Pharmacogénétique Flashcards
Quels 4 cas peuvent survenir à un patient lorsqu’il prend un médicament?
bénéfice, aucune toxicité
Bénéfice, toxicité
Aucun bénéfice, aucune toxicité
Aucun bénéfice, toxicité
Dans quel cas se retrouve en général la majorité de la population?
Bénéfice et aucune toxicité
Qu’est-ce qui explique que 6,7% des gens puissent avoir une réaction sévère au médicament, qu’un médicament puisse être fatal pour 0,32% des gens et pas pour d’autres et que un certain pourcentage des gens ne répondront pas ou mal au traitement?
La variabilité génétique
Comment peut-on améliorer les thérapies en tenant compte de la variabilité génétique?
En identifiant les facteurs associés à la sensibilité différentielle aux médicaments.
Les réactions indésirables peuvent être influencées par des facteurs génétiques en environnementaux, quels sont ces facteurs environnementaux ?
Les médicaments administrés
Les maladies
Autres facteurs (Nutrition, mode de vie, âge , sexe, interactions médicamenteuses..)
Comment peut-on remédier aux problèmes amenés par le régime «la même posologie pour tous»?
Ajuster le traitement en fonction de la génétique
Qu’est-ce que la pharmacogénétique?
Un lien entre la constitution génétique et la réponse thérapeutique, qui tient compte des variations héréditaires et interindividuelles. permet de faire le lien entre génotype et phénotype
Que fut le début de la pharmacogénétique?
Des médecins à Londres en 1975 ont voulu tester si ils réagiraient tous de la même façon à la DÉBRISOQUINE. Ils ont réaliser que certains allaient avoir une chute prolongée de pression alors que d’autres non. Ceci est du au fait que les métaboliseurs pauvres avaient une déficience de CYP2D6 qui ne leur permettait pas de transformer la débrisoquine en métabolite éliminé par les reins.
Quel sont les buts de la pharmacogénétique?
1 Maximiser l’effet du traitement en ciblant les médicaments susceptibles de produire un effet désirable chez les patients.
2 Identifier les individus qui sont à haut risque de subir des effets secondaires indésirables
3 Adapter le traitement en conséquence des facteurs génétiques des patients (en changeant de médicament ou de dose au besoin)
À quoi ça sert de regarder les gènes des patients avant de leur administrer un traitement?
Les gènes produisent les enzymes qui agissent comme médiateurs des effets des médicaments. En regardant les gènes des gens, il serait possible de prédire si ces patients sont susceptibles de bien répondre ou non à un traitement.
Quel impact à la pharmacogénétique en clinique?
Elle augmente la proportion des gens qui ont une réponse favorable à un traitement en prévenant les effets secondaires indésirables (puisque les doses sont mieux ajustées)
Quel pourcentage de nos 3 millards de paires de bases représente nos différences physiques (d’un individu à l’autre)?
0.2%
Quels sont les trois types de polymorphismes?
- SNPs (single nucleotide polymorphism)
- Short indels (quelques pb)
- Polymorphismes de répétition ou de longueur (segments répétés)
Comment sont classés les polymorphismes de répétition?
Selon la longueur du segment qui se répète
Comment se nomme une variation de séquence de l’ADN qui altère une fonction de la cellule?
Les variants fonctionnels
Les variants fonctionnels ont un impact sur quoi?
La réponse aux médicaments
Maladies
Agressions environnementales
À quelle position dans le codon (1,2 ou 3) un SNP pourrait ne pas avoir d’effet?
En position 3
Un changement de base azotée en position 1 ou 2 risque de changer l’acide aminé pour lequel le codon code.
Que peut il arriver si on change le site de liaison de l’ARN polymerase? (Par un polymorphisme)
On peut changer la quantité d’ARNm produite.
Comment les SNPs fonctionnels peuvent affecter la réponse au traitement ?
En modifiant la qualité ou la quantité du produit du gène.
Qu’est-ce que le génotype?
La constitution génétique d’un individu.
La combinaison des allèles d’un ou plusieurs gènes.
