Composition Des ARN Flashcards

1
Q

ARNm

Pourcentage :
Nb de sorte :
Composition :

A

(2% des ARN totaux)

Seul ARN à être traduit en protéine.

1 000 sorte / cellule

Coiffe / 5’UTR / codant / 3’UTR / queue poly a

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2
Q

ARNt

A

16% de ARN totaux

Transport des acides aminés dans le cytoplasme vers les ribosomes, permettent
l’incorporation des acides aminés dans les protéines.

70-90 ribonucléotides

Structure en forme de trèfle

Nombreux nucléotide atypique

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3
Q

Petit ARN

A

1%

ARNsn (ARN small nuclear) : impliqués dans l’épissage des préARNm.
Liés a des prot U1 à U7

ARNsno (ARN small nucleolar) : impliqués dans les modifications chimiques et la
maturation des ARNr.

Ils sont uniquement EUCARYOTES + + + et situés dans le NOYAU !

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4
Q

3 ARN polymérases chez les eucaryotes

A

Pol 1
Pol 2
Pol 3

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5
Q

ARN Pol 1

Localisation :

Transcrit :

Activité cellulaire :

A

Localisation : nucléole

Transcrit : ARNr 5.8S 18S 28S via le 45S

Activité cellulaire : 60-70%

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6
Q

ARN Pol 2

Localisation :

Transcrit :

Activité cellulaire :

A

Localisation : nucleoplasme

Transcrit : ARNm/ ARNSsn / ARNlnc / miARN

Activité cellulaire :10-30%

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7
Q

ARN Pol 3

Localisation :

Transcrit :

Activité cellulaire :

A

Localisation : nucleoplasme

Transcrit : ARNt / ARNr 5S / ARNsn

Activité cellulaire : 10%

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8
Q

Rôle des SU α

A

Liaison aux séquence promotrice, assemblage de l’enzyme, maintien du Brin non transcrit à l’écart

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9
Q

Rôle des SU β et β´

A

Bêta : liaison au Ringo, nucléotides
Bêta’ : liaison à la matrice d’ADN

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10
Q

Rôle SU σ

A

Reconnaissance du promoteur et initiation de la transcription
( Se détache au bout de 10 nucléotides )

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11
Q

ARNsn

A

Moins de 1%
Petite taille < 200 nt
Épissage des pré-ARNm
Excision d’intron par deux réaction de trans-estérification ( consomme bcp d’énergie )
Dans le noyau
Associé a des snRNP ( 7snRNP pour 1 ARNsn )

Avec un spliceosome

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12
Q

Spliceosome

A

Composé de complexe de snRNP = protéine + ARNsn
Riche en U donc U1 ,U2 ,U3,…

U1 = reconnaît le SDE
U2 = reconnaît le A de branchement

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13
Q

ARNr

A

82%

Pas d’épissage / pas d’ajout de cap / pas de queue polyA
Résultat d’une étape de clivage ( pas d’épissage )

Transcription: dans le nucléole d’un précurseur très grand par ARN Pol I

Maturation: ARN 45S = non mature
-modification chimique par des snoRNP
-snoRNP = protéine + snoARN = guide les modifications chimique + les endonucléase ( hydrolyse au NV des espaceurs intra génique )

Obtention: des ARNr 18S , 28S et 5,8S

Formé dans le noyau puis assemblé dans le cytosol

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14
Q

MicroARN

A

Taille : 20nt
Transcrit dans le noyau par l’ARN pol II et maturation dans le noyau et le cytoplasme
Rôle : régulation de l’expression des gènes
-s’hybride ( liaisons hydrogène ) avec ARNm au NV de 3’ UTR
- dégradation de l’ARNm OU Blocage de la traduction de cet ARNm

1) Pri-miARN
2) DROSHA —> pré-miARN
3) dans le cytoplasme DICER
4) RISC le rend simple brin
5) miARN se fixe sur son ARNm cible

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15
Q

Base mineure

A

Hypoxanthine (désamination hydrolytique de l’Adénine) → 6-oxopurine

Pseudo-uracile (surtout présent dans les ARNt au sein du bras TVC).

4-thiouracile (peu important)

5-méthylcytosine (ADN, méthylation spontanée de la Cytosine) : base importante pour la transcription. S’apparie avec la guanine (mésappariement) = hot spot de mutation.
(Attention ici, l’appariement de la cytosine methylée avec la guanine n’est pas un mésappariement en soi, mais la Cm peut devenir une thymine par désamination et c’est là qu’on a une mutation.)

