Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

B3 > RNA. Transkription,Translation (F11+F12) > Flashcards

RNA. Transkription,Translation (F11+F12) Flashcards

1
Q

Hvad er RNA transkription?

A
  • RNA kopi af information fra DNA
  • aflæses i enheder, som kaldes gener
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hvilke typer RNA? + funktion

A

Hovedtyper
- mRNA: koder for proteiner
- tRNA: oversætter mellem mRNA og aminosyre i proteinsyntesen
- rRNA: former ribosomer og katalysere proteinsyntesen

2 mindre typer
- miRNA: regulere gen-ekspression i eukaryoter
- sRNA: regulere gen-ekspression i prokaryoter
- andre små: hjælper i forskellige processer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvad står for transkriptionen af de forskellige RNA? i hhv. pro og eu?

A

prokaryoter
- kun 1 RNA polymerase til alle

eukaryoter
- RNA polymerase 1 –> rRNA
- RNA polymerase 2 –> mRNA + miRNA
- RNA polymerase 3 –> tRNA + andre små

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hvordan starter transkriptionen?

A

RNA polymerase
- kan starte selv med at bryde hydrogenbinding
- bruger kun 1 DNA streng

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvad er den kodende streng? relation til RNA

A

Den fri DNA-streng, som angiver sekvensen for genet.

RNA-transkriptet
- danner ikke basepar
- men er identisk med retning (5’ til 3’) og sekvens (men U erstatter T)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvad er template-strengen? relation til RNA

A

DNA template
- danner basepar med RNA-transkriptet
- aflæses altså 3’ til 5’
- komplimentær til RNA’et

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvad er transkription?

A
  • På DNA strengen sidder små enheder –> gener
  • hvert gen reguleres og koder for et mRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvordan transkripteres DNA til mRNA?

A

promotor og andre regulative regioner gør det muligt for RNA polymerasen at
- starte transkription ved startkodon
- dislocere pre-mRNA ved slutkodon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvordan er et eukaryot gen opbygget?

A

TSS (transcript start) +1
- cap 5’ sættes på her efter transkription

nedstrøms –> kodende region
- startkodon
- slutkodon
- poly(A)-hale

opstrøms –>
- promotor region (-20)
- andre regulative regioner (mere -)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvad er promotor-regionen? funktion?

A

region med boxe, der har sekvenser med bestemt funktion
- sidder tæt på TSS
- binder polymerasen
- genkender startkodon = ved at nu skal der transkripteres.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvad udgør en vigtig komponent i promotor-regionen? hvor+funktion?

A

TATA-boxen
- sidder mellem -26 og -31
- binder sigmafaktoren TBP, som regulere binding mellem RNA polymerase og promotor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvad er en sigmafaktor?

A
  • et protein, som er vigtig for initiering af RNA transkription i operons
  • specificere hvilket gens promoter, der skal sættes i gang
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvilke andre regulative regioner er der?

A

basale transkriptionsfaktorer
- binder til core promoter, TBP
- eks. RNA polymerase og TF2H

specificeret transkriptionsfaktorer
- mere opstrøms på promoter
- enhancer region = aktivator
- silencer region = repressror

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvilken basal transkriptionsfaktor er vigtig at kende? funktion?

A

TF2H
- helicase funktion = deler DNA og gør plads
- fosforylere RNA polymerase = gør aktiv

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvad er en operon?

A

baktieriel operon
- prokaryot celle
- 1 promotor kan godt transkriptere flere gener til 1 mRNA
- ingen introns = alt bruges
- transkription og translation sker i et hug.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvad kan/kan ikke RNA polymerase - til forskel for DNA?

A

RNA polymerase
- kan starte de novo (uden fri OH-gruppe)
- men har ikke exonukleaseaktivitet (ingen proofreading)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hvordan færdigudvikles transkriptionen af mRNA i eukaryote celler?

A
  • når 5’ ende frigives ved start = cap 5’ kommer på.
  • når 3’ ende frigives til sidst = poly(A)-hale på.
  • splicing = introns fjernes
  • transport ud af nuclear pore
  • binder til lille ribosomale subunit
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hvad er cap 5’? opbygning og funktion?

A

Opbygning
- nukleotid GTP (guanosinetri P)
- +1 methyl = methylguanosine

funktion
- beskytte mod nedbrydning
- hjælpe ribosom med at genkende mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hvordan bindes cap 5’ til RNA? + navn?

A

RNA capping
- ved hydrolyse vil GTP (cap5’) binde med alpha-P og frigive 2P (som normalt)

  • 5’-enden i RNA har 3P, men smider 1 P for at binde med alpha-P fra GTP

= tri phosphat binding

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hvad er poly(A)-halen? opbygning og funktion?

A

opbygning
- sekvens af A’er
- kan være rigtig alng

funktion
- beskytter mod nedbrydning
- jo længere, jo bedre beskyttelse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hvordan sættes poly(A)-halen på? + navn?

A

kaldes polyadenylation
- RNA polymerase genkender et poly(A)-signal = nu skal phosphordiesterbinding kløves
- poly (A) polymerase sætter poly(A)-hale i enden efter kløvning.

22
Q

Hvad er splicing?

A

at fjerne ikke-kodende regioner (introns) i det eukaryote mRNA
- fjerne introns
- beholde exons

gør pre-mRNA til mRNA

23
Q

Hvordan splejses det eukaryote RNA?

A
  • overgang mellem intron og exon har en speciel sekvens (AGGU)
  • genkendes af spliceosomet, som splejser.
24
Q

Hvad består spliceosomet af?

