Unidad 2. Genomas y flujo de la información genética Flashcards

(51 cards)

1
Q

¿Qué es el valor C?

A

Es la cantidad de DNA por genoma haploide.

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2
Q

¿Qué es el valor G?

A

Cantidad de genes por genoma haploide.

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3
Q

Explique brevemente el C-Value Paradox

A

La cantidad de DNA en un organismo no está correlacionado con el grado de complejidad fisiológica de un organismo. Esto no se debe a que la presencia de junk-DNA o non-coding RNA aumente la cantidad de DNA.

Este fenómeno desafía la noción de que más DNA significa mayor complejidad biológica.

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4
Q

¿Qué es un gen?

A

Es la unión de secuencias genómicas que codifican un set coherente de productos superpuestos potencialmente funcionales

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5
Q

Describa el papel del housekeeping tRNA

A

Ácido nucleico monocatenario formador de estructuras secundarias por complementariedad. Transporta los aminoácidos. Posee anticodones para la codificación de proteínas. También debe pasar por un proceso de maduración.

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6
Q

Describa el papel del housekeeping rRNA

A

Ácido nucleico monocatenario formador de estructuras secundarias por complementariedad. En eucariotas está unido a proteínas; en archea y bacteria no. Participa en la unión entre el tRNA y el mRNA, facilitando el establecimiento del enlace peptídico durante el proceso de traducción.

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7
Q

Describa el papel del housekeeping mRNA

A

Interviene en la síntesis de proteínas, transportando los genes del núcleo al citoplasma. Es portador de los codones. Experimenta un proceso de maduración o modificaciones postrraduccionales.

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8
Q

Describa el papel del regulatory RNA modificating snRNA

A

Se asocian con proteínas para formar los snRNP’s, los cuales a su vez forman el spliceosoma.

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9
Q

Describa el papel del regulatory RNA modificating snoRNA

A

Promueven las modificaciones postranscripcionales en moléculas de rRNA y tRNA.

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10
Q

Describa el papel del silencing siRNA

A

Al unirse a un complejo de proteínas RISC (contenedoras de AGO), son capaces de reconocer por recombinación homóloga a un mRNA complementario y degradarlo, impidiendo la traducción de dicho mRNA en proteínas.

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11
Q

Describa el papel del silencing miRNA

A

Es análogo al siRNA; al unirse al complejo RISC (contenedor de AGO) es capaz no solo de degradar, sino también de tan solo inhibir la traducción de genes por complementación análoga al mRNA.

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12
Q

Describa la función del piRNA

A

Silencia los transposones en la formación de células gametogénicas para asegurar mantener la integridad del genoma durante la meiosis.

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13
Q

Describa la función del lncRNA

A

Desempeña funciones reguladoras y estructurales relacionadas a la regulación de la expresión genética y remodelación de la cromatina. En las hembras de los mamíferos, interviene en la supresión del segundo cromosoma X sexual.

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14
Q

Describa las características del código genético

A

Es redundante, degenerado, “universal”, tiene siempre un codón de inicio y tres de terminación.

Estas características permiten que el código genético sea robusto y adaptable a diversas mutaciones.

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15
Q

¿Qué son las regiones intergénicas?

A

Son tramos de DNA que se encuentran entre los genes, suelen no producir proteínas y en su lugar dan origen a RNA’s reguladores de la expresión génica. También pueden ser material para el surgimiento de nuevos genes “Novo gene emergence” frente a presión adaptativa.

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16
Q

¿Qué son los cromosomas?

A

Son una forma compacta de DNA que sirve de vehículo para organizar, almacenar, regular y transmitir la información genética.

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17
Q

Describa algunas características de los cromosomas

A
  • Pueden ser circulares o lineales.
  • Contienen tanto los genes como las regiones intergénicas.
  • Son el resultado de la compactación que se da para evitar mutaciones y rearreglos en el genoma.
  • La complejidad de un comosoma es inversamente proporcional a su densidad génica.
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18
Q

¿Qué es la ploidía?

A

Es el número de juegos de cromosomas individuales de una célula o un organismo. Se reconoce como el “estado” de un organismo.

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19
Q

¿Qué es la cromatina?

A

Es el conjunto formado por DNA⁻ + Proteínas⁺ = Cromatina⁰

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20
Q

Mencione las proteínas conformadoras del nucleosoma

A

H2A, H2B, H3, H4

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21
Q

¿Qué es un nucleosoma?

A

Es la unidad de la cromatina eucarionte; un octámero protéico en forma de disco.

22
Q

Explique como está conformado un octámero histónico

A

. / H3 / H4 /
/—————-/
|H2B|H2A|
—————–
|H2A|H2B|
—————–

23
Q

Describa algunas características del nucleosoma

A

Tiene 147 pares de bases por vuelta y el octámero protéico tiene carga positiva

24
Q

¿Cuáles son los niveles de empaquetamiento del DNA?

