ביותא א Flashcards

Question

קישור באמצעות ח.ש

Answer 1

חומצה מיריסטית - 14 פחמנים, נקשרת לקצה האמיני, נוצר קשר אמידי. חומצה פלמיטית - 16 פחמנים, נקשרת לקבוצת תיול של ציסטאין בחלבון, קשר תיואסטרי קבוצה פרנילית - נקשרת לקבוצת תיול של ציסטאין, נוצר קשר תיואתרי

Answer 2

משפחה של חלבונים ציטוזוליים בעלי פעילות טירוזין קינאז, נקשרים לממברנה עי קבוצת מיריסתיול להגברת יציבות לעיתים גם עי חומצה פלמיטית - קישור התלוי בסיגנל חוץ תאי.

Answer 3

GTPase בעלי פעילות - Small GTPase | מעוגנים לממברנה עי קבוצת פרנילית וחומצה פלמיטית

Answer 4

``` קטנים, GTPase בעלי פעילות GTP במצב קושר הם חושפים ליפיד שמעגן אותם לממברנה כ lipid anchored כלומר הם חלבונים מסיסים חלק מהזמן ומעוגנים בשאר ```

Answer 5

לרוב מדובר באלפא הליקס. הקשר הפפטידי הוא פולרי, בסביבה ההידרופיבית של הממברנה זה מחייב את הקשרים הפפטידים ליצור קשרי מימן אחד עם השני. אורך סגמנט חוצה ממברנה כ-20-30 ח.א אך גם חבית ביתא, אורך סגמנט חוצה ממברנה כ-10 ח.א

Answer 6

מדד המתאר את הנטייה ההידרופובית של ח.א, מאפשר לזהות סגמנטים טרנסממברנליים מתאים יותר לאלפא הליקס מכיוון שסדין ביתא קצר מדי וקשה לזיהוי

Answer 7

חוצה ממברנה פעם אחת

Answer 8

יכולות להיות גם אנזימים לא רק תעלות, רצפטורים ואז התעלה משמשת לתמיכה מבנית מבנה קשיח יותר מאלפא הליקסת מאפשר קריסטולוגרפיה 8-22 גדילים נפוצים בחיידקים, מיטו וכלורופלסט ליבה הידרופילית קשרי מימן קשיחים בין הגדילים, לא מאפשרים תזוזה (בניגוד לאלפא הליקס)

Answer 9

תעלה מסוג חבית ביתא בחיידקים סלקטיבית מאד, מאפשרת מעבר רק של מלטוז פורין

Answer 10

דוגמה מורכבת של חבית ביתא 22 גדילים מעביר יוני ברזל בחיידקים

Answer 11

רצפטור לוירוס חיידקי | אנזים חיידקי מסוג ליפאז

Answer 12

מעטפת התא העשירה בסוכרים. | אפיניות גבוהה ללקטינים

Answer 13

יוני - SDS | לא יוני - אוקטיגלוקוזיד, טריטון

Answer 14

``` מתחתיו הדטרגנט מתקיים כמונומרים, מעליו כמיצלות כאשר בריכוז זה נשמר שיווי משקל, מונומרים מתחברים ויוצאים והריכוז של החופשיים נשאר קבוע. מושפע מ: טמפ' pH ריכוז מלחים ```

Answer 15

ממיס חלבונים הידרופוביים | הורסים את המבנה המרחבי של החלבון מאחר ונקשרים לליבה ההידרופובית.

Answer 16

שומרים על המצב הנטיבי נקבל מע' של חלבוני ממברנה המצויים בתוך ליפוזומים ושומרים על הפעילות שלהם. ניתן להרחיק את הדטרגנט עי דילול או הוספה של פוספוליפידים מאפשר לבדוק רק צד אחד של החלבון, באופן אקראי.

