Translacja i potranslacyjna modyfikcja białek Flashcards

(73 cards)

1
Q

Czego wymaga przeniesienie informacji z DNA na RNA?

A

komplementarności zasad azotowych

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Czego wymaga przeniesienie informacji z RNA na polipeptyd?

A

kodu genetycznego

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Jakie są cechy kodu genetycznego?

A
  1. trójkowy
  2. nienakładający się
  3. ciągły (bezprzecinkowy)
  4. ramka odczytu - wybór kodonu AUG
  5. uniwersalny
  6. jednoznaczny
  7. zdegenerowany
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Co to znaczy, że kod genetyczny jest trójkowy?

A

znaczy to że trzy leżące obok siebie nukleotydy tworzą kodon (triplet) - pojęcie to dotyczy sekwencji nukleotydów w mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Co oznacza, że kod genetyczny jest nienakładający się?

A

Rybosom nie cofa się do poprzedniego nukleotydu odczytując kodony mRNA. Informacja zakodowana jest w kolejnych trójkach nukleotydów i nie występują sytuacją, w kótrej jeden z nukleotydów jest częścią dwóch sąsiednich kodonów.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Co przedstawia, proszę ja Ciebie, ten rysunek?

A

różne możliwości występowania ramki odczytu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Co to znaczy, że kod genetyczny jest uniwersalny?

A

znaczy to, że dotyczy wszystkich organizmów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Co to za związek?

A

selenocysteina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Co to znaczy, że kod genetyczny jest jednoznaczny?

A

dany kodon koduje tylko jeden aminokwas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Co to znaczy, że kod genetyczny jest zdegenerowany?

A

jeden aminokwas może być kodowany przez kilka kodonów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Czego dotyczy zasada tolerancji?

A

zawsze musi być zachowana zgodność jedynie między dwoma pierwszymi nukleotydami kodonu (mRNA) i antykodonu (tRNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Co to jest antykodon i kaj się znajduje?

A

jest to sekwencja trzech nukleotydów, których zasady są komplementarne do zasad kodonu danego aminokwasu na mRNA

znajduje się w tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Z czego składa się tRNA?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Którą częścią tRNA łączy się z mRNA (i z którą jego częścią)?

A

antykodon (tRNA) łączy się z kodonem (mRNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Jakie znasz zmodyfikowane zasady tRNA?

A
  • tiourydyna
  • inozyna
  • rybotymidyna
  • pseudourydyna
  • dihydrourydyna
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Co to jest?

A

inozyna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Co to jest za związek?

A

rybotymidyna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Co to jest za związek?

A

pseudourydyna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Co to jest za związek?

A

dihydrourydyna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Za co odpowiedzialne jest ramię akceptorowe tRNA?

A

za wiązanie aminokwasu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Za co odpowiedzialne jest ramię antykodonowe tRNA?

A

za rozpoznawanie kodonów w mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Jaki enzym katalizuje reakcję przyłączenia aminokwasu do tRNA?

A

syntetaza aminoacylo-tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Jaka jest dość istotna zdolność syntetaz aminoacylo-tRNA?

A

sprawdzanie poprawności wprowadzonego aminokwasu i korekcja błędów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Czy amiokwas ma jakiś wpływ na to co dzieje się po przyłączeniu go do tRNA?

