Replikace DNA + Transkripce Flashcards
(19 cards)
Chem. vazba mezi fosfáty v nukleotidu
= Anhydridová vazba
- v nuklotidu fosfáty až 3 za sebou - nukleosid monofosfát/difosfát/trifosfát
Chem. vazba mezi fosfátem a cukrem
= fosfoesterová vazba
Chem. vazba mezi nukleosidem a bází
= N-glykosidická vazba
Purinové báze
= Adenin, guanin
Pyrimidinové báze
= Thymin, Uracil, Cytosin
Konec 5’ řetězce
= zpravidla fosfát
Konec 3’ řetězce
= zpravidla -OH
Konformace DNA
- nejčastější pravotočivá B (10 párů na závit)
- Konformace A: levotočivá, 11 párů na závit, částečně denaturovaná, RNA-RNA
- Konformace Z: levotočivá, 12 párů na závit, závislá na zvýšeném čísle GC párů
Topoizomeráza
- rozmotává nadobrátky při otevření DNA helikázou
Kde se může opakovaně zahájit replikace na stejném počátku během jednoho buněčného cyklu?
- u POLYTENNÍCH CHROMOZOMŮ
- např. v buňkách slinných žláz hmyzu
Přilehlé regulační oblasti genu u bakterií
= promotor a terminátor
DNA dependentní RNA polymeráza
- slouží k syntéze RNA
- bakterie: 1
- eukaryota: 3
Sigma faktor
- jen u prokaryota
- polypeptid (součást RNA polymerázy), který rozpoznává signální sekvenci promotoru a váže tam RNA-polymerázu -> pak vypuštěn
- první sepsaný nukleotid = +1 -> sigma sekvence = -10 a -35
DNA dependentní RNA polymeráza u eukaryota
- jsou 3
- RNA polymeráza I. - produkt rRNA, v jadérku
- RNA polymeráza II. - produkt mRNA, snRNA, v kayroplazmě
- RNA polymeráza III. - produkt 5S rRNA, tRNA, v karyoplazmě
Prekurzory RNA v eukaryota
- jsou upravovány než opustí jádro
- Pre-mRNA (=hnRNA) - capping, splicing, polyadenylace, případně editing
- Pre-rRNA (45S pre-tRNA) - štěpení na 28S; 18S; 5,8S rRNA a modifikace
- Pre-tRNA - štěpení a modifikace, syntéza CCA (=3 báze, vždy tam jsou posttranskripčně připojeny) terminální nukleotidtransferázou
Úprava hnRNA (pre-mRNA)
- polyadenylace 3’ konce
- methylguanosinová čepička na 5’ konci + methylace prvních dvou nukleosidů na C2
- čepička je ochrana před rozdvojením RNAázou
- uvnitř sekvence sestřihem vystřižením INTRONŮ
- methylace uvnitř sekvence RNA
- > úpravy hnRNA jsou KOTRANSKRIPČNÍ
RNA polymeráza II.
- má CTD (= C-terminální doména), na konci jedné podjednotky má pol. sekvenci AMK, která je tvořena HEPTAMERY (opakují se)
= platforma na KOTRANSKRIPČNÍ MODIFIKACE
Terminace RNA polymerázy II.
- zatímco promotor poznáváme na úrovni DNA sekvence, místo terminace je rozpoznané až na úrovni nascendentně syntetizované RNA - RNA je přerušená a na 3’ konec je dosyntetizován polyA konec
Co katalyzuje syntézu polyA sekvence
= Nukleotidyltransferáza
- substrátem je ATP
