Variaciones en el genoma humano

Question 1

¿Qué es la nutrigenética y en qué se diferencia de la nutrigenómica?

Answer 1

Nutrigenética: Estudia cómo las variantes genéticas individuales (SNPs) afectan la respuesta a nutrientes.

Nutrigenómica: Analiza cómo los nutrientes influyen en la expresión génica.

Question 2

¿Qué tecnologías incluye el enfoque “ómicas” en genómica nutricional?

Answer 2

Genómica (ADN), transcriptómica (ARN), proteómica (proteínas), metabolómica (metabolitos).

Question 3

¿Qué factores ambientales interactúan con los genes para causar enfermedades?

Answer 3

Tóxicos (metales pesados), infecciones, dieta, hábitos socioculturales.

Question 4

¿Qué es un SNP y por qué es relevante en nutrigenética?

Answer 4

Polimorfismo de un solo nucleótido (ej. C>T).

Relevancia: Determina susceptibilidad a enfermedades (ej. diabetes) y respuesta a nutrientes.

Question 5

Nombra 3 genes asociados a diabetes tipo 2 (DM2) identificados en estudios de genoma completo.

Answer 5

TCF7L2, FTO, PPARG.

Question 6

¿Qué porcentaje de diabetes es monogénica y cuáles son los genes más comunes?

Answer 6

1-6%. Genes: KCNJ11, ABCC8 (diabetes neonatal), GCK (MODY).

Question 7

¿Qué factores de riesgo modificables y no modificables se asocian a DM2?

Answer 7

Modificables: Obesidad, sedentarismo, dieta.

No modificables: Edad, raza, historia familiar.

Question 8

¿Qué es la medicina de precisión y qué datos utiliza?

Answer 8

Enfoque que integra datos genómicos, fenotípicos y ambientales para personalizar tratamientos.

Question 9

Compara WES (secuenciación de exoma) vs. WGS (genoma completo).

Answer 9

WES: Analiza solo regiones codificantes (85% de mutaciones patogénicas).

WGS: Incluye regiones codificantes y no codificantes (reguladoras).

Question 10

¿Cómo influyen los SNPs en la percepción del sabor y la dieta?

Answer 10

Ejemplo: Variantes en TAS2R38 afectan percepción de lo amargo → mayor consumo de sal.

Question 11

¿Qué genes determinan la tolerancia a la lactosa y cómo se interpretan los resultados?

Answer 11

Gen LCT (persistencia de lactasa).

Resultados: “Tolerante”, “Probablemente intolerante”, “Intolerante”.

Question 12

¿Qué enzimas metabolizan fármacos y cómo afectan la respuesta terapéutica?

Answer 12

CYP2D6, CYP2C9, CYP3A4 (metabolizadores rápidos/lentos).

Ejemplo: Metabolizadores lentos de CYP2D6 requieren dosis menores de antidepresivos.

Question 13

¿Cómo los genes influyen en el tipo de fibras musculares y el rendimiento deportivo?

Answer 13

Fibras tipo I (resistencia, ACTN3).

Fibras tipo II (fuerza/velocidad, MSTN).

Question 14

¿Qué variantes genéticas se asocian a mayor riesgo de lesiones deportivas?

Answer 14

COL1A1 (riesgo de rotura de ligamentos).

Question 15

¿Qué genes están vinculados a trastornos de conducta alimentaria?

Answer 15

FTO (obesidad), DRD2 (adicción a alimentos).

Question 16

¿Cómo se relaciona la serotonina (HTR2A) con el comportamiento alimentario?

Answer 16

Variantes en HTR2A afectan saciedad y ansiedad por comer.

Question 17

¿Qué áreas analiza un test genético como DNA COMPLETE?

Answer 17

Predisposición a enfermedades, farmacogenética, nutrigenética, ancestros, perfil deportivo.

Question 18

¿Qué información proporciona la sección de farmacogenética en estos tests?

Answer 18

Metabolismo de 350+ fármacos (ej. dosis recomendadas para warfarina basadas en VKORC1).

Question 19

Una mujer de 45 años con SOP y sobrepeso quiere evaluar su riesgo de DM2. ¿Qué enfoque nutrigenético sería útil?

Answer 19

Análisis de SNPs en TCF7L2, FTO, PPARG + recomendaciones dietéticas basadas en genotipo (ej. baja en carbohidratos si tiene riesgo alto).

Question 20

¿Por qué es importante integrar la nutrigenética en la medicina clínica?

Answer 20

Permite prevención personalizada, optimización de dietas y reducción de efectos adversos a fármacos.

Question 21

¿Qué es el umbral de riesgo poligénico y cómo se calcula?

Answer 21

Suma de efectos de múltiples SNPs para estimar riesgo de enfermedades complejas (ej. DM2).

Question 22

¿Cómo se interpreta un resultado de riesgo elevado para enfermedad cardiovascular en un test genético?

Answer 22

Implementar cambios en estilo de vida (ej. dieta mediterránea) y monitorización frecuente.

Question 23

¿Qué es la variabilidad genética y cuáles son sus causas principales?

Answer 23

Definición: Diferencias en la secuencia del ADN entre individuos.

Causas:

Factores ambientales (radiación UV, químicos).

Errores en replicación/reparación del ADN.

Especies reactivas de oxígeno.

Question 24

¿Qué porcentaje del genoma humano varía entre individuos y qué tipo de variante es la más común?

Answer 24

0.1% del genoma.

