régulation de la transcription eucaryotes Flashcards
(44 cards)
Quels sont les mécanismes de régulation transcriptionnelle conservés chez les eucaryotes?
- Mécanismes de régulation transcriptionnelle conservés de la levure aux mammifères
- Recrutement des complexes protéiques sur les gènes par les activateurs eucaryotes
- L’intégration du signal et le contrôle combinatoire
- Les répresseurs transcriptionnels
- La transduction du signal et le contrôle des régulateurs transcriptionnels
Ces mécanismes sont fondamentaux pour comprendre la régulation de l’expression génique chez les eucaryotes.
Qu’est-ce qui caractérise les activateurs eucaryotes?
Les activateurs eucaryotes sont des protéines qui lient l’ADN et facilitent ou empêchent l’initiation de la transcription de gènes spécifiques en réponse à des signaux appropriés
Ils recrutent la machinerie transcriptionnelle et interagissent avec d’autres protéines régulatrices.
Quelles sont les modifications des nucléosomes et leur impact sur la transcription?
Les modifications des nucléosomes rendent la machinerie transcriptionnelle accessible à un substrat partiellement masqué
Cela influence l’expression des gènes en complexifiant l’action des activateurs et des répresseurs.
Comment les éléments régulateurs varient-ils entre les gènes bactériens, de levure et humains?
Chez les eucaryotes, il y a plus de sites de liaison et plusieurs sites individuels, tandis que les bactéries ont des éléments régulateurs plus simples
Les séquences régulatrices peuvent s’étendre sur 1000 nucléotides en amont ou en aval du promoteur.
Qu’est-ce qu’un enhancer?
Un enhancer est une séquence régulatrice qui contient plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité, permettant des actions à distance par des boucles d’ADN
Cela facilite l’interaction entre protéines régulatrices et les promoteurs.
Vrai ou Faux: L’activation à distance par les enhancers nécessite des isolateurs.
Vrai
Les isolateurs bloquent l’activation du promoteur induite par les activateurs liés à l’enhancer.
Quel est le rôle de Gal4 dans la transcription chez la levure?
Gal4 est un activateur eucaryote qui active la transcription des gènes de galactose chez Saccharomyces cerevisiae
Il lie quatre sites situés 275 pb en amont de la transcription.
Quel est le motif de liaison à l’ADN des activateurs eucaryotes?
Les activateurs eucaryotes possèdent un domaine de liaison à l’ADN distinct, souvent de type hélice-coude-hélice
Ce motif est crucial pour la reconnaissance des sites spécifiques sur l’ADN.
Qu’est-ce qu’un domaine en doigt à zinc?
Un domaine en doigt à zinc est une structure protéique qui se replie pour lier l’ADN, composée d’environ 30 acides aminés
Il est caractérisé par la présence de cystéines et d’histidines qui stabilisent la structure.
Complétez: Les protéines à homéodomaine contiennent une région _______ conservée.
60 AA
Cette région est essentielle pour leur fonction dans l’embryogenèse et la régulation génique.
Quel est le rôle des motifs hélice-boucle-hélice?
Ils sont impliqués dans la reconnaissance de l’ADN et sont présents dans plusieurs régulateurs eucaryotes
Ces motifs permettent la liaison à des séquences spécifiques et sont cruciaux pour la régulation de l’expression génique.
Vrai ou Faux: Les régions activatrices des activateurs eucaryotes ont des structures définies.
Faux
Les régions activatrices peuvent former des structures en hélice induites par la liaison à l’ADN, mais elles n’ont pas de structures définies.
Quels types d’acides aminés sont souvent présents dans les régions activatrices?
Glutamine, proline et acides aminés acides
Ces régions sont moins universelles mais jouent un rôle clé dans l’activation de la transcription.
Quelles sont les fonctions des protéines régulatrices eucaryotes?
Elles sont impliquées dans diverses fonctions cellulaires telles que la différentiation cellulaire, la stabilité des chromosomes et la régulation de l’expression génique
Des exemples incluent MyoD, CBF1/CPF1, et myc.
Quel est le rôle du complexe Médiateur?
Le complexe Médiateur recrute la machinerie transcriptionnelle et interagit avec l’ARN polymérase
Il joue un rôle clé dans l’initiation et l’elongation de la transcription.
Qu’est-ce qu’un activateur dans le contexte de la transcription?
Un activateur stimule la transcription en liant l’ADN par une surface et l’ARN polymérase par une autre face.
Les activateurs peuvent recruter des modificateurs du nucléosome.
Quels sont les facteurs nécessaires à l’initiation ou à l’élongation de la transcription?
Médiateur et TFIID.
Ces facteurs aident à l’initiation de la transcription chez les eucaryotes.
Comment les activateurs interagissent-ils avec la machinerie transcriptionnelle?
Les activateurs interagissent avec un ou plusieurs complexes et les recrutent sur les gènes.
Ils peuvent agir à distance.
Quel est le rôle des acétyltransférases dans la transcription?
Elles ajoutent des groupements chimiques sur les queues des histones, provoquant une perturbation locale de la structure de la chromatine.
Cela permet d’ ‘desserrer’ l’ADN.
Quel type de modifications sur les histones est associé à l’activation transcriptionnelle?
Acétylation.
Les bromodomaines de TFIID se fixent mieux aux nucléosomes acétylés.
Quels sont les deux types de modificateurs de nucléosomes mentionnés?
- Déplacent
- Remodèlent
Exemples incluent HAT et SWI/SNF.
Quelles protéines sont recrutées par les activateurs pour l’initiation de la transcription?
- TBP
- SAGA
- TAFs
Ces protéines sont essentielles pour des promoteurs spécifiques.
Qu’est-ce qu’un enhancer?
Une séquence d’ADN qui augmente le taux de transcription d’un gène.
Les activateurs peuvent interagir avec les enhancers pour activer des gènes à distance.
Quel est le rôle des isolateurs dans la transcription?
Ils bloquent l’activation par des enhancers en inhibant la communication entre l’enhancer et le promoteur.
Les isolateurs n’inhibent pas directement les activateurs d’autres gènes.
