régulation de la transcription procaryotes

Question 1

Qu’est-ce que la transcription de l’ADN en ARN?

Answer 1

Processus par lequel l’ARN polymérase synthétise de l’ARN à partir d’un modèle d’ADN

Initiée au niveau du promoteur

Question 2

Quelle est la fonction du promoteur?

Answer 2

Région située au début du gène où l’ARN polymérase se lie

Essentiel pour l’initiation de la transcription

Question 3

Quelles sont les phases du cycle de transcription?

Answer 3

Initiation, élongation et terminaison

Chaque phase joue un rôle crucial dans la synthèse de l’ARN

Question 4

Qu’est-ce que le complexe fermé?

Answer 4

État initial de l’ARN polymérase liée au promoteur avant l’ouverture de l’ADN

Prépare l’ARN polymérase à initier la transcription

Question 5

Qu’est-ce que l’échappement dans le cycle de transcription?

Answer 5

L’ARN polymérase quitte le promoteur et commence à transcrire

Marque la transition vers l’élongation

Question 6

Pourquoi la régulation de la transcription est-elle importante?

Answer 6

Permet à la cellule d’adapter la quantité de produits transcrits à ses besoins

Crucial pour la survie et l’adaptation des procaryotes

Question 7

Quelles sont les deux catégories de régulateurs?

Answer 7

Régulateurs positifs (activateurs) et régulateurs négatifs (répresseurs)

Ils contrôlent l’expression génique par des interactions spécifiques avec l’ADN

Question 8

Qu’est-ce qu’un répresseur?

Answer 8

Protéine qui se lie à l’ADN pour inhiber la transcription

Agit en recouvrant partiellement le promoteur

Question 9

Qu’est-ce qu’un activateur?

Answer 9

Protéine qui aide l’ARN polymérase à se fixer à son promoteur

Facilite l’initiation de la transcription

Question 10

Qu’est-ce que l’allostérie?

Answer 10

Changement de la structure d’une protéine après la liaison d’un ligand

Influence la fonction de la protéine régulatrice

Question 11

Comment se fait la régulation coopérative?

Answer 11

Interaction entre plusieurs régulateurs pour moduler l’expression génique

Implique des liaisons protéine/protéine et ADN/protéine

Question 12

Qu’est-ce que l’opéron lac?

Answer 12

Système de régulation des gènes lacZ, lacY et lacA chez E. coli

Impliqué dans l’utilisation du lactose comme source d’énergie

Question 13

Quelles conditions favorisent la production des protéines lac?

Answer 13

Carence en glucose et présence de lactose

Nécessite l’interaction de CAP et du répresseur lac

Question 14

Quel est le rôle de CAP?

Answer 14

Activateur qui se lie à un site CAP pour recruter l’ARN polymérase

Induit une liaison coopérative pour l’initiation de la transcription

Question 15

Quelle est la séquence de l’opérateur lac?

Answer 15

Séquence de 21 pb reconnue par le répresseur lac

Empêche l’ARN polymérase d’interagir avec le promoteur

Question 16

Qu’est-ce que la régulation combinatoire?

Answer 16

Contrôle simultané de plusieurs gènes par un même régulateur

Caractéristique de la régulation des gènes chez les procaryotes

Question 17

Qu’est-ce qu’un facteur σ alternatif?

Answer 17

Sous-unité de l’ARN polymérase qui reconnaît différents promoteurs

Permet l’activation de gènes sous des conditions spécifiques

Question 18

Quel est le rôle de NtrC?

Answer 18

Activateur qui lie l’ADN et active la transcription sous faible niveau d’azote

Implique une phosphorylation pour changer sa conformation

Question 19

Qu’est-ce que la régulation négative par le répresseur galR?

Answer 19

Inhibe la transcription en empêchant la transition de complexe fermé à ouvert

Diffère du mécanisme du répresseur lac

Question 20

Quel est le rôle de NtrC dans la régulation transcriptionnelle?

Answer 20

NtrC active l’ARN pol σ54 et fournit l’énergie nécessaire via son activité ATPase

NtrC change la conformation de l’ARN pol pour passer d’un complexe fermé stable à un complexe ouvert.

Question 21

Quel est l’effet de MerR sur le promoteur de merT?

Answer 21

MerR lie une séquence entre -10 et -35 du promoteur, modifiant la distance à 19 pb

Cela rend la liaison de l’ARN pol σ70 non optimale, empêchant la transcription.