A
  • Nivel de nucleosomas
  • Nivel de solenoide
  • Nivel de scaffold
  • Nivel de cromosomas
25
Describa el empaquetamiento del DNA a nivel de nucleosomas
La cadena de DNA envuelve dos veces al octámero protéico histónico. Es el nivel de "perlas en un collar".
26
Describa el empaquetamiento del DNA a nivel de solenoide
La histona linker H1 une las unidades nucleosomales, permitiendo que este hilo grueso se enrrolle en sí mismo en forma de un "collar de perlas envueltas en un canuto"
27
Describa el empaquetamiento del DNA a nivel de Scaffold
Proteínas clamp condensan la cromatina (canuto de perlas) en "bucles cromosómicos" con un diámetro de 300 nm.
28
Describa el empaquetamiento del DNA a nivel cromosómico
Implica la condensación del scaffold sobre sí mismo para formar los cromosomas
29
¿Cuál es la función de las modificaciones covalentes en las colas de las histonas?
Regulan el grado de compactación de la cromatina.
30
¿Cuáles son las modificaciones covalentes que pueden sufrir las histone-tails?
- Metilación - Acetilación - Fosfatación - Ubiquitinación
31
Mencione todos los posibles genomas
- Genoma nuclear - Genoma mitocondrial - Genoma cloroplastídico
32
¿Qué es la recombinación?
Es el intercambio de material genético entre cromosomas homólogos
33
Describa el origen del genoma mitocondrial
No existe recombinación del genoma mitocondrial en el linaje maternal de células gametogénicas, por tanto el mtDNA de un mamífero proviene casi enteramente de la madre. (Como excepcion, la recombinación del mtDNA, sí ocurre en plantas)
34
Describa las características del citosol mitocondrial en los procesos genéticos
- La mitocondria posee sus propios ribosomas y sus propias proteínas mitocondriales. - Tanto la DNApol como la RNApol tienen origen en el huesped. - Está repleto de especies químicas reactivas ricas en oxígeno.
35
Describa algunas características del genoma mitocondrial
- Existe un alta tasa de mutaciones en el genoma mitocondrial debido a la cantidad de reacciones metabólicas que ocurren en el citoplasma mitocondrial (radicales libres) y a la alta tasa de replicación del mtDNA - No existen intrones ni empaquetamiento en el genoma mitocondrial - Sistemas de reparación menos efecivos en el mtDNA dado el corto tiempo de ciclo celular en las mitocondrias. - D-loop mitocondrial y COI-1 (citocromo-oxidasa 1) son importantes en análisis filogenéticos
36
Describa algunas características del genoma cloroplastídico
- Su proceso de replicación y transcripción comprende sus propias proteínas ribosomales, tRNA rRNA y polRNA. - Corresponde a la teoría endosimbiótica de organismos capaces de obtener si energía de la luz UV.
37
Mencione los procesos reguladores del flujo de la información genética
- La regulación ocurre en los pasos intermedios de entre los procesos de flujo de información genética (replicación, traducción, etc.) 1º mecanismo regulador: Histonas 2º mecanismo regulador: Modificaciones post-transcripcionales. 3º mecanismo regulador: Traducción del RNA maduro o la degradación del mismo 4º mecanismo regulador: Modificaciones post-traduccionales
38
Explique la dependencia del fenotipo con el entorno
La expresión genética depende de la etapa de vida del organismo Fenotipo = Genotipo + Ambiente
39
Cuál es la composición del complejo RISC
Una proteína agonauta y el siRNA.
40
Cuál es la función del complejo RISC
Es capaz de reconocer un mRNA complementario y degradarlo impidiendo la traducción de dicho mRNA.
41
Mencione el coeficiente de sedimentación de bacterias archeas y eukarias.
Bacteria: 70s Archaea: 70s Eukaria: 80s
42
Defina un transcriptoma
Es el conjunto completo de moléculas de mRNA transcritos a partir del DNA de un organismo en un momento dado. Representa la parte del genoma que se está expresando activamente en un momento dado.
43
Defina un genoma
Es el conjunto completo de moléculas de DNA de un individuo. Incluye todos los genes, así como las secuencias no codificantes de DNA.
44
Defina un proteoma
Es el conjunto cmpelto de proteínas expresadas por un organismo, célula, o tejido en un momento dado. Es bastante dinámico y puede variar en respuesta a diferentes condiciones ambientales o de desarrollo.
45
¿Qué es eucromatina?
Del griego "eu" = verdadero es la forma de cromatina que existe en un estado de condensación menor al de la hetrerocromatina en la interfase. Es más disponible a la transcipción.
46
¿Qué es heterocromatina?
Del griego "heteros" = diferente, es la forma más condensada de la cromatina en el núcleo interfásico.
47
¿Qué fue el encode project?
Es un proyecto de insvestigación masivo y colaborativo que tiene como objetivo identificar todos los elementos funcionales del genoma humano
48
Mencione las características del código genético
- Universalidad - Degeneración (redundancia) - No solapamiento - Codones de inicio y terminación
49
¿Qué son las UTR's en el genoma humano?
Son segmentos de RNAm que se encuentran antes del codón de inicio de un gen y después del codón terminante del mismo.
50
Describa el genoma de las levaduras
- Compacto - Presencia de plásmidos - DNA mitocondrial - Dos tipos sexuales - Repeticiones teloméricas
51
¿Por qué es importante la poliploidía en biotecnología?
Puede regular la expresión génica promoviendo cambios fenotípicos en los organismos modificados genéticamente.