RIBOZA-5-P Flashcards

1
Q

kaj je riboza-5-P

A
  • prekurzor za sintezo ribuloze-1,5-bifosfat
  • prekurzor za sintezo nukleotidov (RNA ali DNA)
  • prekurzor za sintezo FMN in FAD (dodatnih 6-7 encimskih korakov od stopnje riboze-5P + ribtolamino uracil)
  • prekurzor za sintezo histidina (dodatnih 12 encimskih korakov)
  • prekurzor za sintezo tiamin pirofosfata (TPP ali vitamin B1, dodatnih 12 encimskih korakov + glicin + tirozin + deoksiksiluloza
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Sinteza nukleotidov oz nukleozidov

A
  • Pri nukleotidih imamo dodano fosfate, pri nukleozidih jih ni na sladkorni podenoti ni
  • Sladkorno podenoto dobimo iz riboze-5P 🡪 uporabljena na 2 različna načina
  • Moramo narediti pirimidn ali purin (dušikove baze), ostale stvari lahko dobimo (ATP, sladkor)
  • Imamo vrjatno aromatičnih obročov
  • Uporabimo 2 popolnoma različni metabolni poti za nastanek dušikovih baz
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

biosinteza pirimidinov

A

TIMIN, CITOZIN, URACIL
Podobna struktura, rabimo narediti obroč (iz različnih komponent)
- Ogljiki pridejo iz aspartata
- CO2 (fiskacija, rabimo vezat)
- Dušik pride iz glutamina
Imamo 2 anorganski snovi, ki jih vgradimo na organski obroč – asimilacija CO2 in NH4 iz okolja. Potem dodamo še aspartat (moramo še sintetizirat)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

KARBONIL SINTAZA

A

Mehanizem
- Bikarbonat (večinska oblika CO2 v vodi pri pH=7), imamo karboksilno in hidroksilno skupino
- COOH moramo aktivirat z ATP (zelo neaktivna oblika karbonila), dobimo karbamatično skupino
- Nato lahko prenesemo amino skupino na karbonilni ogljik (nujna predhodna aktivacija)
- Ko se to zgodi izbijemo fosfat, imamo amino skupino vezano na karbonilni ogljik
- Iz karbamata? (imamo aktivirano karboksilno skupino z amino skupino) lahko naredimo karbamoil fosfat
Enega od dušikov in ogljikov v »obroču« že imamo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

KARBAMOIL FOSFAT SINTEZA UREE

A

Karbamoil fosfat bakterije uporabljajo pri urea ciklu, bolj pomembna pri živalih za odstranjevanje viška dušika (problematično če ne dela urea cikel!)
- Na ornitin vežemo karbamoil fosfat (aktivirana oblika amonija), fosfat izpade
- Dobimo citrulin, na katerega se lahko veže aspartat (potrebna aktivacija z ATP)
- Dobimo zelo dolgo molekulo arginosukcinat, razpade na 2 dela: fumarat in arginin
- Fumarat uporabimo naprej v Krebsovem ciklu (generiranje ATP ali druge potrebe)
- Arginin (dušik) želimo spravit ven, razcepimo arginin na ureo in ortinin
- Odveče dušik preko uree spravimo ven (dušik spravljen v amino skupini, ni amonijak)
Ključno je da odstranimo amonij preko karbanoil fosfata varno spravimo v ureo in ven in ne izgubljamo ogljika

Proteinsko bogata hrana: nastane veliko amonija in glutamta (ta se preko oskaloacetata spravi v aspartat 🡪 eden izmed intermediatov ureaa cikla)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

KARBAMOIL FOSFAT- SINTEZA OROTATA

A

Želimo narediti heterociklični obroč, v pirimidinskem obroč imamo 2 dušikova atoma 🡪 deluje kot dušikova baza
- Preostanek ogljika prispeva aspartat
- Imamo molekuli, ki je pripravljena da se združi v obroč: karbonil, amino skupino na obeh koncih
- Združimo v obroč, dobimo dihidroorotat (prekurzor za vse pirimidinske nukleotide/nukleozide)
- Pride do encimske oksidacije, dobimo dvojno vez
- Dobimo orotat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

