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mécanismes de la transcription Flashcards

(50 cards)

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1
Q

Qu’est-ce que la transcription?

A

Processus de synthèse d’une molécule d’ARN à partir d’un brin d’ADN matrice

Très semblable à la réplication ADN mais avec des différences notables.

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Q

Quelles sont les différences principales entre la transcription et la réplication?

A
  • Brin constitué de ribonucléotides dans la transcription
  • ARN polymérase ne requiert pas d’amorce
  • L’ARN ne reste pas apparié au brin matrice d’ADN
  • Transcription moins fidèle que la réplication

1 erreur/10 000 nucléotides en transcription contre 1/10 000 000 en réplication.

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3
Q

Combien d’ARN polymérases les eucaryotes possèdent-ils?

A

Trois ARN polymérases: Pol I, Pol II, Pol III

Chacune ayant des fonctions spécifiques dans la transcription.

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4
Q

Quel est le rôle des promoteurs dans la transcription?

A

Séquence ADN qui fixe l’ARN polymérase et les facteurs d’initiation requis

Les promoteurs sont cruciaux pour initier la transcription.

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Q

Quelles sont les trois étapes de l’initiation de la transcription?

A
  • Formation du complexe fermé (ADN double-brin)
  • Formation du complexe ouvert (ADN simple-brin)
  • Démarrage de la transcription par l’ARN polymérase

La synthèse initiale d’ARN est souvent inefficace.

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6
Q

Vrai ou faux: L’ARN polymérase nécessite une amorce pour initier la transcription.

A

Faux

L’ARN polymérase peut initier la transcription sans amorce.

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7
Q

Quelle est la vitesse de la polymérase bactérienne pendant l’élongation?

A

Environ 52 nucléotides par seconde

Cela démontre l’efficacité de la transcription chez les bactéries.

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8
Q

Quelle est la fonction du facteur sigma (σ) dans la transcription bactérienne?

A

Convertit l’enzyme minimale en holoenzyme d’ARN polymérase

Permet l’initiation de la transcription uniquement aux promoteurs.

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9
Q

Qu’est-ce qu’un terminateur Rho-indépendant?

A

Terminateur qui provoque terminaison sans d’autres facteurs

Il fonctionne par formation d’une structure tige-boucle dans l’ARN.

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10
Q

Complétez: L’ARN polymérase synthétise initialement des ARN de _______ nucléotides.

A

moins de 10

Cette phase est connue sous le nom de synthèse abortive.

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11
Q

Quels sont les deux types de terminateurs chez les bactéries?

A
  • Rho-dépendant
  • Rho-indépendant

Chacun ayant des mécanismes distincts pour terminer la transcription.

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12
Q

Quels éléments de séquence sont présents dans un terminateur Rho-indépendant?

A
  • Courte séquence répétée inversée
  • Paires de bases A-T (≈8)

Ces éléments aident à former la structure tige-boucle nécessaire à la terminaison.

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13
Q

Vrai ou faux: La transcription chez les eucaryotes nécessite un seul facteur d’initiation.

A

Faux

Les eucaryotes nécessitent plusieurs facteurs d’initiation, appelés facteurs généraux de transcription.

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14
Q

Quelles sont les fonctions des facteurs généraux de transcription (FGT) chez les eucaryotes?

A
  • Aider Pol II à se fixer au promoteur
  • Séparer les brins d’ADN

Ces fonctions sont essentielles pour l’initiation de la transcription.

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15
Q

Complétez: L’ARN polymérase produit des ARN de _______ nucléotides avant de se libérer du promoteur.

A

10

Cela marque le passage de la phase d’initiation à la phase d’élongation.

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16
Q

Quelle est la fonction des canaux dans l’ARN polymérase?

A
  • Canal d’entrée des NTPs
  • Canal de sortie de l’ARN
  • Canaux pour l’entrée et la sortie de l’ADN

Ces canaux facilitent le processus de transcription.

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17
Q

Qu’est-ce que la réparation couplée à la transcription?