A

nie, od chwili przyłączenia to tRNA decyduje o dalszych losach aminokwasu (aminokwas nie jest rozpoznawany)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Co to jest translacja?
proces syntezy łańcucha polipeptydowego białek na matrycy mRNA
26
Czy translacja jest chaotyczna, czy przebiega w określonym porządku?
jest to proces, który przebiega w określonym porządku najpierw przebiega **inicjacja**, następnie wydłużanie łańcucha polipeptydowego, czyli **elongacja**, a na końcu zakończenie syntezy czyli **terminacja**
27
W jakim kierunku odbywa się biosynteza łańcucha polipeptydowego podczas translacji?
od N-końca do C-końca łańcucha polipeptydowego
28
W jakim kierunku rybosomy "czytają" mRNA?
od 5' do 3'
29
Gdzie odbywa się translacja i co to znaczy?
translacja odbywa się na **polirybosomach** (nazywanych również polisomami oznacza to, że jedna cząsteczka mRNA może być "czytana" jednocześnie przez kilka rybosomów
30
W jaki sposób odbywa się wydłużanie łańcucha polipeptydowego podczas translacji?
odbywa się poprzez dodawanie aminokwasów do końca C polipeptydu recydującego poprzez tRNA na rybosomach
31
Jak wygląda polisom(polirybosom)?
32
Gdzie w mRNA zachodzi inicjacja u prokaryota podczas translacji?
sekwencja Shine-Dalgarno
33
Kodon stary to (nazwa aminokwasu i sekwencja):
AUG - metionina
34
Wymień etapy inicjacji (w translacji):
1. Rybosom dysocjuje na podjednostki 40S i 60S 2. Powstaje kompleks zwany kompleksem preinicjacyjnym. Kompleks ten tworzą: inicjujący tRNA, którym jest Met-tRNAi, GTP, eIF-2 oraz podjednostka 40S. 3. Do kompleksu preinicjacyjnego wiązany jest mRNA. Powstaje kompleks inicjacyjny 40S. 4. Podjednostka 60S asocjuje z kompleksem inicjacyjnym 40S tworząc kompleks 80S.
35
Opisz pierwszy etap inicjacji (w translacji):
rybosom dysocjuje na podjednostki 40S i 60S
36
Opisz drugi etap inicjacji (w translacji):
Powstaje kompleks zwany kompleksem preinicjacyjnym. Kompleks ten tworzą: inicjujący tRNA, którym jest Met-tRNAi, GTP, eIF-2 oraz podjednostka 40S.
37
Opisz trzeci etap inicjacji (w translacji):
Do kompleksu preinicjacyjnego wiązany jest mRNA. Powstaje kompleks inicjacyjny 40S (48S).
38
Opis czwarty etap inicjacji (w translacji):
Podjednostka 60S asocjuje z kompleksem inicjacyjnym 40S tworząc kompleks inicjacyjny 80S.
39
Z czego pochodzi energia konieczna do wytworzenia inicjującego biosyntezę białka kompleksu 80S?
z hydrolizy GTP związanego z eIF-2
40
Co ma na celu cykl eIF-2 i jak przebiega??
Jest to odtworzenie kompleksu eIF-2-GTP po hydrolizie GTP podczas inicjacji translacji. GDP musi zostać wymieniony na GTP. Dokonanie tej wymiany jest rolą czynnika inicjującego eIF-2B, nazywannego również czynnikiem wymiany nukleotydu (guanine nucleotide exchange factor - GEF).
41
Co to jest elongacja?
proces wydłużania łańcucha polipeptydowego, który odbywa się w trakcie biosyntezy białka w rybosomie
42
Wymień etapy elongacji:
1. wprowadznie następnego aminoacylo-tRNA do miejsca A 2. hydroliza GTP, zmiana konformacji rybosomu 3. tworzenie wiązania peptydowego
43
Opisz pierwszy etap elongacji:
wprowadznie następnego aminoacylo-tRNA do miejsca A
44
Opisz drugi etap elongacji:
hydroliza GTP, zmiana konformacji rybosomu
45
Opisz trzeci etap elongacji:
tworzenie wiązania peptydowego
46
Jak odczytywany jest mRNA podczas translacji?
