Regulación genética

Question 1

Desde el punto de vista de la regulación génica, en qué se pueden clasificar los genes?

Answer 1

a) constitutivos: aquellos que se expresan continuamente durante el ciclo vital de una cell; genes de histones, de rRNA, etc…
b) regulados: aquellos que se expresan solo en determinado momentos de la vida de una cell; son la mayoría de los genes

Question 2

V o F:
En procariontes ocurre regulación de la expresión en todos los niveles, mientras que en que en eucariontes, el nivel más importante es el transcripcional

Answer 2

F, es al reves (eu/procariontes)

Question 3

Qué implican los mecanismo de regulación pretranscripcional?

Answer 3

computación y compactación del DNA

Question 4

V o F:

Los intrones en general son muchisimo mas pequeños que los exones.

Answer 4

Falso, son mucho mas grandes

Question 5

Cómo es la estructura de un gen eucariota?

Answer 5

1) Región regulatoria: con el promotor y CAAT + caja TATA

2) Región estructural:
Sitio de inicio de la transcripción
- 5’UTR
Primeras 3 bases (ATG) que codifican para el codón de incio
-intrones/exones
ultimas 3 bases TGA, TAA o TAG que codifican para uno de los 3 codones de termino
- 3’UTR

señales de poliadenilación: cola de poli A

Question 6

Como es la nomenclatura de direccionalidad del ADN?

Answer 6

• rio arriba: (-)
• rio abajo: (+)
• (+1): es el nucleótido donde inicia la transcripción

Question 7

Cómo se define un promotor?

Answer 7

Es una combinacion de secuencias cortas generalmente localizadas en la región inmediatamente anterior al gen, a menudo a 200pb del sitio de incio de la transcripción.

Question 8

Cual es el rol de un promotor?

Answer 8

Es un tipo de regulador transcripcional, determina el inicio del proceso.

Question 9

Describe al core de un promotor:

Answer 9

Es la parte que contiene los elementos que permiten la transcripción basal de un gen. Es la sección más cercana de la región codificante (dps vienen la zona proximal y la distal), incluye:

• Cajas TATA: reconocidas por la binding protein TATA, que es una subunidad del Transcription Factor IID (TFIID)
• Secuencias BRE: reconocidas por TFIID
• INR transcripción: secuencia iniciadora localizada en el sitio de partida de la transcripción
• DPE: elemento promotor localizado rio ABAJO de la posición +30; su objetivo es disminuir la velocidad de la transcripción

Question 10

Describe a la región proximal del promotor:

Answer 10

Se ubica entre la región distal y la core. Contiene elementos ubicados en la región río arriba del promotor entre las posiciones -200 a -50. Sus elementos son sitios de reconocimiento de factores de transcripción, entre estas:

• cajas CpG: cuyas citosinas se pueden metilar y cuando lo están, el DNA esta compactado; para pasar de regulación pre a transcripcional
• cajas CCAAT

Question 11

Qué son los enhancers?

Answer 11

son reguladores postivos de la transcripcion basar, la que se inciia a nivel del core del promotor. Las cajas CpG y CCAAT actuan como enhancers.

Question 12

Que son los silenciadores?

Answer 12

Son reguladores negativos de la transcripción (contrarios a los enhancers). En los genes humanamos, los silenciadores se4 encuentran cerca del promotor rio arriba y también dentro de los intrones

Question 13

Qué son los “Elementos límite” o aisladores?

Answer 13

Son regiones de DNA de 0,5 - 3 kb cuya función es bloquear la dispersión de la acción de los enhancers y silenciadores; para evitar que se expanda su acción a genes cercanos

Question 14

A que refieren los elementos de respuesta en los genes?

Answer 14

son modulares de la transcripción en respuestas a elementos externos tales once hormonas o cAMP

Question 15

En qué consiste la transcripción alternativa?