A

Mécanisme par lequel des enzymes de réparation sont recrutées lorsque l’ARN polymérase est bloquée

Cela permet de gérer les dommages sur l’ADN pendant la transcription.

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18
Q

Quel est le rôle de TRCF (Transcription Repair Coupling Factor)?

A

Recrute les enzymes de réparation lorsque l’ARN polymérase est bloquée

TRCF aide à maintenir l’intégrité de la transcription malgré les obstacles.

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19
Q

Quelles sont les ARN polymérases présentes chez les eucaryotes ?

A

Pol I, Pol II et Pol III

Les eucaryotes possèdent trois types de polymérases, contrairement aux bactéries qui n’en ont qu’une.

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20
Q

Quel est le rôle des facteurs généraux de transcription (FGT) chez les eucaryotes ?

A

Aident Pol II à se fixer au promoteur et à séparer les brins d’ADN

Les FGT accomplissent des fonctions similaires au facteur sigma dans la transcription bactérienne.

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21
Q

Qu’est-ce qu’un promoteur minimal ?

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A

Le plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par Pol II in vitro

Il comprend environ 40-60 nucléotides en amont ou en aval du site d’initiation.

22
Q

Quels éléments sont reconnus par TFIIB dans le promoteur ?

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A
  • Élément reconnu par TFIIB (BRE)
  • Élément TATA
  • Élément initiateur (Inr)
  • Éléments d’aval du promoteur (DPE, DCE, MTE)

Les éléments d’aval incluent ‘Downstream promoter element’, ‘Downstream core element’, et ‘Motif ten element’.

23
Q

Quels types d’éléments régulateurs existent en amont du promoteur minimal ?

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A
  • Séquences régulatrices
  • Éléments proximaux du promoteur
  • Séquences activatrices amont (UAS)
  • Enhancers
  • Silencers
  • Éléments frontière et isolateurs

Ces éléments sont nécessaires pour une transcription efficace in vivo.

24
Q

Qu’est-ce que le complexe de préinitiation (PIC) ?

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A

Ensemble des FGTs + Pol II liés au promoteur

Il est essentiel pour l’initiation de la transcription.

