Week 2; HC 3

Question 1

chromatine bestaat uit

Answer 1

DNA + eiwitten

Question 2

waarom is er regulatie van DNA

Answer 2

om te zorgen dat er niet te weinig en niet teveel transcriptie is van een bepaald gen

Question 3

hoe werkt regulatie genexpressie

Answer 3

1. transcriptie
2. processing van RNA
3. transport mRNA naa cytosol
4. keuze wel of niet translatie
5. RNA is niet stabiel
6. translatie (eiwit dat wel of niet actief is)
7. afbraak eiwit

Question 4

functie RNA polymerases

Answer 4

I = transcriptie rRNA genen (translatie)
II = transcriptie mRNA/eiwitcoderende genen
III = transcriptie tRNA genen en sommige rRNA genen

Question 5

promotor functie en plaats

Answer 5

aan het begin van een gen & zorgt dat RNA polymerase de goede kant opgaat

Question 6

enhancer functie en plaats

Answer 6

activeren RNA polymerase. maakt niet uit waar ze liggen MAAR ze liggen wel op hetzelfde chromosoom

Question 7

functie algemene transcriptiefactoren

Answer 7

reguleren RNA polymerase II en zorgen voor transcriptie van alle eiwit coderende genen.

Question 8

hoe zorgen algemene transcriptiefactoren voor herkenning promotor

Answer 8

door binding aan de TAT box

Question 9

proces van algemene transcriptiefactoren

Answer 9

1. algemene transcriptiefactoren met TATA bindende eiwitten
2. recruteert transcriptiefactoren
3. rectruteert RNA polymerase II
4. fosforylering nodig + specifieke TF die elders aan DNA binden
5. aanmaak mRNA

Question 10

genregulator eiwitten zijn …

Answer 10

specifieke transcriptiefactoren

Question 11

wat doen genregulator eiwitten

Answer 11

die bepalen in welke celtypes welke genen tot expressie komen

Question 12

hoe werken genregulator eiwitten

Answer 12

ze herkennen en binden aan specifieke enhancers -> activatie RNA polymerase

Question 13

waar vind de herkenning vna DNA door genregulator eiwit plaats + welke motieven kunnen dit doen

Answer 13

in de grote groef & zinkvinger motief/basisch domein/helix-turn-helix motief

Question 14

wat is het zinkvinger motief

Answer 14

zinkatoom zit vast aan histeines en cysteines. DNA hoeft niet uit elkaar. ze maken via uitstekende aminozuren specifiek contact met basen in het DNA.

Question 15

RNA polymerase II activeringsdomeinen

Answer 15

acidic blob, cofactoren en glutamine-rijk gebied

Question 16

dimerisatie domeinen

Answer 16

leucine zipper motief of helix-loop-helix motief

Question 17

waarvoor zijn ligand bindingsdomeinen nodig

Answer 17

voor binding tussen genregulator eiwitten en kleine moleculen

Question 18

wat zijn en wat doen kernreceptoren

Answer 18

specifieke transcriptiefactoren en het zijn veelzijdige regulators van genexpressie

Question 19

kenmerken kernreceptoren

Answer 19

grote familie zinkvinger eiwitten, homo- en heterodimeren, binden aan specifieke enhancers, worden geactiveerd door ligand binding

Question 20

hoe werkt kernreceptor met transmembraan signalering

Answer 20

1. steroïdhormoon door celmembraan
2. Als steroidhormoon als ligand aan receptor bindt → kernreceptor verandert van vorm → kan actief in celkern worden getransporteerd
3. Bindt aan responsie-elementen in DNA (enhancer) → transcriptie → mRNA
4. door translatie wordt eiwit gemaakt

Question 21

homo- en heterodimeren zorgen voor ….

Answer 21

mogelijkheid om combinaties te vormen met transcriptiefactoren