Answer 15

• Varios genes humanos tienen 2 o mas promotores alternativos, los cuales generan distintas isoformas con propiedades diferentes. Es un tipo de regulación transcripcional. Las isoformas pueden permitir:
  a) expresión tejido específica: distrofia humana
  b) expresión específica en distintos estados del desarrollo: insulina
  c) Localización subcelular diferencial: isoformas solubles o unidas a membrana
  d) capacidad funcional diferencial: receptor de proesterona (y de esteroides en general)
  e) regulación de expresión de genes sexo específicos

Question 16

Que mecanismos de regulación post-transcripcional vamos a estudiar?

Answer 16

• Splicing alternativo: empalme distinto de los exones del gen
• Poliadenilación alternativa: cuando ocurre Splicing alternativos también debe ocurrir (hay tantas, como distintos empalmes hayan); es la misma cola, solo que se pone (por señalización) según las diferentes combinaciónes de exones
• Edición del RNA tejido-dependiente
• Mecanismos de control traduccional

Question 17

Qué es la edición del RNA?

Answer 17

Forma de procesamiento post-transcripcional, que involucra la inserción o deleción de nucleótidos o sustitución de arios nucleótidos del RNA.

Question 18

Qué son los mecanismo epigenéticos?

Answer 18

• Son mecanismo que regulan la expresión de os genes y la estructura de la cromatina.
• Son aquellos no atribuibles a la secuencia del DNA
• El mecanismo mas utilizado es la metilación del DNA

Question 19

Describe la metilación del DNA:

Answer 19

• En vertebrados solo las citosinas son metiladas
• en el DNA humano, aprox el 3% de las C estan metiladas y forman parte de las islas CpG
• Los dinucleotidos CpG son metilados por citosinas metiltransferasas especificas
• La metilación puede tener roles en:
  a) evitar la transposición (defensa)
  b) regulación génica, ya que la metilación a nivel de las islas CpG de los promotores silencia la transcri
• La metilación y acetilación de histonas son mecanismos coordinados (compactación o descompactación; mecanismo pretanscri)

Question 20

V o F:

Por ahora hemos visto que la metilación del DNA regula pretranscripcional y transcripcional

Answer 20

SI 8=D

Question 22

Es importante la metilación en el desarrollo embrionario?

Answer 22

Si, es muy importante, puesto que controla toda la expresión génica; estando a cargo de la compactación del DNA (la demetilación)

Question 23

V o F:

Histonas desacetiladas y DNA metilado es igual es cromatina descompactada con alto nivel de expresión.

Answer 23

F, está muy compactada.

Question 24

Describe a la “inactivación del X”

Answer 24

a) Es un fenómeno epigenético que produce:
- Exclusión alélica: porque las hembras funcionan con un solo alelo (pq uno de sus X se inactiva)

• Expresión hemicogótica: expresión de un solo alelo y no de ambos (tanto en varones como en hembras)
  b) En mujeres, uno de los cromosomas X se heterocromatiza y se inactiva (cromatina sexual o heterocromatina de bar)

Question 25

En relacion a la inactivación del X que pasa en aneuploidias sexuales?

Answer 25

• Turner 45 X: no hay cromatina de bar
• 47 XXX: se herocromatizan 2 y solo hay uno activo
• 47 XXY: se heterocromatiza 1

Question 26

V o F:

en varones siempre hay cromatina de bar

Answer 26

F

Question 27

Que es la hipótesis de Lyon?

Answer 27

Establece que la heterocromatización del cromosoma X se hace al azar; en algunas cells el paterno y en otras el maternos, por lo que las hembras son un mosaico de expresión materna y paterna

Question 28

describe BIEN ESPECIFICO a la inactivación del X:

Answer 28

• Se Xq13 se ubica Xic (centro de inactivación del X), locus que controla el incido y propagación del X
• El gen XIST codifica por un RNA madura de 15kb que solo es codificado por el cromosoma X inactivo, exististiendo exclusión alélica y expresión mono alélica
• El producto del gen XIST es esencial para la función de XIC en inicial la inactivación, pero no para mantenerla
• El RNA producto del gen XIST se une diferencialmente a las bandas claras del bandeo G, ricas en genes

Question 29

A que se le denomina efectos de posición?