Answer 17

חגורה עשויה מ HDL ולכן מסיסים בפלזמה מאפשר לחקור את שני צידי החלבון

Answer 18

משאבת פרוטונים תלוית אור, מוציא פרוטונים התגלה בארכאה שבעה הליקסים שבמרכזם מולקולה קולטת אור - כרומופור מסוג רטינאל, קשור לליזין. אור משרה שינוי מבני ממיר אנרגיה סולרית לאנרגיה של מפל ריכוזים מולקולות ליפידיות קשורות לאתרים בחלבון לייצוב שימוש בטכניקה של electron crystallography שילוב של מיקורסקופ אלקטרונים ודיפרקציית אלקטרונים בעל צבע סגלגל

Answer 19

פוטובליצ'ינג טכניקה המאפשרת למדוד את קצב הדיפוזיה הלטרלית של חלבונים ממברנליים עי סימון פלוריסנטי קרן לייזר מדידת זמן ההתאוששות - כתוצאה מדיפוזיה שימש למדידת קבוע הדיפוזיה של חלבונים ממברנליים וכן למדידת צמיגות הממברנה, כמו שמן זית חסרונות: לא ניתן לעקוב אחר חלבונים יחידים אם חלבון מסוים לא נע לאזור ההתאוששות, זה לא בהכרח אומר שהוא לא מובילי. יכול להיות שהוא מוגבל לאזור מסוים.

Answer 20

קבוע הדיפוזיה של חלבונים ממברנליים גדול - ההתאוששות מהירה יותר בפוטובליצ'ינג

Answer 21

מאפשרת לעקוב אחר חלבון יחיד עי הצמדת נוגדן עם סימון.

Answer 22

זה כך במרבית התאים למשל לצד אפיקלי או בזולטרטלי ההפרדה מתבססת למשל על צמתי אטימה דוגמה קלאסית: תא זרע שמכיל 3 דומיינים ממברנליים מובחנים. דוגמה נוספת - חלקים מובחנים בנוירון, אקסון, דנדריט... ``` ארבע דרכים ליצירת מדורים: יצירת אגרגטיים חלבוניים קישור לחלבון חוץ תאי לחלבון תוך תאי אינטראקציה עם חלבונים על פני תא אחר ```

Answer 23

מוטציה בחלבון ספקטרין

Answer 24

טטרמר הטרודימר

Answer 25

``` ספקטרין Adducin Band 4.1 Band 3 גליקופורין אנקירין אקטין טרופומיוזין ```

Answer 26

דומיינים ממברנליים שנוצרים בגלל שלד התא. | יכולים להיות קבועים או זמניים.

Answer 27

חלבונים שיוצרים עקמומיות בממברנה. למשל עי: ראש הידרופוסבי שנכנס בין הפוספוליפידים חלבון הקושר את הראשים הפולריים העקמומיות יכולה להיות חיובית או שלילית

Answer 28

כ-2 מיקרומטר | כ-10%

Answer 29

כפולה, כלומר 4 שכבות. | בררנית מאד!!

Answer 30

דנא + חלבונים

Answer 31

שלושה הליקסים, ביניהם 2 לולאות.

Answer 32

כ-142 קשרי מימן, | בין הליבה החלבונית לשלד הסוכר פוספט

Answer 33

מורכב מכ-30 סוגי חלבונים הקרויים נוקלאופורינים קיים קשר אבולוציוני לחלבוני מעטפת דוגמת COPII, קלתרין מספרים משתנה בין תא לתא כ-20,000 בתאי פורקנייה כמעט ללא בגלייה מעבר בתוך תווך מיימי מולקולת קטנות מ-5000 דלטון עוברות בחופשיות שומר על סימטריה, צד גרעיני וציטוזולי זהים

Answer 34

Membrane ring proteins - מעגנים לממברנה Scaffold Channel nucleoporins רבים מהחלבונים מכילים זרועות FG פנילאלנין, גליצין יוצרות מבנה לא מאורגן דמויי ג'ל פיברילים הפונים לציטוזול ולגרעין, לא סימטריים

Answer 35

בחלבונים הגדולים מ-60 קילודלטון מורכב מליזין וארגינין אם מדובר בקומפלקס חלבוני, מספיק חלבון אחד עם הסיגנל וירוס ה- SV40 מכיל סיגנל שמאפשר לו להיכנס לגרעין

Answer 36

גנים שמקודדים לאימפורטינים ואקספורטינים,

Answer 37

