Microbiote intestinal Flashcards
Quelles sont les différentes manières de définir le microbiote ?
Definitions :
-Taxonomique (quelles souches?)
- Fonctionnelle (quelles enzymes ?métabolites ?…)
- Ecologique (origine de la colonisation)
- Dynamique (disruption vs résistance + résilience, croissance)
Comment est composé le microbiote?
Bactérie > Levures > Virus
Principaux phyla :
- Bacteroidetes
- Firmicutes (Bacillota)
- Proteobacteria (Pseudomonadota)
- Actinomycetota
Qu’est-ce que la diversité alpha vs beta?
alpha : diversité au sein du même échantillon (nombre d’espèces)
beta : diversité entre plusieurs échantillons (espèces en commun)
Comment évolue le microbiote avec l’âge ?
La diversité augmente.
Au début de la vie : 60-70% du microbiote sont des bifidobacteries vs 10% à l’âge adulte
Comment la diète influence le microbiote ?
Exemple des enfants du burkina vs italie.
Diète du BF : Riche en fibre, pauvre en calorie.
- Bacteroidetes ++
- Bactéries produisant SCFA
- + diversité, activité, compo…
- Protection contre les pathogènes
Vs
Diète italie : Pauvre en fibre, riche en calorie.
- Firmicutes ++
- Moins de diversité
Exemple de souris gnotobiotique privées de fibres :
- Diminution de mucus, les bactéries sont plus proches de l’épithélium.
Quels sont les grandes fonctions du microbiote ?
- Rôle métabolique/Homéostasie énergétique
- Maturation immunitaire
- Effet barrière
- Axe intestin-cerveau
En quoi le microbiote joue un rôle dans l’homéostasie énergétique et le métabolisme ?
- Apport 10% de notre énergie
- Production de métabolites (SCFA)
- métabolisme des a. biliaires et xénobiotiques
- biosynthèse de vitamines (K et B12)
- hydrolyse et fermentation de fibres alimentaires
En quoi le microbiote joue-t-il un rôle de barrière?
En empêchant la prolifération de pathogènes (résistance)
Que sont les CAZmes?
Carbon hydrates-activated enzymes.
ex : Glycoside hydrosale.
Certaines bactéries produisent ces enzymes ce qui fait du microbiote un acteur majeur de la digestion.
Permet la production de :
- a.a
- polysaccharides, SCFA
- vitamines
- microconstituants (glycosinolates, polyphenols)
Donnez un exemple d’expérience mettant en évidence le rôle du microbiote comme barrière et pour le système immunitaire.
Souris IL-10-/-
- Germ-free
Ou - Colonisation aerobie
Ou - Colonisation anaerobie
+ C. Jejuni.
Les souris Germ Free ont mTor activé + infection
Aerobie => mTor moins activé, infection +/-
Anaérobie => mTor désactivé et - infection
Qu’est-ce que la dysbiose?
Une rupture de l’homéostasie entre microbiote et hôte se traduisant par :
- Perte de la richesse
- Augmentation de la perméabilité
- Diminution Faecalibacterium et Akkermansia
- Inflammation de bas grade
Qu’est-ce que la TMF, quand est-elle utilisée?
Transplantation de microbiote fécal.
Selles d’un donneur sain transplanté dans le tube digestif d’un patient pour rétablir équilibre, richesse et diversité du microbiote.
Utilisé pour les infections récurrentes par C. Diff
Donnez les caractéristiques de F prausnitzii
- Gram+
- produit du butyrate
- très sensible O2
- produit un peptide anti-inflammatoire
- Patients de la MC qui ont moins de F Prau font + de rechutes
Qu’est-ce que le SBS ou SGC ?
Comment le microbiote s’adapte-t-il?
Short Bowel Syndrome ou Syndrome de grêle court.
Causé par une chirurgie ou l’intestin est réséqué. Il n’en reste que 30-50 cm enciron.
Les patients SGC ont un microbiote composé à 90% de Lactobacillus.
- Produit >1000Kcal (vs 200-400Kcal pour une personne en santé)
- Augmentation GLP-1 et Leptine.
Lactobiote favorise la biodisponibilité des nutriments et l’énergie dans ce contexte de malabsorption sévère.
Comment trouver une souche intéressante de lactobacille comme potentiel probiotique?
1 - Incubation des souches avec cellules HT29
2- Souches non toxiques/inflammatoire retenues et données à C. Elegans
3 - Souche 63 sélectionnée car non toxique, n’affecte pas les mitochondrie et préserve le muscles avec l’âge
4- Essai de la souche sur rats ayant un apport calorique de 75% Induit synthèse de protéines musculaire et fav voie de l’insuline.
=> ça a un intérêt pour les personnes agées qui sont en risque de dénutrition, microbiote fragile et sarcopénie.