25
Quel est le rôle de TBP dans le complexe de préinitiation ?
Fournit une plateforme pour attirer d'autres FGTs et Pol II ## Footnote TBP se lie à la boîte TATA et interagit avec des facteurs associés.
26
Quelles sont les fonctions de TFIIA ?
Élimine l'interaction des répresseurs avec TBP et agit comme co-activateur pour certains activateurs ## Footnote TFIIA interagit avec TBP mais pas avec l'ADN.
27
Qu'est-ce que TFIIH et ses fonctions principales ?
Contrôle la transition du complexe préinitiation fermé au complexe ouvert, impliqué dans la réparation de l'ADN ## Footnote TFIIH possède des activités ATPase et protéine kinase.
28
Qu'est-ce que la coiffe 5' et son rôle ?
Ajout d'une guanine méthylée à l'extrémité 5' de l'ARN ## Footnote Elle stabilise l'ARNm, protège contre les ribonucléases et aide à l'exportation dans le cytoplasme.
29
Qu'est-ce que la polyadénylation et pourquoi est-elle importante ?
Ajout d'une chaîne de résidus adénine à l'extrémité 3' de l'ARN ## Footnote Elle est intimement liée à la terminaison de la transcription.
30
Quels complexes protéiques sont transportés par Pol II lors de la terminaison de la transcription ?
* CPSF (Cleavage and Polyadenylation Specificity Factor) * CstF (Cleavage Stimulation Factor) ## Footnote Ces complexes stimulent le clivage de l'ARN et la polyadénylation.
31
Vrai ou Faux : Les eucaryotes nécessitent des protéines supplémentaires pour la transcription in vivo.
Vrai ## Footnote Ces protéines incluent le complexe Médiateur et d'autres facteurs régulateurs.
32
Quel est le rôle du médiateur dans la transcription ?
Facilite l'initiation en régulant l'activité CTD kinase de TFIIH ## Footnote Le médiateur est constitué de nombreuses sous-unités et joue un rôle clé dans la régulation de l'expression génique.
33
Quelles sont les étapes de l'ajout de la coiffe 5' à l'ARN ?
* Enlèvement du groupe phosphate à l'extrémité 5' * Ajout du nucléotide GMP * Méthylation du GMP ## Footnote Ces étapes sont essentielles pour la formation de la coiffe 5'.
34
Qu'est-ce que TFIIS et son rôle dans l'élongation ?
Stimule le taux d'élongation et contribue à la vérification de séquence par Pol II ## Footnote TFIIS aide à corriger les erreurs en hydrolysant les bases incorrectes.
35
Qu'est-ce que FACT et son rôle dans la transcription ?
Facilite la transcription à travers les nucléosomes en extrayant des dimères H2A/H2B ## Footnote FACT est un hétérodimère de deux protéines très conservées.
36
Qu'est-ce que le clivage de l'ARNm ?
Ajout d’un grand nb de résidus adénine à son extrémité 3’ ## Footnote Ce processus est essentiel pour la maturation de l'ARNm.
37
Quels sont les complexes protéiques transportés par Pol II à la fin du gène ?
CPSF et CstF ## Footnote CPSF signifie Cleavage and Polyadenylation Specificity Factor et CstF signifie Cleavage Stimulation Factor.
38
Quel est le rôle des signaux Poly-A ?
Stimulent le transfert CPSF et CstF à ARN ## Footnote Ces signaux incluent le clivage de l'ARN en aval du signal AAUAAA.
39
Quel est le rôle de CPSF dans le processus de maturation de l'ARN ?
Recrute Poly-A-polymérase (PAP) ## Footnote PAP ajoute environ 200 résidus d'adénine à l'extrémité 3’ de l'ARN clivé.
40
Que fait le PABP lors de la maturation de l'ARNm ?
Recrutement des PABP (poly (A) binding proteins) ## Footnote Les PABP sont essentielles pour la stabilité et l'exportation de l'ARNm.
41
Vrai ou Faux : Pol II s'arrête immédiatement après le clivage et la polyadénylation de l'ARN.
Faux ## Footnote Pol II continue à transcrire et produit une deuxième molécule d'ARN.
42
Quel modèle de terminaison est associé à l'enzyme qui dégrade le deuxième ARN ?
Modèle torpille ## Footnote Ce modèle implique que l'enzyme dégrade le second ARN dès qu'il émerge de la polymérase.
43
Quel est le rôle de Rat1 dans le modèle de terminaison torpille ?
Dégrade rapidement ARN 5’/3’ et rattrape la Pol II en transcription ## Footnote Rat1 est une RNase très processive qui facilite la terminaison.
44
Quelles sont les deux autres méthodes de terminaison mentionnées ?
Allostérique et réduction du caractère processif de Pol II ## Footnote Ces méthodes dépendent de modifications structurelles de Pol II.
45
Quels sont les promoteurs distincts reconnus par Pol I et Pol III ?
Promoteur central et Élément de contrôle amont (UCE) ## Footnote Pol I est nécessaire pour l’expression d’un gène précurseur des ARNr.
46
Quels facteurs sont requis pour l'initiation de transcription par Pol I ?
SL1 et UBF ## Footnote SL1 comprend TBP + 3 TAFs spécifiques.
47
Quels éléments sont présents dans les promoteurs de Pol III ?
Boîte A, boîte B, boîte C, boîte TATA ## Footnote Les formes varient selon le type de gène, par exemple, gènes ARNt ou gènes codant ARNr 5S.
48
Quelles sont les phases distinctes comprises dans un cycle de transcription ?
Initiation, élongation, terminaison ## Footnote Chaque phase a des mécanismes et des complexes protéiques spécifiques.
49
Quel est le rôle de la queue CTD de la polymérase ?
Permet de transporter des protéines requises à toutes les étapes de la transcription d’un gène ## Footnote La CTD est cruciale pour la coordination de la transcription.
50
Vrai ou Faux : Les ARN polymérases bactériennes et eucaryotes sont très différentes.
Faux ## Footnote Elles partagent de nombreuses similitudes dans leur mécanisme de transcription.

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