``` דומים עד כמעט בלתי ניתן להבחין אימפורטינים - NLS אקספורטינים - NES נקשרים מצד אחד לסיגנל ומצד שני לזרועות ה-FG חלבונים מסיסים ```

Answer 38

Monomeric GTPase protein חיוני לתהליכי אימפורט ואקספורט לגרעין, משקיע את האנרגיה ומעניק את הכיווניות!! GAP in cytosol GEF attached to chromatid In GDP mode, imported to nucleus via special importine recognizing only GDP mode. זה אימפורטין שלא קשור למשפחה

Answer 39

``` חלבון האימפורטין קושר את המטען נכנס באמצעות זרועות FG בתוך הגרעין נקשר ל-RanGTP המטען משתחרר יוצאים ביחד ובציטוזול פוגש את GAP עושה הידרוליזה ל-GDP האימפורטין משתחרר ```

Answer 40

``` אקספורטין קושר מטען בגרעין ויוצא פוגש RanGDP המטען משתחרר ביחד הם חוזרים לגרעין פוגש את GEF קושר GTP האקספורטין משתחרר ```

Answer 41

``` חלבונים שמכילים גם סיגנל NES וגם NLS לכן נעים פנימה והחוצה מהגרעין. אם קצב הכניסה גבוה מקצב היציאה החלבון יהיה בעיקר בגרעין ``` חלקם נעים פנימה והחוצה כל הזמן, אחרים לא. הבקרה על הטרנספורט עי כיבוי והדלקה של הסיגנלים, למשל עי זרחון. או חלבונים שמחזיקים אותם בציטוזול, או מכסים את הסיגנל שלהם.

Answer 42

חלבון הבקרה על גן רדום השולט במטבוליזם של כולסטרול. החלבון נוצר ונשמר כטרנסממברנלי ב-ER מעוגן לשם עי SCAP שקושר כולסטרול, כאשר אין לו כולסטרול לקשור, הוא עובר שינוי מבני ונכנס ביחד עם SREBP לוזיקולות טרנספורט לגולג'י. בגולג'י הוא פוגש פרוטאז ספציפי שחותך את הדומיין הציטוזולי המשתחרר לציטוזול. אז הדומיין החתוך נודד לגרעין ומפעיל את הגנים הנחוצים לאפטייק וביוסינתזה של כולסטרול.

Answer 43

By the same family of export receptors & Ran-GTP

Answer 44

In large assemblies, up to 100 million D מכיל מאות חלבונים מכתריסר סוגים. אלו הם mRNA rubonucleo-protein complex - mRNP's. לא מעורב ישירות Ran-GTP הטרנסלוקציה דרך הגרעין מונעת עי הידרוליזת ATP

Answer 45

``` nuclear factor activated T cells חלבון בקרת שעתוק אשר בתאי טי במנוחה מצוי בציטוזול במצב מזורחן. כאשר התאים מופעלים ריכוז הסידן התוך תאי עולה וחלבון פוספטאז מסיר את הזרחן. הצורה הלא מזורחנת חושפת סיגנל כניסה וחוסמת סיגנל יציאה. הקומפלס NF-AT cacinurin נודד לגרעין שםם הוא מפעיל שעתוק. התגובה מכובת כשריכוז הסידן יורד, וזרחון מחדש גורם לו לצאת לציטוזול. ``` תרופות לדיכוי מע החיסון פועלות על מנגנון זה, חוסמות דה זרחון עי קלצינורין למשל, ציקלוספורין

Answer 46

דינאין מפרק אותה באופן אקטיבי חלבוני ה-NPC נקשר לאימפורטינים כדי לאפשר הרכבה מחדש החלבונים מתפזרים ב-ER

Answer 47

הלמינה הגרעינית ועם חלבונים טרנסממברנליים של הממברנה הפנימית.

Answer 48

מצריכה את Ran-GTP שמשחרר את ה-NPC מהאקספורטינים

ביותא א Flashcards

(73 cards)