NASTANEK ORTIDINA

A

Če hočemo narediti nukleozid moramo gor vezat sladkor ribozo-5P
- Riboza-5P je že aktivirana ampak ni dovolj 🡪 rabimo še enkrat aktivirat, prenesemo pirofosfat (orotat se lahko gor veže)
- Dobimo fosforibozapirofosfat ali PRPP
- Na PRPP vežemo orotat, pride do odcepitve Ppi
- Preko aktiviranega dušika lahko nukleofilno napademo karbokation
- Dobimo N-glikozifno povezavo, oritidin monofosfat (načeloma že nt, ne uporablja DNA/RNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

sinteza uridin fosfata

A

Pomembna je dekarboksilacija CO2 (ga ne najdemo na nukleotidih). Ni tako enostavna reackija
Gama ogljik je preveč daleč za beta dekarboksilacijo, gama dekarboksilacija je zelo počasna
Potrebujemo enicm da blazno pospeši reakcijo (še zmeraj počasno za encimsko katalizirane reakcije)- encim je orotidin-5 dekarboksilaza
Dobimo uridin monofosfat/ uridin-5’ fosfat/UMP

Lahko uporabimo pri sintezi RNA, ne pa pri DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

sinteza utp in ctp

A

Iz UMP lahko naredumo UDP, naredimo UTP
Preko UTP lahko naredimo CTP (razlika v prisotnosti amino skupine pri CTP)
- Rabimo glutamin, da nam donira amino skupino
- Naredimo CTP, nov nukleotid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

kaj je ump

A

uridin-5 monofosfat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

kaj je utp

A

uracil

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

kako sintentiziramo UTP?

A

KARBONIL SINTAZA–> Mehanizem
- Bikarbonat (večinska oblika CO2 v vodi pri pH=7), imamo karboksilno in hidroksilno skupino
- COOH moramo aktivirat z ATP (zelo neaktivna oblika karbonila), dobimo karbamatično skupino
- Nato lahko prenesemo amino skupino na karbonilni ogljik (nujna predhodna aktivacija)
- Ko se to zgodi izbijemo fosfat, imamo amino skupino vezano na karbonilni ogljik
- Iz karbamata? (imamo aktivirano karboksilno skupino z amino skupino) lahko naredimo karbamoil fosfat
Enega od dušikov in ogljikov v »obroču« že imamo
KARBAMOIL FOSFAT – SINTEZA OROTATA
Želimo narediti heterociklični obroč, v pirimidinskem obroč imamo 2 dušikova atoma 🡪 deluje kot dušikova baza
- Preostanek ogljika prispeva aspartat
- Imamo molekuli, ki je pripravljena da se združi v obroč: karbonil, amino skupino na obeh koncih
- Združimo v obroč, dobimo dihidroorotat (prekurzor za vse pirimidinske nukleotide/nukleozide)
- Pride do encimske oksidacije, dobimo dvojno vez
- Dobimo ortotat
NASTANEK ORTIDINA
Če hočemo narediti nukleozid moramo gor vezat sladkor ribozo-5P
- Riboza-5P je že aktivirana ampak ni dovolj 🡪 rabimo še enkrat aktivirat, prenesemo pirofosfat (orotat se lahko gor veže)
- Dobimo fosforibozapirofosfat ali PRPP
- Na PRPP vežemo orotat, pride do odcepitve Ppi
- Preko aktiviranega dušika lahko nukleofilno napademo karbokation
- Dobimo N-glikozifno povezavo, oritidin monofosfat (načeloma že nt, ne uporablja DNA/RNA)
Pomembna je dekarboksilacija CO2 (ga ne najdemo na nukleotidih). Ni tako enostavna reackija
Gama ogljik je preveč daleč za beta dekarboksilacijo, gama dekarboksilacija je zelo počasna
Potrebujemo enicm da blazno pospeši reakcijo (še zmeraj počasno za encimsko katalizirane reakcije)
Dobimo uridin monofosfat/ uridin-5’ fosfat/UMP- iz ump naredimo udp in iz tega utp

