopirox

Question 25

Nomme des antifongiques azoles (identifie les 3 principaux)

Answer 25

***3 principaux 1 - Clotrimazole (topique, vaginite à levure) 2 - Kétoconazole (po ou topique, nisoral) 3 - Fluconazole (po ou IV, muguet/vaginite/balanite) **** 4 - Itraconazole (po ou IV) 5 - Voriconazole (po ou IV) 6 - Posaconazole (po ou IV)

Question 26

Qu'est-ce qui caractérise les levures Candida spp. ?

Answer 26

- Unicellulaire - Plus gros qu'une bactérie (1-2 microns vs 5-8 microns0 - Ovale ou ronde - Réplication par bourgeonnement - Colonise peau, muqueuse, tube GI humain (colonise partout où il y a muqueuses)s buccale et génitale, peau/plis et ongles) - Infx endroits humides (muqueuse - C. albicans, C. krusei, C. glabrata (différentes espèces)

Question 27

Quels antifongiques sont efficaces pour les infections aux Candida/Cryptococcus ?

Answer 27

Tous* - +/- terbinafine - +/- échinocandins

Question 28

Qu'est-ce qui caractérise les candidoses oropharyngées ?

Answer 28

- Atteinte muqueuse orolabiale - Douleur buccale +/- lors d'avaler - Pseudomembranes blanches dans la bouche +/- érythème sous-jacent - Associés à la prise d'antibios, corticostéroïdes inhalés ou immunosuppression (déséquilibre entre bactéries et levures) - Plaques blanches ou rougeurs peuvent être absentes * **Différents de pharyngite streptocoque (amygdales enflées, pu)

Question 29

Qu'est-ce qui caractérise la perlèche ?

Answer 29

Érythème = sécheresse et craquelure commissures labiales (coins bouche) ***Différent de l'herpes orolabiale (petites vésicules de liquides dans le coins de la bouche)

Question 30

Quels sont les traitements pour la candidose oropharyngée ?

Answer 30

Topique - Azoles (clotrimazole) 1er choix - Polyènes : nystatin rince-bouche 1er choix, amphotericine B (magistrale, rare) Systémique : - po : fluconazole (voriconazole, posaconazole0 - IV (rare) : amphotéricine B, caspofongine

Question 31

Qu'est-ce qui caractérise les vulvovaginite candida ?

Answer 31

- Femme post pubère - Symptômes : Érythème, douleur, +/- écoulement blanchâtre - Même facteurs de risque que candidose oropharyngée SAUF récidives fréquentes sans explication - Homme = balanite - Si 1er épisode : référer au md, 50% autre diagnostic (itss, uti, allergie, eczéma) - Si épisode dans la passé, servir mvl

Question 32

Quels sont les traitements pour la vulvovaginites candida ?

Answer 32

Topique : - Clotrimazole (canesten) - 1 jr vs 3 jrs vs 7 jrs (efficacité équivalente)*** - Amphotéricine B (rare) - Acide borique, %-FC (rare) * minimum 3 jrs recommandé, exposition + prolonger à l'antifongique souhaitable, pas dose unique Systémique : - Fluconazole - 1 dose de 150 mg - Autres traitements idem candidose oropharyngée (rare) ****Azoles : tératogène si administration haute dose et prolongée (embryotoxique)

Question 33

Où peuvent survenir les infections Candida systémique ? Quels sont les traitements ?

Answer 33

``` 1 - Sang 2 - Coeur 3 - Urine 4 - Oeil 5 - Cerveau 6 - Os/articulations ``` Traitements : - IV prolongé, +/- chirurgie - Azoles - Échinocandins - Polyènes (Amphotéricine B) - 5 - fluorocytosine

Question 34

Qu'est-ce qui caractérise les infections à levures Cryptococcus ?

Answer 34

- Levure encapsulée - Environnement (oiseaux, végétaux), cosmopolite - Inhalée --> pneumonie --> méningoen céphalite - Autres : infx cutanées, urinaires - Tx : fluconazole ou amphotéricine ***pas enchinocandins

Question 35

Qu'est-ce qui caractérise les infections à levures Malassezia ?

Answer 35

- Levure humaine et animale - Lipophile (aime le gras) - Infections cutanées - Pitysiasis versicolor (hyper ou hypopigmentation cutanée, tronc > membres) - Autres infections : dermatite séborrhéique, pellicules, fungémie rare (intralipide)...

Question 36

Quels sont les traitements pour le pityriasis versicolor ?

Answer 36

Topique : - Selenium sulfide 2.5% (ou Selsun Blue %) - Ketoconazole (Nizoral) - Clotrimazole 1% Systémique (rare) : - Fluconazole - Itraconazole

Question 37

Qu'est-ce qui caractérise les champignons filamenteux ?

Answer 37

- Pluricellulaires - Hyphes - Organes de fructification - Aspect duveteux - Ex : Penicillium roqueforti (non-pathogène) - Ex : Aspergillus spp., Fusarium spp., Scedosporium spp.(pathogènes)

Question 38

Quelles sont les espèces pathogènes de champignons filamenteux les plus fréquentes ?

Answer 38

- Aspergillus fumigatus (aspergillose invasive, poumon) | - Dermatophytes (pied d'athlète, onychomycose,..)

Question 39

Quels sont les facteurs de risque de l'aspergillose invasive aïgue ?

Answer 39

- Immunosuppression prolongée et profonde (neutropénie, chimiothérapie, corticostéroïdes,...) - Environnement riche en conidies d'Apergillus (rénovation, agriculture, ...) * **Mortalité : 50-70%

Question 40

Qu'est-ce qui caractérise l'aspergillose invasive (diagnostic) ?

Answer 40

- Symptômes respiratoires : toux, dyspnée, douleur thoracique, hémoptysie - Fièvre - Lésions cutanée/autres organes - Culture liquide/tissus infectés - Tests antigéniques sanguins ou sur liquide bronchique (galactomannan)

Question 41

Qu'est-ce qui caractérise les traitements pour l'aspergillose ?

Answer 41

- Débuter rapidement! - Diminuer immunosupression si possible - +/- chirurgie - ***Voriconazole***

Question 42

Quel antibiotique n'est pas efficace contre l'aspergillus ?

Answer 42

- Fluconazole | - 5 - FC

Question 43

Les infections dermatophytes (champignons filamenteux) affectent quelles parties du corps et comment surviennent-elles? Quelles en sont les 3 genres ?

Answer 43

- Infection peau, cheveux, ongles - Infecitons via contact personne-à-personne, animaux (zoonoses) ou fomites (surfaces, objets) 3 genres : - Epidermophyton spp. - Trichophyton spp. - Microsporon spp.

Question 44

Que signifie tinea ?

Answer 44

Tinea = infection à dermatophytes

Question 45

Quels sont les traitements des infections à dermatophytes ?

Answer 45

1 - Azoles (clotrimazole, ketoconazole, fluconazole, itraconazole) 2 - Allylamine (terbinafine) 3 - Griséofulvine 4 - Cyclopirox (Loprox)

Question 46

Quelles sont les 2 règles de bases concernant le traitement des infections à dermatophytes ?

Answer 46

1 - Si peau et non sévère (pas kérion, petite zone) : Traitement topique (terbinafine 1% bid x 1 sem, Clotrimazole 1 % bid x 4 sem) 2 - Large zone, sévère, kérion, poils/cheveux, ongles : Traitement systémique (terbinafine, azole parfois)