Answer 29

• Al control de la expresión génica a través de la estructura de la cromatina
• Se sugiere que la cromatina se organiza en dominios funcionales de expresión: Dominios de cromatina
• Estos dominios ejercen función CIS (en la misma hebra) sobnre la regulación coordinada de la expresión de clusters génicos
• La translocación produce expresión genica aberrante del sector translocado
• La heterocromatina induce efectos de posición. En drosophila, la proximidad a centrómeros, telomeros a bloques de heterocromatina, puede suprimir la expresión genica presumiblemente por la alteración de grandes dominios cromatinicos

Question 30

Qué es el imporinting genómico?

Answer 30

• Corresponde a una expresión diferencial del material genetico, ya sea a nivel cromosomico o alelico, dependiendo de si el material genetico es de origen materno o paterno
• El fenomeno de impronta genomica involucra modificaciones del DNA a nivel de las cells somaticas.
• no hay en anfibios, aves, reptiles ni marsupiales

Question 31

Cual es la lista de evidencias que sugieren la existencia de imprinting genómico en mamíferos?

Answer 31

• trasplante de pronúcleos
• fenotipos triploides en humanos
• Expresión de disomias uniparentales en ratones y humanos
• expresión fenotípica de deficiencias cromosom. en ratones y humanos
• Expresión génica en ratones transgénicos
• Expresión de genes específicos en rabotes y humanos: enfermedades en las cuales la edad de aparicio o severidad, depende del sexo del padre que transmite el gen

Question 32

Que son los cigotos andro/ginogeneticos?

Answer 32

• Androgenetico: cigoto en que los 2 conjuntos cromosómicos son de origen paterno
• genigenetico: cigoto en que los 2 conjuntos cromosómicos son de origen materno

Son ambas condiciones letales, que tienen los siguientes equivalentes en humano, respectivamente:

• mola hydatidiforme
• teratomas ováricos (tumores)

Question 33

describe un poco a las triploidías en humanos:

Answer 33

• apoyan al imprinting
• 3 conjuntos de cromosomas haploides:
  a) 2 P y 1 M: androide

b) 2M y 1P: ginoide

Question 34

Qué es una disomía uniparental?

Answer 34

• Condición en la cual ambos cromosomas o segmentos de ambos cromosomas homólogos, provienen de un mismo padre.
• Dependiendo de en qué cormosoma pase, se pueden generar fenotipos diferentes (en ratones por ejemplo) si la disomia es materno o paterna

Question 35

Por que deleciones pueden ser evidencias de imprinting?

Answer 35

Porque, por ejemplo, deleciones en un mismo par cromosómico, pero variando el cromosoma homologo afectado (paterno o materno) puede generar distintos fenotipos o sd.

• Hay genes imprintados en los homólogos: genes que se expresan solo en el cromosoma paterno y lo mismo para el materno

Question 36

Como se explica el imprinting?

Answer 36

• Sabemos que la expresion mendeliana era bialelica, sin embargo, un % de los genes se expresan por un solo alelo
• Muy tempranamente en la vida hay genes que se silencian por metilación
• Algunos genes tienen expresión solo paterna, otros solo materna

El imprinting es: “la expresión materna O paterna de un gen y cuando hay imprinting a expresión monoalelica”

ES UN FENOMENO DE REULACION GENICA EPIGENETICO

Question 37

resumen del imprinting:

Answer 37

https: //drive.google.com/file/d/14M2M4DvVtyom_VSV49dsr9TAZPtgDkMO/view
25: 35

Question 38

V o F:

Cuando un gen esta imprintado, significa que se expresa de esa forma en todas las celulas.

Answer 38

Falso. IGF2 (insulin-like growth factor type 2), por ejemplo, esta imprintado en mucho tejidos, sin embargo, tiene expresión bialelica en cerebro, higado, entre otras

Question 39

V o F:

El imprinting gamético, requiere borrar los imprintings previos

Answer 39

Verdadero