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

KAJ JE CTP

A

CITOZIN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

opiši sintezo ctp-ja

A

KARBONIL SINTAZA–> Mehanizem
- Bikarbonat (večinska oblika CO2 v vodi pri pH=7), imamo karboksilno in hidroksilno skupino
- COOH moramo aktivirat z ATP (zelo neaktivna oblika karbonila), dobimo karbamatično skupino
- Nato lahko prenesemo amino skupino na karbonilni ogljik (nujna predhodna aktivacija)
- Ko se to zgodi izbijemo fosfat, imamo amino skupino vezano na karbonilni ogljik
- Iz karbamata? (imamo aktivirano karboksilno skupino z amino skupino) lahko naredimo karbamoil fosfat
Enega od dušikov in ogljikov v »obroču« že imamo
KARBAMOIL FOSFAT – SINTEZA OROTATA
Želimo narediti heterociklični obroč, v pirimidinskem obroč imamo 2 dušikova atoma 🡪 deluje kot dušikova baza
- Preostanek ogljika prispeva aspartat
- Imamo molekuli, ki je pripravljena da se združi v obroč: karbonil, amino skupino na obeh koncih
- Združimo v obroč, dobimo dihidroorotat (prekurzor za vse pirimidinske nukleotide/nukleozide)
- Pride do encimske oksidacije, dobimo dvojno vez
- Dobimo ortotat
NASTANEK ORTIDINA
Če hočemo narediti nukleozid moramo gor vezat sladkor ribozo-5P
- Riboza-5P je že aktivirana ampak ni dovolj 🡪 rabimo še enkrat aktivirat, prenesemo pirofosfat (orotat se lahko gor veže)
- Dobimo fosforibozapirofosfat ali PRPP
- Na PRPP vežemo orotat, pride do odcepitve Ppi
- Preko aktiviranega dušika lahko nukleofilno napademo karbokation
- Dobimo N-glikozifno povezavo, oritidin monofosfat (načeloma že nt, ne uporablja DNA/RNA)
Pomembna je dekarboksilacija CO2 (ga ne najdemo na nukleotidih). Ni tako enostavna reackija
Gama ogljik je preveč daleč za beta dekarboksilacijo, gama dekarboksilacija je zelo počasna
Potrebujemo enicm da blazno pospeši reakcijo (še zmeraj počasno za encimsko katalizirane reakcije)
Dobimo uridin monofosfat/ uridin-5’ fosfat/UMPDobimo uridin monofosfat/ uridin-5’ fosfat/UMP. iz ump naredimo udp in iz tega utp–> na utp vežemo amino skupino, ki jo donira glutamin- dobimo citozin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

KAJ JE TMP

A

timidin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

opiši sintezo TMP-JA

A

KARBONIL SINTAZA–> Mehanizem
- Bikarbonat (večinska oblika CO2 v vodi pri pH=7), imamo karboksilno in hidroksilno skupino
- COOH moramo aktivirat z ATP (zelo neaktivna oblika karbonila), dobimo karbamatično skupino
- Nato lahko prenesemo amino skupino na karbonilni ogljik (nujna predhodna aktivacija)
- Ko se to zgodi izbijemo fosfat, imamo amino skupino vezano na karbonilni ogljik
- Iz karbamata? (imamo aktivirano karboksilno skupino z amino skupino) lahko naredimo karbamoil fosfat
Enega od dušikov in ogljikov v »obroču« že imamo
KARBAMOIL FOSFAT – SINTEZA OROTATA
Želimo narediti heterociklični obroč, v pirimidinskem obroč imamo 2 dušikova atoma 🡪 deluje kot dušikova baza
- Preostanek ogljika prispeva aspartat
- Imamo molekuli, ki je pripravljena da se združi v obroč: karbonil, amino skupino na obeh koncih
- Združimo v obroč, dobimo dihidroorotat (prekurzor za vse pirimidinske nukleotide/nukleozide)
- Pride do encimske oksidacije, dobimo dvojno vez
- Dobimo ortotat
NASTANEK ORTIDINA
Če hočemo narediti nukleozid moramo gor vezat sladkor ribozo-5P
- Riboza-5P je že aktivirana ampak ni dovolj 🡪 rabimo še enkrat aktivirat, prenesemo pirofosfat (orotat se lahko gor veže)
- Dobimo fosforibozapirofosfat ali PRPP
- Na PRPP vežemo orotat, pride do odcepitve Ppi
- Preko aktiviranega dušika lahko nukleofilno napademo karbokation
- Dobimo N-glikozifno povezavo, oritidin monofosfat (načeloma že nt, ne uporablja DNA/RNA)
Pomembna je dekarboksilacija CO2 (ga ne najdemo na nukleotidih). Ni tako enostavna reackija
Gama ogljik je preveč daleč za beta dekarboksilacijo, gama dekarboksilacija je zelo počasna
Potrebujemo enicm da blazno pospeši reakcijo (še zmeraj počasno za encimsko katalizirane reakcije)
Dobimo uridin monofosfat/ uridin-5’ fosfat/UMP–> udp–> utp–> - Začnemo iz UMP, nato moramo ribozo spremeniti v deoksiribozo (spremenimo sladkor).
- Iz sladkorja, ki ima 2-OH skupini na poziciji 2 in 3 naredimo sladkor, ki ima samo eno -OH (preko radikalskih reakcij)
- Ko dobimo deoksi-UMP ali dUMP, v nadaljevanju dTMP
- Moramo prenesi eno od metilnih skupin, uporabimo THF (veže eno metilno skupino in jo prenese)
- Dobimo timidin