Qu’est-ce que ça veut dire si on représente un allèle par une lettre majuscule?
Que c’est l’allèle dominant/majeur/plus fréquent
Quand on parle de polymorphisme SNPs, combien d’allèles sont en question?
2 allèles
Quand on parle de polymorphisme SNPs, combien de génotypes sont possibles?
3 (pas de snp, un seul snp, snp sur les deux allèles)
Quand on parle de polymorphismes de répétition, combien d’allées sont en question?
Plusieurs, selon le nombre de répétitions possibles
Combien de génotypes sont possibles pour les polymorphismes de répétition?
Plusieurs selon le nombre de répétitions possibles
À quoi sert la base de donnés des snp?
De savoir où sont situés les SNPs et leur fréquence dans la population
Quels sont les trois bases de donnés / consortiums que nous avons vu en classe?
SNP
PharmGKB (pharmacogenomics knowledge base)
CPIC (clinical pharmacogenetics implementation consortium)
À quoi sert PharmGKB?
A nous renseigner sur les modes d’action des certaines maladies et médicaments.
Établi le lien entre génétique et réponse
Quel est l’objectif du CPIC?
Transposer les résultats des recherches pharmacogénomiques en recommendations spécifiques
Quelles sont les deux approches en pharmacogénétique?
L’approche des gènes candidats
Dépistage génomique
Que nécessite l’approche des gènes candidats?
Des connaissances préalables sur le gène candidat.
À quoi sert le dépistage génomique?
Trouver la region du génome ayant les gènes de susceptibilité sans savoir quels sont ces gènes au préalable.
Qu’est-ce qu’un gène candidat?
Un gène qui code pour des déterminants pharmacocinétique et pharmacodynamiques des effets des médicaments
Quels sont les gènes analysés dans des études pharmacogénétiques ? (3)
- Les gènes contrôlant des enzymes qui métabolisent des médicaments et leurs produits. (Ex gènes codants pour CYP2C19 et CYP2D6)
- Les gènes codants pour des transporteurs (influencent absorption, distribution, métabolisme, excrétion)
- Les gènes codants pour les cibles des médicaments (récepteurs ou enzymes)
Comment fait-on pour évaluer si un SNP est responsable d’un effet sur la réponse au médicament?
On compare la fréquence génotypique/allélique du SNP chez :
Sujets répondants vs. non-répondants
Patients avec toxicité vs. patients sans toxicité
Patients avec différentes réactions pharmacocinétiques au médicament
Qu’est-ce qu’une étude d’association?
Quand on associe une forte prévalence d’un polymorphisme à une maladie / une réponse parce que le polymorphisme est plus présent dans le groupe affecté que le groupe référence.
Ou doit se trouver le polymorphisme pour qu’il soit fonctionnel/qu’il ait un effet sur la réponse au médicament.
Région codante ou région régulatrice du gène qui code pour une enzyme/transporteur/récepteur
Qu’y arrive-t-il si le polymorphisme se trouve sur un gène codant pour une enzyme métabolisant un médicament?
L’activité de l’enzyme sera réduite et donc les concentrations plasmatiques de médicament vont être plus élevées que la normale
Qu’y arrive-t-il si le polymorphisme se trouve sur un gène codant pour un récepteur du médicament?
Le mutant homozygote (deux allèles mutants) ne ressentira quasiment pas d’effet car la cible du médicament est sous-représentée.
Le mutant hétérozygote ressentira plus l’effet du médicament que le mutant homozygote et moins que l’homozygote sauvage
Comment peut on faire le génotypage?
Avec la PCR: visualisation du génotype, amplification de la région du polymorphisme
Quelles sont les trois étapes de la PCR?
- Dénaturation de l’ADN
- Appariement des amorces spécifiques
- Synthèse de l’ADN à partir des amorces
Comment on visualise les résultats d’un test PCR?
Sur un gel ex d’agarose avec différents colorants
Que verrons nous sur un test PCR de génotypage?
Les génotypes recherchés ex: GG GC CC et possiblement quel individu a quel génotype.