Variante más común: SNV (variantes de un solo nucleótido).

Question 25

Nombra los 5 tipos principales de variaciones genéticas.

Answer 25

SNV (variantes de un solo nucleótido). Indel (inserciones/deleciones de 1-50 pb). VNTR/STR (repeticiones en tándem: minisatélites y microsatélites). CNV (variantes en el número de copias, >50 pb). Variantes estructurales balanceadas (inversiones, translocaciones).

Question 26

¿Qué son los RFLP y cuál fue su importancia histórica?

Answer 26

Definición: Polimorfismos en fragmentos de restricción (cambios en sitios de corte de enzimas). Importancia: Primeros marcadores para ligamiento genético y criminalística (huellas de ADN).

Question 27

Cómo se generan las CNV y qué enfermedades pueden causar?

Answer 27

Mecanismos: Recombinación no alélica (NAHR). Errores en replicación (FoSTeS). Enfermedades: Duplicación: Ganancia de función (ej. CYP2D6 en metabolismo de fármacos). Deleción: Pérdida de función (ej. anemia hemolítica por ausencia de RHD).

Question 28

¿Qué son los STR y por qué son útiles en genética forense?

Answer 28

Definición: Repeticiones cortas en tándem (ej. (CA)n). Utilidad: Alta tasa de mutación → Perfiles únicos de ADN para identificación.

Question 29

Compara SNV sinónimas vs. no sinónimas.

Answer 29

Sinónimas: No cambian el aminoácido (redundancia del código genético). No sinónimas: Alteran el aminoácido (ej. APOE ε4 en Alzheimer).

Question 30

¿Qué son las variantes estructurales balanceadas y cómo afectan la salud?

Answer 30

Definición: Reordenamientos sin pérdida/ganancia de ADN (inversiones, translocaciones). Impacto: Portadores asintomáticos, pero riesgo de gametos desbalanceados. Si afectan genes: Alteran transcripción o función proteica.

Question 31

Menciona un mecanismo de formación de variantes estructurales complejas.

Answer 31

Cromotripsis: Fragmentación masiva y reparación errónea del ADN → común en cáncer.

Question 32

¿Qué características únicas tiene el mtDNA?

Answer 32

Herencia materna. Alta tasa de mutación. 13 genes para fosforilación oxidativa. Haplogrupos: Marcadores evolutivos (ej. "Eva mitocondrial").

Question 33

Qué son los haplogrupos mitocondriales y cómo se usan?

Answer 33

Definición: Grupos de variantes heredadas de un ancestro materno común. Usos: Estudios migratorios (ej. haplogrupo L3 en África). Identificación forense.

Question 34

Qué información contiene la base de datos dbSNP?

Answer 34

Catálogo de SNV, indel y microsatélites. Frecuencias poblacionales y datos de genotipos.

Question 35

¿Cuál fue el objetivo del Proyecto 1000 Genomas?

Answer 35

Secuenciar 2,504 genomas de 26 poblaciones para catalogar SNV, indel y CNV.

Question 36

Nombra 3 bases de datos para variantes estructurales.

Answer 36

dbVar (CNV, translocaciones). DGV (Database of Genomic Variants). MITOMAP (variantes en mtDNA).

Question 37

¿Cómo afecta la CNV en CYP2D6 la respuesta a fármacos?

Answer 37

0 copias: Metabolizador pobre (PM). >3 copias: Metabolizador ultrarrápido (UM). → Ajuste de dosis necesaria.

Question 38

¿Qué variante en APOE aumenta el riesgo de Alzheimer?

Answer 38

rs429358 (Alelo ε4: cambio Cys→Arg en posición 130).

Question 39

¿Qué indel en BRCA2 se asocia a cáncer de mama?

Answer 39

rs80359352: Deleción de 4 pb (p.A938Pfs*21) → proteína truncada.

Question 40

¿Por qué los microsatélites son útiles en estudios de asociación?

Answer 40

Alta polimorfismo → identifican regiones vinculadas a enfermedades complejas.

Question 41

¿Qué es el HapMap y cómo optimiza los GWAS?

Answer 41

Definición: Mapa de haplotipos (bloques de SNV heredados juntos). Utilidad: Reduce 10M de SNV a ~500k "SNV marcadoras" para GWAS.

Question 42

¿Qué enzima se usa en PCR-RFLP y para qué sirve?

Answer 42

Enzima: Endonucleasas de restricción (ej. Acc36I). Uso: Identificar alelos por patrones de corte en ADN amplificado.

Question 43

Compara SNV, indel y CNV en tamaño y impacto fenotípico.

Answer 43

SNV: tamaño ->1 nucleoticdo impacto - >cambios puntiales (ej. APOE e4) Indelegables: tamaño -> 1-50 nucleotidos impacto -> corrimiento de marcos de lectura CNV: tamaño -> >50pb impacto-> ganancia / pérdida de genes (ej. CCL3L1)

Question 44

¿Qué variante en HFE causa hemocromatosis y cuál es su efecto?

Answer 44

rs1799945 (p.H63D) → acumulación patológica de hierro.

Question 45

¿Cómo se usa UCSC Genome Browser para analizar variantes?

Answer 45

Visualiza secuencias de referencia, variantes y datos de ENCODE.

Question 46

¿Cuáles son los haplogrupos mitocondriales más comunes en poblaciones indígenas mexicanas?

Answer 46

A2 (30-87.5%), B2 (14-53%), C1 (0-31%), D1 (0-12%).