17
Q

Kaj je ttp

A

je nukleozid timidina–> gre po sintezi timidina–> dTDP–> Dttp

18
Q

BIOSTINTEZA PURINOV - NARIŠI

A

Purinski nukloetidi: adenin in gvanin
2 različna nt, ki lahko tvorita različno število vodikovih vezi (2 ali 3)
PURIN = PIRIMIDIN + IMIDAZOLNI OBROČ
Pirimidini so sestavljeni iz enega heterocikličnega obroča z veliko dušiki
Za sintezo purinov ne moremo uporabiti delnega obroča pirimidinov in mu dodati imdazolni obroč 🡪 potrebna sinteza de novo
Ogljike pridelamo iz različnih komponent:
- Glutamin (2 molekuli), donor dušika
- Druga 2 dušika dobimo iz glicina in aspartata
- Za prenos 1C uporabimo FTHF
- Dodamo še anorganski ogljik 🡪 potrebna aktivacija z ATP!
- Nukleotid je ključen za NK, lahko ga uporabimo še kje drugje

Sinteza je energetsko bogat proces, veliko bolje da recikliramo (oz. uplenimo) nt, kot da jih sintetiziramo.

19
Q

SINTEZA PURINA

A

AKTIVACIJA RIBOZE-5P
Sinteza je vezana na ključni intermediat riboza-5P (pri piridinih uporabimo kasneje, samo dodamo)
Tu nam služi kot platforma, kamor dodajamo elemenete in tvorimo purinski obroč.

  • Riboza je že aktivirana z fosfatom
  • Da jo spravimo v biosintezo jo rabimo še enkrat aktivirat z ATP, dodamo pirofosfat, aktiviramo anomerni ogljik
  • Z glutaminom dodamo amino skupino na anomerni ogljik

Samo začetek, v purinskem obroču rabimo 4 dušikove povezave. Tu imamo vzpostavljeno glikozidno povezavo
Aktivirana riboza-PP je uporabna še za sintezo: NAD+, NADP+, histidin, triptofan,…
BIOSINTEZA IMIDAZOLA
Mehanizem sinteze imidazola:
- Predhodno smo dobili en dušik v obroču, zdaj dodamo glicin (aminoskupina na sladkorju)
- Če imamo amino in karboksilno skupino, lahko naredim amid/peptidno povezavo
- Če hočemo COOH vezat, moramo prej aktivirat preko ATP
- Ko se veže še glicin se ze začenja gradnja obroča
- Dodamo formilno skupino (1C) preko folatov, obroča še ne zapremo
- Naredimo še dodatno mesto na karbonilu (keton?)
- Na keton z glutaminom (donor za dušik) dodamo amino skupino, potrebujemo še ATP
- Obroč združimo preko dodatnega ATP: povežemo karbonilni del in amino skupino (težje delamo z imidazolnem obroču, ko je enkrat zaprt)
Na amino skupino vežemo CO2 (neaktivna oblika karboskilne skupine, uporabimo ATP da aktiviramo), podaljšamo verigo
- Encim prestavi pozicijo CO2, uporabimo mutazo
- Imamo 2 kraka, kjer lahko gradimo pirimidinski obroč
- Podaljšanje obroča naredimo z aspartatom (imamo 2 funkcionalni mesti amino in cooh skupino)
- Uporabimo amino skupino da se poveže
- Predhodno aktiviramo ATP, da omogočimo nastanek povezave med amino in COOH skupino 🡪 AK vežemo na COOH konec nastajujočega pirimidinskega obroča
- Velik del molekule gre ven v obliki fumarata, dobimo funkcionalno molekulo
(in general ne uporabljamo vedno istega donorja dušika)
Mehanizem sinteze inozin fosfata
Rabimo zaključit z ogljiki, v nov obroč, uporabno za sintezo GTP/ATP. Moramo dodati 1C in povezat skupaj
- Moramo dodati še 1c, uporabimo formil-THF (uporabljamo načeloma samo pri sintezi pirimidninskih obročov),
- V naslednjem koraku encimsko povežemo, izpade voda
- Dobimo prekurzor za vse purinske nukleotide (2 pomembna + deirvati)

