Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

Biochemia > Struktura i metabolizm RNA > Flashcards

Struktura i metabolizm RNA Flashcards

(93 cards)

Start Studying
1
Q

Jakie wiązanie występuje pomiędzy anomerycznym atomem węgla cząsteczki cukru a atomem azotu wchodzącego w skład zasady azotowej?

A

wiązanie N-glikozydowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Jakie wiązanie występuje pomiędzy resztą fosforanową a gr. OH przy węglu 5’ rybozy lub deoksyrybozy?

A

wiązanie estrowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Właściwości RNA

A
  • zasadniczo jednoniciowe struktury
  • tworzenie struktur ,,hairpin” - ,,spinki do włosów” - wypętlenia
  • odcinki dwuniciowej struktury RNA/RNA (antyrównoległość) przypominają A-DNA
  • asocjacja z białkami - rybonukleoproteiny (zasadnicza forma występowania komórkowych RNA)
  • charakterystyczna absorpcja przy 260 nm
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Jakie wiązania występują pomiędzy komplementarnymi zasadami azotowymi w kwasach nukleinowych?

A

wiązania wodorowe (A=T, GΞC)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Czym jest struktura ,,spinki do włosów”?

A

Jest to wzajemnie komplementarny fragment cząsteczki RNA stanowiący ramię składające się z nukleotydów, których zasady tworzą pary, połączony z petlą zbudowaną z nukleotydów o zasadach nie tworzących par.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Rodzaje RNA

A
  • rybosomalny RNA - rRNA
  • transportujący RNA - tRNA
  • informacyjny RNA - mRNA
  • heterogenny jądrowy RNA - hnRNA
  • mały jądrowy RNA - snRNA
  • mały cytoplazmatyczny RNA - scRNA
  • mitochondrialny RNA - mtRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

W którym miejscu cząsteczki tRNA przyłączają się chemicznie aktywowane aminokwasy?

A

Na końcu CCA-3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Za pomocą jakiego wiązania aminokwasy przyłączane są do tRNA?

A

wiązania estrowego

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Jaką strukturę DNA przypomina dwuniciowa struktura RNA/RNA?

A

A-DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jaka konformacja cukru jest typowa dla B-DNA?

A

C-2’ endo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Jaka konformacja cukru jest typowa dla A-DNA?

A

C-3’ endo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Jaka konformacja cukru jest typowa dla RNA?

A

C-3’ endo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Jakim procesem ulegają kwasy nukleinowe

A
  1. replikacja
  2. transkrypcja
  3. translacja
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Co zachodzi w fazie G1 cyklu komórkowego?

A

Komórka powiększa się i produkuje nowe białka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Czym charakteryzuje się faza G0 cyklu komórkowego?

A

W fazie tej komórki:

  • tracą zdolność do podziału
  • podlegają specjalizacji
  • wykazują mniejsze tempo metabolizmu i mniejszą aktywność transkrypcyjną
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Czym jest punkt R w cyklu komórkowym?

A

Jest to punkt restrykcyjny - komórka decyduje czy nadal odpoczywać, czy wejść w cykl

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

W której fazie cyklu komórkowego dochodzi do replikacji DNA?

A

W fazie S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Co dzieje się w fazie G2cyklu komórkowego?

A

Dochodzi do nasilenia syntezy białek, komórka przygotowuje się do mitozy

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

W jakiej fazie cyklu komórkowego komórka dzieli się (mitoza)?

A

W fazie M

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Jakie rodzaje RNA występują zarówno w komórkach prokariotycznych jak i eukariotycznych?

A
  • rRNA
  • tRNA
  • mRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Rodzaje RNA charakterystyczne wyłącznie dla komórek eukariotycznych

A
  • heterogenny jądrowy RNA hnRNA
  • mały jądrowy RNA snRNA
  • mały cytoplazmatyczny RNA scRNA
  • mikro RNA miRNA
  • długi niekodujący RNA lncRNA
  • mitochondrialny RNA mtRNA

Wszystkie rodzaje RNA uczestniczą w procesie biosyntezy białek!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Charakterystyka nici niematrycowej/kodującej

A

Nie bierze ona bezpośredniego udziału w transkrypcji, lecz stanowi strukturalne odzwierciedlenie pierwotnego transkryptu RNA, z wyjątkiem zasady pirymidynowej w nici kodującej - tyminy, dla której odpowiednikiem w transkrypcie (tj. syntezowanej cząsteczce RNA) jest zasada pirymidynowa - uracyl.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Która z dwóch nici DNA jest transkrybowana?

A

nić matrycowa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Do której z dwóch nici DNA jest podobny transkrypt RNA?

