Tipos De Muestras Para Estudios Y Método De Dx Moleculares Flashcards

1
Q

¿Qué significa tándem?

A

Secuencia de 2 o + bases que se repiten varias veces

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2
Q

Diferencia entre VNTR y STR

A

VNTR: detección de polimorfismos en número de repeticiones en tándem
STR o SSR: secuencia de tipo microsatélite: unidades cortas de 1 a 6 pares de bases que se repiten en tándem un número elevado de veces

La diferencia de VNTR con STR es la repetición de polimorfismos

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3
Q

¿Qué es hibridación?

A

Proceso en dónde se unen 2 cadenas complementarias

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4
Q

¿Qué es PCR?

A

Reacción en cadena de la polimerasa
Localiza secciones definidas o genes que corresponden con virus en cuestión
Permite producción (amplificación) rápida de un segmento específico de ADN

RTPCR - cuantitativa
- Fluorescencia
- Retrotranscripción
Convencional - cualitativa

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5
Q

Pasos de PCR

A
  1. PCR:
  2. Desnaturalización
  3. Emparejamiento
  4. Extensión
  5. Electroforesis
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6
Q

Uso clínico PCR

A

Detección de dif agentes infecciosos difícilmente cultivables
Aplicación en detección de mutaciones puntuales, deleciones o inserciones (analizando longitud de PCR), incluso translocaciones

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7
Q

Reacción en cadena de polimerasa con transcriptasa inversa

A

Método para amplificación de ARN, para analizar expresión génica, sirve para analizar ARNm de cél

PCR se hace solo de ADN - para ciertos virus cuyo material genético tiene ARN o para medir expresión génica de ARNm se hace paso adicional - retrotranscripción (reversa) - se tiene ARN y se convierte en ADN - este recibe nombre de ADN complementario

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8
Q

Diferencias entre técnica PCR cualitativa y cuantitativa

A

Ambas se usan para el diagnostico de enfermedades

  • Cualitativa
    Función: franquear área que quiero amplificar
    Ej. identificar patógenos o genes
  • Cuantitativa
    Hay datos referentes a ciclos, en qué ciclo fue detectada la amplificación, cicle t = cantidad de ciclos que tiene la PCR (35-40), lo que varía es el umbral
    Ej. seguimiento de tx de pacientes, identificar causa viral de px
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9
Q

¿Qué es CT y umbral?

A

CT: Número de ciclos necesario para que señal fluorescente cruce el umbral de detección; valor semicuantitativo, inversamente relacionado con ARN existentes

Umbral: punto mínimo de elongación para expresarse

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10
Q

¿Qué significa un CT alto y uno bajo?

A

CT bajo = mayor expresión de la carga viral del patógeno, menos ciclos

CT alto = menor carga viral, requirió más ciclos para llegar a umbral

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11
Q

Biopsia líquida

A

Menos invasiva y da mayor información

Se detecta
cfADN - ác nucleicos extracelulares circundantes (fuera/libre de cél)
ctADN - ADN tumoral circulante (dentro de cél)
CTC - células tumorales circulantes

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12
Q

Tecnologías para detección de ctADN/cfADN

A

ddPCR
BEAMing
CAPP-Seq
Tam-Seq
WES
WGS
WGBS-Seq

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13
Q

¿Qué significa SNP?

A

Polimorfismo de un solo nucleótido

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14
Q

¿En qué se basa RFLP?

A

En la identificación de diferencias en tamaño de fragmentos generados mediante restricción de endonucleasas

RFLP = detección de polimorfismo en longitud de los fragmentos de restricción

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15
Q

¿Qué es un microarreglo?

A

Chips de ADN, distribución ordenadas de genes en superficie de 4 cm2
Permite estudiar nivel de expresión de múltiples genes de forma simultánea

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16
Q

Fundamento de microarreglos

A

Hibridación de ác nucleicos y su detección por fluorescencia

17
Q

Elementos mínimos de PCR

A

Cebador
Polimerasa
ADN molde
Nucleótidos
Cambios de temperatura para desnaturalización de ADN y funcionamiento de componentes