od końca 5' do końca 3'
47
W jakim kierunku zachodzi synteteza łańcucha polipeptydowego podczas translacji?
**N → C** od końca NH2(N) do końca COOH (C)
48
Jak wygląda tworzenie wiązania peptydowego podczas translacji?
49
Przez co katalizowana jest reakcja powstawania wiązania peptydowego?
transferazę peptydylową
50
Gdzie znajduje się transferaza peptydylowa?
w sekwencji **23S rRNA** dużej podjednostki rybosomu **bakteryjnego**, a przypuszczalnie w obrębie **28S rRNA u eukariota**
51
Z czego pochodzi energia potrzebna do wytworzenia wiązania peptydowego?
pochodzi z ATP hydrolizowanego w trakcie reakcji aktywacji aminokwasu
52
Co to jest terminacja?
zakończenie translacji
53
Które kodony to kodony terminacji?
UAA, UAG, UGA
54
Jak przebiega terminacja?
- utworzenie kompleksu białkowy czynnik terminacyjny-GTP - hydroliza GTP - peptydylotransferaza działa jak hydrolaza
55
Przez co produkowane są antybiotyki?
produkowane są naturalnie przez mikroorganizmy - bakterie, promienice i grzyby od wielu lat (przeszło 60) także (sztucznie) syntetyzowane przez człowieka
56
Jak działają antybiotyki (ogólnie)?
- bakteriobójczo - bakteriostatycznie poprzez hamowanie różnych etapów biosyntezy białka
57
Jaki jest problem adaptacji antybiotyków?
selekcja szczepów opornych
58
Jakie znasz inhibitory transkrypcji?
- rifampicyna - α-amanityna
59
Jaką stałą sedymentacji ma streptomycyna i jak działa?
30S powoduje błędny odczyt mRNA, hamuje inicjację łańcucha peptydowego
60
Jak działa tetracyklina?
hamuje wiązanie aa-tRNA do podjednostki rybosomu
61
Gdzie znajduje się puromycyna i jak działa?
50S i 60S powoduje przedwczesną terminację
62
Gdzie występuje chloramfenikol i jak działa?
50S blokuje transferaze peptydylową (brak tworzenia nowych wiązań peptydowych)
63
Gdzie występuje cykloheksimid i jak działa?
50S blokuje transferaze peptydylową (brak tworzenia nowych wiązań peptydowych)
64
Wymień znane Ci inhibitory biosyntezy białka u eukariota:
1. **rycyna** 2. **α-sarcyna** 3. toksyna błonicy
65
Skąd pochodzi i jak działa rycyna?
to inhibitor biosyntezy białka pochodzi z: rącznik pospolity, trująca roślina, olej rycynowy z owoców N-glikozylaza, usuwa adeninę z 28S rRNA (podjednostka 60S)
66
Skąd pochodzi i jak działa α-sarcyna?
jest to inhibitor biosyntezy białka pochodzi z grzybów endonukleaza - przecina 28S rRNA (podjednostka 60S)
67
Co syntetyzują "wolne" (cytoplazmy) rybosomy?
Synteza białek: * cytozolu * mitochondriów * jądrowych * peroksysomów * wewnętrznej strony błony komórkowej
68
Co syntetyzują "zakotwiczone" (siateczki szorstkiej) rybosomy?
Synteza białek: * siateczki śródplazmatycznej * lizosomów * zewnętrznej strony błony komórkowej * wydzielnicze (pozakomórkowe)
69
Na czym opiera się mechanizm sortowania białek?
na odczytywaniu sekwencji sygnałowych białek i wysyłanie ich do odpowiedniego miejsca w komórce (jądro, błona itp.)
70
Jak wygląda model kierowania białek do organelli subkomórkowych: mitochondriów, peroksysomów, jądra?
71
Za co odpowiedzialne są białka chaperonowe?
białka chaperonowe (opiekuńcze) odpowiedzialne są za prawidłowe zwijanie się innych białek
72
Czym jest receptor dla SRP?
Jest to kompleks rozpoznający sekwencje sygnałową. Receptor SRP jest białkiem wiążącym GTP posiadającym aktywność GTPazy.
73
Jak wygląda regulacja aktywności dla SRP?