A

do nici kodującej (zamiast tyminy ma uracyl)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Sekwencje konsensusowe to region wiązania jakiego enzymu?
Polimerazy RNA
26
Czym jest sekwencja TATA?
Jest to sekwencja DNA znajdująca się w wielu promotorach genów eukariotycznych, położona około -30 - -10 nukleotydów od miejsca startu transkrypcji. Do sekwencji TATA wiąże się białko TBP wchodzące w skład kompleksu preinicjacyjnego, który umożliwia polimerazie RNA rozpoznanie sekwencji promotora i rozpoczęcie transkrypcji. Po związaniu się TBP DNA ulega wygięciu.
27
Funkcja podjednostki α polimerazy RNA zależnej od DNA
* interakcja z promotorem * inicjacja transkrypcji
28
Funkcja podjendostki β polimerazy RNA zależnej od DNA
Inicjacja i elongacja transkrypcji
29
Funkcja podjednostki β' polimerazy RNA zależnej od DNA
wiązanie DNA
30
Funkcja podjednostki δ polimerazy RNA zależnej od DNA
rozpoznawanie promotora
31
Funkcja podjednostki ω polimerazy RNA zależnej od DNA
nieznana XD
32
Etapy działania polimerazy RNA (DNA zależnej)
1. Przeszukiwanie DNA 2. Tworzenie kompleksu zamkniętego 3. Tworzenie kompleksu otwartego 4. Inicjacja 5. Elongacja
33
W którym momencie podjednostka δ oddysocjowuje od polimerazy RNA?
Gdy polimeraza RNA przesunie się poza promotor
34
W jaki sposób powstaje ,,bąbel" transkrypcyjny?
Polimeraza RNA przyłączając się do matrycy DNA powoduje helikalne rozwinięcie podwójnej helisy (powstaje ,,bąbel" transkrypcyjny)
35
W jaki sposób może zachodzić terminacja transkrypcji u Prokaryota?
* z udziałem czynnika białkowego * bez udziału czynnika białkowego
36
Funkcja terminatora
Wyznacza on miejsce terminacji transkrypcji (sekwencja taka tworzy strukturę ,,spinki do włosów"
37
W ukladzie terminatora oddziaływania silne występują na odcinku z przewagą jakich par?
G-C
38
W układzie terminatora oddziaływania słabe występują na odcinku z przewagą jakich par?
A-U
39
Elementy niezbędne dla przebiegu transkrypcji
* matryca - dwuniciowy DNA * polimerazy RNA zależne od DNA - POL RNA (prokaryota); POL RNA I, II, III (eukaryota) * topoizomerazy * NTPS * Mg2+, Mn2+ Proces ,,kierowany" matrycą (DNA) Produkt syntetyzowany w formie niedojrzałej funkcjonalnie (pre-RNA)
40
Czym jest gen?
Jest to odcinek DNA lub dla niektórych wirusów RNA, w którym zapisana jest informacja o określonym produkcie.
41
Jakie fragmenty w swojej strukturze zawiera gen?
Fragmenty kodujące i niekodujące
42
Przykłady fragmentów niekodujących w strukturze genu
* promotor * intron
43
Ile operonów kodujących rRNA i tRNA posiada genom E.coli?
7
44
Co jest produktem informacji zawartej w genach?
* polipepetydy * kwasy rybonukleinowe (tRNA, rRNA, miRNA, snRNA i inne)
45
Etapy obróbki potranskrypcyjnej pre-RNA 30S
46
Etapy obróbki potranskrypcyjnej pre-RNA 45S
47
Jakie stałe sedymentacji mają podjednostki rybosomów prokariotycznych?
50S i 30S
48
Z ilu białek zbudowana jest mniejsza podjednostka rybosomu prokariotycznego?
21
49
Z ilu białek zbudowana jest większa podjednostka rybosomu prokariotycznego?
36 białek
50
Jakie stałe sedymentacji mają podjednostki rybosomów eukariotycznych?
60S i 40S
51
Z ilu białek zbudowana jest mniejsza podjednostka rybosomu eukariotycznego?
33
52
Z ilu białek zbudowana jest większa podjednostka rybosomu eukariotycznego?
49
53
Etapy obróbki potranskrypcyjnej tRNA
1. Rozcinanie pierwotnego transkryptu pre-tRNA 2. Dołączenie CCA-OH-3' 3. Modyfikacje nukleotydów 4. Usuwanie intronów (endonukleazy) 5. Ligacja
54
Co to za zasada?
tiourydyna
55
Co to za zasada?
inozyna
56
Co to zasada?
1-metyloguanozyna
57
Co to za zasada?
rybotymidyna
58
Co to za zasada?
pseudourydyna
59
Co to za zasada?
dihydrourydyna
60
Co jest inhibitorem polimerazy RNA II?
α-amanityna
61
Co jest inhibitorem polimerazy RNA?
rifampicyna
62
Co jest inhibitorem DNA?
aktynomycyna D
63
Gdzie zlokalizowanna jest polimeraza RNA I u Eukaryota?
W jądrze i jąderku
64
Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza I?
pre-rRNA z wyjątkiem 5S rRNA