7-méthylguanine (ARNm) : CAP en 5’.

5,6-dihydrouracile (ARNt au sein du bras DHU).

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16
Q

Désamination

Adénine
Guanine
Cytosine
Thymine

A

Adénine —-> hypoxanthine

Guanine —-> Xanthine

Cytosine —-> Uracile

Thymine —-> pas possible

17
Q

Appariement

Hypoxanthine
Xanthine
Uracile

A

hypoxanthine —-> cytosine

Xanthine —> Thymine

Uracile —-> Adénine

18
Q

Règle de Chargaff

A

Rapport A/T = G/C = 1

A+T / G+C = 1.46

A+G / T+C = 1

19
Q

Caractéristiques ADN B

A

Région interne Hydrophobe

Empilée et partiellement superposées

Plan parallèle

Décalée de 0.34 nm / rotation = 36° / pas d’hélice = 3.4nm / diamètre = 2nm

10pb/tour d’hélice

Résidu phosphate orientés vers l’extérieur

Grand sillon = ARN régulateur et protéines / Petit sillon = fixation histone et protéines

Prot basique lysine ou Arginine

20
Q

Inhibiteur de la gyrase bactérienne

Rôle :
Exemple :

A

Rôle : inhibition pour le traitement des infections urinaire

Exemple : acide nalidixique

21
Q

Inhibiteur de la topoisomérase humaine

Rôle :
Exemple :

A

Rôle : cellule tumorale

Exemple :
Topoisomérase I = Irinotécan ( cancer digestif , colorectaux )
Topoisomérase II = Doxorubicine ( Lymphomes , tumeurs du sein , sarcome , myélomes )

22
Q

ADN Z

A

Zig Zag / Hélice gauchère

Plateaux de base peu inclinés

Méthylation en C5 des îlots CG

Alternance régulière des base purique et pyrimidiques

Multiple cytosine au sein des promoteurs

23
Q

Caractéristique des modifications des Histones

A

Séquence N-term des histones sont libre

Modifications post traductionelle:

  • acéthylation = décompaction
  • méthylation = compactions
24
Q

Fibre de 10 nm du nucléosome

A

150 Pb ( autour des histones ) + 50 Pb (ADN linker)

2 H3 + 2 H4 + 2 H2A-H2B

H1 non comprise dans le nucléosome car lésions entre

25
Q

Fibre de 30 nm du nucléosome

A

Structure solénoïde

6 nucléosomes = 1 hélice

26
Q

Caractéristique de l’ADN mitochondrial

Pourcentage :
Nb de copie / mitochondries :
Taille :

A

< 1% de l’ADN cellulaire

10 copies / mitochondrie

Tailles : 16 569 pb

Fonctionnement autonome

légèrement différent de celui du génome nucléaire

27
Q

Codon STOP

Nucléaire :

A

Nucléaire : UAA / UGA / UAG

28
Q

Taille des Ribosomes Eucaryote

Petite et grande sous unité

A

Eucaryote : 80S = 60S(Grande) + 20S(petite)

Grande —-> ARNr = 5S + 5,8S + 28S
Petite ——-> ARNr = 18S

29
Q

siARN

A

Double brin

Origine exogène : viral ou introduit artificiellement

Cible spécifique

30
Q

miARN

A

Environ 2 600 types chez l’homme

Simple brin / origine Endogène / 18 a 24 nt / transcrit de 90 a 200 nt

Orientation anti-sens ( 40% ) dans les introns

Control près de 50% des gènes

Se lie à la région 3’ UTR —> répression de la traduction / dégradation

1 seul miARN peut cibler jusqu’à 100 ARNm ou plus

31
Q

Maturation des miARN

A

Pri-miARN —> complexe DROSHA —->
pré-miARN ——> enzyme DICER —->
duplex de miARN —-> miARN simple Brin

Complexe RISC

32
Q

Lnc ARN

A

Environ 30 000

Taille : >200 nt - 10 000

S’exprime plus faiblement

5 classes :
- sens et anti sens ( dans la portion 3’ et chevauche au moins un exos codant )
- intronique
- divergent ( proximités du promoteur )
- intergénique ( éloigné d’environ 5 000 nucléotides d’un gène codant )

Action Locale en Cis / action distale en trans

Exemple : XIST inactive le chromosome X ( 19kb )
Ploycomb2 maintien l’inactivation du chromosome X

33
Q

Produits de la dégradation des cytosine

A

Beta-Alanine

NH3

CO2

34
Q

Produits de la dégradation des thymine

A

Acide beta-amino-Isobutyrique