20
Q

MEHANIZEM SINTEZE PIRIMIDINSKEGA OBROČA

A
  • Na amino skupino vežemo CO2 (neaktivna oblika karboskilne skupine, uporabimo ATP da aktiviramo), podaljšamo verigo
  • Encim prestavi pozicijo CO2, uporabimo mutazo
  • Imamo 2 kraka, kjer lahko gradimo pirimidinski obroč
  • Podaljšanje obroča naredimo z aspartatom (imamo 2 funkcionalni mesti amino in cooh skupino)
  • Uporabimo amino skupino da se poveže
  • Predhodno aktiviramo ATP, da omogočimo nastanek povezave med amino in COOH skupino 🡪 AK vežemo na COOH konec nastajujočega pirimidinskega obroča
  • Velik del molekule gre ven v obliki fumarata, dobimo funkcionalno molekulo
    (in general ne uporabljamo vedno istega donorja dušika)
21
Q

BIOSINTEZA INOZIN FOSFATA - PURINSKI OBROČ

A

Mehanizem sinteze inozin fosfata
Rabimo zaključit z ogljiki, v nov obroč, uporabno za sintezo GTP/ATP. Moramo dodati 1C in povezat skupaj
- Moramo dodati še 1c, uporabimo formil-THF (uporabljamo načeloma samo pri sintezi pirimidninskih obročov),
- V naslednjem koraku encimsko povežemo, izpade voda
- Dobimo prekurzor za vse purinske nukleotide (2 pomembna + deirvati)

22
Q

BIOSINTEZA AMP IN GMP IZ INOZIN-5P

A

Če hočmo narediti GTP
- Nenasičeno vez v inozunu spremenimo, oksidiramo ta del in dobimo keton. Omogoča nam dodajanje še enega dušika
- Dodaja se amonijak, rabimo aktivirat z ATP (anorganska spojina)
- Dobimo GDP, dodamo še 2 fosfata in dobimo GTP

Če hočemo narediti ATP
- Dodamo amino skupino (na malo drugačen način), uporabimo aspartat
- Odstranimo večji del aspartata (fumarat), ohranimo samo amino skupino (več načinov dodajanja amino skupin)

23
Q

BIOSINTEZA DEOKSINUKLEOTIDOV

A

Dobimo nt za sintezo RNA, za DNA nt rabimo narediti še eno reackijo (bazni del pustimo pri miru)
Rabimo modificirat sladkorni del, odstranimo eno izmed -OH skupin
- Dobimo deoksiribonukloetide, ni enostavna reakcija, potrebuje radikalske korake
- Za dGTP, dATP, dCTP lahko naredimo s tem nt. Uporabimo encim da iz UDP dobimo dUTP, s pomočjo THF pridemo do DUMP in v nadaljevanju do dTTP.

Mehanizem biosinteze deoksinukleotidov
Potrebujemo encim, ki se ukvarja z radikalskimi stopnjai
- Encim lahko producira radikalsko stopnjo 🡪 mesto na encimu, kjer elektroni niso sparjeni.
- Vzamemo enega od vodikov, prenesemo radikal iz encima na nukleotid, ki ga želimo deoksigenirat (zmanjšamo štrevilo -OH skupin, tarla je drugi C-atom v obroču)
- Encim ima v svojem aktivnem mestu veliko žvepla (2), omogočata protonoacijo OH skupine, izleti ven kot voda iz riboze
- Encim oz. radikal rabimo regenetirat: radikal na ribozi ne rabimo več in ga regeneiramo nazaj??
- Rabimo regenrirat radikal. Regenirramo z encimom brez prostega radikala?
- Dobimo deoksiribonukleoitd
- Vmes imamo resonančno strukturo, kjer imamo možnost dodajanja vodika nazaj

24
Q

UPORABA RIBOZE 5-P PRI BIOSINTEZI

A

Kadar imamo večjo molekulo encim lažje prepozna

Drugje je bila drugačna vloga riboze-5p (pirimidinski dodamo na koncu), purinski porabimo ribozo in gradimo na njej
- Združimo gtp in atp?

