ביותא ב Flashcards
(114 cards)
פרוקסיזום
מקיים תהליכי חמצון
מוקף בממברנה יחידה
משכםל את עצמו
מכיל קטאלז ואוריאה אוקסידאז
מקיים חמצון ביתא - בשמרים וצמחים רק שם
ריאקציה ראשונה לייצור פלזמלוגן - פוספוליפיד חסר מטען, נפוץ במיאלין (90% ממיאלין)
הריאקציה הכללית:
RH2 + O2 -> O2H2 + R
האנזים קטלאז
מנצל מי חמצן על מנת לחמצן: חומצה פורמית, אלכוהול ופורמאלדהיד - פרוקסידציה.
חשוב במיוחד בכליה
הריאקציה המרכזית:
H2O2 + RH2 -> R + 2H2O
Uses H2O2 already existing to oxidise, also when accumulation:
2H2O2 -> 2H2O + O2
רצף סיגנל קצר מכוון חלבונים לפרוקסיזום
SKL - בקצה הקרבוקסילי!!
חלבונים אחרים מכילים סיגנל בקצה האמיני
רצפטורים מסיסים בציטוזול מזהים את הסיגנל, למשל
Pex5
שמוביל חלבונים עם סיגנל בקצה הקרבוקסילי, וכדי לצאת עוברי יוביקווטינציה.
תהליך הכניסה דרך פרוקסינים, שיוצרים תעלה, מונע עי
ATP
תסמונת זלוויגר
פגיעה בפרוקסיזומים. התאים מכילים פרוקסיזומים ריקים מחלה קלה יותר מתקבלת אם הפגיעה היא ב Pex7 לרוב מדובר בפגם ב- Pex5
יצירת פרוקסיזום
הנצה מפרוקסיזום קודם
לעיתים מווזיקולה מה-ER:
Involving Pex15 & Pex3, Pex19
כיצד מגיעים חלבונים לפרוקסיזום?
מתורגים בציטוזול ונישאים עי פרוקסינים,
או בווזיקולות מה-ER.
ER
ממברנה
גיוון בתאים
כ-50% מהממברנה בתא שייכת ל-ER
מתחלק לחלק וגס, כאשר החלוקה תלויה בפונקציה שממלא בתא
חלק - הנצה של וזיקולות, מטבוליזם ליפידים, כולסטרול, הורמונים סטרואידים; בכבד כמות נכבדת, Cyp450
גס - משובץ בריבוזומים
Leyding cells
מצויים באשכים, מכילים כמות גדולה של
ER חלק.
מייצרים הורמונים סטרואידים.
תרגום חלבונים אל חלל ה-ER
Co-translation
יכולים להיות ממברנליים או מסיסים ב-ER
SRP חלקי
וגם רצפטור עבורו על ה ER
GTP hydrolysis on SRP will allow interaction with the translocator on the ER membrane
מצריך סהכ 2 GTP
סיגנל מכווין לER
רצף של כ-20 ח.א, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, בקצה אמיני (שמסונתז ראשון)
יעבור ביקוע, כך שהחלבון הסופי קצר ב-20 ח.א
חלקיק SRP
Signal recognition particle
6 subunits and RNA molecule. בעל מבנה דמוי מתג, מולקולת הרנא בעלת תפקיד מבני פיגומי נקשר לתת היחידה הגדולה מתרכב בגרעינון גם הוא וגם הרצפטור שלו קיימים בכל התאים, יכולת הזיהוי הודות לכיס הידרופובי הכולל מתיונין, מקנה לו פלסטיות. מתתקפל בצורה בעוטפת את הריבוזום וחוסמת את קישור של פקטור אלונגציה, זה עוצר את התרגום עד להגעה לרשתית
טרנסלוקטור ל-ER
יוצר תעלה מלאה במים דרכה עובר הפפטיד
מכיל ציר - יחידת גאמא, פתח, פקק
הפקק סגור עד שמתחבר ריבוזום, כך שהרשתית אטומה
ליבת הטרנסלוקטור מכונה
Sec61
מכילה 3 תתי יחידות שמורות מאד
הטרנסלוקטור ביחד עם החלבונים המסייעים נקרא טרנסלוקון
Post translation into the ER
נפוצה בשמרי ובחלבונים המופרשים החוצה. מצריך שימוש בצ'פרונים דוגמת Bip - an ATPase, homologous to Hsp70 מושך את החלבון לתוך הER לכן מדובר בחלבון מסיס ב-ER
העברה לאחר תרגום בחיידקים
מדובר בהפרשה מחוץ לתא
יש להם הומולוג ל-SRP ועוד
משתמשים בחלבון
SecA - ATPase into a channel which is called SecY and is homologous to Sec61.
חיידקים דוחפים החוצה ויוקריוטים מושכים.
סיכום העברה לER
כולל חיידקים
Co translation - 2 GTP
Post translation - ATP
Bacteria - ATP
סוגי חלבונים טרנס ממברנליים
טייפ 1 -
חלבוני מולטי פס
מה הדוגמה?
סורק את הפפטיד החל מהקצה האמיני SRP
ונקשר לרצף ההידרופובי הראשון
לדוגמה, החלבון רודופסין, שגם עובר גליקוזילציה בקצה האמיני טרמינלי.
חלבוני
tail anchored
post translation pathway לנעיצת חלבונים על הממברנה למשל חלבוני SNARE התהליך: חלבון מסיס תופס את הקצה הקרבוקסילי ההדירופובי, וטוען אותו על Get3 - ATPase, dimer ER נוצר קומפלקס שעושה את דרכו ל שם הוא נקשר לרצפטורים Get1Get2 שמתפקד כמכונת נעיצת חלבונים בממברנה גט 3 משתחרר עי שחלוף ATP to ADP
הזנב הקרבוקסילי נותר נעוץ בממברנה והאמיני שוחה בציטזול
חלבוני הקבע של הER
מחצן שייר תיול ליצירת קשרים דיסולפידיים - PDI
צ’פרון - Bip
לחלבוני קבע יש סיגנל מיוחד הכולל 4 ח.א בקצה הקרבוקסילי הנקרא:
ER retention signal
PDI - protein disulfide isomerase
catalyzes the formation of S-S bonds in cysteine residues, both eukaryotes and bacteria
גליקוזילציה של חלבוני הפרשה
כמחצית מהחלבונים באי אר עוברים גליקוזילציה
מזורז עי האנזים אוליגוסכריד טרנספראז, היושב ליד הטרנסלוקון
N על שייר אספרגין, גליקוזילציה מסוג
שייר האספרגין חייב להיות:
NH2….N-X-S/T……COOH
גליקוזילציה על חלבונים ציטוזוליים וגרעיניים
N-acetyl glucose amine
על שייר סרין/תריאונין
גליקוזילציה O
מתחיל ב
ER
וממשיך בגול’י
בקרת קיפול חלבוני
ER
N glycolisation is important for correct folding of a protein.
קלנקסין וקלרטיקולין
חלבוני קושרי לקטינים הנקשרים לאוליגוסכרידים על פני חלבונים לא מקופלים ומחזירים אותם ב-ER
מונעים בכך אגרגציה של החלבונים.
מזהים סוכרים עם
גליקוזילציה N
וגלוקוז חופשי בקצה - משמע כאלו ששניים מתוך 3 הוסרו עי
ER glucosidase
תיאור מלא של התהליך אצל רשף.