Jaenette Nilsson - Translation

Question 1

Vilka tre typer av RNA behövs vid translation?

Answer 1

• mRNA: messenger RNA. Den RNA molekyl som bär på den genetiska informationen kopierad från DNA.
• tRNA: transfer RNA. RNA molekyler som läser av koden och översätter den till aminosyror.
• rRNA: ribosomalt RNA. RNA molekyler som tillsammans med proteiner bildar ribosomen.

Question 2

Kodon

Answer 2

Tripletter av baser i en mRNA molekyl bestämmer aminosyran. En triplett är ett kodon. Eftersom det finns fyra baser så finns det 64 st olika kodon. 61 st bestämmer aminosyror och tre st är stoppkodon.

Question 3

Läsram

Answer 3

Translation startar alltid med kodonet AUG och läses av från 5’ till 3’ på mRNA molekylen. Sekvensen som läses från ett start till ett stoppkodon kallas för läsram. En mRNA molekyl kan teoretiskt sett ha tre olika läsramar och bestäms av vid vilken AUG starten sker.

Question 4

tRNA

Answer 4

Fungerar som en adapter mellan en specifik aminosyra och ett kodon i en mRNA molekyl. tRNA har tre viktiga uppgifter:
- binda en aminosyra
- baspara med ett kodon i mRNA
- binda in till ribosomen

Question 5

Aminoacyl-tRNA syntetas

Answer 5

Specifika enzym som kopplar rätt aminosyra till rätt tRNA. Det finns ett syntetas för varje aminosyra, alltså 20 st.

Question 6

Aminoacyl-tRNA och peptidyl-tRNA

Answer 6

Aminoacyl-tRNA: har en aminosyra bunden till sig.
Peptidyl-tRNA: har en peptid bunden till sig.

Question 7

Var sker proteinsyntesen hos eukaryoter?

Answer 7

I cytoplasman.

Question 8

Ribosom hos bakterier vs eukaryoter

Answer 8

Hos bakterier: 70S. Stor subenhet på 50S, liten subenhet på 30S.
Hos eukaryoter: 80S. Stor subenhet på 60S och liten subenhet på 40S.

Question 9

Ribosomens säten

Answer 9

På ribosomen finns fyra platser dit RNA kan binda. Till ett ställe binder mRNA och till tre ställen binder tRNA. De tre säterna för tRNA kallas A, P och E.
Till A binder aminoacyl-tRNA. Detta är en tRNA som har en aminosyra bunden till sig.
Till P binder en peptidyl-tRNA. Detta är en tRNA som har en peptid bunden till sig.
Vid E lämnar en tom tRNA molekyl ribosomen.

Question 10

Translationen tre steg

Answer 10

1. Initiering. Translationen startar.
2. Elongering. Peptidkedjan växer.
3. Terminering. Translationen avslutas.

Question 11

Var binder den lilla subenheten hos prokaryoter?

Answer 11

Till en specifik sekvens som kallas Shine Dalgarno.

Question 12

Elongering translation

Answer 12

1. En aminoacyl-tRNA molekyl binder till A-sätet genom att baspara med mRNA’t.
2. Bindningen i karboxyländan på peptidkedjan bryts. Denna binder nu till den fria aminogruppen på aminosyran som sitter på tRNA’t i A-sätet. Detta innebär att det bildas en ny peptidbindning som katalyseras av peptidyl-transferas.
3. mRNA’t flyttas tre nukleotider genom ribosomen, vilket leder till att ett nytt kodon finns i A-sätet. Samtidigt flyttar sig tRNA molekylerna ett steg.

Question 13

Terminering

Answer 13

Stoppsekvenser: UAA, UAG, UGA. Istället för en tRNA så binder en release factor till A sätet, vilket terminerar translationen. Subenheterna, release factor, och den sista tRNA-molekylen släpper alla från varandra.

Question 14

Polysom

Answer 14

Flera ribosomer som translaterar samma mRNA. Som pärlor på en tråd.

Question 15

Hur viker sig nysyntetiserade protein?

Answer 15

De hydrofoba regionerna viks mot mitten, och de hydrofila delarna mot ytterkanten. I vissa fall börjar proteinveckningen under proteinsyntesen.

Question 16

Post-translationella modifieringar

Answer 16

Många proteiner modifieras efter translationen.
- Proteolys: proteinet klyvs av proteaser.
- Glykosylering: sockermolekyler sätts på aminosyrorna aspargin, serin och treonin.
- Många små molekyler kan sättas på olika aminosyror. Fosfat kan tex sättas på aminosyrorna treonin, serin eller tyrosin.

Post-translationella modifieringar av ett protein kan påverka dess struktur och funktion.

Question 17

Molekylära chaperoner

Answer 17

Proteiner som hjälper andra proteiner att vecka sig rätt utan att vara en del av den slutgiltiga strukturen. Chaperoner binder till exponerade hydrofoba regioner på ett protein.

Question 18

Hsp 60 familjen

Answer 18

60 kD proteiner som tillsammans bildar en cylindrisk struktur. Binder till 10-15% av alla cellens proteiner. Skapar ett hydrofobt “rum” där proteinet kan veckas korrekt.

Question 19

Proteasom

Answer 19

Högmolekylärt proteaskomplex som bryter ner ubiquitinerade proteiner. Viktig för kvalitetskontroll av felveckade och skadade protein, och för kontroll av mängden viktiga cellulära proteiner.

Question 19

Nedbrytning av proteiner

Answer 19

Proteiner som bryts ner i proteasomen behöver först märkas med ubiquitin. För detta behövs E3 ligaset. Aktivering av E3 kan reglera nedbrytning. Nedbrytning kan även regleras genom aktivering av en degradationssignal i ett protein.

Question 19

Hsp 70 familjen. Chaperon

Answer 19

70 kD protein-monomer. Binder till regioner i ett protein bestående av 7-8 hydrofoba aminosyror. Kan binda redan innan proteinet har lämnat ribosomen.