A
  • består RNA + proteiner kaldet snurps
    (snRNP’s)
25
Hvad er alternativ splicing?
mulighed for at lave forskellige proteiner ud fra samme pre-mRNA - muligt at vælge hvilke exons, der skal med - men ikke muligt at lave om på rækkefølge
26
Hvordan er RNA struktureret?
enkeltstreng - primær: sekvensen af strengen - sekundær: foldning i 2 dimensioner defineret af baseparring - tertiær: foldning i 3 dimensioner
27
Hvordan syntiseres rRNA og tRNA i prokaryote celler?
syntetiseres i lange transkripter og kløves af i små stykker alt efter, hvad der skal bruges. eks. 16s, 23s eller 2s rRNA
28
Hvordan syntetiseres rRNA i eukaryote celler? hvor?
- foregår i nucleoli, hvor rRNA + protein modificeres - blanding adskilles i 2 subunits (40S og 60S) - transporteres ud af kernen - mødes og danner ribosom (80S)
29
Hvad er tRNA? struktur?
Modent tRNA når - modificeret i loops - introns er fjernet tRNA har - antikodon i bunden - aminosyre-bindings site i toppen
30
Hvad er funktionen af tRNA?
- tRNA oversætter mRNA til aminosyre (adaptor) - det gøres ved at antikodon binder til kodon på mRNA
31
Hvor meget af genom bruges til kodning? hvad består genomet af?
genom = 3 mia. basepar 5% af genom = gener 5 % af gener = exons
32
Hvad er forskelle og ligheder på primasen og RNA polymerase 2?
ved primase - længden af produkt er kortere - ingen proofreading eller exo - bundet indtil den fjernes, hvor RNA polymerase fjernes med det samme
33
Kan RNA danne basepar?
ja. - når den transkripteres ud fra DNA template vil den hurtigt danne DNA-RNA par inden den slipper - når den foldes op i tRNA og translateres
34
Hvad er polycisktronisk RNA?
35
Hvordan er tRNA opbygget?
- loop-dannelse ved baseparring. - antikodon - aminosyre bundet i 3'-ende
36
Hvad er den genetiske kode?
- de 4 basepar kan kombineres i kodons af 3 - hvert kodon koder for 1 aminosyre
37
hvad betyder det at den genetiske kode er redundant og samtidig utvetydig?
redundant: 1 aminosyre kan kodes ud fra flere kodons utvetydig: 1 kodon koder kun for 1 aminosyre. flere kodons end der er aminosyre
38
Hvad er wobble interaktion? eks.
- den sidste baseparring i et kodon er en wobble - kan være variation i hvilken base - grunden til at flere kodons koder for samme aminosyre. eks. CUA og CUC er begge leucine.
39
Hvad er start og stop-kodon under translationen?
startkodon: AUG stopkodon: UGA, UAG, UAA
40
Hvad er specielt for den genetiske kode/DNA'et i mitochondrier?
- minder op bakterier - UGA er ikke stop men koder for tryptophan
41
Hvilke mutationer i DNA'et findes der?
point: 1 base ændring - silent: samme aminosyre - missense: anden aminosyre - neutral: anden aminosyre med samme kemiske egenskaber - nonsense: til stopkodon frameshift: skubber hele læsningen - insertion: tilsætter 1 base - deletion: fjerner 1 base
42
Hvad er aminoacyl-tRNA synethaser?
- enzym, der sætter aminosyre på tRNA med antikodon der passer til - sker før antikodon finder kodon på mRNA
43
Hvordan er ribosomer bygget op? struktur + inddeling
strukturer - 2 protein subunits --> lille (40S) stor (60S) - rRNA = peptidyl-transferase inddeling - A site: aminoacyl-site - P site: peptidyl-site - E site: ejection-site
44
Hvad er translationsprocessen? trin?
Initiering: - samling af ribosom og mRNA elongering: - binding af aminoacyl fra tRNA - dannelse af peptid-binding - translokation terminering - stopkodon - frigivelsesfaktor bindes - peptidkæde frigvies
45
Hvordan foregår initieringen? tRNA, mRNA og subunit 60S
1 - tRNA med methyl - tRNA og eIF2-GTP går i kompleks - dette initieringskompleks binder til lille ribosom unit pga. GTP og andre eIF's 2 - mRNA - eIF4F binder, folder ud og scanner efter kozaksekvensen (start - methyl) 3 - stor ribosom unit - bindes på - hydrolyse af GTP = fjernes sammen med eIF's
46
Hvordan foregår elongeringen?
binding - aminoacetyl tRNA til A-site. - EF + G-protein + GTP hydrolyseres og GTP frigives ved korrekt match peptid - peptidyl-transferase (rRNA) - dannelse af peptidbinding aminoacetyl i A-site translokation - ribosom får videre til næste vha. EF2+GTP - aminosyre fra A --> P (ud med tRNA = klar til nyt)
47
Hvordan foregår termineringen?
- ribosom møder stopkodon - ingen tRNA vil binde = frigivelsesfaktor i stedet - peptidyl-transforase hydrolyserer ende og frigiver peptidkæde
48
Hvad er polysomer?
mRNA, der har flere ribsomer siddende samtidig = koder samtidig.
49
Hvad er chaperoner?
små proteiner som - binder sig til peptidkæde - forhindrer uønskede interaktioner - hjælper med tertiærfoldning ved at katalyserer disulfidbroer.
50
Hvornår er der proteinsyntese i Ru ER?
- proteinsyntese med mange hydrofobe aminosyrer - skal direkte til golgi, så de kan pakkes og sendes - kan ikke lide cytosol
51
Hvad er post translationelle modifikationer? eksempel
- modificering, som sker efter translation - eksempel: fosforylering ved kinaser = aktivt/inaktivt
52
Hvad er signal-peptider?
peptid, der sidder på og guider det nye protein ved transport ud af celle

B3 (14 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions