núcleo y expresión génica Flashcards
envoltura nuclear
doble membrana con CPN
- membrana externa: se continúa con la del RER, ribosomas asociados a la cara ext
entre estas espacio perinuclear: continua con lumen del RER
- membrana interna: conectada con lámina nuclear
lámina nuclear
- tipo de FI
- se forma por prote lámina
- subyace la memb interna
- interactua con cromosoma, se adhiere a la cromatina
- forma el nucleoesqueleto: estructural y expresión de genes (al unirse a la croma)
complejo poro nuclear
complejo macromolecular de aprox 400 nucleoporinas
- dan permeabilidad selectiva
- transportan agua, iones, prote, mRNA, subunidades ribo
- las colas de las nucleoporinas están al centro y regulan el paso de molec más grandes
cromosomas y cromatina
- metafase: mayor grado de compactación
- se organizan en territorios cromosomales
-heterocromatina: condensada, no transcribe (se ve oscura) las fibras nucleosomales están compactadas.
-eucromatina: descondensada, apta para transcri (se ve clara) fibras nucleosomales separadas.
Transportes nucleo citoplasma
las proteínas q ingresan / salen tienen SEÑALES DE LOCALIZACIÓN NUCLEAR (SLN) o SEÑALES DE EXPORTACIÓN NUCLEAR (SEN): secuencias aminoacidicas específicas que son reconocidas por proteínas importinas/exportinas para ser pasadas a través de CPN
- al unirse a la señal forman el complejo proteína cargo-importina o proteína cargo-exportina , los que interactuan con los CPN
- al entrar al CPn se unen a proteína RAN asociada a GTP que permite liberar la proteína cargo de la importina.
asociaciones
proteínas reconocen nucleotidos: asociaciones electrostaticas
prote-prote: asoc electrostaticas e interacciones hidrofóbicas
reprogramacion nuclear
ocurre al transferir un nucleo a otro citoplasma, lo q implica la expresión diferencial de genes: inhibir o activar
modificar el ambiente del nucleo modifica la expresión de genes
expresión génica
- las señales q reciben las células del entorno determinan la expresión de varios genes
- la expresión es particular de cada célula y su entorno
- el fenotipo se observa en células y moléculas
variaciones en la expresión
en dos celulasa diferenciadas;
- las prote q se expresan son en distinta proporción
- algunas son exclusivas del tejido
- la expresión cambia con el envejecimiento y patologías
ligandos
un ligando se une al receptor de membrana, cambiando su conformación
provoca la liberación de proteínas de señalización intracelular
proteína ingresa al núcleo y modifica proteína unida al DNA q activa su transcripción
1 nivel de organización de cromatina: nucleosomas
nucleosoma: 1 octamero de histonas enrollado en dos vueltas de DNA
- octamero: dos de cada tipo
muchos nucleosomas forman una fibra nucleosomal
COLAS DE LAS HISTONAS
- quedan hacia fuera, interactuando con otras
- si estan METILADAS: compacta más la cromatina
- si estan ACETILADAS: descompactan
la fibra nucleosomal:
- en la periferia del nucleo y nucleolo están las zonas más compactas
- zonas descondensadas: house keeping genes: se expresan en la mayoría de la célula
*tissue specific genes: solo transcriben en algunos tipos celulares
2 nivel de organización: TAD
Dominios de asociación topológica
- unidades de cromatina con cercanía entre sí que se aislan de otros dominios a través de proteinas aisladoras
- se repelen entre sí para impedir que una secuencia reguladora regule al otro
- puede descompactar o compactarse la cromatina.
- los genes de un TAD comparten secuencias reguladoras de transcri (enhancer+factor de transcri)
secuencias regulares de transcripción del DNA
regulan cuánto DNA se transcribe
es una secuencia enhancer que se asocia a un factor de transcripción, los que inducen a la RNA polimerasa a q transcriba, aumentando la tasa de transcripción.
un promotor: es una secuencia de nucleotidos q conforma una región promotora, es decir abierta a transcribirse, el DNA está “apto” para la transcripción. aquí se asocian factores de transcripción basales
3 nivel de organización: territorios cromosómicos
cada cromosoma ocupa un territorio discreto en el núcleo
- se genera una arquitectura nuclear específica la cual afecta a la expresión
- la disposición de los cromos es diferente para diferentes tipos celulares
nucleolo
región de transcripción del rRNAZ
- se transcriben genes ribosomales en 5 cromosomas del genoma (10 si se cuentan los homólogos)
- en cada celula hay 400 genes ribo
- la rg espaciadora es donde está el promotor
- se forma el gen ribosomal 45s que se corta y al unirse a proteínas va a salir al nucleo para formar las subunidades