Question 22

Sous quelles conditions le promoteur araBAD est-il actif?

Answer 22

En présence d’arabinose et absence de glucose

Deux activateurs sont impliqués : CAP et AraC.

Question 23

Qu’est-ce que le bactériophage λ?

Answer 23

Un virus qui infecte E. coli

Il peut adopter un cycle lytique ou lysogène.

Question 24

Quelles sont les caractéristiques du cycle lytique du bactériophage λ?

Answer 24

Nécessite la réplication de l’ADN et la synthèse de nouvelles protéines d’enveloppe

Cela conduit à la lyse de la cellule hôte.

Question 25

Quel est le statut d'un prophage?

Answer 25

Un stade dormant du bactériophage λ intégré dans le chromosome bactérien ## Footnote Il est répliqué à chaque division cellulaire.

Question 26

Quel événement induit la transition de lysogène à lytique?

Answer 26

L'exposition à des agents endommageant l'ADN ## Footnote Cela provoque l'induction lysogène.

Question 27

Quels gènes sont impliqués dans la régulation du bactériophage λ?

Answer 27

cI et cro ## Footnote Ils interagissent avec les promoteurs PR, PL et PRM.

Question 28

Quel est le rôle du répresseur λ?

Answer 28

Il empêche l'ARN pol de se fixer sur le promoteur ## Footnote Codé par le gène cI, il a deux domaines pour la liaison à l'ADN et la dimérisation.

Question 29

Comment les protéines régulatrices Cro et λ interagissent-elles avec l'ADN?

Answer 29

Elles lient les 6 opérateurs avec des affinités différentes ## Footnote Cela inclut des sites de liaison comme OR1, OR2, et OR3.

Question 30

Qu'est-ce qui favorise la liaison cooperative du répresseur λ?

Answer 30

La formation de dimères et de tétramères sur des sites adjacents d'ADN ## Footnote L'affinité est optimale sur OR1, favorisant la liaison sur OR2.

Question 31

Quel est l'effet de la liaison du répresseur λ sur le cycle lysogène?

Answer 31

Il se lie sur OR1 et OR2, empêchant la fixation de l'ARN pol sur PR ## Footnote Cela active la transcription à partir de PRM.

Question 32

Quel est le rôle de LexA dans la réponse SOS chez E. coli?

Answer 32

LexA réprime les gènes impliqués dans la réponse SOS ## Footnote Sa destruction active la réponse SOS en permettant la transcription de ces gènes.

Question 33

Qu'est-ce qui active la réponse SOS?

Answer 33

L'accumulation de dommages ou de cassures monocaténaire ## Footnote Cela induit la production de protéines de réparation.

Question 34

Quel est l'effet de la clivage du répresseur λ lors de la réponse SOS?

Answer 34

Il ne peut plus lier OR1 et OR2, induisant la transcription de PR et PL ## Footnote Cela entraîne une croissance lytique.

Question 35

Comment est régulée la quantité de répresseur λ?

Answer 35

Par des mécanismes d'autorégulation positive et négative ## Footnote Un niveau trop faible ou trop élevé peut induire une croissance lytique.

Question 36

Quel est le rôle de l'activateur cII?

Answer 36

Il stimule la transcription de cI (répresseur λ) ## Footnote cII lie un site en amont du promoteur PRE.

Question 37

Quelles sont les étapes précoces du cycle lytique vs lysogène?

Answer 37

À l'infection, transcription initiée à partir de PR et PL ## Footnote PR dirige la synthèse de Cro et de cII, où Cro favorise le développement lytique et cII favorise la croissance lysogène.

Question 38

Quel facteur détermine l'efficacité de cII?

Answer 38

Le rapport phage/bactérie ## Footnote Plus de phages favorisent la transcription de cI et l'intégration dans le chromosome bactérien.

Question 39

Définir l'épigénétique dans le contexte de la régulation génétique.

Answer 39

Hérédité (cellulaire) des profils d'expression géniques en absence de mutation et de signal initiateur ## Footnote Cela permet à certains gènes de rester exprimés sur plusieurs générations.

Question 40

Comment le statut lysogène du phage λ est-il maintenu?

Answer 40

Par le répresseur λ et son autorégulation ## Footnote Cela se produit même en l'absence de signaux d'expression.