2.2 Structures secondaire Flashcards

1
Q

Définition de la structure secondaire

A

Repliement local de plusieurs aa pour former des motifs protéiques

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Q

Par quoi sont maintenues les motifs

A

Par des interactions non covalente entre acide aminés

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3
Q

Quels sont les deux principaux motifs étudiés en ndc

A

Hélice alpha

Feuillet plissé bêta

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4
Q

Quel type de liaison permet la formation de l’hélice

A

Liaisons H

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5
Q

Ou se trouve les liaisons H dans les hélices alpha

A

Entre le groupement amine de l’aa et le groupe carboxyle de l’aa en position n -4

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6
Q

Une hélice alpha de 36 aa fait combien de tour d’hélice

A

10 tours

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7
Q

Pourquoi les hélices alpha sont plus sur la forme right handed

A

Parce que la conformation left handed causent plus d’encombrement stérique

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8
Q

Quels sont les valeurs des angles dièdres dans les hélices alpha

A

Phi =-60

Psi = -50

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9
Q

Par quel technique l’hélice alpha a t elle été validée

A

Cristallographie

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10
Q

Quels sont les aa sont favorables à la formation d’hélice alpha

A

Ala
Glu
Leu
Met

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11
Q

Quels sont les aa sont défavorables à la formation d’hélice alpha

A

Pro

Gly

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12
Q

Pourquoi la proline est défavorable

A

Parce que après la formation du lien peptide, il n’y a pas de H disponible pour faire une liaison H

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13
Q

Les fortes contrainte de quel aa cause une distorsion de l’hélice

A

Proline

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14
Q

Ou est ce qu’on retrouve généralement la proline et la glycine

A

Aux extrémités de l’hélice

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15
Q

De quoi sont composé les feuillets bêta

A

Chaînes polypeptide de 5 a 8 aa dispose parallèlement ou anti-parallèlement

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16
Q

A quoi est lié le groupement NH d’un acide aminé d’une chaîne polypeptide d’un feuillet bêta

A

Au groupement COO- de l’autre chaîne parallèle

17
Q

Comment sont projeter les chaîne d’un feuillet bêta

A

Alternativement en haut et en bas du plan d’un feuillet

18
Q

Quel type de feuillet plissé bêta est le plus stable

A

Les feuillets dispose anti-parallele

19
Q

En général, les feuillets bêta sont forme de combien de segments polypeptide

A

2 a 15 segment polypeptidique d’en moyenne 6 AA

20
Q

De quel type de structures secondaire sont composé les fibrine de soie

A

Feuillet plissé bêta empackter un sur l’autre

21
Q

Les structures secondaire régulières correspondent à quel pourcentage d’une protéine globulaire

A

50%

22
Q

Les autres segments ont quel conformation

A

Solénoïde ou en boucle

23
Q

Les boucles qui relient les structures secondaires sont de longueur et de forme fixe

A

Faux, forme variable

24
Q

Par quoi sont prédéterminés les structure des boucles et dès solénoïde

A

Par la séquence primaire