BIOSINTEZA HISTIDINA
- Imamo ribozo-5P in ATP (naredimo iz riboze-5P)
- Združimo in dobimo molekulo, ki ima obe ribozi vezane gor
- Najprej odstranimo nekaj fosfatov, razdelimo molekuli, nekoliko drugače.
- Dobimo imidazolni obroč (ključna stvar za funkcioniranje histidina)
- Ni še AK, moramo vezati amino skupino iz glutamata
- Vrhnji del moramo spremeniti v COOH, imamo OH (naredimo 2 v 2 korakih)
- Oksidiramo OH, dobimo aldehid, še teka oksidiramo COOH
- Dobimo aminokislino, ki ima imidazolni obroč (ključno pri histidinu)

25
Q

BIOSINTEZA HISTIDINA

A
  • Imamo ribozo-5P in ATP (naredimo iz riboze-5P)
  • Združimo in dobimo molekulo, ki ima obe ribozi vezane gor
  • Najprej odstranimo nekaj fosfatov, razdelimo molekuli, nekoliko drugače.
  • Dobimo imidazolni obroč (ključna stvar za funkcioniranje histidina)
  • Ni še AK, moramo vezati amino skupino iz glutamata
  • Vrhnji del moramo spremeniti v COOH, imamo OH (naredimo 2 v 2 korakih)
  • Oksidiramo OH, dobimo aldehid, še teka oksidiramo COOH
  • Dobimo aminokislino, ki ima imidazolni obroč (ključno pri histidinu)
26
Q

bIOSINTEZA NAD (p) + IZ RIBOZE 5 p

A

Kombiniramo z nikotinamidom (podoben vitaminu B3, B3 ima še eno amino skupino)
- Združimo ribozo (PRPP) in nikotinamin preko glikozidne povezave.
- Ko imamo glikotilamid, ga povežemo z ATP, dobimo NAD+
- Kadarkoli transformiramo do NADP (več mest kamor vežemo P, uporabimo spodnjo/zadnjo OH skupino da vežemo fosfat)
Imamo redoks mediator, ki ga uporabljamo v reakcijah

27
Q

BIOSINTEZA RIBOFLAVINA + FAD

A
  • Iz riboze naredimo ribulozo (iz aldehidnega v keto sladkor)
  • Ko imamo ribulozo lahko kombiniramo z GTP (ga nekoliko modificiramo), dobimo ribitol
  • Imamo pririmidinski obroč, ribozo, manjka nam imidazolni obroč (imamo samo en del – se da iz GTP izsledit z reakcijami, drugo je riboza?)
  • Ti 2 molekuli združimo (z kodenzacijo), dobimo ven RIBITOL (že ima nekaj obročev, podoben intermediatu)
  • Združimo, mutiramo da lahko vgradimo še 3 obroč (gre lahko v sintezo FAD, pomemben prenašalec elektronov)
  • Ga reduciramo in pripravimo za funkcijo redoks prenaševalca
28
Q

KAJ JE FAD

A

FLAVIN ADENIN DINUKLEOTID

29
Q

KAJ JE FMN

A

FLAVIN MONOMUKLEOTID

30
Q

BIOSINTEZA TIAMIN PIROFOSFATA

A

Moramo narediti tiamin pirofosfat, ključni del molekule je, kjer imamo žveplo in dušik (ni prikazano na sliki karbonilni anion)
- Uporabimo ribulozo, histidin dobimo iz ribuloze, cisteina še ne znamo naredit.
- Rabimo donor za žveplo (cistein, klaisčen) na ribulozo, dobimo tiazolni obroč (ključni del)
- Iz histidina in pirodokslafosfata-PLP naredimo nov obroč, združimo na koncu
- Rabimo vložiti 5 ATP za sintezo (veliko!)
- Dobimo vitamin B1