65
Gdzie zlokalizowana jest polimeraza RNA II u Eukaryota?
w jądrze
66
Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza RNA II?
pre-mRNA (hnRNA)
67
Gdzie zlokalizowana jest polimeraza RNA III u Eukaryota?
W jądrze
68
Jaki rodzaj RNA syntetyzuje pomieraza RNA III?
* pre-tRNA * 5S rRNA * snRNA * scRNA
69
Gdzie u Eukaryota zlokalizowana jest polimeraza mitochondrialna?
w mitochondrium
70
Jaki rodzaj RNA jest syntetyzowany przez polimerazę mitochondrialną?
mtRNA
71
Czy w komórce bakterii zachodzi obróbka potranskrypcyjna?
nie
72
Gdzie w komórce eukariotycznej zachodzi proces transkrypcji?
w jądrze
73
Gdzie w komórce eukariotycznej zachodzi proces translacji?
w cytozplazmie
74
Gdzie w komórce bakterii zachodzi proces transkrypcji a gdzie translacji?
Oba te procesy zachodzą w cytoplazmie
75
Jak wygląda schemat organizacji promotorów u Eukaryota?
76
Czynniki transkrypcyjne o jakim działaniu wyróżniamy?
* ogólnym * swoistym
77
Funkcja polimerazy RNA II
Transkrypcja genów białek
78
Czym jest 5'UTR?
Jest to nieulegająca translacji część mRNA położona w kierunku 5' od sekwencji kodującej
79
Etapy dojrzewania eukariotycznego hnRNA do mRNA
* tworzenie ,,czapeczki" (5'-capping) na końcu 5' pierwotnego transkryptu (hnRNA) * poliadenylacja (polyA-tail) na końcu 3' pierwotnego transkryptu (hnRNA) * suwanie intronów (splicing) z pierwotnego transkryptu (hnRNA)
80
Jaka jest rola czapeczki (cap) w komórce?
Ochrona mRNA przed występującymi w komórce nukleazami
81
Jakie sekwencje rozpoznaje endonukleaza podczas obróbki potranskrypcyjnej?
AAUAAA
82
W jakim miejscu endonukleaza rozcina mRNA?
11-30 nukleotydów od sekwencji AAUAAA
83
Jaki enzym przyłącza ,,ogonek" poli-A?
polimeraza poliadenylanowa
84
Czym charakteryzuje się typ 1 obróbki potranskrypcyjnej?
* selfsplicing - samowycinające się introny * udział kofaktora - guanozyny, GMP, GDP, GTP
85
Czym charakteryzuje się typ 2 obróbki potranskrypcyjnej?
* selfsplicing - samowycinające się introny * przebiga bez udziału kofaktora - niezbędna adenina intronu
86
Czym charakteryzuje się typ 3 obróbki potranskrypcyjnej?
* non-selfsplicing - niesamodzielnie wycinające się introny * niezbędna adenina intronu
87
Jakie sekwencje znajdują się w miejscach ,,styków"?
sekwencje konserwatywne
88
Sekwencja konserwatywna
EKSON 1 (3')-(5') INTRON (donorowe) i INTRON (3')-(5') EKSONN 2 (akceptorowe)
89
Charakterystyka miRNA
Są to krótkie sekwencje 21-23 nukleotydów niekodującego RNA, które regulują ekspresje genów na poziomie posttranskrypcyjnym
90
Gdzie zlokalizowane są geny kodujące miRNA?
W intronach, eksonach oraz odcinkach międzygenowych
91
Funkcja miRNA
* Regulacja ekspresji różnych genów w tym również ekspresję protoonkogenów i genów supresorowych =\> mogą działać jako onkogeny czy supresory. Regulują 30% ekspresji genów u ssaków 1 miRNA = setki mRNAs * odgrywają role w powstawaniu i rozwoju nowotworu
92
Lokalizacja w genomie miRNA loci
1. W procesie transkrypcji powstaje (polycistronic primary transcripts) i następnie przez cięcie powstają miRNAs 2. Międzygenowe odcinki ulegają transkrypcji jako niezależne jednostki 3. Geny kodujące miRNA są zlokalizowane w intronach, eksonach i odcinkach międzygenowych
93
RNA -\> DNA
1. Biosynteza białka przebiega bez DNA, ale wymaga RNA 2. 1- i 2-niciowe RNA są nośnikami informacji genetycznej i ulegają replikacji 3. RNA wykazują właściwości katalityczne 4. Grupa 2'-OH w rybozie jest zaangażowana w wielu rekacjach w jakich uczestniczy RNA 5. Purynowe i pirymidynowe kofaktory procesów metabolicznych (niezbędne do funkcjonowania organizmów we wszystkich formach życia) są rybonukleotydami 6. Biosynteza dNTPs odbywa się poprzez redukcję NTPs 7. Genom RNA nie podlega mechanizmom naprawczym charakterystycznym dla DNA 8. Wiązanie fosfodiestrowe w DNA są odporne na hydrolizę alkaliczną 9. DNA jest bardziej odporny na chemiczną degradację oraz działanie promieniowania UV

Biochemia (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions